MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 35851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021821	TCA	2	6	77749	77754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847226
1502	NC_021821	TGA	2	6	77829	77834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847226
1503	NC_021821	TTG	2	6	77836	77841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847226
1504	NC_021821	CGG	2	6	78060	78065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847226
1505	NC_021821	TCT	2	6	78083	78088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847226
1506	NC_021821	ATCA	2	8	78096	78103	50 %	25 %	0 %	25 %	525847226
1507	NC_021821	GAT	2	6	78165	78170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847226
1508	NC_021821	GAT	2	6	78186	78191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847226
1509	NC_021821	CAAAC	2	10	78195	78204	60 %	0 %	0 %	40 %	525847226
1510	NC_021821	GCC	2	6	78244	78249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847226
1511	NC_021821	ATG	2	6	78259	78264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847226
1512	NC_021821	CT	3	6	78273	78278	0 %	50 %	0 %	50 %	525847226
1513	NC_021821	GCC	2	6	78324	78329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847226
1514	NC_021821	CGT	2	6	78344	78349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847226
1515	NC_021821	AGC	2	6	78396	78401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847226
1516	NC_021821	CTG	2	6	78429	78434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847226
1517	NC_021821	ACA	2	6	78446	78451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847226
1518	NC_021821	TGT	2	6	78452	78457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847226
1519	NC_021821	CGC	2	6	78576	78581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847226
1520	NC_021821	A	6	6	78621	78626	100 %	0 %	0 %	0 %	525847226
1521	NC_021821	CAT	2	6	78717	78722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847226
1522	NC_021821	AG	3	6	78742	78747	50 %	0 %	50 %	0 %	525847226
1523	NC_021821	CAC	2	6	78831	78836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847226
1524	NC_021821	ATA	2	6	78864	78869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847226
1525	NC_021821	GCA	2	6	78871	78876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847226
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1527	NC_021821	AGA	2	6	79112	79117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847226
1528	NC_021821	AGT	2	6	79154	79159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021821	ACA	2	6	79192	79197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021821	TTG	2	6	79217	79222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021821	ATT	2	6	79336	79341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021821	ACAA	2	8	79352	79359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_021821	AT	3	6	79365	79370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021821	TA	3	6	79429	79434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021821	AAC	2	6	79445	79450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_021821	TAA	2	6	79455	79460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021821	CAAG	2	8	79470	79477	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_021821	GCC	2	6	79505	79510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_021821	TCA	2	6	79520	79525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847227
1540	NC_021821	T	6	6	79559	79564	0 %	100 %	0 %	0 %	525847227
1541	NC_021821	AAG	2	6	79581	79586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847227
1542	NC_021821	CAT	2	6	79622	79627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847227
1543	NC_021821	GAT	2	6	79631	79636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847227
1544	NC_021821	TCA	2	6	79860	79865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847227
1545	NC_021821	CCG	2	6	79947	79952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847227
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1547	NC_021821	CCA	2	6	80137	80142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847227
1548	NC_021821	ATC	2	6	80151	80156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847227
1549	NC_021821	ATC	2	6	80166	80171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847227
1550	NC_021821	ACC	2	6	80243	80248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847227
1551	NC_021821	AAT	2	6	80249	80254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847227
1552	NC_021821	AAAC	2	8	80255	80262	75 %	0 %	0 %	25 %	525847227
1553	NC_021821	GTC	2	6	80288	80293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847227
1554	NC_021821	AGA	2	6	80359	80364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847227
1555	NC_021821	CCAGC	2	10	80387	80396	20 %	0 %	20 %	60 %	525847227
1556	NC_021821	CGA	2	6	80489	80494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847227
1557	NC_021821	CT	3	6	80513	80518	0 %	50 %	0 %	50 %	525847227
1558	NC_021821	GCTC	2	8	80526	80533	0 %	25 %	25 %	50 %	525847227
1559	NC_021821	CCA	2	6	80598	80603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847227
1560	NC_021821	CAA	2	6	80822	80827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847227
1561	NC_021821	T	6	6	80828	80833	0 %	100 %	0 %	0 %	525847227
1562	NC_021821	ATA	2	6	80862	80867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847227
1563	NC_021821	TCAGC	2	10	80915	80924	20 %	20 %	20 %	40 %	525847228
1564	NC_021821	TCA	2	6	80971	80976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847228
1565	NC_021821	CTT	2	6	80996	81001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847228
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1567	NC_021821	GCG	2	6	81059	81064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847228
1568	NC_021821	CCA	2	6	81095	81100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847228
1569	NC_021821	GTT	2	6	81129	81134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847228
1570	NC_021821	AAT	2	6	81192	81197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847228
1571	NC_021821	TGGTG	2	10	81224	81233	0 %	40 %	60 %	0 %	525847228
1572	NC_021821	ACA	2	6	81296	81301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847228
1573	NC_021821	CCA	2	6	81329	81334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847228
1574	NC_021821	CGCTAA	2	12	81351	81362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525847228
1575	NC_021821	CT	3	6	81363	81368	0 %	50 %	0 %	50 %	525847228
1576	NC_021821	CGA	2	6	81431	81436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847228
1577	NC_021821	GT	3	6	81466	81471	0 %	50 %	50 %	0 %	525847228
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1579	NC_021821	GTG	2	6	81697	81702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847229
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1582	NC_021821	GAAA	2	8	81913	81920	75 %	0 %	25 %	0 %	525847229
1583	NC_021821	CCAA	2	8	81954	81961	50 %	0 %	0 %	50 %	525847229
1584	NC_021821	TGG	2	6	81965	81970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847229
1585	NC_021821	TGA	2	6	81978	81983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847229
1586	NC_021821	GCCA	2	8	81994	82001	25 %	0 %	25 %	50 %	525847229
1587	NC_021821	TCA	2	6	82007	82012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847229
1588	NC_021821	CCA	2	6	82029	82034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847229
1589	NC_021821	GC	3	6	82057	82062	0 %	0 %	50 %	50 %	525847229
1590	NC_021821	T	6	6	82128	82133	0 %	100 %	0 %	0 %	525847229
1591	NC_021821	CTT	2	6	82137	82142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847229
1592	NC_021821	AGCACT	2	12	82157	82168	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525847229
1593	NC_021821	GCG	2	6	82251	82256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847229
1594	NC_021821	CAG	2	6	82320	82325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847229
1595	NC_021821	CTGCT	2	10	82395	82404	0 %	40 %	20 %	40 %	525847230
1596	NC_021821	TTGA	2	8	82407	82414	25 %	50 %	25 %	0 %	525847230
1597	NC_021821	TC	3	6	82466	82471	0 %	50 %	0 %	50 %	525847230
1598	NC_021821	TGA	2	6	82484	82489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847230
1599	NC_021821	TGT	2	6	82538	82543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847230
1600	NC_021821	T	6	6	82571	82576	0 %	100 %	0 %	0 %	525847230
1601	NC_021821	ATCA	2	8	82617	82624	50 %	25 %	0 %	25 %	525847230
1602	NC_021821	ATTC	2	8	82664	82671	25 %	50 %	0 %	25 %	525847230
1603	NC_021821	ATAA	2	8	82742	82749	75 %	25 %	0 %	0 %	525847230
1604	NC_021821	CAT	2	6	82757	82762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847230
1605	NC_021821	T	6	6	82842	82847	0 %	100 %	0 %	0 %	525847230
1606	NC_021821	TA	3	6	82899	82904	50 %	50 %	0 %	0 %	525847230
1607	NC_021821	AAT	2	6	83007	83012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847230
1608	NC_021821	GCG	2	6	83021	83026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847230
1609	NC_021821	GTTT	2	8	83074	83081	0 %	75 %	25 %	0 %	525847230
1610	NC_021821	CTG	2	6	83091	83096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847230
1611	NC_021821	CGA	2	6	83098	83103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847230
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1613	NC_021821	CGT	2	6	83202	83207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847230
1614	NC_021821	AAG	2	6	83212	83217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847230
1615	NC_021821	CCG	3	9	83240	83248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847230
1616	NC_021821	CCA	3	9	83279	83287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847230
1617	NC_021821	CAG	2	6	83307	83312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847230
1618	NC_021821	CAA	2	6	83369	83374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847230
1619	NC_021821	A	7	7	83485	83491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021821	A	6	6	83496	83501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021821	CAT	2	6	83533	83538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021821	AAT	2	6	83559	83564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021821	CCAC	2	8	83590	83597	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1624	NC_021821	GACA	2	8	83609	83616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_021821	A	6	6	83618	83623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021821	GAG	2	6	83624	83629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021821	CTC	2	6	83636	83641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_021821	GCA	2	6	83675	83680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1998	NC_021821	CAA	2	6	104064	104069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847239
1999	NC_021821	CCA	2	6	104097	104102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847239
2000	NC_021821	GCTT	2	8	104179	104186	0 %	50 %	25 %	25 %	525847239

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