MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019955	GGC	2	6	174521	174526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_019955	ACG	2	6	174670	174675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_019955	A	6	6	174676	174681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_019955	GACT	2	8	174710	174717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_019955	GGTT	2	8	174850	174857	0 %	50 %	50 %	0 %	433656474
3506	NC_019955	ATGCC	2	10	174869	174878	20 %	20 %	20 %	40 %	433656474
3507	NC_019955	AG	3	6	174888	174893	50 %	0 %	50 %	0 %	433656474
3508	NC_019955	GCG	2	6	174925	174930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656474
3509	NC_019955	TCG	2	6	174944	174949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656474
3510	NC_019955	TGCT	2	8	175065	175072	0 %	50 %	25 %	25 %	433656474
3511	NC_019955	T	6	6	175099	175104	0 %	100 %	0 %	0 %	433656474
3512	NC_019955	GCGTT	2	10	175105	175114	0 %	40 %	40 %	20 %	433656474
3513	NC_019955	GCT	2	6	175135	175140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656474
3514	NC_019955	TTCT	2	8	175206	175213	0 %	75 %	0 %	25 %	433656474
3515	NC_019955	T	6	6	175321	175326	0 %	100 %	0 %	0 %	433656474
3516	NC_019955	TTGC	2	8	175445	175452	0 %	50 %	25 %	25 %	433656474
3517	NC_019955	TGG	2	6	175458	175463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656474
3518	NC_019955	TCT	2	6	175480	175485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656474
3519	NC_019955	ATGC	2	8	175517	175524	25 %	25 %	25 %	25 %	433656474
3520	NC_019955	GGT	2	6	175542	175547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656474
3521	NC_019955	TCAT	2	8	175567	175574	25 %	50 %	0 %	25 %	433656474
3522	NC_019955	TGC	2	6	175695	175700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656474
3523	NC_019955	AG	3	6	175720	175725	50 %	0 %	50 %	0 %	433656474
3524	NC_019955	T	6	6	175770	175775	0 %	100 %	0 %	0 %	433656474
3525	NC_019955	TAC	2	6	175781	175786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656474
3526	NC_019955	GC	3	6	175907	175912	0 %	0 %	50 %	50 %	433656474
3527	NC_019955	TTC	2	6	176074	176079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656475
3528	NC_019955	GTG	2	6	176105	176110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656475
3529	NC_019955	CGTT	2	8	176146	176153	0 %	50 %	25 %	25 %	433656475
3530	NC_019955	GGC	2	6	176199	176204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656475
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3532	NC_019955	TGG	2	6	176397	176402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656475
3533	NC_019955	CGG	3	9	176403	176411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656475
3534	NC_019955	GGT	2	6	176419	176424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656475
3535	NC_019955	T	6	6	176445	176450	0 %	100 %	0 %	0 %	433656475
3536	NC_019955	ATC	2	6	176502	176507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656475
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3538	NC_019955	CGT	2	6	176795	176800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656476
3539	NC_019955	TTC	2	6	176852	176857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656476
3540	NC_019955	CTT	2	6	176904	176909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656476
3541	NC_019955	AACG	2	8	176911	176918	50 %	0 %	25 %	25 %	433656476
3542	NC_019955	TGT	2	6	176920	176925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656476
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3546	NC_019955	TTG	2	6	177169	177174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656477
3547	NC_019955	ATC	2	6	177363	177368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656477
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3549	NC_019955	CGG	2	6	177442	177447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656477
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3555	NC_019955	AGCG	2	8	177619	177626	25 %	0 %	50 %	25 %	433656478
3556	NC_019955	TTC	2	6	177644	177649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656478
3557	NC_019955	ACG	2	6	177665	177670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656478
3558	NC_019955	TGG	2	6	177733	177738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656478
3559	NC_019955	GCCA	2	8	177761	177768	25 %	0 %	25 %	50 %	433656478
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3562	NC_019955	TTGA	2	8	177876	177883	25 %	50 %	25 %	0 %	433656478
3563	NC_019955	GAT	2	6	177920	177925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656478
3564	NC_019955	GAT	2	6	178055	178060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656478
3565	NC_019955	GAT	2	6	178088	178093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656478
3566	NC_019955	TAG	2	6	178178	178183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656478
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3573	NC_019955	ACT	2	6	178446	178451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656478
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3575	NC_019955	CAG	2	6	178526	178531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656478
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3578	NC_019955	TCG	2	6	178686	178691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656478
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3582	NC_019955	TTG	2	6	178766	178771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656478
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3591	NC_019955	TTG	2	6	179075	179080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656479
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3593	NC_019955	GA	3	6	179209	179214	50 %	0 %	50 %	0 %	433656479
3594	NC_019955	CTT	2	6	179218	179223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656479
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3602	NC_019955	GA	3	6	179667	179672	50 %	0 %	50 %	0 %	433656479
3603	NC_019955	GTA	2	6	179679	179684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656479
3604	NC_019955	TAG	2	6	179716	179721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656479
3605	NC_019955	AGTC	2	8	179741	179748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_019955	TTAA	2	8	179785	179792	50 %	50 %	0 %	0 %	433656480
3607	NC_019955	AAG	2	6	179811	179816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656480
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3611	NC_019955	AGAT	3	12	180038	180049	50 %	25 %	25 %	0 %	433656480
3612	NC_019955	TCT	2	6	180057	180062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656480
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3618	NC_019955	TCA	2	6	180393	180398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3619	NC_019955	TGT	2	6	180406	180411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656480
3620	NC_019955	GTC	2	6	180434	180439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3621	NC_019955	CAT	2	6	180517	180522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3622	NC_019955	ACCAGC	2	12	180650	180661	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433656480
3623	NC_019955	TCA	2	6	180717	180722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3624	NC_019955	TCA	2	6	180771	180776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656480
3625	NC_019955	GAT	2	6	180851	180856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
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3628	NC_019955	TGC	2	6	181091	181096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
3629	NC_019955	GTA	2	6	181242	181247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
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3631	NC_019955	GTA	2	6	181274	181279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
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3635	NC_019955	AGT	2	6	181430	181435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656480
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3642	NC_019955	TCG	2	6	181815	181820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656480
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3652	NC_019955	GC	3	6	182244	182249	0 %	0 %	50 %	50 %	433656480
3653	NC_019955	TTG	2	6	182294	182299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656480
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3656	NC_019955	ATT	4	12	182406	182417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3659	NC_019955	A	6	6	182538	182543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3661	NC_019955	AAT	2	6	182577	182582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3662	NC_019955	TAA	2	6	182618	182623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3663	NC_019955	AT	3	6	182661	182666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3664	NC_019955	ATT	2	6	182722	182727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3665	NC_019955	GGT	2	6	182778	182783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3669	NC_019955	T	6	6	182955	182960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3714	NC_019955	GCAT	2	8	185284	185291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3715	NC_019955	A	6	6	185306	185311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3716	NC_019955	A	7	7	185325	185331	100 %	0 %	0 %	0 %	433656483
3717	NC_019955	GACT	2	8	185390	185397	25 %	25 %	25 %	25 %	433656483
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3722	NC_019955	CGTCCT	2	12	185877	185888	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433656483
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3729	NC_019955	TGG	2	6	186051	186056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656483
3730	NC_019955	TAC	2	6	186072	186077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656483
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3733	NC_019955	ACCCA	2	10	186404	186413	40 %	0 %	0 %	60 %	433656483
3734	NC_019955	GCG	2	6	186480	186485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656483
3735	NC_019955	AGCTGA	2	12	186649	186660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433656483
3736	NC_019955	A	6	6	186696	186701	100 %	0 %	0 %	0 %	433656483
3737	NC_019955	CTTT	2	8	186712	186719	0 %	75 %	0 %	25 %	433656483
3738	NC_019955	ACTA	2	8	186801	186808	50 %	25 %	0 %	25 %	433656483
3739	NC_019955	ACATGG	2	12	186853	186864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433656483
3740	NC_019955	AAG	2	6	186867	186872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656483
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3742	NC_019955	CGTT	2	8	186947	186954	0 %	50 %	25 %	25 %	433656483
3743	NC_019955	GTTG	2	8	186967	186974	0 %	50 %	50 %	0 %	433656483
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3997	NC_019955	GTA	2	6	199172	199177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_019955	TAGA	2	8	199219	199226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_019955	ATTT	2	8	199287	199294	25 %	75 %	0 %	0 %	433656500
4000	NC_019955	AGC	2	6	199318	199323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656500

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