MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021848	TGA	2	6	263669	263674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957686
5003	NC_021848	TTG	2	6	263806	263811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957687
5004	NC_021848	TGC	2	6	263828	263833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957687
5005	NC_021848	TGA	2	6	263874	263879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957687
5006	NC_021848	GCC	2	6	263895	263900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957687
5007	NC_021848	AGA	2	6	263901	263906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957687
5008	NC_021848	GC	3	6	264009	264014	0 %	0 %	50 %	50 %	525957687
5009	NC_021848	TGG	2	6	264084	264089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957687
5010	NC_021848	CAG	2	6	264094	264099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957687
5011	NC_021848	TGC	2	6	264140	264145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957687
5012	NC_021848	GAA	2	6	264262	264267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957687
5013	NC_021848	TGA	2	6	264296	264301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957687
5014	NC_021848	ACGGC	2	10	264323	264332	20 %	0 %	40 %	40 %	525957687
5015	NC_021848	CTA	2	6	264342	264347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957687
5016	NC_021848	TTG	2	6	264365	264370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957687
5017	NC_021848	CTT	2	6	264375	264380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957687
5018	NC_021848	GGT	3	9	264382	264390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957687
5019	NC_021848	GCA	2	6	264462	264467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957687
5020	NC_021848	TAC	2	6	264497	264502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957687
5021	NC_021848	AGC	2	6	264560	264565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957687
5022	NC_021848	TGAT	2	8	264593	264600	25 %	50 %	25 %	0 %	525957687
5023	NC_021848	A	6	6	264749	264754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021848	TGA	2	6	264792	264797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021848	TCA	2	6	264824	264829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021848	AAG	2	6	264867	264872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957688
5027	NC_021848	GAA	2	6	264886	264891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957688
5028	NC_021848	GTA	2	6	264934	264939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957688
5029	NC_021848	GC	3	6	264959	264964	0 %	0 %	50 %	50 %	525957688
5030	NC_021848	GAT	2	6	264965	264970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957688
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5032	NC_021848	AACTCA	2	12	265032	265043	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525957688
5033	NC_021848	GTT	2	6	265048	265053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957688
5034	NC_021848	AT	3	6	265061	265066	50 %	50 %	0 %	0 %	525957688
5035	NC_021848	TTG	2	6	265068	265073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957688
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5038	NC_021848	ACC	2	6	265259	265264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957688
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5040	NC_021848	GT	3	6	265382	265387	0 %	50 %	50 %	0 %	525957688
5041	NC_021848	TACG	2	8	265399	265406	25 %	25 %	25 %	25 %	525957688
5042	NC_021848	GTA	2	6	265439	265444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957688
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5045	NC_021848	GAT	2	6	265496	265501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957688
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5050	NC_021848	CGT	2	6	265633	265638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957688
5051	NC_021848	T	6	6	265736	265741	0 %	100 %	0 %	0 %	525957688
5052	NC_021848	GAT	2	6	265766	265771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957688
5053	NC_021848	CAA	2	6	265777	265782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957688
5054	NC_021848	TGA	2	6	265798	265803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957688
5055	NC_021848	TCAA	2	8	265806	265813	50 %	25 %	0 %	25 %	525957688
5056	NC_021848	ACC	2	6	265919	265924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957688
5057	NC_021848	ATGCG	2	10	265964	265973	20 %	20 %	40 %	20 %	525957688
5058	NC_021848	CAGA	2	8	266110	266117	50 %	0 %	25 %	25 %	525957688
5059	NC_021848	TTC	2	6	266222	266227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957688
5060	NC_021848	GC	3	6	266238	266243	0 %	0 %	50 %	50 %	525957688
5061	NC_021848	GGC	2	6	266288	266293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021848	CTGA	2	8	266482	266489	25 %	25 %	25 %	25 %	525957689
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5065	NC_021848	AGTT	2	8	266558	266565	25 %	50 %	25 %	0 %	525957689
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5070	NC_021848	CG	3	6	266894	266899	0 %	0 %	50 %	50 %	525957689
5071	NC_021848	ATC	2	6	266913	266918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957689
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5073	NC_021848	TCG	2	6	266977	266982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957689
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5086	NC_021848	ATC	2	6	267504	267509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957689
5087	NC_021848	ATCTT	2	10	267535	267544	20 %	60 %	0 %	20 %	525957689
5088	NC_021848	CGGA	2	8	267548	267555	25 %	0 %	50 %	25 %	525957689
5089	NC_021848	AAC	2	6	267561	267566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957689
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5094	NC_021848	TCG	2	6	268117	268122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957689
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5107	NC_021848	GTT	2	6	269034	269039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957690
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5121	NC_021848	CGTTGT	2	12	269588	269599	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525957690
5122	NC_021848	TGC	2	6	269609	269614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957690
5123	NC_021848	GGT	2	6	269622	269627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957690
5124	NC_021848	TCT	2	6	269629	269634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957690
5125	NC_021848	TCT	2	6	269752	269757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957690
5126	NC_021848	CCG	2	6	269770	269775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957690
5127	NC_021848	TCA	2	6	269884	269889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957690
5128	NC_021848	CAT	2	6	269991	269996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957690
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5130	NC_021848	TTGA	2	8	270025	270032	25 %	50 %	25 %	0 %	525957690
5131	NC_021848	GGTTG	2	10	270183	270192	0 %	40 %	60 %	0 %	525957690
5132	NC_021848	GAT	2	6	270201	270206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957690
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5134	NC_021848	TGA	2	6	270316	270321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957690
5135	NC_021848	TAAAGC	2	12	270323	270334	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525957690
5136	NC_021848	TTTGG	2	10	270353	270362	0 %	60 %	40 %	0 %	525957690
5137	NC_021848	ACGGT	2	10	270417	270426	20 %	20 %	40 %	20 %	525957690
5138	NC_021848	ATG	2	6	270564	270569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957690
5139	NC_021848	AGTC	2	8	270723	270730	25 %	25 %	25 %	25 %	525957690
5140	NC_021848	GAC	2	6	270762	270767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957690
5141	NC_021848	CGC	2	6	270800	270805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957691
5142	NC_021848	CAA	2	6	270880	270885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957691
5143	NC_021848	TGG	2	6	270899	270904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957691
5144	NC_021848	TGC	2	6	270934	270939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957691
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5149	NC_021848	GCC	2	6	271235	271240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957691
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5151	NC_021848	TGC	2	6	271281	271286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957691
5152	NC_021848	TG	3	6	271354	271359	0 %	50 %	50 %	0 %	525957691
5153	NC_021848	ACGC	2	8	271365	271372	25 %	0 %	25 %	50 %	525957691
5154	NC_021848	TTG	2	6	271496	271501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957691
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5172	NC_021848	GAC	2	6	272361	272366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957692
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5175	NC_021848	TGG	2	6	272475	272480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957692
5176	NC_021848	CTAG	2	8	272498	272505	25 %	25 %	25 %	25 %	525957692
5177	NC_021848	TCG	2	6	272519	272524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957692
5178	NC_021848	CAT	2	6	272541	272546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957692
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5184	NC_021848	CGTGTG	2	12	272861	272872	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525957692
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5190	NC_021848	CGT	2	6	273009	273014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957692
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5192	NC_021848	AGT	2	6	273111	273116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957692
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5204	NC_021848	TTC	2	6	274072	274077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957693
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5209	NC_021848	GTCTT	2	10	274219	274228	0 %	60 %	20 %	20 %	525957693
5210	NC_021848	ATG	2	6	274265	274270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957693
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5212	NC_021848	ACT	2	6	274340	274345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957693
5213	NC_021848	CGT	2	6	274380	274385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957693
5214	NC_021848	TTGA	2	8	274409	274416	25 %	50 %	25 %	0 %	525957693
5215	NC_021848	ACG	2	6	274442	274447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957693
5216	NC_021848	CAG	2	6	274462	274467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957693
5217	NC_021848	GTT	2	6	274476	274481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957693
5218	NC_021848	TC	3	6	274492	274497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5219	NC_021848	TAGC	2	8	274515	274522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5220	NC_021848	GGT	2	6	274778	274783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957694
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5222	NC_021848	ATG	2	6	274840	274845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957694
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5224	NC_021848	ACC	2	6	274957	274962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957694
5225	NC_021848	ATG	2	6	274990	274995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957694
5226	NC_021848	ATC	2	6	274996	275001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957694
5227	NC_021848	CAGAGC	2	12	275010	275021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957694
5228	NC_021848	ACC	2	6	275049	275054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957694
5229	NC_021848	CAA	2	6	275099	275104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957694
5230	NC_021848	CTTG	2	8	275131	275138	0 %	50 %	25 %	25 %	525957694
5231	NC_021848	GAGT	2	8	275144	275151	25 %	25 %	50 %	0 %	525957694
5232	NC_021848	TG	3	6	275154	275159	0 %	50 %	50 %	0 %	525957694
5233	NC_021848	TTC	2	6	275184	275189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957694
5234	NC_021848	GGA	2	6	275285	275290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957694
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5236	NC_021848	CCAG	2	8	275395	275402	25 %	0 %	25 %	50 %	525957694
5237	NC_021848	GTT	2	6	275439	275444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957694
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5240	NC_021848	TGC	2	6	275588	275593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957695
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5242	NC_021848	AGT	2	6	275688	275693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957695
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5360	NC_021848	GTC	2	6	281549	281554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957698
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5368	NC_021848	TGC	2	6	282100	282105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957698
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5490	NC_021848	CAA	2	6	288290	288295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957702
5491	NC_021848	TGTGGT	2	12	288301	288312	0 %	50 %	50 %	0 %	525957702
5492	NC_021848	CAT	2	6	288314	288319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957702
5493	NC_021848	GA	3	6	288414	288419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_021848	ATA	2	6	288420	288425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_021848	TC	3	6	288490	288495	0 %	50 %	0 %	50 %	525957703
5496	NC_021848	TTG	2	6	288512	288517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957703
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5498	NC_021848	CTG	2	6	288527	288532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957703
5499	NC_021848	TC	3	6	288571	288576	0 %	50 %	0 %	50 %	525957703
5500	NC_021848	TGC	2	6	288818	288823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957703

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