MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021848	TTGA	2	8	134430	134437	25 %	50 %	25 %	0 %	525957589
2502	NC_021848	CTT	2	6	134482	134487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957589
2503	NC_021848	CAC	2	6	134490	134495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957589
2504	NC_021848	TAC	2	6	134528	134533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957589
2505	NC_021848	TCT	2	6	134569	134574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957589
2506	NC_021848	GTG	2	6	134641	134646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957589
2507	NC_021848	CTG	2	6	134812	134817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957589
2508	NC_021848	ATA	2	6	134842	134847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957589
2509	NC_021848	CTT	2	6	134851	134856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957589
2510	NC_021848	CTT	2	6	134860	134865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957589
2511	NC_021848	TGA	2	6	134928	134933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957589
2512	NC_021848	GAT	2	6	134944	134949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957589
2513	NC_021848	A	6	6	135022	135027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_021848	CAAA	2	8	135065	135072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_021848	TGC	2	6	135223	135228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957590
2516	NC_021848	CCAT	2	8	135361	135368	25 %	25 %	0 %	50 %	525957590
2517	NC_021848	TGAAGT	2	12	135383	135394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957590
2518	NC_021848	TCACC	2	10	135410	135419	20 %	20 %	0 %	60 %	525957590
2519	NC_021848	TGG	2	6	135520	135525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957590
2520	NC_021848	T	6	6	135627	135632	0 %	100 %	0 %	0 %	525957590
2521	NC_021848	GGT	2	6	135674	135679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957590
2522	NC_021848	GGC	2	6	135708	135713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957590
2523	NC_021848	AGG	2	6	135726	135731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957590
2524	NC_021848	AGAA	2	8	135750	135757	75 %	0 %	25 %	0 %	525957590
2525	NC_021848	TAA	3	9	135860	135868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_021848	AAAC	2	8	135869	135876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_021848	CGC	2	6	135884	135889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_021848	TGG	2	6	135942	135947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957591
2529	NC_021848	GT	3	6	136076	136081	0 %	50 %	50 %	0 %	525957591
2530	NC_021848	CTT	2	6	136198	136203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957591
2531	NC_021848	TAAA	2	8	136228	136235	75 %	25 %	0 %	0 %	525957591
2532	NC_021848	GCT	2	6	136281	136286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957591
2533	NC_021848	CTG	2	6	136340	136345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957591
2534	NC_021848	CTTG	2	8	136372	136379	0 %	50 %	25 %	25 %	525957591
2535	NC_021848	TCCA	2	8	136401	136408	25 %	25 %	0 %	50 %	525957591
2536	NC_021848	GT	3	6	136479	136484	0 %	50 %	50 %	0 %	525957592
2537	NC_021848	T	6	6	136484	136489	0 %	100 %	0 %	0 %	525957592
2538	NC_021848	ACA	2	6	136546	136551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957592
2539	NC_021848	GTAG	2	8	136562	136569	25 %	25 %	50 %	0 %	525957592
2540	NC_021848	CAAT	2	8	136576	136583	50 %	25 %	0 %	25 %	525957592
2541	NC_021848	TCA	2	6	136666	136671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957592
2542	NC_021848	CAT	2	6	136688	136693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957592
2543	NC_021848	CCAA	2	8	136746	136753	50 %	0 %	0 %	50 %	525957592
2544	NC_021848	TCAG	2	8	136782	136789	25 %	25 %	25 %	25 %	525957592
2545	NC_021848	AGC	2	6	136824	136829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957592
2546	NC_021848	GCA	2	6	136830	136835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957592
2547	NC_021848	ATGGA	2	10	136917	136926	40 %	20 %	40 %	0 %	525957592
2548	NC_021848	GC	3	6	136931	136936	0 %	0 %	50 %	50 %	525957592
2549	NC_021848	TC	4	8	136950	136957	0 %	50 %	0 %	50 %	525957592
2550	NC_021848	CAT	2	6	136966	136971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957592
2551	NC_021848	CAC	2	6	137027	137032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957592
2552	NC_021848	GT	3	6	137036	137041	0 %	50 %	50 %	0 %	525957592
2553	NC_021848	GCT	2	6	137076	137081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957592
2554	NC_021848	TGA	2	6	137110	137115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957592
2555	NC_021848	TACG	2	8	137122	137129	25 %	25 %	25 %	25 %	525957592
2556	NC_021848	CTC	2	6	137272	137277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2557	NC_021848	GTC	2	6	137313	137318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_021848	CCA	2	6	137416	137421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_021848	TTA	2	6	137436	137441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_021848	AAT	2	6	137513	137518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_021848	GAGG	2	8	137543	137550	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021848	TTG	2	6	137591	137596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021848	TGC	2	6	137698	137703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957593
2564	NC_021848	TCT	2	6	137706	137711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957593
2565	NC_021848	GAA	2	6	137767	137772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957593
2566	NC_021848	ATG	3	9	137789	137797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957593
2567	NC_021848	TGC	2	6	137932	137937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957593
2568	NC_021848	CCG	2	6	138008	138013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957593
2569	NC_021848	GAT	2	6	138025	138030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957593
2570	NC_021848	AACGA	2	10	138073	138082	60 %	0 %	20 %	20 %	525957593
2571	NC_021848	GGTTG	2	10	138085	138094	0 %	40 %	60 %	0 %	525957593
2572	NC_021848	GAA	2	6	138097	138102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957593
2573	NC_021848	GAA	2	6	138132	138137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957593
2574	NC_021848	AAC	2	6	138214	138219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957593
2575	NC_021848	TGCT	2	8	138319	138326	0 %	50 %	25 %	25 %	525957593
2576	NC_021848	CAA	2	6	138330	138335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957593
2577	NC_021848	ATG	2	6	138401	138406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957593
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2579	NC_021848	CCA	2	6	138609	138614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957593
2580	NC_021848	T	6	6	138898	138903	0 %	100 %	0 %	0 %	525959920
2581	NC_021848	ATT	2	6	138934	138939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959920
2582	NC_021848	GA	3	6	139033	139038	50 %	0 %	50 %	0 %	525959920
2583	NC_021848	T	6	6	139050	139055	0 %	100 %	0 %	0 %	525959920
2584	NC_021848	GTC	2	6	139087	139092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2585	NC_021848	ATGG	2	8	139130	139137	25 %	25 %	50 %	0 %	525957594
2586	NC_021848	CAA	2	6	139142	139147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957594
2587	NC_021848	CT	3	6	139300	139305	0 %	50 %	0 %	50 %	525957594
2588	NC_021848	CTAT	2	8	139328	139335	25 %	50 %	0 %	25 %	525957594
2589	NC_021848	GAT	2	6	139337	139342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957594
2590	NC_021848	ACA	2	6	139418	139423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957594
2591	NC_021848	CAA	2	6	139495	139500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957594
2592	NC_021848	CACTT	2	10	139523	139532	20 %	40 %	0 %	40 %	525957594
2593	NC_021848	TGA	2	6	139678	139683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957594
2594	NC_021848	CAG	2	6	139725	139730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2595	NC_021848	ATC	2	6	139817	139822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957594
2596	NC_021848	CAAA	2	8	139836	139843	75 %	0 %	0 %	25 %	525957594
2597	NC_021848	CAC	2	6	139869	139874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957594
2598	NC_021848	GAA	2	6	139883	139888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957594
2599	NC_021848	GCA	3	9	139892	139900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2600	NC_021848	CTG	2	6	139941	139946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2601	NC_021848	AGC	2	6	139972	139977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2602	NC_021848	GCG	2	6	139994	139999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957594
2603	NC_021848	AGC	2	6	140044	140049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2604	NC_021848	CGT	2	6	140060	140065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2605	NC_021848	CTG	2	6	140082	140087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2606	NC_021848	CTG	2	6	140217	140222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2607	NC_021848	CTAAC	2	10	140235	140244	40 %	20 %	0 %	40 %	525957594
2608	NC_021848	CGG	2	6	140356	140361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957594
2609	NC_021848	GCT	2	6	140426	140431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2610	NC_021848	TGA	2	6	140433	140438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957594
2611	NC_021848	ACCA	2	8	140502	140509	50 %	0 %	0 %	50 %	525957594
2612	NC_021848	CTG	2	6	140580	140585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2613	NC_021848	TCT	2	6	140634	140639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957594
2614	NC_021848	CAA	2	6	140657	140662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957594
2615	NC_021848	CAG	2	6	140799	140804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957594
2616	NC_021848	GTT	2	6	140822	140827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957594
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2618	NC_021848	CAT	2	6	140968	140973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957594
2619	NC_021848	ACA	2	6	140981	140986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957594
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2621	NC_021848	GTT	2	6	141013	141018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957594
2622	NC_021848	ACT	2	6	141067	141072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957594
2623	NC_021848	GTT	2	6	141088	141093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_021848	CAT	2	6	141129	141134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2992	NC_021848	GAC	2	6	159233	159238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957611
2993	NC_021848	ATT	2	6	159343	159348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_021848	TGC	2	6	159400	159405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2995	NC_021848	A	6	6	159455	159460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_021848	GGAA	2	8	159468	159475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_021848	GTG	2	6	159503	159508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_021848	GCTT	2	8	159609	159616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2999	NC_021848	A	6	6	159642	159647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_021848	A	8	8	159657	159664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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