MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021822	CAC	2	6	288034	288039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853088
5502	NC_021822	CGA	2	6	288043	288048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853088
5503	NC_021822	ACA	2	6	288160	288165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853088
5504	NC_021822	TGG	2	6	288212	288217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853088
5505	NC_021822	GGC	2	6	288225	288230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853088
5506	NC_021822	GAT	2	6	288236	288241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853088
5507	NC_021822	TGAA	2	8	288277	288284	50 %	25 %	25 %	0 %	525853088
5508	NC_021822	GAT	3	9	288302	288310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853088
5509	NC_021822	ATT	2	6	288332	288337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853088
5510	NC_021822	AAT	2	6	288585	288590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853088
5511	NC_021822	GAA	2	6	288606	288611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021822	AATC	2	8	288631	288638	50 %	25 %	0 %	25 %	525853089
5513	NC_021822	CTGC	2	8	288681	288688	0 %	25 %	25 %	50 %	525853089
5514	NC_021822	TGT	2	6	288725	288730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853089
5515	NC_021822	GAC	2	6	288818	288823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853089
5516	NC_021822	TTA	2	6	288893	288898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853089
5517	NC_021822	ACT	2	6	289000	289005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853089
5518	NC_021822	GCA	2	6	289027	289032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853089
5519	NC_021822	TGA	2	6	289058	289063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853089
5520	NC_021822	GTC	2	6	289143	289148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_021822	ACAT	2	8	289190	289197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_021822	AAAT	2	8	289219	289226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021822	CAA	2	6	289255	289260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853090
5524	NC_021822	TC	3	6	289418	289423	0 %	50 %	0 %	50 %	525853090
5525	NC_021822	TGA	3	9	289472	289480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853090
5526	NC_021822	GAAGAT	2	12	289483	289494	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525853090
5527	NC_021822	GTT	2	6	289549	289554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853090
5528	NC_021822	CAT	2	6	289614	289619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853090
5529	NC_021822	AAG	2	6	289748	289753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853090
5530	NC_021822	CGT	2	6	289786	289791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_021822	AGG	2	6	289805	289810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021822	T	6	6	289833	289838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021822	AAC	2	6	289846	289851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_021822	TG	3	6	289917	289922	0 %	50 %	50 %	0 %	525853091
5535	NC_021822	GAC	2	6	289987	289992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853091
5536	NC_021822	GC	3	6	290119	290124	0 %	0 %	50 %	50 %	525853091
5537	NC_021822	GGT	2	6	290131	290136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853091
5538	NC_021822	TGC	2	6	290150	290155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853091
5539	NC_021822	CTT	2	6	290315	290320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853091
5540	NC_021822	GAA	2	6	290344	290349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853091
5541	NC_021822	AAG	2	6	290383	290388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853091
5542	NC_021822	TCA	2	6	290440	290445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_021822	GAC	2	6	290471	290476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_021822	TAT	2	6	290513	290518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_021822	AAG	2	6	290539	290544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853092
5546	NC_021822	TCA	2	6	290815	290820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853092
5547	NC_021822	CG	3	6	290898	290903	0 %	0 %	50 %	50 %	525853092
5548	NC_021822	CGA	2	6	290906	290911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853092
5549	NC_021822	CCA	2	6	290917	290922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853092
5550	NC_021822	T	6	6	291081	291086	0 %	100 %	0 %	0 %	525853092
5551	NC_021822	TGG	2	6	291098	291103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853092
5552	NC_021822	GAT	2	6	291131	291136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853092
5553	NC_021822	TTC	2	6	291212	291217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853092
5554	NC_021822	TTG	2	6	291383	291388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853092
5555	NC_021822	GATT	2	8	291420	291427	25 %	50 %	25 %	0 %	525853092
5556	NC_021822	TCA	2	6	291594	291599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_021822	CCA	2	6	291691	291696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_021822	GA	3	6	291704	291709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021822	CAG	2	6	291727	291732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853093
5560	NC_021822	CAT	2	6	291776	291781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853093
5561	NC_021822	A	6	6	291792	291797	100 %	0 %	0 %	0 %	525853093
5562	NC_021822	A	6	6	291822	291827	100 %	0 %	0 %	0 %	525853093
5563	NC_021822	GTG	3	9	291853	291861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853093
5564	NC_021822	GTTT	2	8	291909	291916	0 %	75 %	25 %	0 %	525853093
5565	NC_021822	CAAAA	2	10	291947	291956	80 %	0 %	0 %	20 %	525853093
5566	NC_021822	TGGC	2	8	291959	291966	0 %	25 %	50 %	25 %	525853093
5567	NC_021822	GAA	2	6	292053	292058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021822	A	6	6	292219	292224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_021822	AACA	2	8	292235	292242	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5570	NC_021822	CGA	2	6	292253	292258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_021822	AAC	2	6	292287	292292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_021822	TAA	2	6	292337	292342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_021822	TTG	2	6	292352	292357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_021822	TAA	2	6	292403	292408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_021822	AGC	2	6	292434	292439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_021822	A	6	6	292517	292522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_021822	TCG	2	6	292637	292642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853094
5578	NC_021822	GCC	2	6	292707	292712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853094
5579	NC_021822	TGC	2	6	292757	292762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853094
5580	NC_021822	TGC	2	6	292919	292924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853094
5581	NC_021822	CAA	2	6	293183	293188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853094
5582	NC_021822	GTTG	2	8	293191	293198	0 %	50 %	50 %	0 %	525853094
5583	NC_021822	TGG	2	6	293304	293309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853094
5584	NC_021822	AAG	2	6	293449	293454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853094
5585	NC_021822	CGA	2	6	293477	293482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853094
5586	NC_021822	GGTT	2	8	293513	293520	0 %	50 %	50 %	0 %	525853094
5587	NC_021822	GGC	2	6	293532	293537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853094
5588	NC_021822	CTT	3	9	293545	293553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853094
5589	NC_021822	GTAC	2	8	293557	293564	25 %	25 %	25 %	25 %	525853094
5590	NC_021822	CTT	2	6	293721	293726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853094
5591	NC_021822	GAT	2	6	293741	293746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853094
5592	NC_021822	TGC	2	6	293833	293838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853094
5593	NC_021822	GC	3	6	293870	293875	0 %	0 %	50 %	50 %	525853094
5594	NC_021822	CTAT	2	8	294022	294029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_021822	ACTCT	2	10	294046	294055	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5596	NC_021822	CTT	2	6	294097	294102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_021822	ATA	2	6	294237	294242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021822	G	6	6	294318	294323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021822	ATC	2	6	294380	294385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853095
5600	NC_021822	CAA	2	6	294525	294530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853095
5601	NC_021822	GT	3	6	294575	294580	0 %	50 %	50 %	0 %	525853095
5602	NC_021822	CTTG	2	8	294678	294685	0 %	50 %	25 %	25 %	525853095
5603	NC_021822	GAT	2	6	294693	294698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853095
5604	NC_021822	TAA	2	6	294747	294752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853095
5605	NC_021822	ATG	2	6	294926	294931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853095
5606	NC_021822	CAT	2	6	294981	294986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853095
5607	NC_021822	TTG	2	6	295062	295067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853095
5608	NC_021822	GCG	2	6	295080	295085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853095
5609	NC_021822	TCA	2	6	295103	295108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853095
5610	NC_021822	T	6	6	295165	295170	0 %	100 %	0 %	0 %	525853095
5611	NC_021822	CGC	2	6	295171	295176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853095
5612	NC_021822	TTC	2	6	295250	295255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853095
5613	NC_021822	ATA	3	9	295285	295293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853096
5614	NC_021822	CAAC	2	8	295321	295328	50 %	0 %	0 %	50 %	525853096
5615	NC_021822	CAT	2	6	295340	295345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853096
5616	NC_021822	AC	3	6	295354	295359	50 %	0 %	0 %	50 %	525853096
5617	NC_021822	GA	3	6	295444	295449	50 %	0 %	50 %	0 %	525853096
5618	NC_021822	GTTT	2	8	295617	295624	0 %	75 %	25 %	0 %	525853096
5619	NC_021822	TGT	2	6	295658	295663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853096
5620	NC_021822	TACC	2	8	295666	295673	25 %	25 %	0 %	50 %	525853096
5621	NC_021822	AG	3	6	295760	295765	50 %	0 %	50 %	0 %	525853096
5622	NC_021822	TGC	2	6	295769	295774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853096
5623	NC_021822	CG	3	6	295798	295803	0 %	0 %	50 %	50 %	525853096
5624	NC_021822	A	6	6	295809	295814	100 %	0 %	0 %	0 %	525853096
5625	NC_021822	TTCG	2	8	295829	295836	0 %	50 %	25 %	25 %	525853096
5626	NC_021822	TCAC	2	8	295842	295849	25 %	25 %	0 %	50 %	525853096
5627	NC_021822	T	6	6	295871	295876	0 %	100 %	0 %	0 %	525853096
5628	NC_021822	AGCA	2	8	295900	295907	50 %	0 %	25 %	25 %	525853096
5629	NC_021822	CAT	2	6	295928	295933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853096
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5638	NC_021822	ACA	2	6	296627	296632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5639	NC_021822	TAGTG	2	10	296845	296854	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5640	NC_021822	TCAC	2	8	296964	296971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5641	NC_021822	TGA	2	6	297046	297051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5644	NC_021822	GATC	2	8	297277	297284	25 %	25 %	25 %	25 %	525854232
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5651	NC_021822	TTG	2	6	297767	297772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5664	NC_021822	A	6	6	298285	298290	100 %	0 %	0 %	0 %	525854233
5665	NC_021822	ATTG	2	8	298392	298399	25 %	50 %	25 %	0 %	525854233
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5747	NC_021822	TTTG	2	8	302717	302724	0 %	75 %	25 %	0 %	525853098
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5749	NC_021822	CTT	2	6	302801	302806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853098
5750	NC_021822	ATAAA	2	10	302884	302893	80 %	20 %	0 %	0 %	525853098
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5753	NC_021822	T	6	6	303009	303014	0 %	100 %	0 %	0 %	525853099
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5762	NC_021822	TAT	2	6	303400	303405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5763	NC_021822	TTA	2	6	303408	303413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5764	NC_021822	TTTTTA	2	12	303474	303485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5765	NC_021822	GCG	2	6	303514	303519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5766	NC_021822	GAA	2	6	303587	303592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5873	NC_021822	TA	3	6	309203	309208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5903	NC_021822	GAT	2	6	310532	310537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5995	NC_021822	ATCGCT	2	12	315614	315625	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525853108
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5997	NC_021822	AGA	2	6	315742	315747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5999	NC_021822	GAA	2	6	315832	315837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854237
6000	NC_021822	A	6	6	315877	315882	100 %	0 %	0 %	0 %	525854237

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