MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021847	CTT	2	6	136	141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021847	ACC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952308
3	NC_021847	AC	3	6	263	268	50 %	0 %	0 %	50 %	525952308
4	NC_021847	ATTG	2	8	308	315	25 %	50 %	25 %	0 %	525952308
5	NC_021847	TCA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952308
6	NC_021847	TA	3	6	334	339	50 %	50 %	0 %	0 %	525952308
7	NC_021847	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021847	AAAG	2	8	386	393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021847	TGG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021847	CAC	2	6	489	494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021847	AAGCA	2	10	556	565	60 %	0 %	20 %	20 %	525952309
12	NC_021847	ACC	2	6	645	650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021847	AGA	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021847	AGA	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021847	CAAA	2	8	745	752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021847	TCT	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021847	CCG	2	6	854	859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021847	TGA	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021847	GAG	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021847	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021847	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021847	AACCA	2	10	1528	1537	60 %	0 %	0 %	40 %	525952310
23	NC_021847	CAT	2	6	1539	1544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952310
24	NC_021847	ATG	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952310
25	NC_021847	CA	3	6	1650	1655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021847	GAA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525952311
27	NC_021847	AGG	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525952311
28	NC_021847	A	6	6	1754	1759	100 %	0 %	0 %	0 %	525952311
29	NC_021847	GT	3	6	1807	1812	0 %	50 %	50 %	0 %	525952311
30	NC_021847	CAA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952311
31	NC_021847	ACA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952311
32	NC_021847	TAA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021847	CAT	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021847	GGA	2	6	2037	2042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021847	TTA	2	6	2060	2065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021847	TGGA	2	8	2066	2073	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021847	AGA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021847	CCA	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021847	ATC	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021847	GCGGA	2	10	2422	2431	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021847	AC	3	6	2789	2794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021847	CGT	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021847	AGC	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021847	ACG	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021847	TGA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021847	CCG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021847	ACC	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021847	CTC	2	6	3356	3361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021847	GAG	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021847	CCA	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021847	GGT	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021847	CA	3	6	3482	3487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021847	GTA	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021847	ATTTCA	2	12	3616	3627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021847	CAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021847	GCC	2	6	3730	3735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021847	TAA	2	6	3857	3862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021847	TC	3	6	3984	3989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021847	ACC	2	6	4014	4019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021847	CGT	2	6	4114	4119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021847	C	6	6	4214	4219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_021847	AAG	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021847	GAG	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021847	CA	3	6	4418	4423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021847	TAC	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021847	CTTT	2	8	4547	4554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021847	ATG	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021847	GCT	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021847	TAG	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021847	GTT	2	6	4652	4657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021847	ACG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021847	GT	3	6	4689	4694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021847	TACT	2	8	4706	4713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021847	AGT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021847	TCGGT	2	10	4897	4906	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021847	GTAC	2	8	5109	5116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021847	GTCA	2	8	5192	5199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021847	GTA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021847	GGA	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021847	C	6	6	5225	5230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_021847	CGT	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021847	TCGC	2	8	5372	5379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021847	GTT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021847	TAC	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021847	TGA	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021847	ATG	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021847	ACAA	2	8	5781	5788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021847	TTG	2	6	5796	5801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021847	TGA	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021847	TGG	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021847	TGG	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021847	CCT	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021847	AGGC	2	8	6022	6029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021847	GGAA	2	8	6079	6086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021847	TGG	2	6	6087	6092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021847	CCG	2	6	6197	6202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021847	CTT	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021847	CTTTA	2	10	6273	6282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021847	TG	3	6	6298	6303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021847	ATC	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021847	AGG	2	6	6332	6337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021847	C	6	6	6414	6419	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_021847	CTAC	2	8	6430	6437	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021847	GT	3	6	6473	6478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021847	ACG	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021847	GT	3	6	6642	6647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021847	ATG	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021847	CGT	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021847	TCC	2	6	6693	6698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021847	GAC	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021847	GCA	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021847	TTC	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021847	GCC	2	6	7138	7143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021847	C	6	6	7202	7207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_021847	ACC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021847	GCT	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021847	CTT	2	6	7373	7378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021847	CTT	2	6	7457	7462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021847	CA	3	6	7463	7468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021847	CTG	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021847	ATC	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021847	TCG	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021847	CAT	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021847	CCG	2	6	7765	7770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021847	GCC	2	6	7840	7845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021847	ATC	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021847	CA	3	6	8033	8038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021847	A	6	6	8143	8148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021847	AC	3	6	8462	8467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021847	CGT	2	6	8480	8485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021847	AGC	2	6	8661	8666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021847	ACG	2	6	8715	8720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021847	TGA	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021847	CCG	2	6	8823	8828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_021847	ACC	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021847	CTC	2	6	9029	9034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021847	GAG	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021847	CCA	2	6	9073	9078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021847	GGT	2	6	9133	9138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021847	CA	3	6	9155	9160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021847	GTA	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021847	ATTTCA	2	12	9289	9300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_021847	CAT	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021847	GCC	2	6	9403	9408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_021847	TAA	2	6	9530	9535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021847	TC	3	6	9657	9662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021847	ACC	2	6	9687	9692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_021847	CGT	2	6	9787	9792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021847	TC	3	6	9826	9831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021847	C	6	6	9887	9892	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_021847	AAG	2	6	9904	9909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021847	GAG	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021847	CA	3	6	10091	10096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021847	TAC	2	6	10162	10167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021847	CTTT	2	8	10220	10227	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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157	NC_021847	GCT	2	6	10236	10241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_021847	GTT	2	6	10325	10330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021847	TACT	2	8	10379	10386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_021847	AGT	2	6	10455	10460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021847	TCGGT	2	10	10570	10579	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_021847	GTAC	2	8	10781	10788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_021847	GTCA	2	8	10864	10871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_021847	GTA	2	6	10872	10877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_021847	TCGC	2	8	11044	11051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_021847	GTT	2	6	11201	11206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021847	TAC	2	6	11234	11239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_021847	CCG	2	6	11595	11600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_021847	TG	3	6	11726	11731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021847	AAT	2	6	11745	11750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_021847	ATG	2	6	12095	12100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_021847	TG	3	6	16713	16718	0 %	50 %	50 %	0 %	525949896
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284	NC_021847	ATG	2	6	16824	16829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949896
285	NC_021847	TAT	2	6	16837	16842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949896
286	NC_021847	TTG	2	6	16866	16871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949896
287	NC_021847	CTT	2	6	16900	16905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
288	NC_021847	AAG	2	6	16920	16925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949896
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290	NC_021847	CTT	2	6	16993	16998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
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295	NC_021847	CA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	0 %	50 %	525949896
296	NC_021847	TGGT	2	8	17378	17385	0 %	50 %	50 %	0 %	525949896
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301	NC_021847	CAA	2	6	17851	17856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
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313	NC_021847	ATT	2	6	18212	18217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949896
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365	NC_021847	ATCA	2	8	20991	20998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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383	NC_021847	A	6	6	22120	22125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_021847	CTTTT	2	10	22192	22201	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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400	NC_021847	TTC	2	6	23284	23289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949903
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404	NC_021847	CTG	2	6	23510	23515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949903
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408	NC_021847	ATTA	2	8	23953	23960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_021847	T	8	8	23999	24006	0 %	100 %	0 %	0 %	525952312
410	NC_021847	CCCTG	2	10	24061	24070	0 %	20 %	20 %	60 %	525952312
411	NC_021847	TGG	2	6	24090	24095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525952312
412	NC_021847	CAA	2	6	24096	24101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952312
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414	NC_021847	TGA	2	6	24236	24241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949904
415	NC_021847	AAC	2	6	24247	24252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949904
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417	NC_021847	CATGGA	2	12	24356	24367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525949904
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421	NC_021847	TGA	2	6	24428	24433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949904
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442	NC_021847	TCA	2	6	25474	25479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949905
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445	NC_021847	A	7	7	25798	25804	100 %	0 %	0 %	0 %	525949905
446	NC_021847	CTT	2	6	26089	26094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949906
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450	NC_021847	ATA	2	6	26287	26292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949906
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452	NC_021847	AGCG	2	8	26356	26363	25 %	0 %	50 %	25 %	525949906
453	NC_021847	GCG	2	6	26411	26416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949906
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459	NC_021847	CTT	2	6	26741	26746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949906
460	NC_021847	ACTTT	2	10	26842	26851	20 %	60 %	0 %	20 %	525949906
461	NC_021847	TGC	2	6	26884	26889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949906
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499	NC_021847	GGCA	2	8	28848	28855	25 %	0 %	50 %	25 %	525949908
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