MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021822	GATA	2	8	262080	262087	50 %	25 %	25 %	0 %	525853062
5002	NC_021822	TAA	2	6	262098	262103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853062
5003	NC_021822	CAC	2	6	262128	262133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853062
5004	NC_021822	CCAG	2	8	262156	262163	25 %	0 %	25 %	50 %	525853062
5005	NC_021822	GTTG	2	8	262269	262276	0 %	50 %	50 %	0 %	525853062
5006	NC_021822	TCT	2	6	262301	262306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853062
5007	NC_021822	TG	3	6	262381	262386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021822	CG	3	6	262511	262516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_021822	TTG	2	6	262528	262533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021822	TAA	2	6	262551	262556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021822	T	6	6	262575	262580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021822	ATATGA	2	12	262585	262596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525853063
5013	NC_021822	CAT	2	6	262627	262632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853063
5014	NC_021822	GT	3	6	262640	262645	0 %	50 %	50 %	0 %	525853063
5015	NC_021822	ACT	2	6	262759	262764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853063
5016	NC_021822	GGC	2	6	262820	262825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853063
5017	NC_021822	TGCT	2	8	262925	262932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_021822	AGAC	2	8	262943	262950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_021822	CAA	2	6	262976	262981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021822	TC	4	8	263003	263010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_021822	GA	3	6	263173	263178	50 %	0 %	50 %	0 %	525853064
5022	NC_021822	TGCC	2	8	263239	263246	0 %	25 %	25 %	50 %	525853064
5023	NC_021822	GCA	2	6	263442	263447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853064
5024	NC_021822	CTTG	2	8	263448	263455	0 %	50 %	25 %	25 %	525853064
5025	NC_021822	TTTTTC	2	12	263471	263482	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525853064
5026	NC_021822	CCA	2	6	263545	263550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853064
5027	NC_021822	ATCA	2	8	263654	263661	50 %	25 %	0 %	25 %	525853064
5028	NC_021822	AACG	2	8	263666	263673	50 %	0 %	25 %	25 %	525853064
5029	NC_021822	TTC	2	6	263810	263815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853064
5030	NC_021822	GTG	2	6	263850	263855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853064
5031	NC_021822	CAT	2	6	263894	263899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853064
5032	NC_021822	T	6	6	263899	263904	0 %	100 %	0 %	0 %	525853064
5033	NC_021822	CGG	2	6	263911	263916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853064
5034	NC_021822	CCAG	2	8	264002	264009	25 %	0 %	25 %	50 %	525853064
5035	NC_021822	TGC	2	6	264228	264233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_021822	TGAG	2	8	264312	264319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021822	AG	3	6	264349	264354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021822	T	7	7	264378	264384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021822	T	6	6	264392	264397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021822	TGC	2	6	264400	264405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_021822	T	6	6	264415	264420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021822	CGT	2	6	264497	264502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5043	NC_021822	CAC	2	6	264587	264592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853065
5044	NC_021822	CCA	2	6	264669	264674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853065
5045	NC_021822	GCT	2	6	264706	264711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5046	NC_021822	TG	3	6	264772	264777	0 %	50 %	50 %	0 %	525853065
5047	NC_021822	GCA	2	6	264808	264813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5048	NC_021822	TTTGAT	2	12	264854	264865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525853065
5049	NC_021822	GCA	2	6	264943	264948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5050	NC_021822	TGC	2	6	264957	264962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5051	NC_021822	AATG	2	8	265031	265038	50 %	25 %	25 %	0 %	525853065
5052	NC_021822	CGT	2	6	265042	265047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5053	NC_021822	TGC	2	6	265146	265151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5054	NC_021822	TTC	2	6	265172	265177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853065
5055	NC_021822	CAC	2	6	265274	265279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853065
5056	NC_021822	ACGC	2	8	265300	265307	25 %	0 %	25 %	50 %	525853065
5057	NC_021822	ATC	2	6	265344	265349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853065
5058	NC_021822	TAA	2	6	265374	265379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853065
5059	NC_021822	A	6	6	265386	265391	100 %	0 %	0 %	0 %	525853065
5060	NC_021822	CTG	2	6	265411	265416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5061	NC_021822	T	6	6	265492	265497	0 %	100 %	0 %	0 %	525853065
5062	NC_021822	ACC	2	6	265508	265513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853065
5063	NC_021822	TCGC	2	8	265536	265543	0 %	25 %	25 %	50 %	525853065
5064	NC_021822	TGC	2	6	265544	265549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853065
5065	NC_021822	TC	3	6	265555	265560	0 %	50 %	0 %	50 %	525853065
5066	NC_021822	TGT	2	6	265581	265586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853065
5067	NC_021822	TGTGC	2	10	265606	265615	0 %	40 %	40 %	20 %	525853065
5068	NC_021822	T	7	7	265630	265636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021822	GT	3	6	265672	265677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021822	CAA	2	6	265741	265746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853066
5071	NC_021822	AGC	2	6	265827	265832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853066
5072	NC_021822	AAC	2	6	265841	265846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853066
5073	NC_021822	ATCC	2	8	265881	265888	25 %	25 %	0 %	50 %	525853066
5074	NC_021822	AT	3	6	265893	265898	50 %	50 %	0 %	0 %	525853066
5075	NC_021822	CCG	2	6	265899	265904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853066
5076	NC_021822	CGC	2	6	265920	265925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853066
5077	NC_021822	TCT	2	6	265996	266001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853066
5078	NC_021822	ATC	2	6	266114	266119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853066
5079	NC_021822	GCG	2	6	266176	266181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853066
5080	NC_021822	GGT	2	6	266398	266403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853066
5081	NC_021822	CTT	2	6	266443	266448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853066
5082	NC_021822	ATG	2	6	266552	266557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853066
5083	NC_021822	TCTA	2	8	266576	266583	25 %	50 %	0 %	25 %	525853066
5084	NC_021822	T	6	6	266592	266597	0 %	100 %	0 %	0 %	525853066
5085	NC_021822	GGT	2	6	266701	266706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853067
5086	NC_021822	TTG	2	6	266753	266758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853067
5087	NC_021822	CTT	2	6	266795	266800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853067
5088	NC_021822	TCA	2	6	266806	266811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853067
5089	NC_021822	TGCAG	2	10	266814	266823	20 %	20 %	40 %	20 %	525853067
5090	NC_021822	GCT	2	6	266908	266913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853067
5091	NC_021822	GCG	2	6	267052	267057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853067
5092	NC_021822	GTT	2	6	267216	267221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853067
5093	NC_021822	GATTT	2	10	267297	267306	20 %	60 %	20 %	0 %	525853067
5094	NC_021822	CAT	2	6	267353	267358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853067
5095	NC_021822	AC	3	6	267365	267370	50 %	0 %	0 %	50 %	525853067
5096	NC_021822	CTT	2	6	267515	267520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853067
5097	NC_021822	AGGA	2	8	267567	267574	50 %	0 %	50 %	0 %	525853067
5098	NC_021822	TGA	2	6	267593	267598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853067
5099	NC_021822	CGT	2	6	267611	267616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853067
5100	NC_021822	GTG	2	6	267658	267663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853067
5101	NC_021822	ACC	2	6	267703	267708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853067
5102	NC_021822	CTT	2	6	267753	267758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853067
5103	NC_021822	GTA	2	6	267778	267783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853067
5104	NC_021822	ATG	2	6	267788	267793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853067
5105	NC_021822	AGT	2	6	267830	267835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853067
5106	NC_021822	TAAAT	2	10	267846	267855	60 %	40 %	0 %	0 %	525853067
5107	NC_021822	CGA	2	6	267881	267886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021822	A	6	6	267929	267934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021822	CAAG	2	8	267935	267942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_021822	CAT	2	6	268055	268060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853068
5111	NC_021822	GAC	2	6	268135	268140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853068
5112	NC_021822	AGA	2	6	268256	268261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021822	CAA	2	6	268272	268277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_021822	AGTTGT	2	12	268285	268296	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525853069
5115	NC_021822	TGC	2	6	268322	268327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853069
5116	NC_021822	GCC	2	6	268375	268380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853069
5117	NC_021822	ATA	2	6	268382	268387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853069
5118	NC_021822	GTT	2	6	268581	268586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853069
5119	NC_021822	ATG	2	6	268613	268618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853069
5120	NC_021822	AGA	2	6	268623	268628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853069
5121	NC_021822	CA	3	6	268687	268692	50 %	0 %	0 %	50 %	525853069
5122	NC_021822	AAG	2	6	268757	268762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853069
5123	NC_021822	ACC	2	6	268798	268803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853069
5124	NC_021822	GTA	2	6	268939	268944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853069
5125	NC_021822	GCAA	2	8	269040	269047	50 %	0 %	25 %	25 %	525853069
5126	NC_021822	CAA	2	6	269070	269075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853069
5127	NC_021822	GCC	2	6	269117	269122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853069
5128	NC_021822	A	6	6	269164	269169	100 %	0 %	0 %	0 %	525853069
5129	NC_021822	AAT	2	6	269204	269209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021822	TTTC	2	8	269367	269374	0 %	75 %	0 %	25 %	525853070
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5133	NC_021822	TTAA	2	8	269601	269608	50 %	50 %	0 %	0 %	525853070
5134	NC_021822	CAT	2	6	269630	269635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853070
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5156	NC_021822	TG	3	6	271002	271007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_021822	TCTTA	2	10	271035	271044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5158	NC_021822	ATC	2	6	271087	271092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_021822	GGC	2	6	271236	271241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853072
5164	NC_021822	A	8	8	271242	271249	100 %	0 %	0 %	0 %	525853072
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5189	NC_021822	GC	3	6	272273	272278	0 %	0 %	50 %	50 %	525853073
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5244	NC_021822	GTCT	2	8	275160	275167	0 %	50 %	25 %	25 %	525853074
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5246	NC_021822	A	6	6	275242	275247	100 %	0 %	0 %	0 %	525853074
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5249	NC_021822	AAG	2	6	275289	275294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853074
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5253	NC_021822	AGT	2	6	275416	275421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853074
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5257	NC_021822	A	6	6	275614	275619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_021822	GCT	2	6	275621	275626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_021822	TTG	2	6	275748	275753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853075
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5361	NC_021822	TTGA	2	8	281610	281617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5363	NC_021822	ACGTT	2	10	281788	281797	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5366	NC_021822	GTA	2	6	281900	281905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853082
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5368	NC_021822	AGA	2	6	281930	281935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853082
5369	NC_021822	GTT	2	6	281947	281952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853082
5370	NC_021822	ACG	2	6	281992	281997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853082
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5372	NC_021822	CCA	2	6	282036	282041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853082
5373	NC_021822	GCA	2	6	282067	282072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853082
5374	NC_021822	AGA	2	6	282162	282167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853082
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5376	NC_021822	GCA	2	6	282238	282243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853082
5377	NC_021822	CGCT	2	8	282325	282332	0 %	25 %	25 %	50 %	525853082
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5379	NC_021822	ATT	2	6	282377	282382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_021822	CTT	2	6	282453	282458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5438	NC_021822	GAT	2	6	284953	284958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853084
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5451	NC_021822	TGC	2	6	285686	285691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853086
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5454	NC_021822	TCAA	2	8	285908	285915	50 %	25 %	0 %	25 %	525853086
5455	NC_021822	TGA	2	6	285995	286000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853086
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5463	NC_021822	T	7	7	286676	286682	0 %	100 %	0 %	0 %	525853087
5464	NC_021822	TTCGG	2	10	286684	286693	0 %	40 %	40 %	20 %	525853087
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5478	NC_021822	ATGA	2	8	287010	287017	50 %	25 %	25 %	0 %	525853087
5479	NC_021822	GA	3	6	287019	287024	50 %	0 %	50 %	0 %	525853087
5480	NC_021822	CCT	2	6	287029	287034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853087
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5482	NC_021822	T	7	7	287170	287176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_021822	TGG	2	6	287200	287205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5484	NC_021822	TA	3	6	287218	287223	50 %	50 %	0 %	0 %	525853088
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5489	NC_021822	TGG	3	9	287585	287593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853088
5490	NC_021822	CCGA	2	8	287598	287605	25 %	0 %	25 %	50 %	525853088
5491	NC_021822	ATT	2	6	287650	287655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853088
5492	NC_021822	GGC	2	6	287739	287744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853088
5493	NC_021822	TCG	2	6	287789	287794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853088
5494	NC_021822	TGA	2	6	287810	287815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853088
5495	NC_021822	AGA	2	6	287819	287824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853088
5496	NC_021822	GAAG	2	8	287852	287859	50 %	0 %	50 %	0 %	525853088
5497	NC_021822	TCA	2	6	287872	287877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853088
5498	NC_021822	TTG	2	6	287883	287888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853088
5499	NC_021822	GC	3	6	287953	287958	0 %	0 %	50 %	50 %	525853088
5500	NC_021822	GTGG	2	8	287985	287992	0 %	25 %	75 %	0 %	525853088

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