MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 5248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021821	TTAT	2	8	1995	2002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021821	TTTA	2	8	2228	2235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021821	TAGC	2	8	2323	2330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021821	ATTT	2	8	2688	2695	25 %	75 %	0 %	0 %	525848541
5	NC_021821	TTTA	2	8	2730	2737	25 %	75 %	0 %	0 %	525848541
6	NC_021821	CAAA	2	8	2802	2809	75 %	0 %	0 %	25 %	525848542
7	NC_021821	TTTC	2	8	2850	2857	0 %	75 %	0 %	25 %	525848542
8	NC_021821	GAAT	2	8	2939	2946	50 %	25 %	25 %	0 %	525848542
9	NC_021821	CATA	2	8	3095	3102	50 %	25 %	0 %	25 %	525848542
10	NC_021821	TTCC	2	8	4424	4431	0 %	50 %	0 %	50 %	525847175
11	NC_021821	TTTG	2	8	4645	4652	0 %	75 %	25 %	0 %	525847175
12	NC_021821	GCTC	2	8	4865	4872	0 %	25 %	25 %	50 %	525847175
13	NC_021821	GTTT	2	8	5083	5090	0 %	75 %	25 %	0 %	525847176
14	NC_021821	TGCT	2	8	5128	5135	0 %	50 %	25 %	25 %	525847176
15	NC_021821	TTGC	2	8	5184	5191	0 %	50 %	25 %	25 %	525847176
16	NC_021821	AGCT	2	8	5274	5281	25 %	25 %	25 %	25 %	525847176
17	NC_021821	TCAA	2	8	6523	6530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021821	ACCA	2	8	6729	6736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021821	TCTT	2	8	6868	6875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021821	ATCA	2	8	6993	7000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021821	TAAG	2	8	7239	7246	50 %	25 %	25 %	0 %	525847177
22	NC_021821	TAGA	2	8	7465	7472	50 %	25 %	25 %	0 %	525847177
23	NC_021821	CTTA	2	8	8457	8464	25 %	50 %	0 %	25 %	525847179
24	NC_021821	ATAA	3	12	9149	9160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021821	TGCC	2	8	9455	9462	0 %	25 %	25 %	50 %	525848544
26	NC_021821	ATCC	2	8	9981	9988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021821	CAAA	2	8	10481	10488	75 %	0 %	0 %	25 %	525848545
28	NC_021821	AACC	2	8	10565	10572	50 %	0 %	0 %	50 %	525848545
29	NC_021821	CAGC	2	8	11211	11218	25 %	0 %	25 %	50 %	525848545
30	NC_021821	AGTA	2	8	11439	11446	50 %	25 %	25 %	0 %	525848545
31	NC_021821	CATT	2	8	11615	11622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021821	GATT	2	8	11711	11718	25 %	50 %	25 %	0 %	525848546
33	NC_021821	CCAT	2	8	11797	11804	25 %	25 %	0 %	50 %	525848546
34	NC_021821	TTTC	2	8	11846	11853	0 %	75 %	0 %	25 %	525848546
35	NC_021821	GTCA	2	8	12020	12027	25 %	25 %	25 %	25 %	525848546
36	NC_021821	AACG	2	8	12155	12162	50 %	0 %	25 %	25 %	525848546
37	NC_021821	GAAC	2	8	12396	12403	50 %	0 %	25 %	25 %	525848546
38	NC_021821	AACT	2	8	12584	12591	50 %	25 %	0 %	25 %	525848546
39	NC_021821	TACT	2	8	12887	12894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021821	ATTG	2	8	13388	13395	25 %	50 %	25 %	0 %	525847181
41	NC_021821	CAAT	2	8	13452	13459	50 %	25 %	0 %	25 %	525847181
42	NC_021821	TTTG	2	8	13630	13637	0 %	75 %	25 %	0 %	525847181
43	NC_021821	TACT	2	8	13881	13888	25 %	50 %	0 %	25 %	525847182
44	NC_021821	TCTA	2	8	14108	14115	25 %	50 %	0 %	25 %	525847182
45	NC_021821	TCTA	2	8	14183	14190	25 %	50 %	0 %	25 %	525847182
46	NC_021821	TTTG	2	8	14278	14285	0 %	75 %	25 %	0 %	525847182
47	NC_021821	TTTA	2	8	14549	14556	25 %	75 %	0 %	0 %	525847182
48	NC_021821	GATT	2	8	14695	14702	25 %	50 %	25 %	0 %	525847183
49	NC_021821	TATT	2	8	15771	15778	25 %	75 %	0 %	0 %	525847183
50	NC_021821	ATTT	2	8	15841	15848	25 %	75 %	0 %	0 %	525848547
51	NC_021821	AGAA	2	8	16824	16831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021821	AATA	2	8	16960	16967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021821	ATCT	2	8	17120	17127	25 %	50 %	0 %	25 %	525847185
54	NC_021821	TTCT	2	8	17549	17556	0 %	75 %	0 %	25 %	525847185
55	NC_021821	TATT	2	8	17656	17663	25 %	75 %	0 %	0 %	525847185
56	NC_021821	ACTA	2	8	18277	18284	50 %	25 %	0 %	25 %	525848548
57	NC_021821	AGCT	2	8	18324	18331	25 %	25 %	25 %	25 %	525848548
58	NC_021821	CAGC	2	8	18607	18614	25 %	0 %	25 %	50 %	525848548
59	NC_021821	TAGT	2	8	18831	18838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021821	GTCA	2	8	19018	19025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021821	ATTT	2	8	19240	19247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021821	AAGA	2	8	19446	19453	75 %	0 %	25 %	0 %	525848549
63	NC_021821	TATC	2	8	19655	19662	25 %	50 %	0 %	25 %	525848550
64	NC_021821	GGAT	2	8	19713	19720	25 %	25 %	50 %	0 %	525848550
65	NC_021821	TATC	2	8	21409	21416	25 %	50 %	0 %	25 %	525848552
66	NC_021821	TAAG	2	8	21590	21597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021821	TCAC	2	8	21681	21688	25 %	25 %	0 %	50 %	525847186
68	NC_021821	TCCT	2	8	22138	22145	0 %	50 %	0 %	50 %	525847186
69	NC_021821	ATTC	2	8	24196	24203	25 %	50 %	0 %	25 %	525848553
70	NC_021821	GAGT	2	8	24496	24503	25 %	25 %	50 %	0 %	525848553
71	NC_021821	TAAA	2	8	24879	24886	75 %	25 %	0 %	0 %	525848553
72	NC_021821	GAAC	2	8	25040	25047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021821	GACA	2	8	25474	25481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021821	GGTT	2	8	25891	25898	0 %	50 %	50 %	0 %	525847187
75	NC_021821	TCGG	2	8	26185	26192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021821	CAAA	2	8	26202	26209	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021821	ACTT	2	8	26545	26552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021821	AAAT	2	8	26753	26760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021821	TTAA	2	8	26873	26880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021821	AATA	2	8	27475	27482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021821	TTTC	2	8	27792	27799	0 %	75 %	0 %	25 %	525848554
82	NC_021821	AACC	2	8	28014	28021	50 %	0 %	0 %	50 %	525848555
83	NC_021821	ATTG	2	8	28183	28190	25 %	50 %	25 %	0 %	525848555
84	NC_021821	CGCA	2	8	28219	28226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021821	ATTC	2	8	28257	28264	25 %	50 %	0 %	25 %	525848556
86	NC_021821	AAAT	2	8	28376	28383	75 %	25 %	0 %	0 %	525848556
87	NC_021821	TGCT	2	8	28587	28594	0 %	50 %	25 %	25 %	525848557
88	NC_021821	CTAA	2	8	29264	29271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021821	CAAA	2	8	29450	29457	75 %	0 %	0 %	25 %	525847190
90	NC_021821	CTCA	2	8	29567	29574	25 %	25 %	0 %	50 %	525847190
91	NC_021821	TCAG	2	8	29618	29625	25 %	25 %	25 %	25 %	525847190
92	NC_021821	TTCG	2	8	30269	30276	0 %	50 %	25 %	25 %	525847190
93	NC_021821	AGAA	2	8	30748	30755	75 %	0 %	25 %	0 %	525847191
94	NC_021821	TCAA	2	8	31227	31234	50 %	25 %	0 %	25 %	525847191
95	NC_021821	TGAG	2	8	31259	31266	25 %	25 %	50 %	0 %	525847191
96	NC_021821	TCAG	2	8	31426	31433	25 %	25 %	25 %	25 %	525847191
97	NC_021821	CACG	2	8	31557	31564	25 %	0 %	25 %	50 %	525847191
98	NC_021821	TCAT	2	8	31691	31698	25 %	50 %	0 %	25 %	525847191
99	NC_021821	CGAG	2	8	33872	33879	25 %	0 %	50 %	25 %	525847193
100	NC_021821	CACT	2	8	33977	33984	25 %	25 %	0 %	50 %	525847193
101	NC_021821	TAAC	2	8	34217	34224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021821	GAAC	2	8	34715	34722	50 %	0 %	25 %	25 %	525847194
103	NC_021821	CTAT	2	8	34781	34788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021821	ATAA	2	8	34914	34921	75 %	25 %	0 %	0 %	525848558
105	NC_021821	TGTT	2	8	35005	35012	0 %	75 %	25 %	0 %	525848558
106	NC_021821	TAAG	2	8	35520	35527	50 %	25 %	25 %	0 %	525848559
107	NC_021821	TGAT	2	8	35547	35554	25 %	50 %	25 %	0 %	525848559
108	NC_021821	GGAA	2	8	35908	35915	50 %	0 %	50 %	0 %	525848559
109	NC_021821	CCAA	2	8	36165	36172	50 %	0 %	0 %	50 %	525848559
110	NC_021821	GCGG	2	8	36176	36183	0 %	0 %	75 %	25 %	525848559
111	NC_021821	TGAA	2	8	36234	36241	50 %	25 %	25 %	0 %	525848559
112	NC_021821	ATGA	2	8	37582	37589	50 %	25 %	25 %	0 %	525848560
113	NC_021821	AGAT	2	8	37839	37846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021821	CTTT	2	8	37884	37891	0 %	75 %	0 %	25 %	525847195
115	NC_021821	CCCA	2	8	37923	37930	25 %	0 %	0 %	75 %	525847195
116	NC_021821	ATAA	2	8	38098	38105	75 %	25 %	0 %	0 %	525847195
117	NC_021821	GTTT	2	8	38180	38187	0 %	75 %	25 %	0 %	525847195
118	NC_021821	TTGC	2	8	38307	38314	0 %	50 %	25 %	25 %	525847195
119	NC_021821	CTAG	2	8	38507	38514	25 %	25 %	25 %	25 %	525847195
120	NC_021821	ATGA	2	8	38605	38612	50 %	25 %	25 %	0 %	525847195
121	NC_021821	TACC	2	8	38685	38692	25 %	25 %	0 %	50 %	525847195
122	NC_021821	CGCA	2	8	39707	39714	25 %	0 %	25 %	50 %	525847196
123	NC_021821	CAAC	2	8	40097	40104	50 %	0 %	0 %	50 %	525847196
124	NC_021821	CAGC	2	8	42665	42672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021821	AACC	2	8	42841	42848	50 %	0 %	0 %	50 %	525847198
126	NC_021821	TAAG	2	8	43198	43205	50 %	25 %	25 %	0 %	525847198
127	NC_021821	CCAA	2	8	43760	43767	50 %	0 %	0 %	50 %	525847199
128	NC_021821	CAAT	2	8	43962	43969	50 %	25 %	0 %	25 %	525847199
129	NC_021821	CATA	2	8	44089	44096	50 %	25 %	0 %	25 %	525847199
130	NC_021821	CAAA	2	8	44190	44197	75 %	0 %	0 %	25 %	525847199
131	NC_021821	TGGT	2	8	44539	44546	0 %	50 %	50 %	0 %	525847199
132	NC_021821	GTCT	2	8	44788	44795	0 %	50 %	25 %	25 %	525847199
133	NC_021821	TAGT	2	8	44975	44982	25 %	50 %	25 %	0 %	525847199
134	NC_021821	GGCT	2	8	45237	45244	0 %	25 %	50 %	25 %	525847199
135	NC_021821	ACTG	2	8	45275	45282	25 %	25 %	25 %	25 %	525847199
136	NC_021821	AATA	2	8	45309	45316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021821	TTTG	2	8	45659	45666	0 %	75 %	25 %	0 %	525847200
138	NC_021821	ATGA	2	8	47416	47423	50 %	25 %	25 %	0 %	525847201
139	NC_021821	CTTG	2	8	47592	47599	0 %	50 %	25 %	25 %	525847201
140	NC_021821	TGCG	2	8	47732	47739	0 %	25 %	50 %	25 %	525847201
141	NC_021821	CTCG	2	8	48418	48425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021821	TTTG	2	8	49109	49116	0 %	75 %	25 %	0 %	525847202
143	NC_021821	ATGC	2	8	49443	49450	25 %	25 %	25 %	25 %	525847202
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