MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 8609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	ATCA	2	8	440	447	50 %	25 %	0 %	25 %	433656323
2	NC_019955	GTGG	2	8	641	648	0 %	25 %	75 %	0 %	433656323
3	NC_019955	GGTT	2	8	696	703	0 %	50 %	50 %	0 %	433656323
4	NC_019955	GTCG	2	8	1348	1355	0 %	25 %	50 %	25 %	433656324
5	NC_019955	ATCA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	0 %	25 %	433656324
6	NC_019955	TTGG	2	8	2182	2189	0 %	50 %	50 %	0 %	433656324
7	NC_019955	ATTA	2	8	2311	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019955	ACCA	2	8	2464	2471	50 %	0 %	0 %	50 %	433656325
9	NC_019955	AGCA	2	8	2985	2992	50 %	0 %	25 %	25 %	433656325
10	NC_019955	GTGA	2	8	2993	3000	25 %	25 %	50 %	0 %	433656325
11	NC_019955	AGCC	2	8	3022	3029	25 %	0 %	25 %	50 %	433656325
12	NC_019955	TACG	2	8	3152	3159	25 %	25 %	25 %	25 %	433656325
13	NC_019955	TCGA	2	8	3778	3785	25 %	25 %	25 %	25 %	433656325
14	NC_019955	TTGA	2	8	3893	3900	25 %	50 %	25 %	0 %	433656325
15	NC_019955	AAGA	2	8	3958	3965	75 %	0 %	25 %	0 %	433656325
16	NC_019955	GTTA	2	8	4012	4019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019955	TTCA	2	8	4064	4071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019955	TTTG	2	8	4345	4352	0 %	75 %	25 %	0 %	433656326
19	NC_019955	CGAC	2	8	4409	4416	25 %	0 %	25 %	50 %	433656326
20	NC_019955	CCGG	2	8	4917	4924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019955	CACG	2	8	5393	5400	25 %	0 %	25 %	50 %	433656328
22	NC_019955	AAAC	2	8	5465	5472	75 %	0 %	0 %	25 %	433656328
23	NC_019955	GTAC	2	8	5722	5729	25 %	25 %	25 %	25 %	433656329
24	NC_019955	CCGA	2	8	6003	6010	25 %	0 %	25 %	50 %	433656329
25	NC_019955	AATG	2	8	6430	6437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019955	CCAG	2	8	6668	6675	25 %	0 %	25 %	50 %	433656330
27	NC_019955	CAAA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	0 %	25 %	433656330
28	NC_019955	GTTA	2	8	7292	7299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019955	TAAA	2	8	7307	7314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019955	GAAA	2	8	7443	7450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019955	ATCA	2	8	8061	8068	50 %	25 %	0 %	25 %	433656332
32	NC_019955	TTGG	2	8	8542	8549	0 %	50 %	50 %	0 %	433656332
33	NC_019955	TTCG	2	8	8757	8764	0 %	50 %	25 %	25 %	433656332
34	NC_019955	CTAA	2	8	8934	8941	50 %	25 %	0 %	25 %	433656332
35	NC_019955	TGCA	2	8	8998	9005	25 %	25 %	25 %	25 %	433656332
36	NC_019955	GTTC	2	8	9447	9454	0 %	50 %	25 %	25 %	433656333
37	NC_019955	ACGT	2	8	9601	9608	25 %	25 %	25 %	25 %	433656333
38	NC_019955	CGAC	2	8	9664	9671	25 %	0 %	25 %	50 %	433656333
39	NC_019955	GATG	2	8	9770	9777	25 %	25 %	50 %	0 %	433656333
40	NC_019955	CGTG	2	8	9818	9825	0 %	25 %	50 %	25 %	433656333
41	NC_019955	TTCT	2	8	9967	9974	0 %	75 %	0 %	25 %	433656333
42	NC_019955	ATTG	2	8	10193	10200	25 %	50 %	25 %	0 %	433656333
43	NC_019955	ATTT	2	8	10389	10396	25 %	75 %	0 %	0 %	433656334
44	NC_019955	TGTT	2	8	10465	10472	0 %	75 %	25 %	0 %	433656334
45	NC_019955	TCAG	2	8	10828	10835	25 %	25 %	25 %	25 %	433656334
46	NC_019955	CCAT	2	8	11753	11760	25 %	25 %	0 %	50 %	433656335
47	NC_019955	CAAG	2	8	11988	11995	50 %	0 %	25 %	25 %	433656335
48	NC_019955	CGTT	2	8	12026	12033	0 %	50 %	25 %	25 %	433656335
49	NC_019955	TGGT	2	8	13531	13538	0 %	50 %	50 %	0 %	433656335
50	NC_019955	TAGA	2	8	13787	13794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019955	ATCA	2	8	14195	14202	50 %	25 %	0 %	25 %	433656336
52	NC_019955	TCAT	2	8	14477	14484	25 %	50 %	0 %	25 %	433656336
53	NC_019955	GAAA	2	8	14586	14593	75 %	0 %	25 %	0 %	433656337
54	NC_019955	TTAA	2	8	15050	15057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019955	CAAT	2	8	15745	15752	50 %	25 %	0 %	25 %	433656339
56	NC_019955	GTCA	2	8	16250	16257	25 %	25 %	25 %	25 %	433656339
57	NC_019955	CAAA	2	8	16492	16499	75 %	0 %	0 %	25 %	433656339
58	NC_019955	GAGC	2	8	16591	16598	25 %	0 %	50 %	25 %	433656339
59	NC_019955	GCGT	2	8	16756	16763	0 %	25 %	50 %	25 %	433656339
60	NC_019955	GGTA	2	8	17902	17909	25 %	25 %	50 %	0 %	433656340
61	NC_019955	CGGT	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	433656340
62	NC_019955	AGGT	2	8	18832	18839	25 %	25 %	50 %	0 %	433656340
63	NC_019955	GTTT	2	8	18955	18962	0 %	75 %	25 %	0 %	433656340
64	NC_019955	AGCT	2	8	19510	19517	25 %	25 %	25 %	25 %	433656341
65	NC_019955	GTTC	2	8	20136	20143	0 %	50 %	25 %	25 %	433656341
66	NC_019955	CGGA	2	8	20953	20960	25 %	0 %	50 %	25 %	433656341
67	NC_019955	TAGG	2	8	21003	21010	25 %	25 %	50 %	0 %	433656341
68	NC_019955	GTTG	2	8	21053	21060	0 %	50 %	50 %	0 %	433656341
69	NC_019955	GACT	2	8	21236	21243	25 %	25 %	25 %	25 %	433656341
70	NC_019955	TTCT	2	8	21452	21459	0 %	75 %	0 %	25 %	433656342
71	NC_019955	TGCG	2	8	21574	21581	0 %	25 %	50 %	25 %	433656342
72	NC_019955	GCAG	2	8	21627	21634	25 %	0 %	50 %	25 %	433656342
73	NC_019955	AAGT	2	8	21918	21925	50 %	25 %	25 %	0 %	433656342
74	NC_019955	GTTC	2	8	22686	22693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019955	CTAT	2	8	23024	23031	25 %	50 %	0 %	25 %	433656343
76	NC_019955	CATT	2	8	23140	23147	25 %	50 %	0 %	25 %	433656343
77	NC_019955	TTAT	2	8	23644	23651	25 %	75 %	0 %	0 %	433656344
78	NC_019955	ACTG	2	8	23689	23696	25 %	25 %	25 %	25 %	433656344
79	NC_019955	AAAC	2	8	23862	23869	75 %	0 %	0 %	25 %	433656345
80	NC_019955	TAAC	2	8	24170	24177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019955	CGTT	2	8	24194	24201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019955	TAGA	2	8	24302	24309	50 %	25 %	25 %	0 %	433656347
83	NC_019955	TTGA	2	8	25265	25272	25 %	50 %	25 %	0 %	433656348
84	NC_019955	AACC	2	8	26303	26310	50 %	0 %	0 %	50 %	433656349
85	NC_019955	CCAG	2	8	26369	26376	25 %	0 %	25 %	50 %	433656349
86	NC_019955	AGCA	2	8	27811	27818	50 %	0 %	25 %	25 %	433656350
87	NC_019955	TAGA	2	8	28067	28074	50 %	25 %	25 %	0 %	433656351
88	NC_019955	ATCA	2	8	28120	28127	50 %	25 %	0 %	25 %	433656351
89	NC_019955	CAAG	2	8	28611	28618	50 %	0 %	25 %	25 %	433656351
90	NC_019955	GCCA	2	8	28635	28642	25 %	0 %	25 %	50 %	433656351
91	NC_019955	GTTT	2	8	29148	29155	0 %	75 %	25 %	0 %	433656351
92	NC_019955	TGCT	2	8	29304	29311	0 %	50 %	25 %	25 %	433656351
93	NC_019955	ACCA	2	8	29365	29372	50 %	0 %	0 %	50 %	433656351
94	NC_019955	AGTT	2	8	30354	30361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019955	ATGA	2	8	30495	30502	50 %	25 %	25 %	0 %	433656352
96	NC_019955	TACC	2	8	30569	30576	25 %	25 %	0 %	50 %	433656352
97	NC_019955	TCAA	2	8	31154	31161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019955	TGAC	2	8	31457	31464	25 %	25 %	25 %	25 %	433656353
99	NC_019955	CTTA	2	8	32583	32590	25 %	50 %	0 %	25 %	433656353
100	NC_019955	CTCA	2	8	32848	32855	25 %	25 %	0 %	50 %	433656354
101	NC_019955	GAAG	2	8	32932	32939	50 %	0 %	50 %	0 %	433656354
102	NC_019955	GGTT	2	8	33028	33035	0 %	50 %	50 %	0 %	433656354
103	NC_019955	GAAA	2	8	33294	33301	75 %	0 %	25 %	0 %	433656355
104	NC_019955	GTAG	2	8	35059	35066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019955	TGAC	2	8	36260	36267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019955	GTAC	2	8	36343	36350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019955	AGTA	2	8	36746	36753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019955	CGTC	2	8	36783	36790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019955	AAAG	2	8	36905	36912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019955	ACCC	2	8	39217	39224	25 %	0 %	0 %	75 %	433656356
111	NC_019955	GACA	2	8	39430	39437	50 %	0 %	25 %	25 %	433656356
112	NC_019955	TTTG	2	8	39469	39476	0 %	75 %	25 %	0 %	433656356
113	NC_019955	AACA	2	8	39787	39794	75 %	0 %	0 %	25 %	433656356
114	NC_019955	ATGA	2	8	39901	39908	50 %	25 %	25 %	0 %	433656356
115	NC_019955	CGAT	2	8	40288	40295	25 %	25 %	25 %	25 %	433656357
116	NC_019955	TCAC	2	8	40885	40892	25 %	25 %	0 %	50 %	433656357
117	NC_019955	TCTA	2	8	40904	40911	25 %	50 %	0 %	25 %	433656357
118	NC_019955	CAGA	2	8	41602	41609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019955	TTAT	2	8	41745	41752	25 %	75 %	0 %	0 %	433656358
120	NC_019955	AGCT	2	8	41754	41761	25 %	25 %	25 %	25 %	433656358
121	NC_019955	CGTA	2	8	41811	41818	25 %	25 %	25 %	25 %	433656358
122	NC_019955	GACC	2	8	42517	42524	25 %	0 %	25 %	50 %	433656359
123	NC_019955	GACC	2	8	42535	42542	25 %	0 %	25 %	50 %	433656359
124	NC_019955	GGCA	2	8	42767	42774	25 %	0 %	50 %	25 %	433656359
125	NC_019955	TCCA	2	8	42941	42948	25 %	25 %	0 %	50 %	433656359
126	NC_019955	GAAC	2	8	42951	42958	50 %	0 %	25 %	25 %	433656359
127	NC_019955	TGGC	2	8	43389	43396	0 %	25 %	50 %	25 %	433656359
128	NC_019955	CTTG	2	8	43760	43767	0 %	50 %	25 %	25 %	433656359
129	NC_019955	CAAT	2	8	44140	44147	50 %	25 %	0 %	25 %	433656359
130	NC_019955	TGCT	2	8	45041	45048	0 %	50 %	25 %	25 %	433656359
131	NC_019955	ACCA	2	8	45844	45851	50 %	0 %	0 %	50 %	433656360
132	NC_019955	TAAA	2	8	46293	46300	75 %	25 %	0 %	0 %	433656360
133	NC_019955	AAAG	2	8	46348	46355	75 %	0 %	25 %	0 %	433656360
134	NC_019955	GCTT	2	8	46489	46496	0 %	50 %	25 %	25 %	433656361
135	NC_019955	TGAA	2	8	46983	46990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019955	TTCA	2	8	46993	47000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019955	CTAT	2	8	47764	47771	25 %	50 %	0 %	25 %	433656362
138	NC_019955	CAGT	2	8	47800	47807	25 %	25 %	25 %	25 %	433656362
139	NC_019955	ATTG	2	8	47821	47828	25 %	50 %	25 %	0 %	433656362
140	NC_019955	TTGA	2	8	48206	48213	25 %	50 %	25 %	0 %	433656362
141	NC_019955	AAGC	2	8	48438	48445	50 %	0 %	25 %	25 %	433656362
142	NC_019955	TGGT	2	8	48512	48519	0 %	50 %	50 %	0 %	433656362
143	NC_019955	GTTC	2	8	48563	48570	0 %	50 %	25 %	25 %	433656362
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265	NC_019955	TGGT	2	8	92102	92109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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