MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019971	TGA	2	6	51611	51616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019971	TG	3	6	51637	51642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019971	GAT	2	6	51775	51780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659223
1004	NC_019971	ATT	2	6	51850	51855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019971	T	6	6	51930	51935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019971	GTT	2	6	51972	51977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019971	CAAC	2	8	52013	52020	50 %	0 %	0 %	50 %	433659224
1008	NC_019971	ACGG	2	8	52070	52077	25 %	0 %	50 %	25 %	433659224
1009	NC_019971	T	6	6	52160	52165	0 %	100 %	0 %	0 %	433659224
1010	NC_019971	ATC	2	6	52170	52175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659224
1011	NC_019971	CAG	2	6	52190	52195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659224
1012	NC_019971	CTGT	2	8	52278	52285	0 %	50 %	25 %	25 %	433659224
1013	NC_019971	ATC	2	6	52287	52292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659224
1014	NC_019971	TGG	2	6	52480	52485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659224
1015	NC_019971	GT	3	6	52501	52506	0 %	50 %	50 %	0 %	433659224
1016	NC_019971	CAT	2	6	52511	52516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659224
1017	NC_019971	TAGCAA	2	12	52576	52587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	433659224
1018	NC_019971	CGT	2	6	52589	52594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659224
1019	NC_019971	TCGC	2	8	52633	52640	0 %	25 %	25 %	50 %	433659224
1020	NC_019971	AGC	2	6	52641	52646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659224
1021	NC_019971	CGG	2	6	52712	52717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659224
1022	NC_019971	GGC	2	6	52802	52807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659224
1023	NC_019971	TAC	2	6	52890	52895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659224
1024	NC_019971	AGC	2	6	52914	52919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659224
1025	NC_019971	CTT	2	6	52943	52948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659224
1026	NC_019971	CGG	2	6	52969	52974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659224
1027	NC_019971	AGAGA	2	10	52998	53007	60 %	0 %	40 %	0 %	433659224
1028	NC_019971	GTTA	2	8	53057	53064	25 %	50 %	25 %	0 %	433659224
1029	NC_019971	GT	3	6	53092	53097	0 %	50 %	50 %	0 %	433659224
1030	NC_019971	ATC	2	6	53277	53282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659224
1031	NC_019971	TGT	2	6	53365	53370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019971	A	6	6	53379	53384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019971	TGT	2	6	53469	53474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659225
1034	NC_019971	GAT	2	6	53478	53483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659225
1035	NC_019971	ACCA	2	8	53545	53552	50 %	0 %	0 %	50 %	433659225
1036	NC_019971	TGA	2	6	53573	53578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659225
1037	NC_019971	TGC	2	6	53634	53639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1038	NC_019971	AC	3	6	53698	53703	50 %	0 %	0 %	50 %	433659225
1039	NC_019971	GTC	2	6	53719	53724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1040	NC_019971	CAC	2	6	53730	53735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659225
1041	NC_019971	CGC	2	6	53808	53813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659225
1042	NC_019971	CG	3	6	53845	53850	0 %	0 %	50 %	50 %	433659225
1043	NC_019971	TTG	2	6	54002	54007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659225
1044	NC_019971	CGT	2	6	54021	54026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1045	NC_019971	TCT	2	6	54053	54058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659225
1046	NC_019971	CAT	2	6	54103	54108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659225
1047	NC_019971	T	6	6	54154	54159	0 %	100 %	0 %	0 %	433659225
1048	NC_019971	AC	3	6	54186	54191	50 %	0 %	0 %	50 %	433659225
1049	NC_019971	CCA	2	6	54193	54198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659225
1050	NC_019971	GCA	2	6	54260	54265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1051	NC_019971	CTG	2	6	54279	54284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1052	NC_019971	CCA	2	6	54318	54323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659225
1053	NC_019971	GCT	2	6	54405	54410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1054	NC_019971	TGC	2	6	54428	54433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1055	NC_019971	GC	3	6	54448	54453	0 %	0 %	50 %	50 %	433659225
1056	NC_019971	GCTT	2	8	54482	54489	0 %	50 %	25 %	25 %	433659225
1057	NC_019971	CAA	2	6	54541	54546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659225
1058	NC_019971	ATC	2	6	54556	54561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659225
1059	NC_019971	TGC	2	6	54604	54609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1060	NC_019971	ATCA	2	8	54616	54623	50 %	25 %	0 %	25 %	433659225
1061	NC_019971	CTC	2	6	54643	54648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659225
1062	NC_019971	TCGG	2	8	54664	54671	0 %	25 %	50 %	25 %	433659225
1063	NC_019971	GGC	2	6	54736	54741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659225
1064	NC_019971	GAA	2	6	54766	54771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659225
1065	NC_019971	AGG	2	6	54799	54804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659225
1066	NC_019971	CTA	2	6	54885	54890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659225
1067	NC_019971	TTC	2	6	54922	54927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659225
1068	NC_019971	AACCA	2	10	54931	54940	60 %	0 %	0 %	40 %	433659225
1069	NC_019971	TAA	2	6	54967	54972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659225
1070	NC_019971	GCG	2	6	55014	55019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659225
1071	NC_019971	GTA	2	6	55021	55026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659225
1072	NC_019971	CAG	2	6	55071	55076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659225
1073	NC_019971	TGG	2	6	55110	55115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659225
1074	NC_019971	CG	3	6	55121	55126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_019971	A	6	6	55130	55135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019971	CGAG	2	8	55137	55144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_019971	GTA	2	6	55273	55278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659226
1078	NC_019971	ACC	2	6	55336	55341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659226
1079	NC_019971	CA	3	6	55424	55429	50 %	0 %	0 %	50 %	433659226
1080	NC_019971	TTCA	2	8	55477	55484	25 %	50 %	0 %	25 %	433659226
1081	NC_019971	TGA	2	6	55683	55688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659226
1082	NC_019971	CG	3	6	55714	55719	0 %	0 %	50 %	50 %	433659226
1083	NC_019971	CCG	2	6	55733	55738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659226
1084	NC_019971	GTG	2	6	55788	55793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659226
1085	NC_019971	ACCA	2	8	55806	55813	50 %	0 %	0 %	50 %	433659226
1086	NC_019971	CA	3	6	55812	55817	50 %	0 %	0 %	50 %	433659226
1087	NC_019971	GAA	2	6	55825	55830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659226
1088	NC_019971	T	6	6	55959	55964	0 %	100 %	0 %	0 %	433659227
1089	NC_019971	TTG	2	6	55989	55994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659227
1090	NC_019971	GTT	2	6	56087	56092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659227
1091	NC_019971	ATG	2	6	56267	56272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659227
1092	NC_019971	TAA	2	6	56366	56371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659227
1093	NC_019971	T	6	6	56372	56377	0 %	100 %	0 %	0 %	433659227
1094	NC_019971	GAT	2	6	56394	56399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659227
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1096	NC_019971	GCA	2	6	56683	56688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659227
1097	NC_019971	T	6	6	56700	56705	0 %	100 %	0 %	0 %	433659227
1098	NC_019971	ATA	2	6	56707	56712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659227
1099	NC_019971	CGA	2	6	56738	56743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_019971	AAT	2	6	56797	56802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019971	GCA	2	6	56850	56855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659228
1102	NC_019971	CCG	2	6	56899	56904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659228
1103	NC_019971	GCACC	2	10	56981	56990	20 %	0 %	20 %	60 %	433659228
1104	NC_019971	CAC	2	6	57008	57013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659228
1105	NC_019971	CAG	2	6	57157	57162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659228
1106	NC_019971	AGTG	2	8	57221	57228	25 %	25 %	50 %	0 %	433659228
1107	NC_019971	CTT	2	6	57283	57288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659228
1108	NC_019971	GT	3	6	57309	57314	0 %	50 %	50 %	0 %	433659228
1109	NC_019971	TGG	2	6	57325	57330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659228
1110	NC_019971	CAC	2	6	57354	57359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659228
1111	NC_019971	ATCT	2	8	57564	57571	25 %	50 %	0 %	25 %	433659228
1112	NC_019971	CGT	2	6	57733	57738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_019971	AT	3	6	57782	57787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019971	ATGG	2	8	57854	57861	25 %	25 %	50 %	0 %	433659229
1115	NC_019971	GTC	2	6	57957	57962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659229
1116	NC_019971	TG	3	6	58140	58145	0 %	50 %	50 %	0 %	433659229
1117	NC_019971	TAC	2	6	58205	58210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659229
1118	NC_019971	TCA	2	6	58257	58262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659229
1119	NC_019971	TGA	2	6	58374	58379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659229
1120	NC_019971	TGC	2	6	58485	58490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659229
1121	NC_019971	CCT	2	6	58625	58630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_019971	TCT	2	6	58644	58649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019971	T	7	7	58686	58692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019971	GT	4	8	58693	58700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019971	GTA	2	6	58711	58716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019971	T	6	6	58726	58731	0 %	100 %	0 %	0 %	433659230
1127	NC_019971	TGC	2	6	58767	58772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659230
1128	NC_019971	GCTCTT	2	12	58903	58914	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433659230
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