MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017270	TTAT	2	8	49743	49750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017270	CAAG	2	8	49755	49762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_017270	GCG	2	6	49770	49775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017270	T	7	7	49789	49795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017270	TGA	2	6	49823	49828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017270	GAA	2	6	49829	49834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017270	TGG	2	6	49890	49895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423411
1008	NC_017270	ACA	2	6	49903	49908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423411
1009	NC_017270	TGCGC	2	10	49918	49927	0 %	20 %	40 %	40 %	384423411
1010	NC_017270	GTTTG	2	10	49963	49972	0 %	60 %	40 %	0 %	384423411
1011	NC_017270	TGC	2	6	50001	50006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423411
1012	NC_017270	AGC	2	6	50022	50027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423411
1013	NC_017270	GCTA	2	8	50060	50067	25 %	25 %	25 %	25 %	384423411
1014	NC_017270	GCCA	2	8	50164	50171	25 %	0 %	25 %	50 %	384423411
1015	NC_017270	CGTG	2	8	50218	50225	0 %	25 %	50 %	25 %	384423411
1016	NC_017270	ATC	2	6	50232	50237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423411
1017	NC_017270	GTT	2	6	50240	50245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423411
1018	NC_017270	GC	3	6	50308	50313	0 %	0 %	50 %	50 %	384423411
1019	NC_017270	CAA	2	6	50324	50329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423411
1020	NC_017270	GTA	2	6	50366	50371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423411
1021	NC_017270	GA	3	6	50460	50465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017270	AAGAT	2	10	50520	50529	60 %	20 %	20 %	0 %	384423412
1023	NC_017270	CAA	2	6	50534	50539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423412
1024	NC_017270	GTG	3	9	50610	50618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423412
1025	NC_017270	CGC	2	6	50738	50743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423412
1026	NC_017270	T	6	6	50819	50824	0 %	100 %	0 %	0 %	384423412
1027	NC_017270	TGG	2	6	50855	50860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423412
1028	NC_017270	TGG	3	9	50863	50871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423412
1029	NC_017270	TTG	2	6	50898	50903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423412
1030	NC_017270	GCA	2	6	50911	50916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423412
1031	NC_017270	CTACTT	2	12	50995	51006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384423412
1032	NC_017270	T	6	6	51044	51049	0 %	100 %	0 %	0 %	384423412
1033	NC_017270	GAT	2	6	51050	51055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423412
1034	NC_017270	AATG	2	8	51059	51066	50 %	25 %	25 %	0 %	384423412
1035	NC_017270	TA	3	6	51089	51094	50 %	50 %	0 %	0 %	384423412
1036	NC_017270	TCG	2	6	51193	51198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423412
1037	NC_017270	AATC	2	8	51273	51280	50 %	25 %	0 %	25 %	384423412
1038	NC_017270	CAG	2	6	51540	51545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423413
1039	NC_017270	GC	3	6	51568	51573	0 %	0 %	50 %	50 %	384423413
1040	NC_017270	GGC	2	6	51593	51598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423413
1041	NC_017270	T	7	7	51605	51611	0 %	100 %	0 %	0 %	384423413
1042	NC_017270	AGG	2	6	51655	51660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423413
1043	NC_017270	GC	4	8	51689	51696	0 %	0 %	50 %	50 %	384423413
1044	NC_017270	A	6	6	51722	51727	100 %	0 %	0 %	0 %	384423413
1045	NC_017270	GAT	2	6	51732	51737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423413
1046	NC_017270	ACA	2	6	51754	51759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423413
1047	NC_017270	GCA	2	6	51794	51799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423413
1048	NC_017270	CGA	2	6	51817	51822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423413
1049	NC_017270	TTG	2	6	51825	51830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423413
1050	NC_017270	GGT	2	6	51840	51845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423413
1051	NC_017270	GCG	2	6	51846	51851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423413
1052	NC_017270	TTA	2	6	51870	51875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423413
1053	NC_017270	CAG	2	6	51879	51884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423413
1054	NC_017270	ATG	2	6	52000	52005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423413
1055	NC_017270	ATC	2	6	52008	52013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423413
1056	NC_017270	ATG	2	6	52095	52100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423413
1057	NC_017270	ACA	2	6	52139	52144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423413
1058	NC_017270	GC	3	6	52150	52155	0 %	0 %	50 %	50 %	384423413
1059	NC_017270	CGAT	2	8	52159	52166	25 %	25 %	25 %	25 %	384423413
1060	NC_017270	ATCC	2	8	52288	52295	25 %	25 %	0 %	50 %	384423414
1061	NC_017270	TGT	2	6	52336	52341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423414
1062	NC_017270	T	6	6	52343	52348	0 %	100 %	0 %	0 %	384423414
1063	NC_017270	TGA	2	6	52440	52445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423414
1064	NC_017270	AGTG	2	8	52454	52461	25 %	25 %	50 %	0 %	384423414
1065	NC_017270	CT	3	6	52516	52521	0 %	50 %	0 %	50 %	384423414
1066	NC_017270	TGCT	2	8	52641	52648	0 %	50 %	25 %	25 %	384423415
1067	NC_017270	CAT	2	6	52727	52732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423415
1068	NC_017270	CGA	2	6	52772	52777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423415
1069	NC_017270	GCA	2	6	52805	52810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423415
1070	NC_017270	CAT	2	6	52832	52837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423415
1071	NC_017270	TGC	2	6	52956	52961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423415
1072	NC_017270	TCG	2	6	52984	52989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423415
1073	NC_017270	AGCAC	2	10	53011	53020	40 %	0 %	20 %	40 %	384423415
1074	NC_017270	CTAT	2	8	53023	53030	25 %	50 %	0 %	25 %	384423415
1075	NC_017270	TCA	2	6	53084	53089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423415
1076	NC_017270	GGTA	2	8	53112	53119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017270	TAG	2	6	53120	53125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017270	A	6	6	53189	53194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017270	A	6	6	53320	53325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017270	ACA	2	6	53335	53340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017270	GCC	2	6	53359	53364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_017270	TCT	2	6	53365	53370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017270	AAG	2	6	53384	53389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017270	CAAT	2	8	53412	53419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_017270	TG	3	6	53421	53426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017270	TGA	2	6	53436	53441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017270	GGC	2	6	53624	53629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017270	GCA	2	6	53655	53660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017270	GCG	2	6	53688	53693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017270	CGA	2	6	53867	53872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017270	GAT	2	6	53892	53897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017270	GCA	2	6	53941	53946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017270	GAA	2	6	54000	54005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017270	GGT	2	6	54043	54048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017270	AGA	2	6	54083	54088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017270	CAG	2	6	54109	54114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017270	GGT	2	6	54174	54179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017270	G	6	6	54256	54261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017270	GGC	2	6	54320	54325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017270	GAA	2	6	54563	54568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017270	TGC	2	6	54639	54644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017270	GTC	2	6	54651	54656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017270	TGG	2	6	54729	54734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017270	GGA	2	6	54765	54770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017270	GAC	2	6	54778	54783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017270	TCA	2	6	54790	54795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017270	AC	3	6	54816	54821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017270	CGT	2	6	54884	54889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017270	AC	3	6	54985	54990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_017270	AAG	2	6	55021	55026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017270	GGA	2	6	55045	55050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017270	CCT	2	6	55126	55131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_017270	TGA	2	6	55148	55153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017270	CA	3	6	55159	55164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_017270	GATT	2	8	55165	55172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017270	GCATG	2	10	55225	55234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_017270	CCA	2	6	55266	55271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_017270	ACA	2	6	55345	55350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017270	ATT	2	6	55352	55357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017270	GTT	2	6	55358	55363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017270	CAA	2	6	55399	55404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017270	GTT	2	6	55510	55515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017270	GAG	2	6	55758	55763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017270	GTA	2	6	55785	55790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017270	GCG	2	6	55791	55796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017270	G	6	6	55943	55948	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017270	TCC	2	6	55953	55958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_017270	CTGA	2	8	55973	55980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_017270	GTAC	2	8	56057	56064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_017270	GTG	2	6	56084	56089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017270	GGA	2	6	56261	56266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017270	TAC	2	6	56384	56389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1134	NC_017270	AC	3	6	56478	56483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1156	NC_017270	GGA	2	6	57797	57802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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