MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022234	GGC	2	6	208152	208157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5502	NC_022234	CGT	2	6	208164	208169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5503	NC_022234	TGGCC	2	10	208230	208239	0 %	20 %	40 %	40 %	538344403
5504	NC_022234	TGGCC	2	10	208290	208299	0 %	20 %	40 %	40 %	538344403
5505	NC_022234	GGC	2	6	208323	208328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5506	NC_022234	CGT	2	6	208335	208340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5507	NC_022234	GGT	2	6	208351	208356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344403
5508	NC_022234	TGGC	2	8	208376	208383	0 %	25 %	50 %	25 %	538344403
5509	NC_022234	GCC	2	6	208420	208425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5510	NC_022234	CGT	2	6	208524	208529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5511	NC_022234	GCC	2	6	208546	208551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5512	NC_022234	GC	3	6	208582	208587	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5513	NC_022234	GCT	2	6	208606	208611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5514	NC_022234	CGT	2	6	208650	208655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5515	NC_022234	GTC	2	6	208663	208668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5516	NC_022234	GGT	2	6	208669	208674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344403
5517	NC_022234	CGT	2	6	208710	208715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5518	NC_022234	GAT	2	6	208750	208755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344403
5519	NC_022234	CGT	2	6	208776	208781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5520	NC_022234	AGT	2	6	208782	208787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344403
5521	NC_022234	CGC	2	6	208797	208802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5522	NC_022234	AGGT	2	8	208817	208824	25 %	25 %	50 %	0 %	538344403
5523	NC_022234	CGT	2	6	208869	208874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5524	NC_022234	CGT	2	6	208914	208919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5525	NC_022234	CGGT	2	8	208946	208953	0 %	25 %	50 %	25 %	538344403
5526	NC_022234	GCG	2	6	209015	209020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5527	NC_022234	CGT	2	6	209037	209042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5528	NC_022234	GGC	2	6	209050	209055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5529	NC_022234	ACG	2	6	209066	209071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5530	NC_022234	CCTT	2	8	209075	209082	0 %	50 %	0 %	50 %	538344403
5531	NC_022234	TGA	2	6	209100	209105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344403
5532	NC_022234	GAT	2	6	209143	209148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344403
5533	NC_022234	CTGC	2	8	209158	209165	0 %	25 %	25 %	50 %	538344403
5534	NC_022234	TGA	2	6	209166	209171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344403
5535	NC_022234	CGG	2	6	209229	209234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5536	NC_022234	CGC	2	6	209235	209240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5537	NC_022234	TGC	2	6	209249	209254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5538	NC_022234	CCA	2	6	209256	209261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344403
5539	NC_022234	TGC	2	6	209270	209275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5540	NC_022234	GCG	2	6	209285	209290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5541	NC_022234	GGCC	2	8	209346	209353	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5542	NC_022234	AGC	2	6	209381	209386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5543	NC_022234	GGGTGA	2	12	209400	209411	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	538344403
5544	NC_022234	CAG	2	6	209449	209454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5545	NC_022234	GGC	3	9	209511	209519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5546	NC_022234	CG	3	6	209544	209549	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5547	NC_022234	GC	4	8	209569	209576	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5548	NC_022234	GGC	2	6	209596	209601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5549	NC_022234	G	6	6	209640	209645	0 %	0 %	100 %	0 %	538344403
5550	NC_022234	GCC	2	6	209704	209709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5551	NC_022234	CGG	2	6	209712	209717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5552	NC_022234	CGC	2	6	209745	209750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5553	NC_022234	CGGC	2	8	209751	209758	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5554	NC_022234	CGC	2	6	209784	209789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5555	NC_022234	CTT	2	6	209794	209799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344403
5556	NC_022234	GTT	2	6	209818	209823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344403
5557	NC_022234	ATC	2	6	209885	209890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344403
5558	NC_022234	TCG	2	6	209915	209920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5559	NC_022234	CGG	2	6	209939	209944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5560	NC_022234	GGTC	2	8	209958	209965	0 %	25 %	50 %	25 %	538344403
5561	NC_022234	GCC	2	6	210032	210037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5562	NC_022234	TTC	2	6	210053	210058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344403
5563	NC_022234	CGG	2	6	210072	210077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5564	NC_022234	CAT	2	6	210079	210084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344403
5565	NC_022234	GCG	2	6	210134	210139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5566	NC_022234	GC	3	6	210180	210185	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5567	NC_022234	T	6	6	210215	210220	0 %	100 %	0 %	0 %	538344403
5568	NC_022234	GTC	2	6	210238	210243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5569	NC_022234	TGA	2	6	210309	210314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344403
5570	NC_022234	GCA	2	6	210390	210395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5571	NC_022234	GC	3	6	210412	210417	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5572	NC_022234	GGCG	2	8	210427	210434	0 %	0 %	75 %	25 %	538344403
5573	NC_022234	CAG	2	6	210451	210456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5574	NC_022234	GCA	2	6	210480	210485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5575	NC_022234	CTT	2	6	210499	210504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344403
5576	NC_022234	ATG	2	6	210548	210553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344403
5577	NC_022234	GGC	2	6	210646	210651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5578	NC_022234	GCGCTC	2	12	210706	210717	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344403
5579	NC_022234	CGT	2	6	210729	210734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5580	NC_022234	G	6	6	210738	210743	0 %	0 %	100 %	0 %	538344403
5581	NC_022234	TC	3	6	210764	210769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_022234	GTC	3	9	210785	210793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_022234	GCC	2	6	210833	210838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344404
5584	NC_022234	CGG	2	6	210839	210844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344404
5585	NC_022234	GCC	2	6	210936	210941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344404
5586	NC_022234	GCC	2	6	210971	210976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344404
5587	NC_022234	CTG	2	6	211007	211012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_022234	CGA	2	6	211076	211081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344405
5589	NC_022234	AGC	2	6	211109	211114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344405
5590	NC_022234	AGA	2	6	211115	211120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344405
5591	NC_022234	CGCT	2	8	211152	211159	0 %	25 %	25 %	50 %	538344405
5592	NC_022234	TC	3	6	211332	211337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_022234	TTA	2	6	211355	211360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538344406
5594	NC_022234	GCA	2	6	211364	211369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5595	NC_022234	CTG	2	6	211463	211468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5596	NC_022234	TTCT	2	8	211653	211660	0 %	75 %	0 %	25 %	538344406
5597	NC_022234	CTTT	2	8	211675	211682	0 %	75 %	0 %	25 %	538344406
5598	NC_022234	GTA	2	6	211799	211804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344406
5599	NC_022234	TCA	2	6	211836	211841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344406
5600	NC_022234	ATCGG	2	10	211858	211867	20 %	20 %	40 %	20 %	538344406
5601	NC_022234	CTTC	2	8	211906	211913	0 %	50 %	0 %	50 %	538344406
5602	NC_022234	TGC	2	6	211951	211956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5603	NC_022234	GCG	2	6	211978	211983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344406
5604	NC_022234	GGT	2	6	211990	211995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344406
5605	NC_022234	CTTC	2	8	212017	212024	0 %	50 %	0 %	50 %	538344406
5606	NC_022234	GGC	2	6	212037	212042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344406
5607	NC_022234	TCT	2	6	212043	212048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344406
5608	NC_022234	GGT	2	6	212129	212134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344406
5609	NC_022234	TGC	2	6	212149	212154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5610	NC_022234	CG	3	6	212221	212226	0 %	0 %	50 %	50 %	538344406
5611	NC_022234	GCT	3	9	212243	212251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5612	NC_022234	GTG	2	6	212346	212351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344406
5613	NC_022234	TTC	2	6	212421	212426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344406
5614	NC_022234	GT	3	6	212427	212432	0 %	50 %	50 %	0 %	538344406
5615	NC_022234	CG	3	6	212446	212451	0 %	0 %	50 %	50 %	538344406
5616	NC_022234	TTC	2	6	212481	212486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344406
5617	NC_022234	TGA	2	6	212526	212531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344406
5618	NC_022234	CG	3	6	212548	212553	0 %	0 %	50 %	50 %	538344406
5619	NC_022234	GC	3	6	212587	212592	0 %	0 %	50 %	50 %	538344406
5620	NC_022234	CCG	2	6	212607	212612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344406
5621	NC_022234	CGT	2	6	212749	212754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5622	NC_022234	CCG	2	6	212785	212790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344406
5623	NC_022234	G	6	6	212810	212815	0 %	0 %	100 %	0 %	538344406
5624	NC_022234	CAT	2	6	212860	212865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344406
5625	NC_022234	GGCTCT	2	12	212866	212877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5626	NC_022234	GTC	2	6	212921	212926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5627	NC_022234	TCG	2	6	213048	213053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
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5631	NC_022234	ACG	2	6	213221	213226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344406
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5635	NC_022234	CTG	2	6	213463	213468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
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5642	NC_022234	GCG	3	9	213642	213650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344406
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5645	NC_022234	GCCG	2	8	213721	213728	0 %	0 %	50 %	50 %	538344406
5646	NC_022234	TCG	2	6	213732	213737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
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5650	NC_022234	CGT	2	6	214048	214053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5651	NC_022234	GTC	2	6	214061	214066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
5652	NC_022234	GATG	2	8	214081	214088	25 %	25 %	50 %	0 %	538344406
5653	NC_022234	TTC	2	6	214101	214106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344406
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5655	NC_022234	GTA	3	9	214178	214186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344406
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5659	NC_022234	CGT	2	6	214312	214317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344406
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5661	NC_022234	GCTGTA	2	12	214373	214384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538344406
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5723	NC_022234	CGC	2	6	216973	216978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344407
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5727	NC_022234	GGTGAT	2	12	217034	217045	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	538344407
5728	NC_022234	CGGCCG	2	12	217120	217131	0 %	0 %	50 %	50 %	538344407
5729	NC_022234	GC	3	6	217222	217227	0 %	0 %	50 %	50 %	538344407
5730	NC_022234	GCT	2	6	217229	217234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344407
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5732	NC_022234	CGT	2	6	217378	217383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344407
5733	NC_022234	CGCC	2	8	217420	217427	0 %	0 %	25 %	75 %	538344407
5734	NC_022234	CTG	2	6	217442	217447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344407
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5736	NC_022234	GGGC	2	8	217539	217546	0 %	0 %	75 %	25 %	538344407
5737	NC_022234	CAG	3	9	217556	217564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344407
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5739	NC_022234	GTC	2	6	217625	217630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344407
5740	NC_022234	CAGGCT	2	12	217670	217681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344407
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5742	NC_022234	GCT	2	6	217792	217797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344407
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5865	NC_022234	GCG	2	6	222358	222363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5866	NC_022234	GT	3	6	222372	222377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5867	NC_022234	TC	3	6	222378	222383	0 %	50 %	0 %	50 %	538344411
5868	NC_022234	CGG	2	6	222411	222416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344411
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5870	NC_022234	TCGG	2	8	222452	222459	0 %	25 %	50 %	25 %	538344411
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5897	NC_022234	CCTCGA	2	12	223453	223464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538344412
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5902	NC_022234	TGGG	2	8	223577	223584	0 %	25 %	75 %	0 %	538344412
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5953	NC_022234	TTG	2	6	225304	225309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5973	NC_022234	GCGCG	2	10	226059	226068	0 %	0 %	60 %	40 %	538344415
5974	NC_022234	TCG	2	6	226079	226084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344415
5975	NC_022234	TGCC	2	8	226086	226093	0 %	25 %	25 %	50 %	538344415
5976	NC_022234	GCCG	2	8	226131	226138	0 %	0 %	50 %	50 %	538344415
5977	NC_022234	GC	3	6	226191	226196	0 %	0 %	50 %	50 %	538344415
5978	NC_022234	GTG	2	6	226210	226215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344415
5979	NC_022234	CGG	2	6	226239	226244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344415
5980	NC_022234	GGCG	2	8	226254	226261	0 %	0 %	75 %	25 %	538344415
5981	NC_022234	GGA	2	6	226296	226301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344415
5982	NC_022234	TC	3	6	226358	226363	0 %	50 %	0 %	50 %	538344416
5983	NC_022234	CTA	2	6	226369	226374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344416
5984	NC_022234	CTT	7	21	226375	226395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344416
5985	NC_022234	CGT	2	6	226409	226414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344416
5986	NC_022234	GCT	2	6	226484	226489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344416
5987	NC_022234	GCT	2	6	226547	226552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344416
5988	NC_022234	CAA	2	6	226643	226648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344416
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5990	NC_022234	GCG	2	6	226780	226785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344416
5991	NC_022234	GGT	2	6	226787	226792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344416
5992	NC_022234	GC	3	6	226817	226822	0 %	0 %	50 %	50 %	538344416
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