MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021848	GAT	2	6	53491	53496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957523
1002	NC_021848	CGT	2	6	53498	53503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1003	NC_021848	CGA	2	6	53527	53532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1004	NC_021848	TTG	2	6	53667	53672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957523
1005	NC_021848	CTG	2	6	53825	53830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1006	NC_021848	TCG	2	6	53862	53867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1007	NC_021848	GAA	2	6	53870	53875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957523
1008	NC_021848	TGA	2	6	53935	53940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957523
1009	NC_021848	TGT	2	6	53964	53969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957523
1010	NC_021848	GC	3	6	54038	54043	0 %	0 %	50 %	50 %	525957523
1011	NC_021848	CAG	2	6	54167	54172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1012	NC_021848	GAT	2	6	54199	54204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957523
1013	NC_021848	GAA	2	6	54238	54243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957523
1014	NC_021848	GAA	2	6	54254	54259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957523
1015	NC_021848	TGG	2	6	54293	54298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957523
1016	NC_021848	AAG	3	9	54498	54506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957523
1017	NC_021848	CCAA	2	8	54567	54574	50 %	0 %	0 %	50 %	525957523
1018	NC_021848	CTTG	2	8	54607	54614	0 %	50 %	25 %	25 %	525957523
1019	NC_021848	AAC	2	6	54615	54620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957523
1020	NC_021848	ATC	2	6	54836	54841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957523
1021	NC_021848	GAA	2	6	54842	54847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957523
1022	NC_021848	CGG	2	6	54922	54927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957523
1023	NC_021848	GAC	2	6	55031	55036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1024	NC_021848	TGG	2	6	55053	55058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957523
1025	NC_021848	ATG	2	6	55076	55081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957523
1026	NC_021848	CGA	2	6	55116	55121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1027	NC_021848	TCA	2	6	55167	55172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957523
1028	NC_021848	GGT	2	6	55196	55201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957523
1029	NC_021848	TCT	2	6	55207	55212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957523
1030	NC_021848	TGA	2	6	55368	55373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957523
1031	NC_021848	GCA	2	6	55458	55463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1032	NC_021848	TTGA	2	8	55499	55506	25 %	50 %	25 %	0 %	525957523
1033	NC_021848	AAGC	2	8	55550	55557	50 %	0 %	25 %	25 %	525957523
1034	NC_021848	GCA	2	6	55558	55563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957523
1035	NC_021848	CAA	2	6	55571	55576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957523
1036	NC_021848	TGA	2	6	55636	55641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957523
1037	NC_021848	ATCA	2	8	55688	55695	50 %	25 %	0 %	25 %	525957523
1038	NC_021848	A	6	6	55764	55769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021848	CCA	2	6	55832	55837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957524
1040	NC_021848	AAG	2	6	55851	55856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957524
1041	NC_021848	GAA	2	6	55964	55969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957524
1042	NC_021848	GTC	2	6	55974	55979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957524
1043	NC_021848	ACG	2	6	56037	56042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957524
1044	NC_021848	CG	3	6	56143	56148	0 %	0 %	50 %	50 %	525957524
1045	NC_021848	TGC	2	6	56173	56178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957524
1046	NC_021848	AGA	2	6	56188	56193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957524
1047	NC_021848	CCAA	2	8	56250	56257	50 %	0 %	0 %	50 %	525957524
1048	NC_021848	GCA	2	6	56308	56313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957524
1049	NC_021848	AAAC	2	8	56329	56336	75 %	0 %	0 %	25 %	525957524
1050	NC_021848	CTG	2	6	56350	56355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957524
1051	NC_021848	CAGAG	2	10	56384	56393	40 %	0 %	40 %	20 %	525957524
1052	NC_021848	GTG	2	6	56395	56400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957524
1053	NC_021848	CTT	2	6	56404	56409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957524
1054	NC_021848	AGCA	2	8	56579	56586	50 %	0 %	25 %	25 %	525957524
1055	NC_021848	GT	3	6	56626	56631	0 %	50 %	50 %	0 %	525957524
1056	NC_021848	GAT	2	6	56684	56689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957524
1057	NC_021848	CAA	2	6	56753	56758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957524
1058	NC_021848	TGC	2	6	56759	56764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957524
1059	NC_021848	CCG	2	6	56776	56781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957524
1060	NC_021848	GCCA	2	8	56938	56945	25 %	0 %	25 %	50 %	525957524
1061	NC_021848	CCAC	2	8	56985	56992	25 %	0 %	0 %	75 %	525957524
1062	NC_021848	CGC	2	6	56993	56998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957524
1063	NC_021848	CGG	2	6	57070	57075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957524
1064	NC_021848	TGT	2	6	57100	57105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021848	TATTT	2	10	57277	57286	20 %	80 %	0 %	0 %	525957525
1066	NC_021848	GAC	2	6	57468	57473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957526
1067	NC_021848	AGG	2	6	57562	57567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957526
1068	NC_021848	CAGTTC	2	12	57666	57677	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525957526
1069	NC_021848	TAC	2	6	57696	57701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957526
1070	NC_021848	GT	3	6	57789	57794	0 %	50 %	50 %	0 %	525957526
1071	NC_021848	CT	3	6	57820	57825	0 %	50 %	0 %	50 %	525957526
1072	NC_021848	GAA	2	6	57843	57848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957526
1073	NC_021848	GAC	2	6	57866	57871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957526
1074	NC_021848	TTG	2	6	57946	57951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957526
1075	NC_021848	GAA	2	6	57972	57977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957526
1076	NC_021848	TCT	2	6	57985	57990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957526
1077	NC_021848	ACC	2	6	58030	58035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957526
1078	NC_021848	GAT	2	6	58097	58102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957526
1079	NC_021848	CCA	2	6	58232	58237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957527
1080	NC_021848	TCA	2	6	58275	58280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957527
1081	NC_021848	TGGA	2	8	58282	58289	25 %	25 %	50 %	0 %	525957527
1082	NC_021848	TCA	2	6	58346	58351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957527
1083	NC_021848	GTG	2	6	58360	58365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957527
1084	NC_021848	GAT	2	6	58404	58409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957527
1085	NC_021848	GCG	2	6	58417	58422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957527
1086	NC_021848	ACGT	2	8	58481	58488	25 %	25 %	25 %	25 %	525957527
1087	NC_021848	TGT	2	6	58529	58534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957527
1088	NC_021848	TAA	2	6	58596	58601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957527
1089	NC_021848	T	6	6	58612	58617	0 %	100 %	0 %	0 %	525957527
1090	NC_021848	GGC	2	6	58639	58644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957527
1091	NC_021848	GTC	2	6	58657	58662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957527
1092	NC_021848	GTG	2	6	58667	58672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957527
1093	NC_021848	TGA	2	6	58917	58922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957527
1094	NC_021848	TGG	2	6	58931	58936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957527
1095	NC_021848	GCA	3	9	58960	58968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957527
1096	NC_021848	TCG	2	6	59077	59082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957527
1097	NC_021848	TTGA	2	8	59104	59111	25 %	50 %	25 %	0 %	525957527
1098	NC_021848	CCT	2	6	59139	59144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525957527
1099	NC_021848	A	6	6	59182	59187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021848	GAAG	2	8	59224	59231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021848	TCT	2	6	59240	59245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957528
1102	NC_021848	T	6	6	59305	59310	0 %	100 %	0 %	0 %	525957528
1103	NC_021848	GCT	2	6	59318	59323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957528
1104	NC_021848	TCA	2	6	59381	59386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957528
1105	NC_021848	CTT	2	6	59400	59405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957528
1106	NC_021848	GCA	2	6	59421	59426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957528
1107	NC_021848	GCT	2	6	59444	59449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957528
1108	NC_021848	TTG	2	6	59465	59470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957528
1109	NC_021848	GAC	3	9	59544	59552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957528
1110	NC_021848	CTG	2	6	59628	59633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957528
1111	NC_021848	GAT	2	6	59710	59715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957528
1112	NC_021848	CTT	2	6	59718	59723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957528
1113	NC_021848	CAG	2	6	59883	59888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957529
1114	NC_021848	GCA	2	6	59961	59966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957529
1115	NC_021848	GCG	2	6	60117	60122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957529
1116	NC_021848	ACAG	2	8	60128	60135	50 %	0 %	25 %	25 %	525957529
1117	NC_021848	CCAGAC	2	12	60252	60263	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525957529
1118	NC_021848	GCA	2	6	60267	60272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957529
1119	NC_021848	AAG	2	6	60295	60300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957529
1120	NC_021848	GCC	2	6	60412	60417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957529
1121	NC_021848	GCT	2	6	60427	60432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957529
1122	NC_021848	GAT	2	6	60501	60506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957529
1123	NC_021848	GCG	2	6	60537	60542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957529
1124	NC_021848	TCT	2	6	60678	60683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957529
1125	NC_021848	GT	3	6	60826	60831	0 %	50 %	50 %	0 %	525957529
1126	NC_021848	AAGATG	2	12	60867	60878	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525957529
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1129	NC_021848	TCA	2	6	61253	61258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021848	T	6	6	61262	61267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021848	TTG	2	6	61276	61281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021848	GTC	2	6	61349	61354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957530
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1144	NC_021848	TCA	2	6	61677	61682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957530
1145	NC_021848	GCC	2	6	61694	61699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957530
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1153	NC_021848	CCA	2	6	62225	62230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957530
1154	NC_021848	CTG	2	6	62277	62282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957530
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1160	NC_021848	AAT	2	6	62683	62688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_021848	TAA	2	6	62710	62715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_021848	ATT	2	6	62737	62742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_021848	GA	3	6	62776	62781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_021848	TCT	2	6	63020	63025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957531
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1183	NC_021848	TTC	2	6	64148	64153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957533
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1193	NC_021848	T	6	6	64623	64628	0 %	100 %	0 %	0 %	525957534
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1199	NC_021848	TTCAA	2	10	65018	65027	40 %	40 %	0 %	20 %	525957535
1200	NC_021848	CATG	2	8	65085	65092	25 %	25 %	25 %	25 %	525957535
1201	NC_021848	CAT	2	6	65109	65114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957535
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1217	NC_021848	ATC	2	6	65887	65892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957535
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1220	NC_021848	TTC	2	6	66085	66090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1221	NC_021848	CTT	2	6	66096	66101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
1222	NC_021848	CTT	2	6	66132	66137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957535
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1226	NC_021848	TTAC	2	8	66256	66263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1227	NC_021848	CTT	2	6	66356	66361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959911
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1232	NC_021848	TTC	2	6	66654	66659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959911
1233	NC_021848	CAA	2	6	66660	66665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959911
1234	NC_021848	ATG	2	6	66727	66732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959911
1235	NC_021848	GTC	2	6	66834	66839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959911
1236	NC_021848	ATGGTG	2	12	66841	66852	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525959911
1237	NC_021848	CAA	2	6	66875	66880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959911
1238	NC_021848	GGT	2	6	66894	66899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959911
1239	NC_021848	GAC	2	6	66969	66974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959911
1240	NC_021848	T	6	6	67003	67008	0 %	100 %	0 %	0 %	525959911
1241	NC_021848	CCA	2	6	67089	67094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957536
1242	NC_021848	TGA	2	6	67123	67128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957536
1243	NC_021848	GAGC	2	8	67152	67159	25 %	0 %	50 %	25 %	525957536
1244	NC_021848	TTTG	2	8	67287	67294	0 %	75 %	25 %	0 %	525957536
1245	NC_021848	GAC	2	6	67321	67326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1246	NC_021848	TGC	2	6	67350	67355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1247	NC_021848	GCT	2	6	67478	67483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1248	NC_021848	CAG	2	6	67495	67500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957536
1249	NC_021848	AGT	2	6	67589	67594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957537
1250	NC_021848	CCAA	2	8	67608	67615	50 %	0 %	0 %	50 %	525957537
1251	NC_021848	TTG	2	6	67622	67627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957537
1252	NC_021848	TGA	2	6	67657	67662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957537
1253	NC_021848	CGA	2	6	67789	67794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957537
1254	NC_021848	GTT	2	6	67868	67873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957537
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1259	NC_021848	AT	3	6	68064	68069	50 %	50 %	0 %	0 %	525957537
1260	NC_021848	AATC	2	8	68123	68130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1359	NC_021848	A	6	6	73887	73892	100 %	0 %	0 %	0 %	525957545
1360	NC_021848	GCA	2	6	73894	73899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957545
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1371	NC_021848	GC	3	6	74380	74385	0 %	0 %	50 %	50 %	525957545
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