MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019971	TGA	2	6	207247	207252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659357
4002	NC_019971	TCG	2	6	207262	207267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659358
4003	NC_019971	ACA	2	6	207354	207359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659358
4004	NC_019971	TGC	2	6	207478	207483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659358
4005	NC_019971	CAAA	2	8	207490	207497	75 %	0 %	0 %	25 %	433659358
4006	NC_019971	TGG	2	6	207520	207525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659358
4007	NC_019971	T	6	6	207534	207539	0 %	100 %	0 %	0 %	433659358
4008	NC_019971	GTG	2	6	207613	207618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659358
4009	NC_019971	GCA	2	6	207652	207657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659358
4010	NC_019971	ACGC	2	8	207749	207756	25 %	0 %	25 %	50 %	433659358
4011	NC_019971	GTT	2	6	207845	207850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659358
4012	NC_019971	GCC	2	6	207897	207902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659358
4013	NC_019971	T	6	6	207966	207971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_019971	TGC	2	6	207980	207985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_019971	TCA	2	6	208106	208111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_019971	AATA	2	8	208158	208165	75 %	25 %	0 %	0 %	433659359
4017	NC_019971	GGTT	2	8	208244	208251	0 %	50 %	50 %	0 %	433659359
4018	NC_019971	TGC	2	6	208297	208302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659359
4019	NC_019971	T	6	6	208339	208344	0 %	100 %	0 %	0 %	433659359
4020	NC_019971	CGA	2	6	208345	208350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659359
4021	NC_019971	AGA	2	6	208415	208420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659359
4022	NC_019971	AAC	2	6	208422	208427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659359
4023	NC_019971	CTT	2	6	208462	208467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659359
4024	NC_019971	CTT	3	9	208507	208515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659359
4025	NC_019971	GTA	2	6	208523	208528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659359
4026	NC_019971	TTG	2	6	208572	208577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659359
4027	NC_019971	CAG	2	6	208595	208600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659359
4028	NC_019971	GTACTT	2	12	208703	208714	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433659359
4029	NC_019971	GCT	2	6	208718	208723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659359
4030	NC_019971	GTA	2	6	208730	208735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659359
4031	NC_019971	CAT	2	6	208829	208834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659359
4032	NC_019971	TCG	2	6	208923	208928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659359
4033	NC_019971	CAC	2	6	208976	208981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659359
4034	NC_019971	AGA	2	6	209030	209035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659359
4035	NC_019971	CCG	2	6	209067	209072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659359
4036	NC_019971	GCC	2	6	209141	209146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659359
4037	NC_019971	CGG	2	6	209200	209205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659359
4038	NC_019971	TTC	2	6	209277	209282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659359
4039	NC_019971	GTT	2	6	209297	209302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_019971	A	6	6	209362	209367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019971	AAGA	2	8	209405	209412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019971	GATG	2	8	209561	209568	25 %	25 %	50 %	0 %	433659360
4043	NC_019971	GGT	2	6	209574	209579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659360
4044	NC_019971	TGG	2	6	209621	209626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659360
4045	NC_019971	TGT	2	6	209642	209647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659360
4046	NC_019971	GGT	2	6	209675	209680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659360
4047	NC_019971	GCTAA	2	10	209691	209700	40 %	20 %	20 %	20 %	433659360
4048	NC_019971	CGT	2	6	209709	209714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659360
4049	NC_019971	CCGCG	2	10	209719	209728	0 %	0 %	40 %	60 %	433659360
4050	NC_019971	GGC	2	6	209801	209806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659360
4051	NC_019971	AC	3	6	209865	209870	50 %	0 %	0 %	50 %	433659360
4052	NC_019971	A	6	6	209910	209915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_019971	T	7	7	209953	209959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_019971	TG	3	6	209978	209983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019971	AGT	2	6	209994	209999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_019971	A	6	6	210025	210030	100 %	0 %	0 %	0 %	433659361
4057	NC_019971	GC	3	6	210104	210109	0 %	0 %	50 %	50 %	433659361
4058	NC_019971	AAC	2	6	210117	210122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659361
4059	NC_019971	CGA	2	6	210140	210145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659361
4060	NC_019971	GAA	2	6	210234	210239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659361
4061	NC_019971	AAC	2	6	210294	210299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659361
4062	NC_019971	GAT	2	6	210402	210407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659361
4063	NC_019971	GCTC	2	8	210456	210463	0 %	25 %	25 %	50 %	433659361
4064	NC_019971	GCG	2	6	210471	210476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659361
4065	NC_019971	ATG	2	6	210493	210498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659361
4066	NC_019971	GCC	2	6	210500	210505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659361
4067	NC_019971	TCG	2	6	210542	210547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659361
4068	NC_019971	GAA	2	6	210555	210560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659361
4069	NC_019971	ATG	2	6	210584	210589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019971	CAT	2	6	210705	210710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659362
4071	NC_019971	GTG	2	6	210714	210719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659362
4072	NC_019971	TTAG	2	8	210720	210727	25 %	50 %	25 %	0 %	433659362
4073	NC_019971	CAA	2	6	210761	210766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659362
4074	NC_019971	AGTGT	2	10	210795	210804	20 %	40 %	40 %	0 %	433659362
4075	NC_019971	CCTT	2	8	210811	210818	0 %	50 %	0 %	50 %	433659362
4076	NC_019971	TCTT	2	8	210895	210902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_019971	CTT	2	6	210979	210984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_019971	CT	3	6	210991	210996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_019971	TAA	2	6	211060	211065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019971	TGG	2	6	211070	211075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019971	TGT	2	6	211160	211165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019971	TG	3	6	211178	211183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019971	A	6	6	211213	211218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019971	TAAT	2	8	211219	211226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_019971	GT	3	6	211254	211259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_019971	TGT	2	6	211308	211313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_019971	AT	3	6	211369	211374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019971	ATT	2	6	211428	211433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_019971	AAC	2	6	211434	211439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_019971	TGA	2	6	211449	211454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019971	TG	3	6	211462	211467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_019971	CCA	2	6	211472	211477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_019971	CAATA	2	10	211506	211515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4094	NC_019971	TATT	2	8	211547	211554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019971	TCAT	2	8	211579	211586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_019971	TTG	2	6	211598	211603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019971	GTT	2	6	211611	211616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019971	ATA	2	6	211618	211623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_019971	TTGCT	2	10	211653	211662	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4100	NC_019971	CTT	2	6	211664	211669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_019971	TGT	2	6	211673	211678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019971	TTTA	2	8	211689	211696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_019971	A	6	6	211764	211769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019971	AAT	2	6	211857	211862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019971	GCA	2	6	211920	211925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659363
4106	NC_019971	CA	3	6	211924	211929	50 %	0 %	0 %	50 %	433659363
4107	NC_019971	GAT	2	6	211938	211943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659363
4108	NC_019971	CGC	2	6	211946	211951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659363
4109	NC_019971	TGT	2	6	211958	211963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659363
4110	NC_019971	CAT	2	6	211985	211990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659363
4111	NC_019971	TAGCAC	2	12	212016	212027	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433659363
4112	NC_019971	TTGT	2	8	212066	212073	0 %	75 %	25 %	0 %	433659363
4113	NC_019971	GAC	2	6	212125	212130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659363
4114	NC_019971	G	6	6	212211	212216	0 %	0 %	100 %	0 %	433659363
4115	NC_019971	AGA	2	6	212229	212234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659363
4116	NC_019971	A	6	6	212451	212456	100 %	0 %	0 %	0 %	433659363
4117	NC_019971	CGCT	2	8	212485	212492	0 %	25 %	25 %	50 %	433659363
4118	NC_019971	GTT	2	6	212511	212516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659363
4119	NC_019971	GGT	2	6	212569	212574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659363
4120	NC_019971	TGA	2	6	212649	212654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659363
4121	NC_019971	TCA	2	6	212680	212685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659363
4122	NC_019971	TTG	2	6	212734	212739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659363
4123	NC_019971	AAC	2	6	212794	212799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_019971	AAT	2	6	212815	212820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659364
4125	NC_019971	A	6	6	212825	212830	100 %	0 %	0 %	0 %	433659364
4126	NC_019971	GCTG	2	8	212864	212871	0 %	25 %	50 %	25 %	433659364
4127	NC_019971	GAT	2	6	212879	212884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659364
4128	NC_019971	AAG	2	6	212916	212921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659364
4129	NC_019971	CGA	2	6	212964	212969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659364
4130	NC_019971	AAG	2	6	213051	213056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659364
4131	NC_019971	TAA	2	6	213115	213120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659364
4132	NC_019971	GAC	3	9	213149	213157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659364
4133	NC_019971	GCG	2	6	213200	213205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659364
4134	NC_019971	AAG	2	6	213216	213221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659364
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4137	NC_019971	AAG	2	6	213281	213286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659364
4138	NC_019971	CTC	2	6	213300	213305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659364
4139	NC_019971	TGA	2	6	213370	213375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659364
4140	NC_019971	CAC	2	6	213384	213389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659364
4141	NC_019971	TCT	2	6	213424	213429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659364
4142	NC_019971	ATA	2	6	213468	213473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659364
4143	NC_019971	CTA	2	6	213550	213555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659364
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4145	NC_019971	TGA	2	6	213619	213624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659364
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4149	NC_019971	GAAGA	2	10	213764	213773	60 %	0 %	40 %	0 %	433659364
4150	NC_019971	GTT	2	6	213778	213783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659364
4151	NC_019971	ATCG	2	8	213802	213809	25 %	25 %	25 %	25 %	433659364
4152	NC_019971	ATC	2	6	214004	214009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659364
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4160	NC_019971	CGT	2	6	214395	214400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659364
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4176	NC_019971	AGA	2	6	215224	215229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659364
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4213	NC_019971	GAGCA	2	10	217310	217319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4214	NC_019971	GA	3	6	217391	217396	50 %	0 %	50 %	0 %	433659366
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4228	NC_019971	CGTC	2	8	218256	218263	0 %	25 %	25 %	50 %	433659367
4229	NC_019971	TGAG	2	8	218274	218281	25 %	25 %	50 %	0 %	433659367
4230	NC_019971	TTC	2	6	218303	218308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659367
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4235	NC_019971	ATC	2	6	218506	218511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4240	NC_019971	TGAC	2	8	218883	218890	25 %	25 %	25 %	25 %	433659368
4241	NC_019971	CGAG	2	8	219093	219100	25 %	0 %	50 %	25 %	433659368
4242	NC_019971	GCA	2	6	219127	219132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659368
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4245	NC_019971	GTTG	2	8	219325	219332	0 %	50 %	50 %	0 %	433659368
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4247	NC_019971	CAA	2	6	219409	219414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659368
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4249	NC_019971	TTG	2	6	219472	219477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_019971	AATT	2	8	219491	219498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_019971	AAG	2	6	219521	219526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_019971	GAA	3	9	219571	219579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_019971	GCT	2	6	226270	226275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659376
4375	NC_019971	CTG	2	6	226395	226400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659376
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4378	NC_019971	GTG	2	6	226543	226548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659376
4379	NC_019971	TGA	2	6	226582	226587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659376
4380	NC_019971	GGT	2	6	226590	226595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659376
4381	NC_019971	TGA	2	6	226610	226615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659376
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4410	NC_019971	CAT	2	6	227747	227752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659376
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4480	NC_019971	ATT	2	6	230980	230985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4481	NC_019971	A	6	6	231006	231011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4482	NC_019971	TTCA	2	8	231012	231019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4483	NC_019971	AAT	2	6	231052	231057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4484	NC_019971	TTG	2	6	231119	231124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4485	NC_019971	ATG	2	6	231253	231258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4491	NC_019971	AGA	2	6	231459	231464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659379
4492	NC_019971	G	6	6	231486	231491	0 %	0 %	100 %	0 %	433659379
4493	NC_019971	GAT	2	6	231604	231609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659379
4494	NC_019971	GTG	2	6	231629	231634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659379
4495	NC_019971	TCC	2	6	231657	231662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659379
4496	NC_019971	CAG	2	6	231715	231720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659379
4497	NC_019971	ATC	2	6	231757	231762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659379
4498	NC_019971	CAA	3	9	231855	231863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659379
4499	NC_019971	CCAAA	2	10	231934	231943	60 %	0 %	0 %	40 %	433659379
4500	NC_019971	GTG	2	6	232045	232050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659379

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