MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021822	TGA	2	6	105538	105543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852926
2002	NC_021822	TTG	2	6	105600	105605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852926
2003	NC_021822	ACA	2	6	105616	105621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852926
2004	NC_021822	ACGC	2	8	105640	105647	25 %	0 %	25 %	50 %	525852926
2005	NC_021822	GCTTT	2	10	105648	105657	0 %	60 %	20 %	20 %	525852926
2006	NC_021822	TGC	2	6	105824	105829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852926
2007	NC_021822	CGC	2	6	106003	106008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852926
2008	NC_021822	GTC	2	6	106031	106036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852926
2009	NC_021822	GAT	2	6	106037	106042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852926
2010	NC_021822	CTT	2	6	106156	106161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852926
2011	NC_021822	TGG	2	6	106244	106249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852926
2012	NC_021822	CAC	2	6	106303	106308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852926
2013	NC_021822	GGAA	2	8	106339	106346	50 %	0 %	50 %	0 %	525852926
2014	NC_021822	ACC	2	6	106359	106364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852926
2015	NC_021822	GC	3	6	106385	106390	0 %	0 %	50 %	50 %	525852926
2016	NC_021822	GCC	2	6	106421	106426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852926
2017	NC_021822	ACA	2	6	106435	106440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852926
2018	NC_021822	CGC	2	6	106453	106458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852926
2019	NC_021822	ACG	2	6	106511	106516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852926
2020	NC_021822	GTT	2	6	106595	106600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852926
2021	NC_021822	TGA	2	6	106695	106700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852926
2022	NC_021822	TGCG	2	8	106734	106741	0 %	25 %	50 %	25 %	525852926
2023	NC_021822	CT	3	6	106842	106847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2024	NC_021822	GCT	2	6	106858	106863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_021822	CTG	2	6	106920	106925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852927
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2027	NC_021822	TGA	2	6	107067	107072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852927
2028	NC_021822	TCA	2	6	107087	107092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852927
2029	NC_021822	AG	3	6	107114	107119	50 %	0 %	50 %	0 %	525852927
2030	NC_021822	GCC	2	6	107179	107184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852927
2031	NC_021822	GTTT	2	8	107342	107349	0 %	75 %	25 %	0 %	525852927
2032	NC_021822	CAAAGC	2	12	107358	107369	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525852927
2033	NC_021822	TTTG	2	8	107389	107396	0 %	75 %	25 %	0 %	525852927
2034	NC_021822	CCG	2	6	107447	107452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852927
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2036	NC_021822	GCA	2	6	107498	107503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852927
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2038	NC_021822	CATGG	2	10	107646	107655	20 %	20 %	40 %	20 %	525852927
2039	NC_021822	TAA	2	6	107716	107721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852927
2040	NC_021822	TTGG	2	8	107809	107816	0 %	50 %	50 %	0 %	525852927
2041	NC_021822	TGT	2	6	107862	107867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852927
2042	NC_021822	TCA	2	6	107870	107875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852927
2043	NC_021822	AGT	2	6	107945	107950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852927
2044	NC_021822	AAT	2	6	107983	107988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_021822	ATG	2	6	108236	108241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852928
2046	NC_021822	TGA	2	6	108252	108257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852928
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2048	NC_021822	TC	3	6	108279	108284	0 %	50 %	0 %	50 %	525852928
2049	NC_021822	TGCT	2	8	108285	108292	0 %	50 %	25 %	25 %	525852928
2050	NC_021822	CAATG	2	10	108295	108304	40 %	20 %	20 %	20 %	525852928
2051	NC_021822	AAC	2	6	108455	108460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852928
2052	NC_021822	TCT	2	6	108523	108528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852928
2053	NC_021822	AC	3	6	108537	108542	50 %	0 %	0 %	50 %	525852928
2054	NC_021822	TCAA	2	8	108583	108590	50 %	25 %	0 %	25 %	525852928
2055	NC_021822	ATG	2	6	108609	108614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852928
2056	NC_021822	GTTT	2	8	108629	108636	0 %	75 %	25 %	0 %	525852928
2057	NC_021822	CTT	2	6	108738	108743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852928
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2061	NC_021822	T	6	6	109292	109297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_021822	CAG	2	6	109405	109410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852929
2063	NC_021822	TGA	2	6	109449	109454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852929
2064	NC_021822	TGG	2	6	109499	109504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852929
2065	NC_021822	TCT	2	6	109517	109522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852929
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2072	NC_021822	TA	3	6	109850	109855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_021822	GT	4	8	109865	109872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2075	NC_021822	GTTT	2	8	109979	109986	0 %	75 %	25 %	0 %	525852930
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2093	NC_021822	GTTTG	2	10	111093	111102	0 %	60 %	40 %	0 %	525852931
2094	NC_021822	TGG	2	6	111104	111109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852931
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2101	NC_021822	TGG	2	6	111459	111464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852931
2102	NC_021822	TGA	2	6	111530	111535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852931
2103	NC_021822	T	6	6	111616	111621	0 %	100 %	0 %	0 %	525852931
2104	NC_021822	GCG	2	6	111637	111642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852931
2105	NC_021822	CGAC	2	8	111740	111747	25 %	0 %	25 %	50 %	525852931
2106	NC_021822	GTG	2	6	111760	111765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852931
2107	NC_021822	CAT	2	6	111801	111806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852931
2108	NC_021822	A	6	6	111856	111861	100 %	0 %	0 %	0 %	525852931
2109	NC_021822	CAA	2	6	111909	111914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852931
2110	NC_021822	CT	3	6	111996	112001	0 %	50 %	0 %	50 %	525852931
2111	NC_021822	CT	3	6	112092	112097	0 %	50 %	0 %	50 %	525852931
2112	NC_021822	GTG	2	6	112213	112218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852931
2113	NC_021822	TTTGGG	2	12	112242	112253	0 %	50 %	50 %	0 %	525852931
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2119	NC_021822	TTGT	2	8	112501	112508	0 %	75 %	25 %	0 %	525852931
2120	NC_021822	ACC	2	6	112519	112524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852931
2121	NC_021822	GTA	2	6	112534	112539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852931
2122	NC_021822	TGA	2	6	112631	112636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852931
2123	NC_021822	TTG	2	6	112763	112768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852932
2124	NC_021822	CTACG	2	10	112942	112951	20 %	20 %	20 %	40 %	525852932
2125	NC_021822	GC	3	6	113056	113061	0 %	0 %	50 %	50 %	525852932
2126	NC_021822	AGAC	2	8	113121	113128	50 %	0 %	25 %	25 %	525852932
2127	NC_021822	GTG	2	6	113131	113136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852932
2128	NC_021822	TTTGA	2	10	113185	113194	20 %	60 %	20 %	0 %	525852932
2129	NC_021822	TGGTG	2	10	113229	113238	0 %	40 %	60 %	0 %	525852932
2130	NC_021822	AGA	2	6	113243	113248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852932
2131	NC_021822	CTTG	2	8	113274	113281	0 %	50 %	25 %	25 %	525852932
2132	NC_021822	GTT	2	6	113329	113334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852932
2133	NC_021822	ACTA	2	8	113341	113348	50 %	25 %	0 %	25 %	525852932
2134	NC_021822	TTGA	2	8	113365	113372	25 %	50 %	25 %	0 %	525852932
2135	NC_021822	TTTGT	2	10	113479	113488	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_021822	T	6	6	113510	113515	0 %	100 %	0 %	0 %	525852933
2137	NC_021822	GCTG	2	8	113553	113560	0 %	25 %	50 %	25 %	525852933
2138	NC_021822	GGCAT	2	10	113592	113601	20 %	20 %	40 %	20 %	525852933
2139	NC_021822	TCG	2	6	113743	113748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852933
2140	NC_021822	ATG	2	6	113817	113822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852933
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2142	NC_021822	TGG	2	6	114010	114015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852933
2143	NC_021822	ACT	2	6	114032	114037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852933
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2147	NC_021822	ATG	2	6	114210	114215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852933
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2150	NC_021822	GGCA	2	8	114380	114387	25 %	0 %	50 %	25 %	525852933
2151	NC_021822	TGT	2	6	114391	114396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852933
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2161	NC_021822	CGT	2	6	115243	115248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852935
2162	NC_021822	CGT	2	6	115278	115283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852935
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2164	NC_021822	T	6	6	115409	115414	0 %	100 %	0 %	0 %	525852935
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2179	NC_021822	GA	3	6	116065	116070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2180	NC_021822	AGG	2	6	116087	116092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2181	NC_021822	AATT	2	8	116122	116129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2182	NC_021822	TGAG	2	8	116186	116193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2183	NC_021822	T	6	6	116230	116235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2184	NC_021822	ATGA	2	8	116313	116320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2185	NC_021822	AAGC	2	8	116360	116367	50 %	0 %	25 %	25 %	525852936
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2194	NC_021822	GCT	2	6	116618	116623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852936
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2197	NC_021822	GTC	2	6	116762	116767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852936
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2213	NC_021822	TGGC	2	8	117686	117693	0 %	25 %	50 %	25 %	525852936
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2216	NC_021822	GAT	2	6	117901	117906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854215
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2219	NC_021822	CA	3	6	117998	118003	50 %	0 %	0 %	50 %	525854215
2220	NC_021822	ACG	2	6	118058	118063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854215
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2223	NC_021822	CTG	2	6	118103	118108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854215
2224	NC_021822	CTAT	2	8	118157	118164	25 %	50 %	0 %	25 %	525854215
2225	NC_021822	GC	3	6	118226	118231	0 %	0 %	50 %	50 %	525854215
2226	NC_021822	AGA	2	6	118305	118310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854215
2227	NC_021822	GAT	2	6	118329	118334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854215
2228	NC_021822	CG	3	6	118335	118340	0 %	0 %	50 %	50 %	525854215
2229	NC_021822	CTG	2	6	118396	118401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854215
2230	NC_021822	TGG	2	6	118476	118481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854215
2231	NC_021822	TAAACC	2	12	118517	118528	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525854215
2232	NC_021822	TGA	2	6	118629	118634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854215
2233	NC_021822	TTG	2	6	118652	118657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854215
2234	NC_021822	GCG	2	6	118696	118701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854215
2235	NC_021822	AGGCA	2	10	118782	118791	40 %	0 %	40 %	20 %	525854215
2236	NC_021822	GGTT	2	8	118800	118807	0 %	50 %	50 %	0 %	525854215
2237	NC_021822	AAC	2	6	118873	118878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854215
2238	NC_021822	GCA	2	6	118942	118947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854215
2239	NC_021822	TGAC	2	8	118958	118965	25 %	25 %	25 %	25 %	525854215
2240	NC_021822	TTTC	2	8	119032	119039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2241	NC_021822	TTC	2	6	119095	119100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2242	NC_021822	GGT	2	6	119259	119264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_021822	CAT	2	6	119278	119283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_021822	T	6	6	119300	119305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_021822	TTCC	2	8	119308	119315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2246	NC_021822	AGC	2	6	119374	119379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2369	NC_021822	ATT	2	6	125529	125534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2496	NC_021822	GGC	2	6	131271	131276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852948
2497	NC_021822	GAC	2	6	131292	131297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852948
2498	NC_021822	GT	3	6	131326	131331	0 %	50 %	50 %	0 %	525852949
2499	NC_021822	GTT	2	6	131339	131344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852949
2500	NC_021822	TGAC	2	8	131350	131357	25 %	25 %	25 %	25 %	525852949

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