MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021822	TGT	2	6	78982	78987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021822	TTTA	2	8	78998	79005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021822	A	6	6	79073	79078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021822	AAT	2	6	79166	79171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021822	GCA	2	6	79229	79234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852907
1506	NC_021822	CA	3	6	79233	79238	50 %	0 %	0 %	50 %	525852907
1507	NC_021822	GAT	2	6	79247	79252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852907
1508	NC_021822	CGC	2	6	79255	79260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852907
1509	NC_021822	TGT	2	6	79267	79272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852907
1510	NC_021822	CAT	2	6	79294	79299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852907
1511	NC_021822	TTGT	2	8	79375	79382	0 %	75 %	25 %	0 %	525852907
1512	NC_021822	GAC	2	6	79434	79439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852907
1513	NC_021822	AGA	2	6	79538	79543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852907
1514	NC_021822	A	6	6	79760	79765	100 %	0 %	0 %	0 %	525852907
1515	NC_021822	G	6	6	79787	79792	0 %	0 %	100 %	0 %	525852907
1516	NC_021822	CGCT	2	8	79794	79801	0 %	25 %	25 %	50 %	525852907
1517	NC_021822	GGT	2	6	79878	79883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852907
1518	NC_021822	TGA	2	6	79958	79963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852907
1519	NC_021822	TCA	2	6	79989	79994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852907
1520	NC_021822	TTG	2	6	80043	80048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852907
1521	NC_021822	AAC	2	6	80103	80108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021822	AAT	2	6	80124	80129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852908
1523	NC_021822	A	6	6	80134	80139	100 %	0 %	0 %	0 %	525852908
1524	NC_021822	GAT	2	6	80188	80193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852908
1525	NC_021822	AAG	2	6	80225	80230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852908
1526	NC_021822	CGA	2	6	80273	80278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1527	NC_021822	AAG	2	6	80360	80365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852908
1528	NC_021822	TAA	2	6	80424	80429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852908
1529	NC_021822	GAC	3	9	80458	80466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1530	NC_021822	TGC	2	6	80508	80513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1531	NC_021822	AAG	2	6	80525	80530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852908
1532	NC_021822	CAA	2	6	80550	80555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1533	NC_021822	AGA	2	6	80556	80561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852908
1534	NC_021822	AAG	2	6	80590	80595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852908
1535	NC_021822	CTC	2	6	80609	80614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525852908
1536	NC_021822	TGA	2	6	80679	80684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852908
1537	NC_021822	CAC	2	6	80693	80698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852908
1538	NC_021822	TCT	2	6	80733	80738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852908
1539	NC_021822	ATA	2	6	80777	80782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852908
1540	NC_021822	CTA	2	6	80859	80864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1541	NC_021822	AAGTG	2	10	80880	80889	40 %	20 %	40 %	0 %	525852908
1542	NC_021822	TGA	2	6	80928	80933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852908
1543	NC_021822	CAC	2	6	80952	80957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852908
1544	NC_021822	CGA	2	6	80960	80965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1545	NC_021822	AATA	2	8	80986	80993	75 %	25 %	0 %	0 %	525852908
1546	NC_021822	GAAGA	2	10	81073	81082	60 %	0 %	40 %	0 %	525852908
1547	NC_021822	GTT	2	6	81087	81092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852908
1548	NC_021822	ATCG	2	8	81111	81118	25 %	25 %	25 %	25 %	525852908
1549	NC_021822	ATC	2	6	81313	81318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1550	NC_021822	CAG	2	6	81441	81446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1551	NC_021822	GGC	2	6	81498	81503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852908
1552	NC_021822	AGA	2	6	81555	81560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852908
1553	NC_021822	AGC	2	6	81576	81581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1554	NC_021822	ATG	2	6	81617	81622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852908
1555	NC_021822	GGT	2	6	81639	81644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852908
1556	NC_021822	AAC	2	6	81682	81687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1557	NC_021822	CGT	2	6	81704	81709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1558	NC_021822	CAAC	2	8	81719	81726	50 %	0 %	0 %	50 %	525852908
1559	NC_021822	AGC	2	6	81855	81860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1560	NC_021822	ACT	2	6	81962	81967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1561	NC_021822	AAC	2	6	82000	82005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1562	NC_021822	GCG	2	6	82084	82089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852908
1563	NC_021822	TTC	2	6	82131	82136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852908
1564	NC_021822	GCGA	2	8	82177	82184	25 %	0 %	50 %	25 %	525852908
1565	NC_021822	CAA	2	6	82234	82239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1566	NC_021822	CAA	2	6	82260	82265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1567	NC_021822	ACA	2	6	82271	82276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1568	NC_021822	GT	3	6	82288	82293	0 %	50 %	50 %	0 %	525852908
1569	NC_021822	TGAAG	2	10	82296	82305	40 %	20 %	40 %	0 %	525852908
1570	NC_021822	CCG	2	6	82367	82372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852908
1571	NC_021822	TGA	2	6	82380	82385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852908
1572	NC_021822	TAC	2	6	82423	82428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1573	NC_021822	TGAA	2	8	82439	82446	50 %	25 %	25 %	0 %	525852908
1574	NC_021822	AGA	2	6	82533	82538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852908
1575	NC_021822	GAC	2	6	82605	82610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1576	NC_021822	ATT	2	6	82614	82619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852908
1577	NC_021822	A	6	6	82846	82851	100 %	0 %	0 %	0 %	525852908
1578	NC_021822	TTC	2	6	82861	82866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852908
1579	NC_021822	TG	3	6	82897	82902	0 %	50 %	50 %	0 %	525852908
1580	NC_021822	GGCA	2	8	82914	82921	25 %	0 %	50 %	25 %	525852908
1581	NC_021822	ACA	2	6	82955	82960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1582	NC_021822	CAGC	2	8	82997	83004	25 %	0 %	25 %	50 %	525852908
1583	NC_021822	TGA	2	6	83010	83015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852908
1584	NC_021822	GCA	2	6	83020	83025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1585	NC_021822	TA	3	6	83053	83058	50 %	50 %	0 %	0 %	525852908
1586	NC_021822	CTT	2	6	83181	83186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852908
1587	NC_021822	GCT	2	6	83235	83240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1588	NC_021822	CAT	2	6	83274	83279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1589	NC_021822	TGG	2	6	83324	83329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852908
1590	NC_021822	ACC	2	6	83406	83411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852908
1591	NC_021822	CAA	2	6	83566	83571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1592	NC_021822	CGGTA	2	10	83575	83584	20 %	20 %	40 %	20 %	525852908
1593	NC_021822	CAA	2	6	83636	83641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852908
1594	NC_021822	AG	3	6	83751	83756	50 %	0 %	50 %	0 %	525852908
1595	NC_021822	TGC	2	6	83819	83824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852908
1596	NC_021822	TCA	2	6	83906	83911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1597	NC_021822	GGT	2	6	83983	83988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852908
1598	NC_021822	GATGC	2	10	84028	84037	20 %	20 %	40 %	20 %	525852908
1599	NC_021822	ATG	2	6	84067	84072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852908
1600	NC_021822	GTG	2	6	84170	84175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852908
1601	NC_021822	TAC	2	6	84199	84204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852908
1602	NC_021822	GCA	2	6	84277	84282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021822	GAT	2	6	84329	84334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852909
1604	NC_021822	TCT	2	6	84342	84347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852909
1605	NC_021822	TCA	2	6	84349	84354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852909
1606	NC_021822	GCTTT	2	10	84363	84372	0 %	60 %	20 %	20 %	525852909
1607	NC_021822	GCA	2	6	84387	84392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852909
1608	NC_021822	AAG	2	6	84394	84399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852909
1609	NC_021822	GGT	2	6	84550	84555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852909
1610	NC_021822	GAGCA	2	10	84619	84628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_021822	GA	3	6	84700	84705	50 %	0 %	50 %	0 %	525852910
1612	NC_021822	TCA	2	6	84731	84736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852910
1613	NC_021822	TTTC	2	8	84854	84861	0 %	75 %	0 %	25 %	525852910
1614	NC_021822	TGA	2	6	84908	84913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852910
1615	NC_021822	TTG	2	6	85000	85005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852910
1616	NC_021822	TGG	2	6	85038	85043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852910
1617	NC_021822	CAT	2	6	85117	85122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852910
1618	NC_021822	GGC	2	6	85145	85150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852910
1619	NC_021822	CAA	2	6	85168	85173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852910
1620	NC_021822	TTCT	2	8	85263	85270	0 %	75 %	0 %	25 %	525852910
1621	NC_021822	GC	3	6	85304	85309	0 %	0 %	50 %	50 %	525852910
1622	NC_021822	ATG	2	6	85349	85354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852910
1623	NC_021822	GTT	2	6	85375	85380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021822	GCTT	2	8	85492	85499	0 %	50 %	25 %	25 %	525852911
1625	NC_021822	ATG	2	6	85546	85551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852911
1626	NC_021822	CA	3	6	85558	85563	50 %	0 %	0 %	50 %	525852911
1627	NC_021822	CGTC	2	8	85565	85572	0 %	25 %	25 %	50 %	525852911
1628	NC_021822	TGAG	2	8	85583	85590	25 %	25 %	50 %	0 %	525852911
1629	NC_021822	TTC	2	6	85612	85617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852911
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1632	NC_021822	AGT	2	6	85793	85798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021822	ATC	2	6	85815	85820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021822	TGT	2	6	85842	85847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852912
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1639	NC_021822	CGAG	2	8	86402	86409	25 %	0 %	50 %	25 %	525852912
1640	NC_021822	TCT	2	6	86627	86632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852912
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1644	NC_021822	TAT	2	6	86762	86767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1645	NC_021822	TTG	2	6	86781	86786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1646	NC_021822	AATT	2	8	86800	86807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1647	NC_021822	AAG	2	6	86830	86835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1648	NC_021822	GAA	3	9	86880	86888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1656	NC_021822	TGG	2	6	87407	87412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854211
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1659	NC_021822	TAT	2	6	87575	87580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1673	NC_021822	T	6	6	88169	88174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1695	NC_021822	CG	3	6	89337	89342	0 %	0 %	50 %	50 %	525852915
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1726	NC_021822	AATA	2	8	91564	91571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1727	NC_021822	TAA	2	6	91581	91586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1731	NC_021822	TATTTT	2	12	91666	91677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1732	NC_021822	AACA	2	8	91720	91727	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1733	NC_021822	AC	3	6	91845	91850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1734	NC_021822	T	6	6	91882	91887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1739	NC_021822	TATT	2	8	92059	92066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1740	NC_021822	ATT	2	6	92212	92217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1741	NC_021822	A	6	6	92245	92250	100 %	0 %	0 %	0 %	525854213
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1746	NC_021822	ACC	2	6	92773	92778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854213
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1753	NC_021822	CAT	2	6	93024	93029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854213
1754	NC_021822	TAC	2	6	93076	93081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854213
1755	NC_021822	GAA	2	6	93099	93104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854213
1756	NC_021822	GTG	2	6	93253	93258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854213
1757	NC_021822	CAA	3	9	93282	93290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854213
1758	NC_021822	TC	3	6	93306	93311	0 %	50 %	0 %	50 %	525854213
1759	NC_021822	AGG	2	6	93320	93325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525854213
1760	NC_021822	GTT	2	6	93334	93339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854213
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1762	NC_021822	ATC	2	6	93363	93368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854213
1763	NC_021822	TCG	3	9	93381	93389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854213
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1767	NC_021822	CTG	2	6	93701	93706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852917
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1770	NC_021822	GTG	2	6	93849	93854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852917
1771	NC_021822	TGA	2	6	93888	93893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852917
1772	NC_021822	GGT	2	6	93896	93901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852917
1773	NC_021822	TGA	2	6	93916	93921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852917
1774	NC_021822	GAT	2	6	93958	93963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852917
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1776	NC_021822	CAT	2	6	94048	94053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852917
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1779	NC_021822	GCT	2	6	94213	94218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852917
1780	NC_021822	CAT	2	6	94264	94269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852917
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1782	NC_021822	GTG	2	6	94295	94300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852917
1783	NC_021822	AACA	2	8	94354	94361	75 %	0 %	0 %	25 %	525852917
1784	NC_021822	CCG	2	6	94396	94401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852917
1785	NC_021822	CCG	2	6	94425	94430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852917
1786	NC_021822	ATT	2	6	94554	94559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852917
1787	NC_021822	AG	3	6	94606	94611	50 %	0 %	50 %	0 %	525852917
1788	NC_021822	TCGC	2	8	94619	94626	0 %	25 %	25 %	50 %	525852917
1789	NC_021822	AAG	2	6	94629	94634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852917
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1866	NC_021822	T	7	7	98136	98142	0 %	100 %	0 %	0 %	525852918
1867	NC_021822	CAT	2	6	98143	98148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852918
1868	NC_021822	CTT	2	6	98154	98159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1870	NC_021822	CAA	2	6	98269	98274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1872	NC_021822	A	6	6	98311	98316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1873	NC_021822	TTCA	2	8	98317	98324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1874	NC_021822	AAT	2	6	98357	98362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1875	NC_021822	TTG	2	6	98424	98429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1876	NC_021822	TTGA	2	8	98456	98463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1877	NC_021822	ATG	2	6	98558	98563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1880	NC_021822	CTG	2	6	98661	98666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1881	NC_021822	CGA	2	6	98722	98727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1882	NC_021822	CGA	2	6	98739	98744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1883	NC_021822	AGA	2	6	98764	98769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852919
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1972	NC_021822	AG	3	6	103816	103821	50 %	0 %	50 %	0 %	525852924
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1987	NC_021822	TTC	2	6	104712	104717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852925
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1992	NC_021822	AAATC	2	10	105253	105262	60 %	20 %	0 %	20 %	525852925
1993	NC_021822	CTTG	2	8	105263	105270	0 %	50 %	25 %	25 %	525852925
1994	NC_021822	TGGT	2	8	105290	105297	0 %	50 %	50 %	0 %	525852925
1995	NC_021822	CGA	2	6	105314	105319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852925
1996	NC_021822	CTTG	2	8	105383	105390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1997	NC_021822	TTG	2	6	105439	105444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_021822	AGT	2	6	105463	105468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852926
1999	NC_021822	AC	3	6	105479	105484	50 %	0 %	0 %	50 %	525852926
2000	NC_021822	CTT	2	6	105496	105501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852926

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