MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019955	TCA	2	6	121784	121789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656426
2502	NC_019955	ATG	2	6	121790	121795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656426
2503	NC_019955	TGG	2	6	121799	121804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656426
2504	NC_019955	CAG	2	6	121903	121908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656426
2505	NC_019955	TC	3	6	121913	121918	0 %	50 %	0 %	50 %	433656426
2506	NC_019955	ATC	2	6	121929	121934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656426
2507	NC_019955	A	6	6	121954	121959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_019955	T	6	6	121978	121983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_019955	TTTC	2	8	122019	122026	0 %	75 %	0 %	25 %	433656427
2510	NC_019955	AAGC	2	8	122055	122062	50 %	0 %	25 %	25 %	433656427
2511	NC_019955	GCT	2	6	122111	122116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656427
2512	NC_019955	GCC	2	6	122120	122125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656427
2513	NC_019955	TTCGTA	2	12	122128	122139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433656427
2514	NC_019955	ATC	2	6	122167	122172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656427
2515	NC_019955	CGATAC	2	12	122277	122288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433656427
2516	NC_019955	CGC	2	6	122398	122403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656427
2517	NC_019955	GA	3	6	122457	122462	50 %	0 %	50 %	0 %	433656427
2518	NC_019955	TCA	2	6	122489	122494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656427
2519	NC_019955	GTA	2	6	122695	122700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656427
2520	NC_019955	CGA	2	6	122771	122776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656427
2521	NC_019955	GGAAA	2	10	122821	122830	60 %	0 %	40 %	0 %	433656427
2522	NC_019955	CAA	2	6	122832	122837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656427
2523	NC_019955	GA	3	6	122875	122880	50 %	0 %	50 %	0 %	433656427
2524	NC_019955	TCT	2	6	123266	123271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656428
2525	NC_019955	CTA	2	6	123327	123332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2526	NC_019955	TGAT	2	8	123362	123369	25 %	50 %	25 %	0 %	433656428
2527	NC_019955	CGAT	2	8	123377	123384	25 %	25 %	25 %	25 %	433656428
2528	NC_019955	CAAG	2	8	123388	123395	50 %	0 %	25 %	25 %	433656428
2529	NC_019955	AAGAG	2	10	123421	123430	60 %	0 %	40 %	0 %	433656428
2530	NC_019955	ATC	2	6	123445	123450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2531	NC_019955	AAT	2	6	123517	123522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656428
2532	NC_019955	TGTT	2	8	123665	123672	0 %	75 %	25 %	0 %	433656428
2533	NC_019955	GCA	2	6	123705	123710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2534	NC_019955	TTG	2	6	123715	123720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656428
2535	NC_019955	TCC	2	6	123746	123751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656428
2536	NC_019955	GAT	2	6	123847	123852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2537	NC_019955	AGC	2	6	123908	123913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2538	NC_019955	GTA	2	6	123952	123957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2539	NC_019955	TCA	2	6	124071	124076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2540	NC_019955	TGC	2	6	124105	124110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2541	NC_019955	GTT	2	6	124116	124121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656428
2542	NC_019955	TCA	2	6	124187	124192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2543	NC_019955	CCA	2	6	124193	124198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656428
2544	NC_019955	TGC	2	6	124229	124234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2545	NC_019955	TTG	2	6	124310	124315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656428
2546	NC_019955	GTTT	2	8	124353	124360	0 %	75 %	25 %	0 %	433656428
2547	NC_019955	GGC	2	6	124383	124388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656428
2548	NC_019955	AC	3	6	124500	124505	50 %	0 %	0 %	50 %	433656428
2549	NC_019955	GAC	2	6	124633	124638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2550	NC_019955	CAA	2	6	124644	124649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656428
2551	NC_019955	GTA	2	6	124741	124746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2552	NC_019955	TCAAAC	2	12	124784	124795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	433656428
2553	NC_019955	TGA	2	6	124854	124859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2554	NC_019955	TTC	2	6	124997	125002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656428
2555	NC_019955	TGA	2	6	125211	125216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2556	NC_019955	GAT	2	6	125254	125259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656428
2557	NC_019955	TCG	2	6	125303	125308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2558	NC_019955	CGA	2	6	125318	125323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656428
2559	NC_019955	TCA	2	6	125481	125486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2560	NC_019955	GGT	2	6	125520	125525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656428
2561	NC_019955	CAC	2	6	125575	125580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656428
2562	NC_019955	ATC	2	6	125636	125641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656428
2563	NC_019955	CTTG	2	8	125864	125871	0 %	50 %	25 %	25 %	433656429
2564	NC_019955	TAA	2	6	125901	125906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656429
2565	NC_019955	GAAA	2	8	125931	125938	75 %	0 %	25 %	0 %	433656429
2566	NC_019955	TCT	3	9	126026	126034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656429
2567	NC_019955	ACGT	2	8	126123	126130	25 %	25 %	25 %	25 %	433656429
2568	NC_019955	GCG	2	6	126208	126213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656429
2569	NC_019955	TG	3	6	126229	126234	0 %	50 %	50 %	0 %	433656429
2570	NC_019955	GGC	2	6	126360	126365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656429
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2573	NC_019955	TCAA	2	8	126580	126587	50 %	25 %	0 %	25 %	433656429
2574	NC_019955	TTG	2	6	126628	126633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656429
2575	NC_019955	CGA	2	6	126714	126719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656429
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2577	NC_019955	GAT	2	6	126774	126779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656429
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2579	NC_019955	GTTT	2	8	126824	126831	0 %	75 %	25 %	0 %	433656429
2580	NC_019955	CGG	2	6	126932	126937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656429
2581	NC_019955	ATG	2	6	126961	126966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656429
2582	NC_019955	CTTG	2	8	126998	127005	0 %	50 %	25 %	25 %	433656429
2583	NC_019955	GAG	2	6	127129	127134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433656429
2584	NC_019955	T	6	6	127139	127144	0 %	100 %	0 %	0 %	433656429
2585	NC_019955	GTC	2	6	127167	127172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656429
2586	NC_019955	CGA	2	6	127175	127180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656429
2587	NC_019955	GCA	2	6	127215	127220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_019955	AT	3	6	127273	127278	50 %	50 %	0 %	0 %	433656430
2589	NC_019955	GTG	2	6	127286	127291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656430
2590	NC_019955	GGCCA	2	10	127293	127302	20 %	0 %	40 %	40 %	433656430
2591	NC_019955	GCC	2	6	127372	127377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656430
2592	NC_019955	TGG	2	6	127423	127428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656430
2593	NC_019955	GCCCG	2	10	127432	127441	0 %	0 %	40 %	60 %	433656430
2594	NC_019955	CG	3	6	127458	127463	0 %	0 %	50 %	50 %	433656430
2595	NC_019955	TGA	2	6	127541	127546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656430
2596	NC_019955	CATC	2	8	127605	127612	25 %	25 %	0 %	50 %	433656430
2597	NC_019955	GAT	3	9	127648	127656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656430
2598	NC_019955	ATG	2	6	127796	127801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656430
2599	NC_019955	T	6	6	127836	127841	0 %	100 %	0 %	0 %	433656430
2600	NC_019955	CAG	2	6	127843	127848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656430
2601	NC_019955	GGC	2	6	127918	127923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656430
2602	NC_019955	TTG	2	6	127924	127929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656430
2603	NC_019955	GTTG	2	8	127938	127945	0 %	50 %	50 %	0 %	433656430
2604	NC_019955	TGAG	2	8	127952	127959	25 %	25 %	50 %	0 %	433656430
2605	NC_019955	CGT	2	6	127961	127966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656430
2606	NC_019955	CAAC	2	8	127989	127996	50 %	0 %	0 %	50 %	433656430
2607	NC_019955	CGA	2	6	128061	128066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656430
2608	NC_019955	ACGTC	2	10	128070	128079	20 %	20 %	20 %	40 %	433656430
2609	NC_019955	ATGC	2	8	128139	128146	25 %	25 %	25 %	25 %	433656430
2610	NC_019955	ACA	2	6	128199	128204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656430
2611	NC_019955	CAT	2	6	128241	128246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656430
2612	NC_019955	TGT	2	6	128271	128276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656430
2613	NC_019955	AAT	2	6	128345	128350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_019955	GAA	2	6	128376	128381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_019955	AGA	2	6	128387	128392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_019955	T	6	6	128422	128427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_019955	TAG	2	6	128501	128506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656431
2618	NC_019955	TG	3	6	128551	128556	0 %	50 %	50 %	0 %	433656431
2619	NC_019955	CGAT	2	8	128560	128567	25 %	25 %	25 %	25 %	433656431
2620	NC_019955	GTT	2	6	128568	128573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656431
2621	NC_019955	GAA	2	6	128622	128627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656431
2622	NC_019955	CAGTTG	2	12	128628	128639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656431
2623	NC_019955	TAC	2	6	128696	128701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656431
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2629	NC_019955	GAT	2	6	129040	129045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2631	NC_019955	CTC	2	6	129112	129117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2632	NC_019955	TGAC	2	8	129136	129143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2633	NC_019955	A	6	6	129150	129155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_019955	GCGAG	2	10	129165	129174	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2635	NC_019955	AGT	2	6	129227	129232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656432
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2638	NC_019955	CTG	2	6	129335	129340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
2639	NC_019955	GCT	2	6	129412	129417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656432
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2662	NC_019955	TGA	2	6	130467	130472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656432
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2670	NC_019955	CAC	2	6	130872	130877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2673	NC_019955	T	7	7	131077	131083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2715	NC_019955	GAG	3	9	133614	133622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2716	NC_019955	TTTG	2	8	133690	133697	0 %	75 %	25 %	0 %	433656435
2717	NC_019955	GT	3	6	133801	133806	0 %	50 %	50 %	0 %	433656435
2718	NC_019955	GC	3	6	133833	133838	0 %	0 %	50 %	50 %	433656435
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2723	NC_019955	CAC	2	6	134065	134070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656435
2724	NC_019955	TTC	2	6	134117	134122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656435
2725	NC_019955	CTT	2	6	134128	134133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656435
2726	NC_019955	ATA	2	6	134169	134174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656435
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2728	NC_019955	AG	3	6	134324	134329	50 %	0 %	50 %	0 %	433656436
2729	NC_019955	T	6	6	134373	134378	0 %	100 %	0 %	0 %	433656436
2730	NC_019955	TCT	2	6	134384	134389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656436
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2734	NC_019955	GGT	2	6	134631	134636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656436
2735	NC_019955	CTT	2	6	134639	134644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656436
2736	NC_019955	TGC	2	6	134651	134656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2737	NC_019955	GCTGAT	2	12	134657	134668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656436
2738	NC_019955	GCA	2	6	134793	134798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2739	NC_019955	CGT	2	6	134812	134817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656436
2740	NC_019955	T	6	6	134892	134897	0 %	100 %	0 %	0 %	433656436
2741	NC_019955	CAAA	2	8	134926	134933	75 %	0 %	0 %	25 %	433656436
2742	NC_019955	A	6	6	134931	134936	100 %	0 %	0 %	0 %	433656436
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2989	NC_019955	TGATG	2	10	147806	147815	20 %	40 %	40 %	0 %	433656446
2990	NC_019955	AGC	2	6	147832	147837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656446
2991	NC_019955	TGC	2	6	147848	147853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656446
2992	NC_019955	GAT	2	6	147917	147922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656446
2993	NC_019955	GTG	2	6	147940	147945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656446
2994	NC_019955	GTG	2	6	147952	147957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656446
2995	NC_019955	GCG	2	6	147981	147986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656446
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2998	NC_019955	A	7	7	148195	148201	100 %	0 %	0 %	0 %	433656447
2999	NC_019955	GTA	2	6	148214	148219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656447
3000	NC_019955	GTT	3	9	148255	148263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656447

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