MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022234	CGG	2	6	187324	187329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344385
5002	NC_022234	GC	3	6	187331	187336	0 %	0 %	50 %	50 %	538344385
5003	NC_022234	GCG	2	6	187399	187404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344385
5004	NC_022234	CGC	2	6	187412	187417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344385
5005	NC_022234	CGT	2	6	187447	187452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344385
5006	NC_022234	TGCGA	2	10	187470	187479	20 %	20 %	40 %	20 %	538344385
5007	NC_022234	AGT	2	6	187534	187539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344385
5008	NC_022234	GCGCT	2	10	187552	187561	0 %	20 %	40 %	40 %	538344385
5009	NC_022234	GCC	2	6	187607	187612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344385
5010	NC_022234	TGCG	2	8	187627	187634	0 %	25 %	50 %	25 %	538344385
5011	NC_022234	TTC	2	6	187659	187664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344385
5012	NC_022234	GCA	2	6	187678	187683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344385
5013	NC_022234	GCC	2	6	187721	187726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344385
5014	NC_022234	GCA	2	6	187744	187749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344385
5015	NC_022234	GCCG	2	8	187841	187848	0 %	0 %	50 %	50 %	538344385
5016	NC_022234	AGGC	2	8	187852	187859	25 %	0 %	50 %	25 %	538344385
5017	NC_022234	CTT	2	6	187989	187994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344386
5018	NC_022234	CGC	2	6	188031	188036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344386
5019	NC_022234	CAG	2	6	188056	188061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344386
5020	NC_022234	CGAG	2	8	188062	188069	25 %	0 %	50 %	25 %	538344386
5021	NC_022234	GCT	2	6	188091	188096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344386
5022	NC_022234	GC	3	6	188188	188193	0 %	0 %	50 %	50 %	538344386
5023	NC_022234	GGTCTC	2	12	188218	188229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344386
5024	NC_022234	TGA	2	6	188235	188240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344386
5025	NC_022234	CCA	2	6	188244	188249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344386
5026	NC_022234	GCC	2	6	188287	188292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344386
5027	NC_022234	GCG	2	6	188337	188342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344386
5028	NC_022234	CGT	2	6	188376	188381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344386
5029	NC_022234	GGT	2	6	188388	188393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344386
5030	NC_022234	GCG	2	6	188421	188426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344386
5031	NC_022234	TGG	2	6	188451	188456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344386
5032	NC_022234	TGG	4	12	188478	188489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344386
5033	NC_022234	TCG	2	6	188495	188500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344386
5034	NC_022234	ATC	2	6	188567	188572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344386
5035	NC_022234	CGC	2	6	188604	188609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344386
5036	NC_022234	CCAGAC	2	12	188686	188697	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538344386
5037	NC_022234	ACC	2	6	188831	188836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344386
5038	NC_022234	TTGCC	2	10	188889	188898	0 %	40 %	20 %	40 %	538344386
5039	NC_022234	GTC	2	6	188956	188961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344386
5040	NC_022234	GAG	2	6	189038	189043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_022234	GC	3	6	189055	189060	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5042	NC_022234	CGGC	3	12	189069	189080	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5043	NC_022234	CGC	2	6	189122	189127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344387
5044	NC_022234	CGG	2	6	189131	189136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344387
5045	NC_022234	GCGTAG	2	12	189141	189152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344387
5046	NC_022234	GCG	2	6	189160	189165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344387
5047	NC_022234	AGC	2	6	189183	189188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5048	NC_022234	GCG	2	6	189202	189207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344387
5049	NC_022234	GCCGAT	2	12	189227	189238	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5050	NC_022234	CCCAT	2	10	189241	189250	20 %	20 %	0 %	60 %	538344387
5051	NC_022234	CGG	2	6	189265	189270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344387
5052	NC_022234	CCG	2	6	189327	189332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344387
5053	NC_022234	CG	3	6	189447	189452	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5054	NC_022234	AGC	2	6	189456	189461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5055	NC_022234	CGA	2	6	189478	189483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5056	NC_022234	GCC	2	6	189485	189490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344387
5057	NC_022234	CAG	2	6	189497	189502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5058	NC_022234	CGC	2	6	189505	189510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344387
5059	NC_022234	CG	3	6	189523	189528	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5060	NC_022234	CAG	2	6	189548	189553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5061	NC_022234	CAG	2	6	189593	189598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5062	NC_022234	GAA	2	6	189599	189604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344387
5063	NC_022234	CAG	3	9	189614	189622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5064	NC_022234	GC	3	6	189629	189634	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5065	NC_022234	GGC	2	6	189665	189670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344387
5066	NC_022234	GC	4	8	189674	189681	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5067	NC_022234	CGGC	2	8	189682	189689	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5068	NC_022234	GCG	2	6	189694	189699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344387
5069	NC_022234	GCA	2	6	189733	189738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5070	NC_022234	GC	3	6	189757	189762	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5071	NC_022234	ATC	2	6	189825	189830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344387
5072	NC_022234	GCCA	2	8	189868	189875	25 %	0 %	25 %	50 %	538344387
5073	NC_022234	CAG	2	6	189884	189889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5074	NC_022234	CGG	2	6	189892	189897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344387
5075	NC_022234	TGC	2	6	189901	189906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344387
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5077	NC_022234	TGC	2	6	189958	189963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344387
5078	NC_022234	TGA	2	6	189991	189996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344387
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5080	NC_022234	GC	4	8	190039	190046	0 %	0 %	50 %	50 %	538344387
5081	NC_022234	GCC	2	6	190050	190055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344387
5082	NC_022234	TGC	2	6	190063	190068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344387
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5085	NC_022234	GGC	2	6	190405	190410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_022234	TTG	2	6	190512	190517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_022234	GCG	2	6	190521	190526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_022234	CCG	2	6	190628	190633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344388
5089	NC_022234	GCG	2	6	190640	190645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344388
5090	NC_022234	CGG	2	6	190749	190754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344388
5091	NC_022234	GCA	3	9	190839	190847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344388
5092	NC_022234	TTC	2	6	190855	190860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344388
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5094	NC_022234	GCC	2	6	190890	190895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344388
5095	NC_022234	TCG	2	6	190940	190945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344388
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5098	NC_022234	CG	3	6	191032	191037	0 %	0 %	50 %	50 %	538344388
5099	NC_022234	CTGC	2	8	191068	191075	0 %	25 %	25 %	50 %	538344388
5100	NC_022234	TGCC	2	8	191152	191159	0 %	25 %	25 %	50 %	538344388
5101	NC_022234	GCC	2	6	191205	191210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344388
5102	NC_022234	CGA	2	6	191223	191228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344388
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5104	NC_022234	CCA	2	6	191275	191280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344388
5105	NC_022234	TGA	2	6	191385	191390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344388
5106	NC_022234	ACG	2	6	191459	191464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344388
5107	NC_022234	CGG	2	6	191480	191485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344388
5108	NC_022234	TCA	2	6	191487	191492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344388
5109	NC_022234	GAA	2	6	191563	191568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344388
5110	NC_022234	TGAT	2	8	191618	191625	25 %	50 %	25 %	0 %	538344388
5111	NC_022234	CAG	2	6	191644	191649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344388
5112	NC_022234	GGT	2	6	191656	191661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344388
5113	NC_022234	CG	3	6	191694	191699	0 %	0 %	50 %	50 %	538344388
5114	NC_022234	TGCG	2	8	191705	191712	0 %	25 %	50 %	25 %	538344388
5115	NC_022234	GTT	2	6	191740	191745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344388
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5119	NC_022234	CTG	2	6	191956	191961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344388
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5121	NC_022234	CGC	2	6	191986	191991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344388
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5229	NC_022234	ACAG	2	8	196096	196103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5230	NC_022234	ATG	2	6	196166	196171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344391
5231	NC_022234	CGG	2	6	196197	196202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344391
5232	NC_022234	GGC	2	6	196249	196254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344391
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5238	NC_022234	GCG	2	6	196416	196421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344391
5239	NC_022234	GCCAC	2	10	196425	196434	20 %	0 %	20 %	60 %	538344391
5240	NC_022234	TCG	2	6	196491	196496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344391
5241	NC_022234	CGCGC	2	10	196522	196531	0 %	0 %	40 %	60 %	538344391
5242	NC_022234	CCT	2	6	196544	196549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344391
5243	NC_022234	GC	4	8	196574	196581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5244	NC_022234	GCA	2	6	196603	196608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_022234	GCAT	2	8	196617	196624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5246	NC_022234	CATT	2	8	196694	196701	25 %	50 %	0 %	25 %	538344392
5247	NC_022234	TGGC	2	8	196712	196719	0 %	25 %	50 %	25 %	538344392
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5252	NC_022234	GGA	2	6	196930	196935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344392
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5255	NC_022234	CGATGC	2	12	196986	196997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344392
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5350	NC_022234	GGC	2	6	200849	200854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5351	NC_022234	GCA	2	6	200869	200874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5352	NC_022234	GAA	2	6	200878	200883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_022234	TG	3	6	200932	200937	0 %	50 %	50 %	0 %	538344397
5354	NC_022234	TGG	2	6	200973	200978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344397
5355	NC_022234	GCTT	2	8	201024	201031	0 %	50 %	25 %	25 %	538344397
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5357	NC_022234	TCG	2	6	201062	201067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344397
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5359	NC_022234	TGA	2	6	201162	201167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344397
5360	NC_022234	AGGGT	2	10	201222	201231	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_022234	GA	3	6	201343	201348	50 %	0 %	50 %	0 %	538344398
5362	NC_022234	AG	3	6	201353	201358	50 %	0 %	50 %	0 %	538344398
5363	NC_022234	TGG	2	6	201423	201428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344398
5364	NC_022234	TTC	2	6	201431	201436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344398
5365	NC_022234	GTTC	2	8	201456	201463	0 %	50 %	25 %	25 %	538344398
5366	NC_022234	CCGA	2	8	201469	201476	25 %	0 %	25 %	50 %	538344398
5367	NC_022234	GCC	2	6	201583	201588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344398
5368	NC_022234	AGT	2	6	201616	201621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344398
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5370	NC_022234	GAT	2	6	201724	201729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344398
5371	NC_022234	TGA	2	6	201822	201827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344398
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5385	NC_022234	CTG	2	6	202705	202710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344398
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5387	NC_022234	CCG	2	6	202878	202883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5388	NC_022234	CAA	2	6	202904	202909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_022234	AGC	2	6	202913	202918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5390	NC_022234	ATG	2	6	202919	202924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_022234	TGA	2	6	203105	203110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344399
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5397	NC_022234	GTT	3	9	203377	203385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_022234	CGT	2	6	203398	203403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5399	NC_022234	GTC	2	6	203582	203587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344400
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5425	NC_022234	CGAAGG	2	12	204823	204834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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5427	NC_022234	CAT	2	6	204953	204958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344401
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5431	NC_022234	TCG	2	6	205282	205287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344401
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5433	NC_022234	TGC	2	6	205419	205424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5434	NC_022234	TTC	2	6	205438	205443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5435	NC_022234	AGA	2	6	205460	205465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5436	NC_022234	TCA	2	6	205499	205504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5437	NC_022234	AC	3	6	205606	205611	50 %	0 %	0 %	50 %	538344402
5438	NC_022234	CTG	2	6	205627	205632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344402
5439	NC_022234	TCAT	2	8	205633	205640	25 %	50 %	0 %	25 %	538344402
5440	NC_022234	GTCG	2	8	205805	205812	0 %	25 %	50 %	25 %	538344402
5441	NC_022234	AAG	2	6	205842	205847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344402
5442	NC_022234	TCG	2	6	205870	205875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344402
5443	NC_022234	TTCAT	2	10	205876	205885	20 %	60 %	0 %	20 %	538344402
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5445	NC_022234	AGTGG	2	10	205895	205904	20 %	20 %	60 %	0 %	538344403
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5453	NC_022234	GATC	2	8	206319	206326	25 %	25 %	25 %	25 %	538344403
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5470	NC_022234	CCGG	2	8	207133	207140	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5471	NC_022234	TGC	2	6	207144	207149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
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5473	NC_022234	CGGC	2	8	207191	207198	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5474	NC_022234	TGTCGG	2	12	207213	207224	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538344403
5475	NC_022234	CCG	2	6	207243	207248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
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5479	NC_022234	GGCC	2	8	207363	207370	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5480	NC_022234	GCG	2	6	207388	207393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
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5484	NC_022234	GTC	2	6	207523	207528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5485	NC_022234	TCG	2	6	207650	207655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5486	NC_022234	TGC	2	6	207662	207667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5487	NC_022234	CCG	2	6	207672	207677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344403
5488	NC_022234	CG	3	6	207724	207729	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5489	NC_022234	TGG	2	6	207762	207767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344403
5490	NC_022234	GGC	2	6	207777	207782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5491	NC_022234	TCG	2	6	207812	207817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5492	NC_022234	GCTC	2	8	207828	207835	0 %	25 %	25 %	50 %	538344403
5493	NC_022234	GGC	2	6	207837	207842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5494	NC_022234	CGA	2	6	207882	207887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5495	NC_022234	GGT	2	6	207904	207909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344403
5496	NC_022234	AGC	2	6	207959	207964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5497	NC_022234	GGC	2	6	208026	208031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403
5498	NC_022234	CAG	2	6	208033	208038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344403
5499	NC_022234	GGCC	2	8	208062	208069	0 %	0 %	50 %	50 %	538344403
5500	NC_022234	GCG	2	6	208120	208125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344403

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