MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021822	TTTC	2	8	27640	27647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_021822	TGG	2	6	27653	27658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021822	CAAA	2	8	27726	27733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_021822	T	6	6	27782	27787	0 %	100 %	0 %	0 %	525852868
505	NC_021822	GAA	2	6	27803	27808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852868
506	NC_021822	TCT	2	6	27825	27830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852868
507	NC_021822	GCC	2	6	27857	27862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852868
508	NC_021822	AAC	2	6	27888	27893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852868
509	NC_021822	TTTCA	2	10	27911	27920	20 %	60 %	0 %	20 %	525852868
510	NC_021822	TGT	2	6	27980	27985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852868
511	NC_021822	TGT	2	6	28063	28068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852868
512	NC_021822	TCA	2	6	28083	28088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852868
513	NC_021822	GTG	2	6	28098	28103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852868
514	NC_021822	TCA	2	6	28116	28121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852868
515	NC_021822	AAC	2	6	28133	28138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852868
516	NC_021822	TAA	2	6	28192	28197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852868
517	NC_021822	CCGC	2	8	28215	28222	0 %	0 %	25 %	75 %	525852868
518	NC_021822	CCA	2	6	28227	28232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852868
519	NC_021822	T	6	6	28325	28330	0 %	100 %	0 %	0 %	525852868
520	NC_021822	TCTT	2	8	28494	28501	0 %	75 %	0 %	25 %	525852868
521	NC_021822	ATG	2	6	28563	28568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852868
522	NC_021822	GTA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852868
523	NC_021822	AGT	2	6	28673	28678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852868
524	NC_021822	GTA	2	6	28688	28693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852868
525	NC_021822	T	6	6	28703	28708	0 %	100 %	0 %	0 %	525852868
526	NC_021822	CGCT	2	8	28807	28814	0 %	25 %	25 %	50 %	525852868
527	NC_021822	GCT	2	6	28828	28833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852868
528	NC_021822	GGT	2	6	28843	28848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852868
529	NC_021822	GTC	2	6	28883	28888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852868
530	NC_021822	TCA	2	6	28945	28950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852868
531	NC_021822	GAT	2	6	29078	29083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852868
532	NC_021822	CGC	2	6	29089	29094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852868
533	NC_021822	CGT	2	6	29125	29130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852868
534	NC_021822	TTTGCT	2	12	29138	29149	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525852868
535	NC_021822	TAA	2	6	29160	29165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852868
536	NC_021822	TTC	2	6	29177	29182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852868
537	NC_021822	TCA	2	6	29193	29198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852868
538	NC_021822	T	6	6	29261	29266	0 %	100 %	0 %	0 %	525852868
539	NC_021822	GTT	2	6	29282	29287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852868
540	NC_021822	GTAA	2	8	29335	29342	50 %	25 %	25 %	0 %	525852868
541	NC_021822	CGG	2	6	29382	29387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852868
542	NC_021822	CCA	2	6	29442	29447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852868
543	NC_021822	A	6	6	29453	29458	100 %	0 %	0 %	0 %	525852868
544	NC_021822	TTGT	2	8	29498	29505	0 %	75 %	25 %	0 %	525852868
545	NC_021822	AGT	2	6	29578	29583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852868
546	NC_021822	GTC	2	6	29609	29614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852868
547	NC_021822	TTC	2	6	29636	29641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852868
548	NC_021822	TGC	2	6	29712	29717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852868
549	NC_021822	TCA	2	6	29742	29747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852868
550	NC_021822	AGT	3	9	29755	29763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852868
551	NC_021822	T	8	8	29806	29813	0 %	100 %	0 %	0 %	525852868
552	NC_021822	TGC	2	6	29887	29892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852868
553	NC_021822	AG	3	6	30041	30046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021822	TTG	2	6	30097	30102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021822	TCA	2	6	30180	30185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021822	A	6	6	30209	30214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021822	AC	3	6	30218	30223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_021822	CAT	2	6	30355	30360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852869
559	NC_021822	GCAA	2	8	30404	30411	50 %	0 %	25 %	25 %	525852869
560	NC_021822	TGT	2	6	30499	30504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852869
561	NC_021822	AAAT	2	8	30536	30543	75 %	25 %	0 %	0 %	525852869
562	NC_021822	CCA	2	6	30551	30556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852869
563	NC_021822	GTT	2	6	30572	30577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852869
564	NC_021822	ACG	2	6	30602	30607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852869
565	NC_021822	ACG	2	6	30649	30654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852869
566	NC_021822	ACC	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852869
567	NC_021822	GCT	3	9	30782	30790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852869
568	NC_021822	AC	3	6	30795	30800	50 %	0 %	0 %	50 %	525852869
569	NC_021822	GCG	2	6	30847	30852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852869
570	NC_021822	CAGA	2	8	30855	30862	50 %	0 %	25 %	25 %	525852869
571	NC_021822	TCA	2	6	30933	30938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852869
572	NC_021822	CAC	2	6	30946	30951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852869
573	NC_021822	CCAA	2	8	30991	30998	50 %	0 %	0 %	50 %	525852869
574	NC_021822	GCC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852869
575	NC_021822	GTG	2	6	31038	31043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852869
576	NC_021822	CGC	2	6	31131	31136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852869
577	NC_021822	TGAA	2	8	31157	31164	50 %	25 %	25 %	0 %	525852869
578	NC_021822	CCA	2	6	31206	31211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852869
579	NC_021822	AAT	2	6	31243	31248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852869
580	NC_021822	TGA	2	6	31342	31347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852869
581	NC_021822	TC	3	6	31484	31489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_021822	A	6	6	31491	31496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021822	ATT	2	6	31662	31667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021822	ATG	2	6	31684	31689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021822	ATGCGT	2	12	31902	31913	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525852870
586	NC_021822	ACA	2	6	31988	31993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852870
587	NC_021822	AAT	2	6	32029	32034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852870
588	NC_021822	CCA	2	6	32060	32065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852870
589	NC_021822	CGA	2	6	32153	32158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852870
590	NC_021822	TCT	2	6	32162	32167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852870
591	NC_021822	TTC	2	6	32270	32275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852870
592	NC_021822	CTT	2	6	32289	32294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852870
593	NC_021822	ATG	2	6	32389	32394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852870
594	NC_021822	TGA	2	6	32424	32429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852870
595	NC_021822	GCC	2	6	32486	32491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852870
596	NC_021822	CTT	2	6	32593	32598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852870
597	NC_021822	TGCG	2	8	32649	32656	0 %	25 %	50 %	25 %	525852870
598	NC_021822	GAC	2	6	32661	32666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852870
599	NC_021822	CAC	2	6	32698	32703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852870
600	NC_021822	CGTCTG	2	12	32706	32717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852870
601	NC_021822	AAT	2	6	32778	32783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852870
602	NC_021822	TCAT	2	8	32801	32808	25 %	50 %	0 %	25 %	525852870
603	NC_021822	TTGT	2	8	32906	32913	0 %	75 %	25 %	0 %	525852871
604	NC_021822	CAT	2	6	32954	32959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852871
605	NC_021822	TCT	2	6	32961	32966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852871
606	NC_021822	TCA	2	6	33012	33017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852871
607	NC_021822	ACT	2	6	33024	33029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852871
608	NC_021822	CTA	2	6	33088	33093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852871
609	NC_021822	ACG	2	6	33224	33229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852871
610	NC_021822	AG	3	6	33310	33315	50 %	0 %	50 %	0 %	525852871
611	NC_021822	GAA	2	6	33326	33331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852871
612	NC_021822	GTT	2	6	33433	33438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852871
613	NC_021822	CACG	2	8	33444	33451	25 %	0 %	25 %	50 %	525852871
614	NC_021822	GCA	2	6	33589	33594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852871
615	NC_021822	CTT	2	6	33625	33630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852871
616	NC_021822	GTG	2	6	33677	33682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852871
617	NC_021822	GTT	2	6	33727	33732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852871
618	NC_021822	AC	3	6	33743	33748	50 %	0 %	0 %	50 %	525852871
619	NC_021822	GAT	2	6	33810	33815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852871
620	NC_021822	CGT	2	6	33829	33834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852871
621	NC_021822	CCG	2	6	33849	33854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852871
622	NC_021822	TACG	2	8	33931	33938	25 %	25 %	25 %	25 %	525852871
623	NC_021822	GCATC	2	10	33985	33994	20 %	20 %	20 %	40 %	525852871
624	NC_021822	CAAAC	2	10	34049	34058	60 %	0 %	0 %	40 %	525852871
625	NC_021822	CTTG	2	8	34077	34084	0 %	50 %	25 %	25 %	525852871
626	NC_021822	GAGGC	2	10	34104	34113	20 %	0 %	60 %	20 %	525852871
627	NC_021822	CTT	2	6	34156	34161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852871
628	NC_021822	AC	3	6	34271	34276	50 %	0 %	0 %	50 %	525852871
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761	NC_021822	A	7	7	40964	40970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
762	NC_021822	TTGC	2	8	41003	41010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
763	NC_021822	CAAG	2	8	41034	41041	50 %	0 %	25 %	25 %	525852877
764	NC_021822	CCG	3	9	41168	41176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852877
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768	NC_021822	GAT	2	6	41370	41375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
769	NC_021822	GTAC	2	8	41380	41387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
770	NC_021822	GA	3	6	41533	41538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
771	NC_021822	GGA	2	6	41539	41544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
772	NC_021822	AT	3	6	41545	41550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_021822	CAT	2	6	41602	41607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
774	NC_021822	TCT	2	6	41650	41655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_021822	CTT	2	6	41661	41666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_021822	CAA	2	6	41673	41678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_021822	ACTA	2	8	41686	41693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
778	NC_021822	GAA	2	6	41770	41775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852878
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881	NC_021822	TGAT	2	8	47603	47610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
882	NC_021822	AAG	2	6	47728	47733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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