MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_021822	TCAGC	2	10	1174980	1174989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22502	NC_021822	TCA	3	9	1175011	1175019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853698
22503	NC_021822	GCC	2	6	1175040	1175045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853698
22504	NC_021822	TCT	2	6	1175051	1175056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
22505	NC_021822	AAG	2	6	1175109	1175114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853698
22506	NC_021822	CA	4	8	1175115	1175122	50 %	0 %	0 %	50 %	525853698
22507	NC_021822	ACC	2	6	1175127	1175132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853698
22508	NC_021822	CGAG	2	8	1175147	1175154	25 %	0 %	50 %	25 %	525853698
22509	NC_021822	GCG	2	6	1175179	1175184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853698
22510	NC_021822	TTC	2	6	1175335	1175340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
22511	NC_021822	ACC	2	6	1175443	1175448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853698
22512	NC_021822	CCA	2	6	1175489	1175494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853698
22513	NC_021822	CAACGC	2	12	1175514	1175525	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525853698
22514	NC_021822	CTT	2	6	1175558	1175563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
22515	NC_021822	CAG	2	6	1175612	1175617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22516	NC_021822	CAC	2	6	1175645	1175650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853698
22517	NC_021822	ATG	2	6	1175680	1175685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
22518	NC_021822	TGT	2	6	1175699	1175704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853698
22519	NC_021822	GAC	2	6	1175926	1175931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22520	NC_021822	GTT	2	6	1175945	1175950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853698
22521	NC_021822	CG	3	6	1175994	1175999	0 %	0 %	50 %	50 %	525853698
22522	NC_021822	TGC	2	6	1176039	1176044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22523	NC_021822	ATC	2	6	1176049	1176054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853698
22524	NC_021822	AGC	2	6	1176126	1176131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22525	NC_021822	GGC	2	6	1176151	1176156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853698
22526	NC_021822	GCT	2	6	1176193	1176198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22527	NC_021822	AGC	2	6	1176213	1176218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22528	NC_021822	GCA	2	6	1176307	1176312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22529	NC_021822	TTC	2	6	1176363	1176368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
22530	NC_021822	TCA	2	6	1176380	1176385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853698
22531	NC_021822	CAA	2	6	1176447	1176452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853698
22532	NC_021822	TCT	2	6	1176463	1176468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
22533	NC_021822	GTC	2	6	1176490	1176495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22534	NC_021822	GAA	2	6	1176501	1176506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853698
22535	NC_021822	GCA	2	6	1176514	1176519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22536	NC_021822	GAA	2	6	1176531	1176536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853698
22537	NC_021822	GTA	2	6	1176592	1176597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
22538	NC_021822	GCC	2	6	1176645	1176650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853698
22539	NC_021822	TTGA	2	8	1176700	1176707	25 %	50 %	25 %	0 %	525853698
22540	NC_021822	ATG	2	6	1176754	1176759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
22541	NC_021822	CCA	2	6	1176935	1176940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853698
22542	NC_021822	ATG	2	6	1177006	1177011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
22543	NC_021822	TAGG	2	8	1177083	1177090	25 %	25 %	50 %	0 %	525853698
22544	NC_021822	CGA	2	6	1177154	1177159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22545	NC_021822	GTCGT	2	10	1177165	1177174	0 %	40 %	40 %	20 %	525853698
22546	NC_021822	CTT	2	6	1177335	1177340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
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22548	NC_021822	CTT	2	6	1177466	1177471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
22549	NC_021822	GCA	2	6	1177489	1177494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22550	NC_021822	CAG	2	6	1177505	1177510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22551	NC_021822	AGC	2	6	1177536	1177541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
22552	NC_021822	T	6	6	1177577	1177582	0 %	100 %	0 %	0 %	525853698
22553	NC_021822	CAC	3	9	1177613	1177621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853698
22554	NC_021822	TTAA	2	8	1177690	1177697	50 %	50 %	0 %	0 %	525853698
22555	NC_021822	ATCGG	2	10	1177963	1177972	20 %	20 %	40 %	20 %	525853698
22556	NC_021822	GTA	2	6	1178010	1178015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
22557	NC_021822	GAT	2	6	1178103	1178108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
22558	NC_021822	CCT	2	6	1178164	1178169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853699
22559	NC_021822	TG	3	6	1178235	1178240	0 %	50 %	50 %	0 %	525853699
22560	NC_021822	ATG	3	9	1178274	1178282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853699
22561	NC_021822	ACG	2	6	1178315	1178320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853699
22562	NC_021822	ACG	2	6	1178384	1178389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853699
22563	NC_021822	ACG	2	6	1178394	1178399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853699
22564	NC_021822	ACGC	2	8	1178482	1178489	25 %	0 %	25 %	50 %	525853699
22565	NC_021822	TCTAGT	2	12	1178571	1178582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525853699
22566	NC_021822	CGT	2	6	1178702	1178707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853699
22567	NC_021822	CG	3	6	1178853	1178858	0 %	0 %	50 %	50 %	525853699
22568	NC_021822	TGC	2	6	1178902	1178907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853699
22569	NC_021822	TGG	2	6	1178934	1178939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853699
22570	NC_021822	GCT	2	6	1178982	1178987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853699
22571	NC_021822	AGA	2	6	1179014	1179019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853699
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22573	NC_021822	CTT	2	6	1179064	1179069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853699
22574	NC_021822	CTGTG	2	10	1179101	1179110	0 %	40 %	40 %	20 %	525853699
22575	NC_021822	TCT	2	6	1179120	1179125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853699
22576	NC_021822	AT	3	6	1179144	1179149	50 %	50 %	0 %	0 %	525853699
22577	NC_021822	CT	4	8	1179210	1179217	0 %	50 %	0 %	50 %	525853699
22578	NC_021822	ATT	2	6	1179224	1179229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853699
22579	NC_021822	GCC	2	6	1179261	1179266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853699
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22581	NC_021822	AC	3	6	1179333	1179338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22582	NC_021822	ACAG	2	8	1179346	1179353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22583	NC_021822	TAAT	2	8	1179401	1179408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22584	NC_021822	TTCA	2	8	1179457	1179464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22585	NC_021822	ATC	2	6	1179488	1179493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22586	NC_021822	TCA	2	6	1179539	1179544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22587	NC_021822	TTG	2	6	1179557	1179562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22588	NC_021822	T	7	7	1179638	1179644	0 %	100 %	0 %	0 %	525853700
22589	NC_021822	A	8	8	1179645	1179652	100 %	0 %	0 %	0 %	525853700
22590	NC_021822	TGG	2	6	1179743	1179748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853700
22591	NC_021822	AGGT	2	8	1179776	1179783	25 %	25 %	50 %	0 %	525853700
22592	NC_021822	CGA	2	6	1179864	1179869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853700
22593	NC_021822	TGCA	2	8	1179896	1179903	25 %	25 %	25 %	25 %	525853700
22594	NC_021822	CG	3	6	1180013	1180018	0 %	0 %	50 %	50 %	525853700
22595	NC_021822	GAC	2	6	1180129	1180134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853700
22596	NC_021822	CGTT	2	8	1180155	1180162	0 %	50 %	25 %	25 %	525853700
22597	NC_021822	T	6	6	1180209	1180214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22598	NC_021822	AATTG	2	10	1180241	1180250	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22599	NC_021822	T	6	6	1180277	1180282	0 %	100 %	0 %	0 %	525853701
22600	NC_021822	CAT	2	6	1180328	1180333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853701
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22602	NC_021822	GGCAA	2	10	1180393	1180402	40 %	0 %	40 %	20 %	525853701
22603	NC_021822	CG	3	6	1180419	1180424	0 %	0 %	50 %	50 %	525853701
22604	NC_021822	ACC	2	6	1180433	1180438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853701
22605	NC_021822	TGT	2	6	1180534	1180539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853701
22606	NC_021822	TTCAT	2	10	1180590	1180599	20 %	60 %	0 %	20 %	525853701
22607	NC_021822	TTC	2	6	1180628	1180633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853701
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22609	NC_021822	GAA	2	6	1180712	1180717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853701
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22612	NC_021822	CAAA	2	8	1180948	1180955	75 %	0 %	0 %	25 %	525853701
22613	NC_021822	CAC	2	6	1180960	1180965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853701
22614	NC_021822	TTC	2	6	1180973	1180978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853701
22615	NC_021822	TCAA	2	8	1181028	1181035	50 %	25 %	0 %	25 %	525853701
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22617	NC_021822	GGT	2	6	1181105	1181110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853701
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22655	NC_021822	ATT	2	6	1183134	1183139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22732	NC_021822	A	6	6	1187950	1187955	100 %	0 %	0 %	0 %	525853706
22733	NC_021822	CCA	2	6	1187982	1187987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853706
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22966	NC_021822	TCG	2	6	1199329	1199334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22967	NC_021822	GAT	2	6	1199435	1199440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853716
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22997	NC_021822	CAA	2	6	1201204	1201209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853718
22998	NC_021822	CTC	2	6	1201233	1201238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853718
22999	NC_021822	AAG	2	6	1201271	1201276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853718
23000	NC_021822	TAA	2	6	1201342	1201347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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