MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 35851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021821	ATGCC	2	10	188761	188770	20 %	20 %	20 %	40 %	525847297
3502	NC_021821	GTT	2	6	188840	188845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847297
3503	NC_021821	CTT	2	6	188863	188868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847297
3504	NC_021821	CTT	2	6	188947	188952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847297
3505	NC_021821	AGA	2	6	188984	188989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847297
3506	NC_021821	TTCC	2	8	188999	189006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_021821	GTT	2	6	189009	189014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021821	AATT	2	8	189086	189093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021821	AAGGA	2	10	189106	189115	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021821	GGTT	2	8	189218	189225	0 %	50 %	50 %	0 %	525847298
3511	NC_021821	GGC	2	6	189258	189263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847298
3512	NC_021821	GTC	2	6	189505	189510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847298
3513	NC_021821	TCA	3	9	189563	189571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847298
3514	NC_021821	ACA	2	6	189579	189584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847298
3515	NC_021821	CAG	2	6	189615	189620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847298
3516	NC_021821	TTC	2	6	189631	189636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847298
3517	NC_021821	GCG	2	6	189714	189719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847298
3518	NC_021821	TGC	2	6	189736	189741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847298
3519	NC_021821	TGA	2	6	189779	189784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847298
3520	NC_021821	CAA	2	6	189876	189881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847298
3521	NC_021821	GAT	2	6	189901	189906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847298
3522	NC_021821	TGT	2	6	189996	190001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847298
3523	NC_021821	CGT	2	6	190092	190097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847298
3524	NC_021821	ATT	2	6	190144	190149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847298
3525	NC_021821	CAAA	2	8	190151	190158	75 %	0 %	0 %	25 %	525847298
3526	NC_021821	TTG	2	6	190555	190560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847298
3527	NC_021821	AGAA	2	8	190561	190568	75 %	0 %	25 %	0 %	525847298
3528	NC_021821	TAT	2	6	190617	190622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847298
3529	NC_021821	ATC	2	6	190658	190663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847298
3530	NC_021821	CAA	2	6	190683	190688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847298
3531	NC_021821	CTCG	2	8	190713	190720	0 %	25 %	25 %	50 %	525847298
3532	NC_021821	ATG	2	6	190753	190758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847298
3533	NC_021821	AT	3	6	190780	190785	50 %	50 %	0 %	0 %	525847298
3534	NC_021821	TCCA	2	8	190789	190796	25 %	25 %	0 %	50 %	525847298
3535	NC_021821	AGAA	2	8	190804	190811	75 %	0 %	25 %	0 %	525847298
3536	NC_021821	CAC	2	6	190861	190866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847298
3537	NC_021821	A	6	6	190970	190975	100 %	0 %	0 %	0 %	525847298
3538	NC_021821	TGT	2	6	191025	191030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847298
3539	NC_021821	CTT	2	6	191052	191057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847298
3540	NC_021821	TCA	2	6	191076	191081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847298
3541	NC_021821	GTT	2	6	191132	191137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847298
3542	NC_021821	CCA	2	6	191148	191153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847298
3543	NC_021821	TTG	2	6	191162	191167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847298
3544	NC_021821	TCT	2	6	191202	191207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847298
3545	NC_021821	A	7	7	191284	191290	100 %	0 %	0 %	0 %	525847298
3546	NC_021821	CT	3	6	191392	191397	0 %	50 %	0 %	50 %	525847298
3547	NC_021821	AAC	2	6	191437	191442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847298
3548	NC_021821	TAAA	2	8	191455	191462	75 %	25 %	0 %	0 %	525847298
3549	NC_021821	ATT	2	6	191471	191476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847298
3550	NC_021821	TTA	2	6	191487	191492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847298
3551	NC_021821	T	7	7	191508	191514	0 %	100 %	0 %	0 %	525847298
3552	NC_021821	TCT	2	6	191545	191550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848571
3553	NC_021821	AAG	2	6	191551	191556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848571
3554	NC_021821	AGT	2	6	191570	191575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848571
3555	NC_021821	GTA	2	6	191586	191591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848571
3556	NC_021821	T	6	6	191592	191597	0 %	100 %	0 %	0 %	525848571
3557	NC_021821	T	6	6	191622	191627	0 %	100 %	0 %	0 %	525848571
3558	NC_021821	T	6	6	191696	191701	0 %	100 %	0 %	0 %	525848571
3559	NC_021821	CAT	2	6	191795	191800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848571
3560	NC_021821	ATG	2	6	191806	191811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848571
3561	NC_021821	CCG	2	6	192029	192034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848571
3562	NC_021821	AGT	2	6	192041	192046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848571
3563	NC_021821	CCAC	2	8	192130	192137	25 %	0 %	0 %	75 %	525848571
3564	NC_021821	GTAC	2	8	192209	192216	25 %	25 %	25 %	25 %	525848571
3565	NC_021821	CAC	2	6	192347	192352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848571
3566	NC_021821	GAA	2	6	192388	192393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848571
3567	NC_021821	CAG	2	6	192422	192427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848571
3568	NC_021821	TGAC	2	8	192449	192456	25 %	25 %	25 %	25 %	525848571
3569	NC_021821	CCTTC	2	10	192467	192476	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3570	NC_021821	ACG	2	6	192515	192520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021821	AGT	2	6	192529	192534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847299
3572	NC_021821	TCA	2	6	192576	192581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847299
3573	NC_021821	GT	3	6	192590	192595	0 %	50 %	50 %	0 %	525847299
3574	NC_021821	CGTGT	2	10	192614	192623	0 %	40 %	40 %	20 %	525847299
3575	NC_021821	CAT	2	6	192625	192630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847299
3576	NC_021821	GAT	2	6	192659	192664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847299
3577	NC_021821	TTC	2	6	192674	192679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847299
3578	NC_021821	TCAG	2	8	192699	192706	25 %	25 %	25 %	25 %	525847299
3579	NC_021821	TTCG	2	8	192713	192720	0 %	50 %	25 %	25 %	525847299
3580	NC_021821	CAT	2	6	192724	192729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847299
3581	NC_021821	CGT	2	6	192743	192748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847299
3582	NC_021821	GCA	2	6	192799	192804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847299
3583	NC_021821	CAGC	2	8	192898	192905	25 %	0 %	25 %	50 %	525847299
3584	NC_021821	CGA	2	6	192983	192988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847299
3585	NC_021821	ATGTG	2	10	193249	193258	20 %	40 %	40 %	0 %	525847299
3586	NC_021821	TCT	2	6	193323	193328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847299
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3588	NC_021821	GTG	2	6	193436	193441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847299
3589	NC_021821	GTA	2	6	193443	193448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847299
3590	NC_021821	GAT	2	6	193523	193528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847299
3591	NC_021821	TGT	3	9	193639	193647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847299
3592	NC_021821	TGT	2	6	193685	193690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847299
3593	NC_021821	TCGT	2	8	193708	193715	0 %	50 %	25 %	25 %	525847299
3594	NC_021821	GCT	2	6	193784	193789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847299
3595	NC_021821	CAAT	2	8	193791	193798	50 %	25 %	0 %	25 %	525847299
3596	NC_021821	T	7	7	193927	193933	0 %	100 %	0 %	0 %	525847299
3597	NC_021821	ATT	2	6	193958	193963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021821	ATT	2	6	193998	194003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021821	T	6	6	194026	194031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021821	T	6	6	194061	194066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021821	TGA	2	6	194075	194080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021821	CCAA	2	8	194101	194108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_021821	AAC	2	6	194111	194116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_021821	TAA	2	6	194168	194173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021821	ATTA	2	8	194235	194242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021821	AT	3	6	194360	194365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021821	AGT	2	6	194378	194383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021821	CAAA	2	8	194385	194392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_021821	AAG	2	6	194459	194464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021821	GCG	2	6	194500	194505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847300
3611	NC_021821	GCT	2	6	194506	194511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847300
3612	NC_021821	TGA	2	6	194516	194521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847300
3613	NC_021821	CAAT	2	8	194539	194546	50 %	25 %	0 %	25 %	525847300
3614	NC_021821	AG	3	6	194598	194603	50 %	0 %	50 %	0 %	525847300
3615	NC_021821	GTA	2	6	194716	194721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847300
3616	NC_021821	GCGG	2	8	194731	194738	0 %	0 %	75 %	25 %	525847300
3617	NC_021821	GGAA	2	8	194829	194836	50 %	0 %	50 %	0 %	525847300
3618	NC_021821	CCAA	2	8	194840	194847	50 %	0 %	0 %	50 %	525847300
3619	NC_021821	TGA	2	6	194897	194902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847300
3620	NC_021821	GGC	2	6	194950	194955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847300
3621	NC_021821	TG	4	8	194967	194974	0 %	50 %	50 %	0 %	525847300
3622	NC_021821	TCTG	2	8	194996	195003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_021821	GCA	2	6	195087	195092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847301
3624	NC_021821	GC	3	6	195129	195134	0 %	0 %	50 %	50 %	525847301
3625	NC_021821	TAT	2	6	195189	195194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847301
3626	NC_021821	TAA	2	6	195280	195285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847301
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3628	NC_021821	TGC	2	6	195530	195535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847301
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3631	NC_021821	TGC	2	6	195650	195655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847301
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3642	NC_021821	CCT	2	6	196397	196402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3643	NC_021821	TAT	2	6	196412	196417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847302
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3872	NC_021821	ACA	2	6	208792	208797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847318
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3883	NC_021821	ATC	2	6	209268	209273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847318
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3885	NC_021821	ACCG	2	8	209333	209340	25 %	0 %	25 %	50 %	525847318
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3954	NC_021821	TTG	2	6	213082	213087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848572
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3961	NC_021821	CTG	2	6	213240	213245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848572
3962	NC_021821	GTC	2	6	213269	213274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848572
3963	NC_021821	G	6	6	213297	213302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3970	NC_021821	TTG	2	6	213553	213558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847321
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3981	NC_021821	GTG	2	6	214138	214143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847322
3982	NC_021821	CAATG	2	10	214146	214155	40 %	20 %	20 %	20 %	525847322
3983	NC_021821	GTA	2	6	214172	214177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847322
3984	NC_021821	CTT	2	6	214207	214212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847322
3985	NC_021821	GTTG	2	8	214226	214233	0 %	50 %	50 %	0 %	525847322
3986	NC_021821	GCC	2	6	214367	214372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847322
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3989	NC_021821	GCA	2	6	214473	214478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847322
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3992	NC_021821	AC	3	6	214576	214581	50 %	0 %	0 %	50 %	525847322
3993	NC_021821	TGA	2	6	214696	214701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847322
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3996	NC_021821	GCT	2	6	214816	214821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847322
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