MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021848	TTG	2	6	159774	159779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021848	TGA	2	6	159895	159900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021848	GGTGG	2	10	159956	159965	0 %	20 %	80 %	0 %	525959923
3004	NC_021848	TCG	2	6	159981	159986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959923
3005	NC_021848	CTG	2	6	160020	160025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959923
3006	NC_021848	TTC	2	6	160040	160045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959923
3007	NC_021848	TAA	2	6	160088	160093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959923
3008	NC_021848	GCG	2	6	160160	160165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959923
3009	NC_021848	T	6	6	160188	160193	0 %	100 %	0 %	0 %	525959923
3010	NC_021848	ATTG	2	8	160234	160241	25 %	50 %	25 %	0 %	525959923
3011	NC_021848	GCA	2	6	160252	160257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959923
3012	NC_021848	GTT	2	6	160294	160299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959923
3013	NC_021848	TTG	2	6	160315	160320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959923
3014	NC_021848	ATT	2	6	160400	160405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959923
3015	NC_021848	CAT	2	6	160406	160411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959923
3016	NC_021848	GTC	2	6	160479	160484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957612
3017	NC_021848	ATT	2	6	160491	160496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957612
3018	NC_021848	CAT	2	6	160604	160609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957612
3019	NC_021848	GC	3	6	160651	160656	0 %	0 %	50 %	50 %	525957612
3020	NC_021848	TTGT	2	8	160657	160664	0 %	75 %	25 %	0 %	525957612
3021	NC_021848	TGT	2	6	160836	160841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957612
3022	NC_021848	CTT	2	6	160880	160885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957612
3023	NC_021848	CAA	2	6	160892	160897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957612
3024	NC_021848	GCC	2	6	160932	160937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957612
3025	NC_021848	TGA	2	6	160940	160945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957612
3026	NC_021848	TTC	2	6	161031	161036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957612
3027	NC_021848	T	7	7	161064	161070	0 %	100 %	0 %	0 %	525957612
3028	NC_021848	TTTC	2	8	161072	161079	0 %	75 %	0 %	25 %	525957612
3029	NC_021848	ATG	2	6	161130	161135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957612
3030	NC_021848	T	6	6	161250	161255	0 %	100 %	0 %	0 %	525957612
3031	NC_021848	GAT	2	6	161285	161290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957612
3032	NC_021848	CAA	2	6	161539	161544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_021848	AAT	2	6	161595	161600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021848	GTG	2	6	161637	161642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021848	TAA	2	6	161743	161748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021848	AAT	2	6	161766	161771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021848	GAA	2	6	161786	161791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957613
3038	NC_021848	GTC	2	6	161814	161819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957613
3039	NC_021848	T	6	6	161855	161860	0 %	100 %	0 %	0 %	525957613
3040	NC_021848	GAAC	2	8	161881	161888	50 %	0 %	25 %	25 %	525957613
3041	NC_021848	TGA	2	6	161923	161928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957613
3042	NC_021848	GCA	2	6	161984	161989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957613
3043	NC_021848	TTG	2	6	162003	162008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957613
3044	NC_021848	TAT	2	6	162130	162135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021848	ATTT	2	8	162138	162145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021848	TTA	2	6	162147	162152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021848	GT	3	6	162212	162217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021848	A	6	6	162236	162241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021848	GAC	2	6	162278	162283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021848	TGA	2	6	162350	162355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021848	ATTA	2	8	162446	162453	50 %	50 %	0 %	0 %	525957614
3052	NC_021848	CT	3	6	162541	162546	0 %	50 %	0 %	50 %	525957614
3053	NC_021848	CAA	2	6	162606	162611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957614
3054	NC_021848	TTA	2	6	162613	162618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957614
3055	NC_021848	GTA	2	6	162636	162641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957614
3056	NC_021848	TTG	2	6	162654	162659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957614
3057	NC_021848	GCG	2	6	162672	162677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957614
3058	NC_021848	AAT	2	6	162762	162767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957614
3059	NC_021848	CTT	2	6	162770	162775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957614
3060	NC_021848	GCA	2	6	162862	162867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957614
3061	NC_021848	CA	3	6	162882	162887	50 %	0 %	0 %	50 %	525957614
3062	NC_021848	CCA	2	6	162992	162997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957614
3063	NC_021848	CGC	2	6	163001	163006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957614
3064	NC_021848	TGG	2	6	163088	163093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957614
3065	NC_021848	ACA	2	6	163192	163197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957614
3066	NC_021848	G	6	6	163202	163207	0 %	0 %	100 %	0 %	525957614
3067	NC_021848	TCA	2	6	163222	163227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957614
3068	NC_021848	CGA	2	6	163258	163263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957614
3069	NC_021848	CAC	2	6	163277	163282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957614
3070	NC_021848	AAG	2	6	163300	163305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957614
3071	NC_021848	GGT	2	6	163319	163324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957614
3072	NC_021848	CAGC	2	8	163372	163379	25 %	0 %	25 %	50 %	525957614
3073	NC_021848	GC	3	6	163480	163485	0 %	0 %	50 %	50 %	525957614
3074	NC_021848	CAC	2	6	163547	163552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957614
3075	NC_021848	GCG	2	6	163669	163674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957614
3076	NC_021848	CGG	3	9	163684	163692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957614
3077	NC_021848	GGT	2	6	163715	163720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957614
3078	NC_021848	ATC	2	6	163740	163745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957614
3079	NC_021848	CCG	2	6	163768	163773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957614
3080	NC_021848	CA	3	6	163788	163793	50 %	0 %	0 %	50 %	525957614
3081	NC_021848	GTA	2	6	163926	163931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957614
3082	NC_021848	TAT	2	6	164114	164119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957614
3083	NC_021848	CTT	2	6	164218	164223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_021848	AC	3	6	164254	164259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_021848	GTT	2	6	164261	164266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021848	ATC	2	6	164385	164390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_021848	A	6	6	164482	164487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021848	A	6	6	164495	164500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021848	GTG	2	6	164561	164566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021848	TAC	2	6	164571	164576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_021848	AGC	2	6	164650	164655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957615
3092	NC_021848	ATTG	2	8	164669	164676	25 %	50 %	25 %	0 %	525957615
3093	NC_021848	AAGC	2	8	164697	164704	50 %	0 %	25 %	25 %	525957615
3094	NC_021848	CTG	2	6	164712	164717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957615
3095	NC_021848	GT	3	6	164739	164744	0 %	50 %	50 %	0 %	525957615
3096	NC_021848	AAG	2	6	164797	164802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957615
3097	NC_021848	GAA	2	6	164946	164951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957615
3098	NC_021848	GAA	2	6	165114	165119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957615
3099	NC_021848	GAAAA	2	10	165189	165198	80 %	0 %	20 %	0 %	525957615
3100	NC_021848	TAA	2	6	165228	165233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021848	AAC	2	6	165261	165266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957616
3102	NC_021848	ATGG	2	8	165278	165285	25 %	25 %	50 %	0 %	525957616
3103	NC_021848	AG	3	6	165331	165336	50 %	0 %	50 %	0 %	525957616
3104	NC_021848	GTGAT	2	10	165369	165378	20 %	40 %	40 %	0 %	525957616
3105	NC_021848	GCGAG	2	10	165379	165388	20 %	0 %	60 %	20 %	525957616
3106	NC_021848	AGCGT	2	10	165422	165431	20 %	20 %	40 %	20 %	525957616
3107	NC_021848	AGA	2	6	165439	165444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957616
3108	NC_021848	CGAT	2	8	165462	165469	25 %	25 %	25 %	25 %	525957616
3109	NC_021848	TGC	2	6	165586	165591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957616
3110	NC_021848	TG	3	6	165593	165598	0 %	50 %	50 %	0 %	525957616
3111	NC_021848	GCA	2	6	165622	165627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957616
3112	NC_021848	GGT	2	6	165632	165637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957616
3113	NC_021848	CCGTT	2	10	165684	165693	0 %	40 %	20 %	40 %	525957616
3114	NC_021848	GCAG	2	8	165695	165702	25 %	0 %	50 %	25 %	525957616
3115	NC_021848	ATGCT	2	10	165786	165795	20 %	40 %	20 %	20 %	525957616
3116	NC_021848	TGAA	2	8	165868	165875	50 %	25 %	25 %	0 %	525957616
3117	NC_021848	A	6	6	165874	165879	100 %	0 %	0 %	0 %	525957616
3118	NC_021848	ATG	2	6	165910	165915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959924
3119	NC_021848	CGG	2	6	165944	165949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959924
3120	NC_021848	GCGAG	2	10	165971	165980	20 %	0 %	60 %	20 %	525959924
3121	NC_021848	AC	3	6	166057	166062	50 %	0 %	0 %	50 %	525959924
3122	NC_021848	TTTA	2	8	166088	166095	25 %	75 %	0 %	0 %	525959924
3123	NC_021848	TCG	2	6	166119	166124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959924
3124	NC_021848	CGA	2	6	166224	166229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959924
3125	NC_021848	TGA	2	6	166457	166462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959924
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3127	NC_021848	CAAA	2	8	166661	166668	75 %	0 %	0 %	25 %	525959924
3128	NC_021848	CATT	2	8	166675	166682	25 %	50 %	0 %	25 %	525959924
3129	NC_021848	GCGCA	2	10	166780	166789	20 %	0 %	40 %	40 %	525959924
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3142	NC_021848	ATG	2	6	167379	167384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3220	NC_021848	CA	3	6	171989	171994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3241	NC_021848	TGA	2	6	173439	173444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957622
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3244	NC_021848	TC	3	6	173567	173572	0 %	50 %	0 %	50 %	525957623
3245	NC_021848	AGC	2	6	173605	173610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957623
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3369	NC_021848	GAT	2	6	179555	179560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959926
3370	NC_021848	TGT	2	6	179590	179595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959926
3371	NC_021848	TGG	2	6	179680	179685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959926
3372	NC_021848	ATC	2	6	179735	179740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959926
3373	NC_021848	TCGTGC	2	12	179806	179817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959926
3374	NC_021848	ATCA	2	8	180005	180012	50 %	25 %	0 %	25 %	525959926
3375	NC_021848	ATC	2	6	180014	180019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959926
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3379	NC_021848	A	6	6	180128	180133	100 %	0 %	0 %	0 %	525959926
3380	NC_021848	GTA	3	9	180140	180148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959926
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3385	NC_021848	CAC	2	6	180400	180405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959926
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3387	NC_021848	CAT	2	6	180475	180480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959926
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3390	NC_021848	TCA	2	6	180646	180651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3392	NC_021848	GCT	2	6	180720	180725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3393	NC_021848	GCT	2	6	180759	180764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3394	NC_021848	TAGA	2	8	180777	180784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3395	NC_021848	AAAC	2	8	180882	180889	75 %	0 %	0 %	25 %	525957626
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3403	NC_021848	TTGAGT	2	12	181114	181125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525957626
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3414	NC_021848	CTTTG	2	10	181661	181670	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3416	NC_021848	A	6	6	181695	181700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3417	NC_021848	A	6	6	181702	181707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3432	NC_021848	GAA	2	6	182657	182662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957627
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3436	NC_021848	TGA	2	6	183073	183078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957627
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3470	NC_021848	AAG	2	6	184812	184817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957628
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3472	NC_021848	TGC	2	6	184955	184960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3473	NC_021848	CAAC	2	8	184977	184984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3474	NC_021848	TTAG	2	8	185006	185013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3475	NC_021848	TCTTTC	2	12	185050	185061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3476	NC_021848	T	6	6	185118	185123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3477	NC_021848	TA	3	6	185197	185202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3478	NC_021848	TTCC	2	8	185218	185225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3479	NC_021848	AGC	2	6	185239	185244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3486	NC_021848	GA	3	6	185489	185494	50 %	0 %	50 %	0 %	525957629
3487	NC_021848	TGCT	2	8	185664	185671	0 %	50 %	25 %	25 %	525957630
3488	NC_021848	TAC	2	6	185720	185725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957630
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