MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021822	ATAG	2	8	158541	158548	50 %	25 %	25 %	0 %	525852976
3002	NC_021822	GTCA	2	8	158566	158573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_021822	TGGAAA	2	12	158600	158611	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525852977
3004	NC_021822	TTG	2	6	158621	158626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852977
3005	NC_021822	AAATC	2	10	158627	158636	60 %	20 %	0 %	20 %	525852977
3006	NC_021822	TC	3	6	158729	158734	0 %	50 %	0 %	50 %	525852977
3007	NC_021822	CAA	2	6	158784	158789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852977
3008	NC_021822	ATG	2	6	158794	158799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852977
3009	NC_021822	AGA	2	6	158811	158816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852977
3010	NC_021822	GAA	2	6	158857	158862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852977
3011	NC_021822	TGT	2	6	158914	158919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852977
3012	NC_021822	TCA	2	6	158991	158996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_021822	GTTTT	2	10	159037	159046	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021822	T	6	6	159043	159048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021822	GGT	2	6	159093	159098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854217
3016	NC_021822	GT	3	6	159097	159102	0 %	50 %	50 %	0 %	525854217
3017	NC_021822	CTC	2	6	159123	159128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854217
3018	NC_021822	AGC	2	6	159130	159135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854217
3019	NC_021822	CTT	2	6	159158	159163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854217
3020	NC_021822	AATC	2	8	159264	159271	50 %	25 %	0 %	25 %	525854217
3021	NC_021822	GTTT	2	8	159281	159288	0 %	75 %	25 %	0 %	525854217
3022	NC_021822	TA	3	6	159319	159324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021822	ACA	2	6	159436	159441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852978
3024	NC_021822	ATGAC	2	10	159495	159504	40 %	20 %	20 %	20 %	525852978
3025	NC_021822	GA	3	6	159523	159528	50 %	0 %	50 %	0 %	525852978
3026	NC_021822	CTA	2	6	159697	159702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852978
3027	NC_021822	GAGCC	2	10	159721	159730	20 %	0 %	40 %	40 %	525852978
3028	NC_021822	TTG	2	6	159731	159736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852978
3029	NC_021822	ATT	2	6	159759	159764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852978
3030	NC_021822	GTTCT	2	10	159807	159816	0 %	60 %	20 %	20 %	525852978
3031	NC_021822	TGA	2	6	160010	160015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021822	CTT	2	6	160019	160024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_021822	TTGA	2	8	160066	160073	25 %	50 %	25 %	0 %	525852979
3034	NC_021822	GCTAT	2	10	160078	160087	20 %	40 %	20 %	20 %	525852979
3035	NC_021822	TGG	2	6	160125	160130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852979
3036	NC_021822	AGT	2	6	160145	160150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852979
3037	NC_021822	TGG	2	6	160218	160223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852979
3038	NC_021822	T	6	6	160313	160318	0 %	100 %	0 %	0 %	525852979
3039	NC_021822	ACG	2	6	160374	160379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3040	NC_021822	CCA	2	6	160392	160397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852979
3041	NC_021822	TTTGC	2	10	160406	160415	0 %	60 %	20 %	20 %	525852979
3042	NC_021822	AAT	2	6	160457	160462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852979
3043	NC_021822	CGT	2	6	160470	160475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3044	NC_021822	GCA	2	6	160603	160608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3045	NC_021822	GAGT	2	8	160619	160626	25 %	25 %	50 %	0 %	525852979
3046	NC_021822	CTT	2	6	160631	160636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852979
3047	NC_021822	TCT	2	6	160750	160755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852979
3048	NC_021822	TGC	2	6	160756	160761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3049	NC_021822	TCTG	2	8	160819	160826	0 %	50 %	25 %	25 %	525852979
3050	NC_021822	GTT	2	6	160910	160915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852979
3051	NC_021822	TGG	2	6	160924	160929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852979
3052	NC_021822	GC	3	6	160941	160946	0 %	0 %	50 %	50 %	525852979
3053	NC_021822	GAT	2	6	161060	161065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852979
3054	NC_021822	GT	3	6	161135	161140	0 %	50 %	50 %	0 %	525852979
3055	NC_021822	CAG	2	6	161160	161165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3056	NC_021822	T	6	6	161174	161179	0 %	100 %	0 %	0 %	525852979
3057	NC_021822	CAG	2	6	161182	161187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3058	NC_021822	CGG	2	6	161213	161218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852979
3059	NC_021822	TGT	2	6	161290	161295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852979
3060	NC_021822	TGA	2	6	161299	161304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852979
3061	NC_021822	GGA	2	6	161338	161343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525852979
3062	NC_021822	CAC	2	6	161348	161353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852979
3063	NC_021822	CGT	2	6	161372	161377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3064	NC_021822	CGC	2	6	161420	161425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852979
3065	NC_021822	CGA	2	6	161464	161469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
3066	NC_021822	ACTC	2	8	161509	161516	25 %	25 %	0 %	50 %	525852980
3067	NC_021822	TCTT	2	8	161563	161570	0 %	75 %	0 %	25 %	525852980
3068	NC_021822	TCAA	2	8	161584	161591	50 %	25 %	0 %	25 %	525852980
3069	NC_021822	CGCT	2	8	161660	161667	0 %	25 %	25 %	50 %	525852980
3070	NC_021822	GC	3	6	161772	161777	0 %	0 %	50 %	50 %	525852980
3071	NC_021822	ACG	2	6	161863	161868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3072	NC_021822	CAT	2	6	161991	161996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852980
3073	NC_021822	CTA	2	6	162002	162007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852980
3074	NC_021822	TAA	2	6	162031	162036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852980
3075	NC_021822	CTG	2	6	162069	162074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3076	NC_021822	CAG	2	6	162174	162179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3077	NC_021822	CGT	2	6	162185	162190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3078	NC_021822	GCC	2	6	162312	162317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852980
3079	NC_021822	TGCC	2	8	162344	162351	0 %	25 %	25 %	50 %	525852980
3080	NC_021822	TCA	2	6	162364	162369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852980
3081	NC_021822	CTT	2	6	162395	162400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852980
3082	NC_021822	TCG	2	6	162460	162465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3083	NC_021822	TCG	2	6	162505	162510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3084	NC_021822	CAA	2	6	162605	162610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852980
3085	NC_021822	GGC	2	6	162678	162683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852980
3086	NC_021822	CGT	2	6	162749	162754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3087	NC_021822	AG	3	6	162780	162785	50 %	0 %	50 %	0 %	525852980
3088	NC_021822	CTTGC	2	10	162786	162795	0 %	40 %	20 %	40 %	525852980
3089	NC_021822	T	7	7	162797	162803	0 %	100 %	0 %	0 %	525852980
3090	NC_021822	GC	3	6	162860	162865	0 %	0 %	50 %	50 %	525852980
3091	NC_021822	GTTT	2	8	162868	162875	0 %	75 %	25 %	0 %	525852980
3092	NC_021822	GCA	2	6	162974	162979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852980
3093	NC_021822	GAA	2	6	163006	163011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852980
3094	NC_021822	CGC	2	6	163032	163037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852980
3095	NC_021822	AAG	2	6	163100	163105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021822	A	6	6	163133	163138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021822	AAC	2	6	163240	163245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021822	GC	3	6	163306	163311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_021822	ACA	2	6	163317	163322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_021822	GAA	2	6	163347	163352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021822	AAC	2	6	163361	163366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852981
3102	NC_021822	ATT	2	6	163400	163405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852981
3103	NC_021822	TGGC	2	8	163416	163423	0 %	25 %	50 %	25 %	525852981
3104	NC_021822	CTT	2	6	163564	163569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852981
3105	NC_021822	ACG	2	6	163590	163595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852981
3106	NC_021822	A	6	6	163617	163622	100 %	0 %	0 %	0 %	525852981
3107	NC_021822	CAC	2	6	163731	163736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852981
3108	NC_021822	TGCC	2	8	163761	163768	0 %	25 %	25 %	50 %	525852981
3109	NC_021822	GGGA	2	8	163798	163805	25 %	0 %	75 %	0 %	525852981
3110	NC_021822	TGG	2	6	163894	163899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852981
3111	NC_021822	GAT	2	6	163922	163927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852981
3112	NC_021822	GTT	2	6	163954	163959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852981
3113	NC_021822	GCA	2	6	163997	164002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852981
3114	NC_021822	GGA	2	6	164003	164008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525852981
3115	NC_021822	TGT	2	6	164082	164087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852981
3116	NC_021822	TGA	2	6	164089	164094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852981
3117	NC_021822	GC	4	8	164137	164144	0 %	0 %	50 %	50 %	525852981
3118	NC_021822	CGG	2	6	164151	164156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852981
3119	NC_021822	CG	3	6	164201	164206	0 %	0 %	50 %	50 %	525852981
3120	NC_021822	TCG	2	6	164339	164344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852981
3121	NC_021822	AAG	2	6	164352	164357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852981
3122	NC_021822	GCA	2	6	164363	164368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852981
3123	NC_021822	GATT	2	8	164395	164402	25 %	50 %	25 %	0 %	525852981
3124	NC_021822	ATAG	2	8	164432	164439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021822	GAG	2	6	164469	164474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021822	CTT	2	6	164518	164523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852982
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3130	NC_021822	GCT	2	6	164787	164792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852982
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3132	NC_021822	TCT	2	6	164835	164840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852982
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3134	NC_021822	CTG	2	6	164881	164886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852982
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3177	NC_021822	TAAT	2	8	166373	166380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3180	NC_021822	TAT	2	6	166486	166491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3183	NC_021822	GTGA	2	8	166545	166552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3184	NC_021822	TGG	2	6	166558	166563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3185	NC_021822	TGA	2	6	166635	166640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852984
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3229	NC_021822	ATTT	2	8	169251	169258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_021822	TAATT	2	10	169276	169285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_021822	CTC	2	6	169287	169292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3232	NC_021822	T	6	6	169299	169304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_021822	ATG	2	6	169315	169320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_021822	ATT	2	6	169324	169329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_021822	GAT	2	6	169415	169420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_021822	TAC	2	6	169425	169430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_021822	CAG	2	6	169463	169468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_021822	GCA	2	6	169490	169495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852986
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3248	NC_021822	AAC	2	6	169979	169984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_021822	CT	3	6	170041	170046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_021822	GTC	2	6	170058	170063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_021822	ATGCCA	2	12	170077	170088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_021822	ATT	2	6	170092	170097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_021822	AG	3	6	170117	170122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_021822	TAC	2	6	170221	170226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852987
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3257	NC_021822	GTG	2	6	170270	170275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852987
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3259	NC_021822	TTA	2	6	170460	170465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852987
3260	NC_021822	GCT	2	6	170548	170553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_021822	TCA	2	6	170588	170593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_021822	GAGC	2	8	170599	170606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3263	NC_021822	CAT	2	6	170683	170688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852988
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3265	NC_021822	GCT	2	6	170765	170770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852988
3266	NC_021822	TGA	2	6	170785	170790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852988
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3268	NC_021822	TTG	2	6	171005	171010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852988
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3270	NC_021822	ATG	2	6	171146	171151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852988
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3272	NC_021822	TCG	2	6	171239	171244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852988
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3278	NC_021822	TGC	2	6	171530	171535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852989
3279	NC_021822	TGAC	2	8	171549	171556	25 %	25 %	25 %	25 %	525852989
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3281	NC_021822	A	6	6	171653	171658	100 %	0 %	0 %	0 %	525852989
3282	NC_021822	ATGC	2	8	171719	171726	25 %	25 %	25 %	25 %	525852989
3283	NC_021822	TTCA	2	8	171750	171757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3284	NC_021822	GTTT	2	8	171795	171802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3285	NC_021822	T	7	7	171800	171806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3286	NC_021822	AT	3	6	171895	171900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3287	NC_021822	ATTA	2	8	172004	172011	50 %	50 %	0 %	0 %	525852990
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3305	NC_021822	TAATCA	2	12	173114	173125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525852990
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3322	NC_021822	CAAG	2	8	174088	174095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3323	NC_021822	ATG	2	6	174099	174104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3335	NC_021822	TGTC	2	8	174848	174855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3336	NC_021822	A	6	6	174890	174895	100 %	0 %	0 %	0 %	525852993
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3351	NC_021822	TCAA	2	8	175644	175651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3352	NC_021822	GTAA	2	8	175655	175662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3353	NC_021822	GTT	2	6	175666	175671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3354	NC_021822	A	6	6	175776	175781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3355	NC_021822	TTAG	2	8	175839	175846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3356	NC_021822	TA	3	6	175858	175863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3357	NC_021822	GAC	2	6	175896	175901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852994
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3359	NC_021822	CAT	2	6	175920	175925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852994
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3362	NC_021822	TCTG	2	8	176037	176044	0 %	50 %	25 %	25 %	525852994
3363	NC_021822	TGC	2	6	176048	176053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852994
3364	NC_021822	CAAT	2	8	176249	176256	50 %	25 %	0 %	25 %	525852994
3365	NC_021822	GGAA	2	8	176264	176271	50 %	0 %	50 %	0 %	525852994
3366	NC_021822	CAT	3	9	176289	176297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852994
3367	NC_021822	AGCGC	2	10	176469	176478	20 %	0 %	40 %	40 %	525852994
3368	NC_021822	GA	3	6	176547	176552	50 %	0 %	50 %	0 %	525852994
3369	NC_021822	TCA	2	6	176601	176606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852994
3370	NC_021822	A	6	6	176657	176662	100 %	0 %	0 %	0 %	525852994
3371	NC_021822	GAT	2	6	176802	176807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852994
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3373	NC_021822	AGGCG	2	10	176982	176991	20 %	0 %	60 %	20 %	525852994
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3381	NC_021822	TGAT	2	8	177349	177356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_021822	AAAG	2	8	177521	177528	75 %	0 %	25 %	0 %	525852995
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3496	NC_021822	TTCG	2	8	182804	182811	0 %	50 %	25 %	25 %	525853000
3497	NC_021822	TCT	2	6	182872	182877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853000
3498	NC_021822	ATG	2	6	182951	182956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853000
3499	NC_021822	GCT	2	6	182958	182963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853000
3500	NC_021822	TGG	2	6	182979	182984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853000

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