MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021848	GT	3	6	25865	25870	0 %	50 %	50 %	0 %	525957504
502	NC_021848	GTA	2	6	25991	25996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957504
503	NC_021848	TCTGC	2	10	26017	26026	0 %	40 %	20 %	40 %	525957504
504	NC_021848	CTT	2	6	26050	26055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957504
505	NC_021848	CGG	2	6	26159	26164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957504
506	NC_021848	AAC	2	6	26167	26172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957504
507	NC_021848	TTC	2	6	26284	26289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957504
508	NC_021848	ACA	2	6	26324	26329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957504
509	NC_021848	CAG	2	6	26357	26362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957504
510	NC_021848	TGT	2	6	26487	26492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957504
511	NC_021848	TGA	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957504
512	NC_021848	CAA	2	6	26515	26520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957504
513	NC_021848	A	6	6	26606	26611	100 %	0 %	0 %	0 %	525957504
514	NC_021848	ACCG	2	8	26634	26641	25 %	0 %	25 %	50 %	525957504
515	NC_021848	TTG	2	6	26642	26647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957504
516	NC_021848	TGC	2	6	26690	26695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957504
517	NC_021848	AGA	2	6	26726	26731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021848	GCC	2	6	26873	26878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957505
519	NC_021848	TCTA	2	8	26985	26992	25 %	50 %	0 %	25 %	525957505
520	NC_021848	AG	3	6	27038	27043	50 %	0 %	50 %	0 %	525957505
521	NC_021848	ATA	2	6	27054	27059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957505
522	NC_021848	GAA	2	6	27121	27126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957505
523	NC_021848	TCG	2	6	27138	27143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957505
524	NC_021848	AAGCTC	2	12	27147	27158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525957505
525	NC_021848	CGAG	2	8	27208	27215	25 %	0 %	50 %	25 %	525957505
526	NC_021848	TGTC	2	8	27330	27337	0 %	50 %	25 %	25 %	525957505
527	NC_021848	A	6	6	27413	27418	100 %	0 %	0 %	0 %	525957505
528	NC_021848	ATC	2	6	27519	27524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957505
529	NC_021848	A	6	6	27644	27649	100 %	0 %	0 %	0 %	525959908
530	NC_021848	TGGTTG	2	12	27706	27717	0 %	50 %	50 %	0 %	525959908
531	NC_021848	CGG	2	6	27747	27752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959908
532	NC_021848	CCAA	2	8	27801	27808	50 %	0 %	0 %	50 %	525959908
533	NC_021848	GCAAC	2	10	27811	27820	40 %	0 %	20 %	40 %	525959908
534	NC_021848	TCT	2	6	27853	27858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959908
535	NC_021848	GCA	2	6	27931	27936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959908
536	NC_021848	TGCGGA	2	12	27978	27989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525959908
537	NC_021848	AG	3	6	28065	28070	50 %	0 %	50 %	0 %	525959908
538	NC_021848	GGC	2	6	28236	28241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959908
539	NC_021848	AAG	2	6	28289	28294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959908
540	NC_021848	AACC	2	8	28315	28322	50 %	0 %	0 %	50 %	525959908
541	NC_021848	GC	3	6	28431	28436	0 %	0 %	50 %	50 %	525959908
542	NC_021848	AAACAA	2	12	28450	28461	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525959908
543	NC_021848	TGG	2	6	28522	28527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959908
544	NC_021848	AGCG	2	8	28550	28557	25 %	0 %	50 %	25 %	525959908
545	NC_021848	CTG	2	6	28568	28573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959908
546	NC_021848	CGAT	2	8	28641	28648	25 %	25 %	25 %	25 %	525959908
547	NC_021848	GAA	2	6	28722	28727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957506
548	NC_021848	TTA	2	6	28819	28824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957506
549	NC_021848	GATC	2	8	28874	28881	25 %	25 %	25 %	25 %	525957506
550	NC_021848	GGATGC	2	12	28898	28909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525957506
551	NC_021848	TCG	2	6	28937	28942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957506
552	NC_021848	TGG	3	9	28954	28962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957506
553	NC_021848	CGG	2	6	29002	29007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957506
554	NC_021848	TCA	2	6	29062	29067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957506
555	NC_021848	CAG	2	6	29090	29095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957506
556	NC_021848	TAC	2	6	29106	29111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957506
557	NC_021848	GAA	2	6	29208	29213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957506
558	NC_021848	TGC	2	6	29332	29337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957506
559	NC_021848	GTC	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957506
560	NC_021848	AGA	2	6	29561	29566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957506
561	NC_021848	GC	3	6	29592	29597	0 %	0 %	50 %	50 %	525957506
562	NC_021848	TGAG	2	8	29686	29693	25 %	25 %	50 %	0 %	525957506
563	NC_021848	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957506
564	NC_021848	AGA	2	6	29726	29731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957506
565	NC_021848	CG	3	6	29800	29805	0 %	0 %	50 %	50 %	525957506
566	NC_021848	CTT	2	6	29816	29821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957506
567	NC_021848	CAT	2	6	29837	29842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957506
568	NC_021848	AGC	2	6	29891	29896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957506
569	NC_021848	CGTG	2	8	30002	30009	0 %	25 %	50 %	25 %	525957506
570	NC_021848	ATC	2	6	30064	30069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957506
571	NC_021848	CAA	2	6	30084	30089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957506
572	NC_021848	GT	3	6	30187	30192	0 %	50 %	50 %	0 %	525957506
573	NC_021848	GAT	2	6	30218	30223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957506
574	NC_021848	TGCG	2	8	30232	30239	0 %	25 %	50 %	25 %	525957506
575	NC_021848	ATG	2	6	30241	30246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957506
576	NC_021848	CTT	2	6	30294	30299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957506
577	NC_021848	TGA	2	6	30349	30354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957506
578	NC_021848	TCA	2	6	30452	30457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957507
579	NC_021848	AGC	3	9	30490	30498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957507
580	NC_021848	TGA	2	6	30507	30512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957507
581	NC_021848	ATC	2	6	30521	30526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957507
582	NC_021848	AGAA	2	8	30546	30553	75 %	0 %	25 %	0 %	525957507
583	NC_021848	TTG	2	6	30584	30589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957507
584	NC_021848	GTT	2	6	30634	30639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957507
585	NC_021848	TGC	2	6	30666	30671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957507
586	NC_021848	AAAC	2	8	30703	30710	75 %	0 %	0 %	25 %	525957507
587	NC_021848	AAG	2	6	30717	30722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957507
588	NC_021848	AGA	2	6	30727	30732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957507
589	NC_021848	TGAGT	2	10	30742	30751	20 %	40 %	40 %	0 %	525957507
590	NC_021848	CAA	2	6	30787	30792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957507
591	NC_021848	ACT	2	6	30876	30881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957507
592	NC_021848	CGTT	2	8	30936	30943	0 %	50 %	25 %	25 %	525957507
593	NC_021848	TATT	2	8	30948	30955	25 %	75 %	0 %	0 %	525957507
594	NC_021848	CTT	2	6	31069	31074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957507
595	NC_021848	ACT	2	6	31080	31085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957507
596	NC_021848	CAG	2	6	31146	31151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957507
597	NC_021848	AGC	2	6	31348	31353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957507
598	NC_021848	GAA	2	6	31439	31444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957507
599	NC_021848	TGA	2	6	31456	31461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957507
600	NC_021848	GATGGT	2	12	31564	31575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525957507
601	NC_021848	CAT	2	6	31618	31623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957507
602	NC_021848	GGC	2	6	31628	31633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957507
603	NC_021848	TCA	2	6	31692	31697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957508
604	NC_021848	GAA	2	6	31736	31741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957508
605	NC_021848	ATGG	2	8	31844	31851	25 %	25 %	50 %	0 %	525957508
606	NC_021848	CA	3	6	31894	31899	50 %	0 %	0 %	50 %	525957508
607	NC_021848	TTA	2	6	31970	31975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957508
608	NC_021848	ATA	2	6	32072	32077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957508
609	NC_021848	CGG	2	6	32091	32096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957508
610	NC_021848	T	6	6	32103	32108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021848	TAA	2	6	32177	32182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021848	AAT	2	6	32228	32233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021848	TGC	2	6	32300	32305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021848	AG	4	8	32382	32389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021848	GGT	2	6	32408	32413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959909
616	NC_021848	TAG	2	6	32430	32435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959909
617	NC_021848	GCA	2	6	32471	32476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959909
618	NC_021848	GGC	2	6	32546	32551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959909
619	NC_021848	GCT	2	6	32573	32578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959909
620	NC_021848	ATA	2	6	32619	32624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959909
621	NC_021848	GGT	2	6	32717	32722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959909
622	NC_021848	TGGA	2	8	32745	32752	25 %	25 %	50 %	0 %	525959909
623	NC_021848	TAA	2	6	32776	32781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959909
624	NC_021848	CAA	3	9	32796	32804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959909
625	NC_021848	ATG	2	6	32820	32825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959909
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627	NC_021848	GCT	2	6	32880	32885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959909
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