MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021822	GTT	2	6	54242	54247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852886
1002	NC_021822	GGA	2	6	54470	54475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525852886
1003	NC_021822	TGC	2	6	54604	54609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852886
1004	NC_021822	TGG	2	6	54634	54639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852886
1005	NC_021822	ATTT	2	8	54743	54750	25 %	75 %	0 %	0 %	525852886
1006	NC_021822	GTCG	2	8	54754	54761	0 %	25 %	50 %	25 %	525852886
1007	NC_021822	T	6	6	54764	54769	0 %	100 %	0 %	0 %	525852886
1008	NC_021822	CGAAG	2	10	54778	54787	40 %	0 %	40 %	20 %	525852886
1009	NC_021822	GCG	2	6	54792	54797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852886
1010	NC_021822	TGG	2	6	54870	54875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852886
1011	NC_021822	CAT	2	6	54931	54936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852886
1012	NC_021822	ATC	2	6	54992	54997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852886
1013	NC_021822	GAA	2	6	55018	55023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852886
1014	NC_021822	ACC	2	6	55031	55036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852886
1015	NC_021822	CTG	2	6	55043	55048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852886
1016	NC_021822	ACA	2	6	55082	55087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852886
1017	NC_021822	TGA	2	6	55110	55115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852886
1018	NC_021822	TCA	2	6	55143	55148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852886
1019	NC_021822	GCG	2	6	55205	55210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852886
1020	NC_021822	AAGCGA	2	12	55308	55319	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525852886
1021	NC_021822	GAAA	2	8	55384	55391	75 %	0 %	25 %	0 %	525852886
1022	NC_021822	CTG	2	6	55407	55412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852886
1023	NC_021822	TTG	2	6	55416	55421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852886
1024	NC_021822	CTA	2	6	55427	55432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852886
1025	NC_021822	TTGGC	2	10	55458	55467	0 %	40 %	40 %	20 %	525852886
1026	NC_021822	TTG	2	6	55469	55474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852886
1027	NC_021822	ATC	2	6	55487	55492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852886
1028	NC_021822	CCA	2	6	55523	55528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852886
1029	NC_021822	GT	3	6	55529	55534	0 %	50 %	50 %	0 %	525852886
1030	NC_021822	GCG	2	6	55550	55555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852886
1031	NC_021822	CCA	2	6	55571	55576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852886
1032	NC_021822	CTT	2	6	55690	55695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852886
1033	NC_021822	AT	3	6	55758	55763	50 %	50 %	0 %	0 %	525852886
1034	NC_021822	TGA	2	6	55764	55769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852886
1035	NC_021822	TTTGG	2	10	55798	55807	0 %	60 %	40 %	0 %	525852886
1036	NC_021822	GTGTG	2	10	55830	55839	0 %	40 %	60 %	0 %	525852886
1037	NC_021822	GTTT	2	8	55861	55868	0 %	75 %	25 %	0 %	525852886
1038	NC_021822	TTG	2	6	55949	55954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852887
1039	NC_021822	GTG	2	6	55958	55963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852887
1040	NC_021822	CAA	2	6	55996	56001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852887
1041	NC_021822	GCG	2	6	56075	56080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852887
1042	NC_021822	GT	3	6	56093	56098	0 %	50 %	50 %	0 %	525852887
1043	NC_021822	A	6	6	56147	56152	100 %	0 %	0 %	0 %	525852887
1044	NC_021822	ATA	2	6	56174	56179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852887
1045	NC_021822	GTT	2	6	56202	56207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852887
1046	NC_021822	AAG	2	6	56225	56230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852887
1047	NC_021822	CGAA	2	8	56232	56239	50 %	0 %	25 %	25 %	525852887
1048	NC_021822	TGA	2	6	56292	56297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852887
1049	NC_021822	ACC	2	6	56356	56361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852887
1050	NC_021822	TTG	2	6	56366	56371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852887
1051	NC_021822	GGT	2	6	56419	56424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852887
1052	NC_021822	GGT	2	6	56445	56450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852887
1053	NC_021822	GCC	2	6	56452	56457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852887
1054	NC_021822	GAA	2	6	56470	56475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852887
1055	NC_021822	ATG	2	6	56572	56577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852887
1056	NC_021822	CCGA	2	8	56584	56591	25 %	0 %	25 %	50 %	525852887
1057	NC_021822	TAC	2	6	56620	56625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852887
1058	NC_021822	GTG	2	6	56650	56655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852887
1059	NC_021822	TCCAGA	2	12	56676	56687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525852887
1060	NC_021822	TGAT	2	8	56720	56727	25 %	50 %	25 %	0 %	525852887
1061	NC_021822	CA	3	6	56847	56852	50 %	0 %	0 %	50 %	525852887
1062	NC_021822	GTG	2	6	56892	56897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852887
1063	NC_021822	AATA	2	8	56923	56930	75 %	25 %	0 %	0 %	525852887
1064	NC_021822	CG	3	6	56980	56985	0 %	0 %	50 %	50 %	525852887
1065	NC_021822	AG	3	6	57033	57038	50 %	0 %	50 %	0 %	525852887
1066	NC_021822	AAG	2	6	57042	57047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852887
1067	NC_021822	GT	3	6	57055	57060	0 %	50 %	50 %	0 %	525852887
1068	NC_021822	GTC	2	6	57145	57150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852887
1069	NC_021822	TTTCA	2	10	57188	57197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_021822	TGG	2	6	57210	57215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021822	T	6	6	57241	57246	0 %	100 %	0 %	0 %	525852888
1072	NC_021822	T	6	6	57380	57385	0 %	100 %	0 %	0 %	525852888
1073	NC_021822	TCT	2	6	57392	57397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852888
1074	NC_021822	GCGCT	2	10	57430	57439	0 %	20 %	40 %	40 %	525852888
1075	NC_021822	CTTG	2	8	57531	57538	0 %	50 %	25 %	25 %	525852888
1076	NC_021822	TTG	2	6	57554	57559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852888
1077	NC_021822	TTGA	2	8	57638	57645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021822	GAA	2	6	57679	57684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021822	CTTTT	2	10	57808	57817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_021822	AGG	2	6	57821	57826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021822	ACT	2	6	57894	57899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_021822	TCT	2	6	57907	57912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021822	TCT	2	6	57923	57928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_021822	AAG	2	6	58115	58120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852889
1085	NC_021822	TGA	2	6	58149	58154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852889
1086	NC_021822	ACT	2	6	58256	58261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852889
1087	NC_021822	TTC	2	6	58288	58293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852889
1088	NC_021822	GAG	2	6	58328	58333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525852889
1089	NC_021822	TAC	2	6	58425	58430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852889
1090	NC_021822	CGG	2	6	58452	58457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852889
1091	NC_021822	GAA	2	6	58480	58485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852889
1092	NC_021822	CAA	2	6	58533	58538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852889
1093	NC_021822	GAA	2	6	58569	58574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852889
1094	NC_021822	CAT	2	6	58584	58589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852889
1095	NC_021822	CCA	2	6	58664	58669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852889
1096	NC_021822	GTG	2	6	58684	58689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852889
1097	NC_021822	TCA	2	6	58724	58729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852889
1098	NC_021822	GAA	2	6	58738	58743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852889
1099	NC_021822	AAGA	2	8	58819	58826	75 %	0 %	25 %	0 %	525852889
1100	NC_021822	TGG	2	6	58842	58847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852889
1101	NC_021822	TGT	2	6	58852	58857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852889
1102	NC_021822	ATC	2	6	58865	58870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852889
1103	NC_021822	GTT	2	6	58875	58880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852889
1104	NC_021822	GGC	2	6	58930	58935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852889
1105	NC_021822	TCAG	2	8	59012	59019	25 %	25 %	25 %	25 %	525852889
1106	NC_021822	G	6	6	59049	59054	0 %	0 %	100 %	0 %	525852889
1107	NC_021822	TCCAA	2	10	59058	59067	40 %	20 %	0 %	40 %	525852889
1108	NC_021822	TGG	2	6	59076	59081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852889
1109	NC_021822	GCG	2	6	59101	59106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852889
1110	NC_021822	TTGA	2	8	59326	59333	25 %	50 %	25 %	0 %	525852889
1111	NC_021822	GAA	2	6	59337	59342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852889
1112	NC_021822	T	6	6	59510	59515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021822	GTTCA	2	10	59526	59535	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_021822	GTC	2	6	59705	59710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852890
1115	NC_021822	AC	4	8	59737	59744	50 %	0 %	0 %	50 %	525852890
1116	NC_021822	T	6	6	59816	59821	0 %	100 %	0 %	0 %	525852890
1117	NC_021822	GCA	2	6	60016	60021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852890
1118	NC_021822	TGT	2	6	60035	60040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852890
1119	NC_021822	GCTC	2	8	60103	60110	0 %	25 %	25 %	50 %	525852890
1120	NC_021822	AAG	3	9	60179	60187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021822	GA	3	6	60200	60205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021822	CAT	2	6	60276	60281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021822	AAG	2	6	60310	60315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021822	TATT	2	8	60395	60402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021822	TGA	2	6	60526	60531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021822	GTT	2	6	60587	60592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021822	CAG	2	6	60648	60653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021822	CGGAC	2	10	60666	60675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_021822	TCT	2	6	60783	60788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021822	TCTTT	2	10	60806	60815	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_021822	TTG	2	6	60868	60873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852891
1132	NC_021822	ACT	2	6	60875	60880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852891
1133	NC_021822	CATC	2	8	60913	60920	25 %	25 %	0 %	50 %	525852891
1134	NC_021822	TTA	2	6	61035	61040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852891
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1137	NC_021822	TCCT	2	8	61114	61121	0 %	50 %	0 %	50 %	525852891
1138	NC_021822	ATC	2	6	61122	61127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852891
1139	NC_021822	TTC	2	6	61131	61136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852891
1140	NC_021822	TAC	2	6	61158	61163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852891
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1149	NC_021822	CAC	2	6	61717	61722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852891
1150	NC_021822	ATC	2	6	61863	61868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852891
1151	NC_021822	CGT	2	6	61947	61952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852891
1152	NC_021822	AGCA	2	8	61961	61968	50 %	0 %	25 %	25 %	525852891
1153	NC_021822	GCT	2	6	61986	61991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852891
1154	NC_021822	CCG	2	6	62073	62078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1155	NC_021822	T	7	7	62089	62095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_021822	TG	3	6	62112	62117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_021822	ATC	2	6	62324	62329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852892
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1159	NC_021822	GCCA	2	8	62398	62405	25 %	0 %	25 %	50 %	525852892
1160	NC_021822	ATG	2	6	62432	62437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852892
1161	NC_021822	TCT	2	6	62438	62443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852892
1162	NC_021822	TGT	2	6	62469	62474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852892
1163	NC_021822	TGA	2	6	62498	62503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852892
1164	NC_021822	TTCA	2	8	62509	62516	25 %	50 %	0 %	25 %	525852892
1165	NC_021822	ATA	2	6	62527	62532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852892
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1184	NC_021822	TGAG	2	8	63204	63211	25 %	25 %	50 %	0 %	525852892
1185	NC_021822	AG	3	6	63214	63219	50 %	0 %	50 %	0 %	525852892
1186	NC_021822	ATC	2	6	63288	63293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1187	NC_021822	TGTT	2	8	63296	63303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1188	NC_021822	TTTGG	2	10	63368	63377	0 %	60 %	40 %	0 %	525852893
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1196	NC_021822	ATT	2	6	63963	63968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1197	NC_021822	ATA	2	6	64001	64006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1198	NC_021822	AAT	2	6	64026	64031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1199	NC_021822	GTA	2	6	64036	64041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1200	NC_021822	TTG	2	6	64117	64122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852894
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1230	NC_021822	TGT	2	6	65450	65455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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