MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021847	GAA	2	6	28902	28907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949908
502	NC_021847	TGA	3	9	29132	29140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949908
503	NC_021847	TCGT	2	8	29161	29168	0 %	50 %	25 %	25 %	525949908
504	NC_021847	CATTG	2	10	29312	29321	20 %	40 %	20 %	20 %	525949908
505	NC_021847	GT	3	6	29383	29388	0 %	50 %	50 %	0 %	525949908
506	NC_021847	A	9	9	29447	29455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021847	CAG	2	6	29506	29511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949909
508	NC_021847	CAA	2	6	29512	29517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949909
509	NC_021847	AAC	2	6	29717	29722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949909
510	NC_021847	GCA	2	6	29760	29765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949909
511	NC_021847	ACG	2	6	29801	29806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949909
512	NC_021847	TAG	2	6	29833	29838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949909
513	NC_021847	ACC	2	6	29912	29917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949909
514	NC_021847	TAA	2	6	29971	29976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021847	GTA	2	6	30010	30015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949910
516	NC_021847	AATC	2	8	30148	30155	50 %	25 %	0 %	25 %	525949910
517	NC_021847	ACG	3	9	30191	30199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949910
518	NC_021847	GAA	2	6	30200	30205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949910
519	NC_021847	GAC	2	6	30372	30377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949911
520	NC_021847	CCA	2	6	30466	30471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949911
521	NC_021847	TAC	2	6	30479	30484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949911
522	NC_021847	CAG	2	6	30547	30552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949912
523	NC_021847	ACG	2	6	30593	30598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949912
524	NC_021847	CTT	2	6	30610	30615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949912
525	NC_021847	GCT	2	6	30648	30653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949912
526	NC_021847	TTG	2	6	30774	30779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949912
527	NC_021847	CGG	2	6	30798	30803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949912
528	NC_021847	TCT	2	6	30810	30815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949912
529	NC_021847	ATT	2	6	30948	30953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021847	GTC	2	6	30974	30979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021847	ATT	2	6	31061	31066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021847	GC	3	6	31073	31078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_021847	TTTG	2	8	31087	31094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021847	TTGT	2	8	31217	31224	0 %	75 %	25 %	0 %	525949913
535	NC_021847	TGT	2	6	31294	31299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949913
536	NC_021847	CAC	2	6	31309	31314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949913
537	NC_021847	ATC	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949913
538	NC_021847	GAAT	2	8	31393	31400	50 %	25 %	25 %	0 %	525949913
539	NC_021847	CCA	2	6	31407	31412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949913
540	NC_021847	ATG	2	6	31458	31463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949913
541	NC_021847	GAT	2	6	31613	31618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949913
542	NC_021847	AC	3	6	31688	31693	50 %	0 %	0 %	50 %	525949913
543	NC_021847	CAC	2	6	31748	31753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949913
544	NC_021847	ATGG	2	8	31818	31825	25 %	25 %	50 %	0 %	525949913
545	NC_021847	AGT	2	6	31857	31862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021847	GC	3	6	31888	31893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_021847	AGC	2	6	31954	31959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952313
548	NC_021847	TTTCAC	2	12	32041	32052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525952313
549	NC_021847	GGC	2	6	32079	32084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525952313
550	NC_021847	TTCT	2	8	32142	32149	0 %	75 %	0 %	25 %	525952313
551	NC_021847	GTC	2	6	32173	32178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952313
552	NC_021847	TGAAG	2	10	32203	32212	40 %	20 %	40 %	0 %	525952313
553	NC_021847	GC	3	6	32269	32274	0 %	0 %	50 %	50 %	525952313
554	NC_021847	ACG	2	6	32275	32280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952313
555	NC_021847	CA	3	6	32303	32308	50 %	0 %	0 %	50 %	525952313
556	NC_021847	T	6	6	32317	32322	0 %	100 %	0 %	0 %	525952313
557	NC_021847	A	6	6	32335	32340	100 %	0 %	0 %	0 %	525952313
558	NC_021847	T	6	6	32368	32373	0 %	100 %	0 %	0 %	525952313
559	NC_021847	ACC	2	6	32398	32403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952313
560	NC_021847	T	6	6	32404	32409	0 %	100 %	0 %	0 %	525952313
561	NC_021847	TTA	2	6	32489	32494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525952313
562	NC_021847	CTT	2	6	32520	32525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952313
563	NC_021847	GCTTC	2	10	32553	32562	0 %	40 %	20 %	40 %	525952313
564	NC_021847	AT	3	6	32567	32572	50 %	50 %	0 %	0 %	525952313
565	NC_021847	CAA	2	6	32679	32684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952313
566	NC_021847	TCC	2	6	32749	32754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525952313
567	NC_021847	CTAT	2	8	32796	32803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_021847	ATT	2	6	32856	32861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949914
569	NC_021847	TCA	2	6	33056	33061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949914
570	NC_021847	GCT	2	6	33095	33100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949914
571	NC_021847	GTC	2	6	33182	33187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949914
572	NC_021847	CAC	2	6	33229	33234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949914
573	NC_021847	AGA	2	6	33244	33249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949914
574	NC_021847	CTA	2	6	33291	33296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949914
575	NC_021847	GCT	2	6	33378	33383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949914
576	NC_021847	TCA	2	6	33389	33394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949914
577	NC_021847	CTT	2	6	33411	33416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949914
578	NC_021847	TGG	2	6	33427	33432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949914
579	NC_021847	CAT	2	6	33471	33476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949914
580	NC_021847	GTCA	2	8	33487	33494	25 %	25 %	25 %	25 %	525949914
581	NC_021847	AGTG	2	8	33535	33542	25 %	25 %	50 %	0 %	525949914
582	NC_021847	CTG	2	6	33577	33582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949914
583	NC_021847	CCA	2	6	33616	33621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949914
584	NC_021847	ACC	2	6	33625	33630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949914
585	NC_021847	T	6	6	33708	33713	0 %	100 %	0 %	0 %	525949914
586	NC_021847	TC	3	6	33723	33728	0 %	50 %	0 %	50 %	525949914
587	NC_021847	ATG	2	6	33737	33742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949914
588	NC_021847	GAA	2	6	33829	33834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949914
589	NC_021847	ACG	2	6	33835	33840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949914
590	NC_021847	CAT	2	6	34038	34043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949914
591	NC_021847	TTG	2	6	34111	34116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949914
592	NC_021847	GACGC	2	10	34156	34165	20 %	0 %	40 %	40 %	525949914
593	NC_021847	AACA	2	8	34196	34203	75 %	0 %	0 %	25 %	525949914
594	NC_021847	GCCA	2	8	34244	34251	25 %	0 %	25 %	50 %	525949914
595	NC_021847	CAA	2	6	34309	34314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949914
596	NC_021847	TAA	2	6	34376	34381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021847	CTT	2	6	34383	34388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021847	ACA	2	6	34391	34396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021847	CTG	2	6	34454	34459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949915
600	NC_021847	CTT	2	6	34465	34470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949915
601	NC_021847	T	6	6	34544	34549	0 %	100 %	0 %	0 %	525949915
602	NC_021847	CAT	2	6	34556	34561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949915
603	NC_021847	TCA	2	6	34575	34580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949915
604	NC_021847	CAA	2	6	34625	34630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949915
605	NC_021847	GCC	2	6	34689	34694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949915
606	NC_021847	AGA	2	6	34706	34711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949915
607	NC_021847	GCA	2	6	34847	34852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949915
608	NC_021847	TTC	2	6	34910	34915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949915
609	NC_021847	CAT	2	6	34936	34941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949915
610	NC_021847	AAT	2	6	34943	34948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949915
611	NC_021847	CAG	2	6	34975	34980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949915
612	NC_021847	GAT	2	6	35021	35026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949915
613	NC_021847	GAT	2	6	35074	35079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949915
614	NC_021847	CTG	2	6	35083	35088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949915
615	NC_021847	GCC	2	6	35093	35098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949915
616	NC_021847	GAA	2	6	35103	35108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949915
617	NC_021847	ACA	2	6	35119	35124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949915
618	NC_021847	CGT	2	6	35126	35131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949915
619	NC_021847	CGA	2	6	35182	35187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949915
620	NC_021847	ACC	3	9	35201	35209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949915
621	NC_021847	GTT	2	6	35338	35343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949915
622	NC_021847	TGA	2	6	35349	35354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949915
623	NC_021847	GA	3	6	35430	35435	50 %	0 %	50 %	0 %	525949915
624	NC_021847	AAC	2	6	35463	35468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949915
625	NC_021847	AGA	2	6	35546	35551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021847	TC	3	6	35562	35567	0 %	50 %	0 %	50 %	525949916
627	NC_021847	CTT	2	6	35642	35647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
628	NC_021847	TTC	2	6	35664	35669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
629	NC_021847	CTT	2	6	35721	35726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
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633	NC_021847	CTT	2	6	35885	35890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
634	NC_021847	CTT	2	6	35906	35911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
635	NC_021847	TTC	2	6	35955	35960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
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639	NC_021847	ACT	2	6	36265	36270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952314
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