MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_019971	CGG	2	6	1196447	1196452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660231
23003	NC_019971	ATCA	2	8	1196558	1196565	50 %	25 %	0 %	25 %	433660231
23004	NC_019971	CCA	2	6	1196566	1196571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660231
23005	NC_019971	CTG	2	6	1196626	1196631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660231
23006	NC_019971	CTC	2	6	1196650	1196655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433660232
23007	NC_019971	TCA	2	6	1196696	1196701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660232
23008	NC_019971	TGT	2	6	1196745	1196750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660232
23009	NC_019971	AAT	2	6	1196800	1196805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433660232
23010	NC_019971	AATC	2	8	1196808	1196815	50 %	25 %	0 %	25 %	433660232
23011	NC_019971	CGG	2	6	1196839	1196844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660232
23012	NC_019971	GAA	2	6	1196851	1196856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660232
23013	NC_019971	CCAA	2	8	1196897	1196904	50 %	0 %	0 %	50 %	433660232
23014	NC_019971	TTC	2	6	1196935	1196940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660232
23015	NC_019971	TCA	2	6	1196967	1196972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660232
23016	NC_019971	CTCA	2	8	1197106	1197113	25 %	25 %	0 %	50 %	433660232
23017	NC_019971	CGG	2	6	1197230	1197235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660232
23018	NC_019971	TGA	2	6	1197264	1197269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660232
23019	NC_019971	T	6	6	1197311	1197316	0 %	100 %	0 %	0 %	433660232
23020	NC_019971	CTTTGG	2	12	1197378	1197389	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433660232
23021	NC_019971	TTC	2	6	1197523	1197528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660232
23022	NC_019971	T	6	6	1197536	1197541	0 %	100 %	0 %	0 %	433660232
23023	NC_019971	ATC	2	6	1197619	1197624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660232
23024	NC_019971	CAA	2	6	1197668	1197673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23025	NC_019971	T	6	6	1197738	1197743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23026	NC_019971	CAA	2	6	1197791	1197796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23027	NC_019971	AAC	2	6	1197799	1197804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23028	NC_019971	GAA	2	6	1197930	1197935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23029	NC_019971	A	6	6	1197953	1197958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23030	NC_019971	TAA	2	6	1197965	1197970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23031	NC_019971	CTT	2	6	1198195	1198200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660233
23032	NC_019971	ACGA	2	8	1198223	1198230	50 %	0 %	25 %	25 %	433660233
23033	NC_019971	GCC	2	6	1198265	1198270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660233
23034	NC_019971	CATTTG	2	12	1198307	1198318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433660233
23035	NC_019971	GCA	2	6	1198405	1198410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660233
23036	NC_019971	AC	3	6	1198438	1198443	50 %	0 %	0 %	50 %	433660233
23037	NC_019971	TCA	2	6	1198497	1198502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660233
23038	NC_019971	CATC	2	8	1198504	1198511	25 %	25 %	0 %	50 %	433660233
23039	NC_019971	GTT	2	6	1198574	1198579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660233
23040	NC_019971	TG	3	6	1198594	1198599	0 %	50 %	50 %	0 %	433660233
23041	NC_019971	CAC	2	6	1198645	1198650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660233
23042	NC_019971	AAC	2	6	1198725	1198730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660233
23043	NC_019971	CGT	2	6	1198963	1198968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23044	NC_019971	GAA	2	6	1199047	1199052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660234
23045	NC_019971	ACG	2	6	1199070	1199075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660234
23046	NC_019971	CT	3	6	1199169	1199174	0 %	50 %	0 %	50 %	433660234
23047	NC_019971	GTG	2	6	1199221	1199226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433660234
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23050	NC_019971	AGA	2	6	1199289	1199294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660234
23051	NC_019971	GC	3	6	1199331	1199336	0 %	0 %	50 %	50 %	433660234
23052	NC_019971	CTT	2	6	1199554	1199559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660235
23053	NC_019971	CTCA	2	8	1199672	1199679	25 %	25 %	0 %	50 %	433660235
23054	NC_019971	CTTT	2	8	1199719	1199726	0 %	75 %	0 %	25 %	433660235
23055	NC_019971	ACC	2	6	1199736	1199741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660235
23056	NC_019971	CTG	2	6	1199756	1199761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660235
23057	NC_019971	TAG	2	6	1199763	1199768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660235
23058	NC_019971	AGAA	2	8	1199785	1199792	75 %	0 %	25 %	0 %	433660235
23059	NC_019971	TGTC	2	8	1199803	1199810	0 %	50 %	25 %	25 %	433660235
23060	NC_019971	CAT	2	6	1199845	1199850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660235
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23063	NC_019971	CCA	2	6	1199903	1199908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660235
23064	NC_019971	GAA	2	6	1199925	1199930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660235
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23067	NC_019971	AAC	2	6	1200009	1200014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660235
23068	NC_019971	TGCG	2	8	1200106	1200113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23069	NC_019971	GAT	2	6	1200150	1200155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23070	NC_019971	ATCC	2	8	1200206	1200213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23071	NC_019971	TG	3	6	1200218	1200223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23072	NC_019971	CCT	2	6	1200238	1200243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23073	NC_019971	T	7	7	1200303	1200309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23074	NC_019971	A	6	6	1200315	1200320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23075	NC_019971	AAT	2	6	1200353	1200358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23076	NC_019971	GTC	2	6	1200363	1200368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23077	NC_019971	TTC	2	6	1200373	1200378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23078	NC_019971	TTC	2	6	1200452	1200457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23079	NC_019971	GA	4	8	1200497	1200504	50 %	0 %	50 %	0 %	433660236
23080	NC_019971	TC	3	6	1200557	1200562	0 %	50 %	0 %	50 %	433660236
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23083	NC_019971	TCG	2	6	1200623	1200628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660236
23084	NC_019971	TACT	2	8	1200630	1200637	25 %	50 %	0 %	25 %	433660236
23085	NC_019971	TGC	2	6	1200720	1200725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660236
23086	NC_019971	TTGC	2	8	1200742	1200749	0 %	50 %	25 %	25 %	433660236
23087	NC_019971	GGC	2	6	1200789	1200794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660236
23088	NC_019971	ACA	2	6	1200830	1200835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660236
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23090	NC_019971	TTC	2	6	1200874	1200879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660236
23091	NC_019971	GGC	2	6	1200880	1200885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660236
23092	NC_019971	GAC	2	6	1200991	1200996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660236
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23099	NC_019971	CGGG	2	8	1201418	1201425	0 %	0 %	75 %	25 %	433660236
23100	NC_019971	ACT	2	6	1201460	1201465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660236
23101	NC_019971	TGC	2	6	1201481	1201486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660236
23102	NC_019971	CTTTG	3	15	1201511	1201525	0 %	60 %	20 %	20 %	433660236
23103	NC_019971	CG	3	6	1201687	1201692	0 %	0 %	50 %	50 %	433660236
23104	NC_019971	TTG	2	6	1201708	1201713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660236
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23106	NC_019971	CTA	2	6	1201734	1201739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660236
23107	NC_019971	TTC	2	6	1201745	1201750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660236
23108	NC_019971	TGG	2	6	1201797	1201802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433660236
23109	NC_019971	TGC	2	6	1201823	1201828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660236
23110	NC_019971	CAA	2	6	1201858	1201863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660236
23111	NC_019971	CCT	2	6	1201883	1201888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433660236
23112	NC_019971	ATTCTC	2	12	1202002	1202013	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23113	NC_019971	CAT	2	6	1202025	1202030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23114	NC_019971	CAA	2	6	1202127	1202132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23115	NC_019971	GCA	3	9	1202176	1202184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23116	NC_019971	AGC	2	6	1202244	1202249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23117	NC_019971	GCG	2	6	1202363	1202368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660237
23118	NC_019971	GCTC	2	8	1202470	1202477	0 %	25 %	25 %	50 %	433660237
23119	NC_019971	CCA	2	6	1202496	1202501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660237
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23354	NC_019971	AAG	2	6	1215859	1215864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660248
23355	NC_019971	CTA	2	6	1215884	1215889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660248
23356	NC_019971	ACC	2	6	1215932	1215937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660248
23357	NC_019971	GTTT	2	8	1216018	1216025	0 %	75 %	25 %	0 %	433660248
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23359	NC_019971	CCG	2	6	1216105	1216110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660248
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23374	NC_019971	T	6	6	1216750	1216755	0 %	100 %	0 %	0 %	433660249
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23377	NC_019971	A	7	7	1216830	1216836	100 %	0 %	0 %	0 %	433660249
23378	NC_019971	TGA	2	6	1216840	1216845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660249
23379	NC_019971	ATAG	2	8	1216884	1216891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23380	NC_019971	CAT	2	6	1216906	1216911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23382	NC_019971	TA	3	6	1217068	1217073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23383	NC_019971	GAT	2	6	1217075	1217080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23384	NC_019971	CAA	2	6	1217091	1217096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660251
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23403	NC_019971	CTAT	2	8	1218400	1218407	25 %	50 %	0 %	25 %	433660252
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23417	NC_019971	AGC	2	6	1219065	1219070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660252
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23429	NC_019971	CTG	2	6	1219652	1219657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660252
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23441	NC_019971	TTTG	2	8	1220241	1220248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23442	NC_019971	AATCG	2	10	1220296	1220305	40 %	20 %	20 %	20 %	433660253
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23454	NC_019971	CGC	2	6	1220733	1220738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660253
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23464	NC_019971	TTC	2	6	1221075	1221080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660253
23465	NC_019971	TTC	2	6	1221116	1221121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660253
23466	NC_019971	ACA	2	6	1221146	1221151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660253
23467	NC_019971	ATCA	2	8	1221255	1221262	50 %	25 %	0 %	25 %	433660253
23468	NC_019971	CGCT	2	8	1221290	1221297	0 %	25 %	25 %	50 %	433660253
23469	NC_019971	CAAGC	2	10	1221311	1221320	40 %	0 %	20 %	40 %	433660253
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