MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021848	ATT	2	6	186310	186315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957631
3502	NC_021848	GGT	2	6	186316	186321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957631
3503	NC_021848	TGC	2	6	186411	186416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957631
3504	NC_021848	CGA	2	6	186447	186452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957631
3505	NC_021848	ATT	2	6	186480	186485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957631
3506	NC_021848	CAT	2	6	186546	186551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957631
3507	NC_021848	TG	3	6	186590	186595	0 %	50 %	50 %	0 %	525957631
3508	NC_021848	ACG	2	6	186649	186654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957631
3509	NC_021848	AAG	2	6	186683	186688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957631
3510	NC_021848	AAT	2	6	186733	186738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021848	CAT	2	6	186772	186777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957632
3512	NC_021848	TCG	2	6	186948	186953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957632
3513	NC_021848	ACA	2	6	187134	187139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957632
3514	NC_021848	A	6	6	187139	187144	100 %	0 %	0 %	0 %	525957632
3515	NC_021848	ACT	2	6	187257	187262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957632
3516	NC_021848	CGA	2	6	187300	187305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957632
3517	NC_021848	TCG	2	6	187309	187314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957632
3518	NC_021848	GCA	2	6	187356	187361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957632
3519	NC_021848	CG	3	6	187375	187380	0 %	0 %	50 %	50 %	525957632
3520	NC_021848	GT	3	6	187425	187430	0 %	50 %	50 %	0 %	525957632
3521	NC_021848	TTG	2	6	187475	187480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957632
3522	NC_021848	TGA	2	6	187615	187620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957632
3523	NC_021848	TCG	2	6	187669	187674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957632
3524	NC_021848	GAC	2	6	187870	187875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957633
3525	NC_021848	TTG	2	6	187940	187945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957633
3526	NC_021848	TGA	2	6	188081	188086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957633
3527	NC_021848	TAT	2	6	188108	188113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957633
3528	NC_021848	GCT	2	6	188170	188175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957633
3529	NC_021848	TGGT	2	8	188222	188229	0 %	50 %	50 %	0 %	525957633
3530	NC_021848	GCT	2	6	188248	188253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957633
3531	NC_021848	GTTG	2	8	188268	188275	0 %	50 %	50 %	0 %	525957633
3532	NC_021848	CAAC	2	8	188300	188307	50 %	0 %	0 %	50 %	525957633
3533	NC_021848	TGAATG	2	12	188315	188326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957633
3534	NC_021848	TCA	2	6	188385	188390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957633
3535	NC_021848	TGCG	2	8	188558	188565	0 %	25 %	50 %	25 %	525957633
3536	NC_021848	GTTG	2	8	188573	188580	0 %	50 %	50 %	0 %	525957633
3537	NC_021848	ATGCA	2	10	188668	188677	40 %	20 %	20 %	20 %	525957634
3538	NC_021848	GA	4	8	188687	188694	50 %	0 %	50 %	0 %	525957634
3539	NC_021848	GAT	2	6	188711	188716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957634
3540	NC_021848	TCG	2	6	188782	188787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957634
3541	NC_021848	GCT	2	6	188801	188806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957634
3542	NC_021848	CGT	2	6	188937	188942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957634
3543	NC_021848	CGA	2	6	188971	188976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957634
3544	NC_021848	CAT	2	6	189026	189031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957634
3545	NC_021848	GCT	2	6	189039	189044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957634
3546	NC_021848	TC	3	6	189068	189073	0 %	50 %	0 %	50 %	525957634
3547	NC_021848	AGC	2	6	189121	189126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957634
3548	NC_021848	ACT	2	6	189128	189133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957634
3549	NC_021848	GTTG	2	8	189290	189297	0 %	50 %	50 %	0 %	525957635
3550	NC_021848	CTCA	2	8	189303	189310	25 %	25 %	0 %	50 %	525957635
3551	NC_021848	ATT	2	6	189339	189344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957635
3552	NC_021848	TAC	2	6	189377	189382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957635
3553	NC_021848	AAAG	2	8	189388	189395	75 %	0 %	25 %	0 %	525957635
3554	NC_021848	AC	3	6	189399	189404	50 %	0 %	0 %	50 %	525957635
3555	NC_021848	CT	3	6	189464	189469	0 %	50 %	0 %	50 %	525957635
3556	NC_021848	GTA	2	6	189560	189565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957635
3557	NC_021848	GTG	2	6	189593	189598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957635
3558	NC_021848	ACG	3	9	189605	189613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957635
3559	NC_021848	ACA	2	6	189656	189661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957635
3560	NC_021848	GCC	2	6	189688	189693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957635
3561	NC_021848	AAAG	2	8	189694	189701	75 %	0 %	25 %	0 %	525957635
3562	NC_021848	CAAAG	2	10	189712	189721	60 %	0 %	20 %	20 %	525957635
3563	NC_021848	AACC	2	8	189743	189750	50 %	0 %	0 %	50 %	525957635
3564	NC_021848	GCC	2	6	189763	189768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957635
3565	NC_021848	AAC	2	6	189769	189774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957635
3566	NC_021848	CGG	2	6	189843	189848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957635
3567	NC_021848	ATT	2	6	189987	189992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957635
3568	NC_021848	CTG	2	6	190019	190024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957635
3569	NC_021848	AAC	2	6	190170	190175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_021848	GAC	2	6	190299	190304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021848	ATC	3	9	190326	190334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021848	TAC	2	6	190335	190340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_021848	TACT	2	8	190436	190443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_021848	GAA	3	9	190447	190455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021848	GTG	2	6	190481	190486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021848	TAG	2	6	190528	190533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021848	TCG	2	6	190544	190549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_021848	GAA	2	6	190587	190592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021848	TGG	2	6	190668	190673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021848	TGA	2	6	190699	190704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021848	AGA	2	6	190811	190816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021848	TGC	2	6	190820	190825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_021848	AGA	2	6	190844	190849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021848	TGC	2	6	190861	190866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_021848	TGG	2	6	190904	190909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021848	ATT	2	6	190935	190940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021848	GAT	2	6	190980	190985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021848	AGA	2	6	191015	191020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021848	CAAAA	2	10	191029	191038	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3590	NC_021848	GAA	2	6	191091	191096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021848	GA	3	6	191104	191109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021848	TTC	2	6	191318	191323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957636
3593	NC_021848	GTC	2	6	191362	191367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957636
3594	NC_021848	AGCTG	2	10	191418	191427	20 %	20 %	40 %	20 %	525957636
3595	NC_021848	TGA	2	6	191514	191519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957636
3596	NC_021848	GCG	2	6	191573	191578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957636
3597	NC_021848	CTT	2	6	191580	191585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957636
3598	NC_021848	C	6	6	192017	192022	0 %	0 %	0 %	100 %	525957636
3599	NC_021848	TGA	3	9	192036	192044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957636
3600	NC_021848	CTA	2	6	192108	192113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957636
3601	NC_021848	AAT	2	6	192171	192176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957636
3602	NC_021848	T	6	6	192295	192300	0 %	100 %	0 %	0 %	525957636
3603	NC_021848	TTTTGA	2	12	192316	192327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525957636
3604	NC_021848	AAT	2	6	192364	192369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957636
3605	NC_021848	TGAA	2	8	192446	192453	50 %	25 %	25 %	0 %	525957636
3606	NC_021848	TTC	2	6	192577	192582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957636
3607	NC_021848	CAC	2	6	192603	192608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957636
3608	NC_021848	CGG	2	6	192625	192630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957636
3609	NC_021848	AAG	2	6	192652	192657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957636
3610	NC_021848	GCA	2	6	192680	192685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957636
3611	NC_021848	AGTG	2	8	192727	192734	25 %	25 %	50 %	0 %	525957636
3612	NC_021848	TGC	2	6	192752	192757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957636
3613	NC_021848	ATGGC	2	10	192758	192767	20 %	20 %	40 %	20 %	525957636
3614	NC_021848	GTT	2	6	192910	192915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957636
3615	NC_021848	GCG	2	6	193001	193006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957636
3616	NC_021848	GCC	2	6	193021	193026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957636
3617	NC_021848	AGC	2	6	193063	193068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957636
3618	NC_021848	TG	3	6	193136	193141	0 %	50 %	50 %	0 %	525957636
3619	NC_021848	GCG	2	6	193169	193174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957636
3620	NC_021848	AG	3	6	193184	193189	50 %	0 %	50 %	0 %	525957636
3621	NC_021848	CTG	2	6	193231	193236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957636
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3864	NC_021848	T	6	6	206115	206120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3865	NC_021848	GAGT	2	8	206135	206142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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