MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 1601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017269	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017269	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	384422538
4	NC_017269	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	384422538
5	NC_017269	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	384422538
6	NC_017269	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	384422538
7	NC_017269	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	384422539
8	NC_017269	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017269	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017269	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	384422542
11	NC_017269	TG	3	6	6051	6056	0 %	50 %	50 %	0 %	384422543
12	NC_017269	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	384422543
13	NC_017269	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	384422543
14	NC_017269	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	384422543
15	NC_017269	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
16	NC_017269	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	384422544
17	NC_017269	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
18	NC_017269	CT	3	6	7477	7482	0 %	50 %	0 %	50 %	384422544
19	NC_017269	TA	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	384422544
20	NC_017269	GC	4	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
21	NC_017269	AG	3	6	8516	8521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017269	TC	3	6	8773	8778	0 %	50 %	0 %	50 %	384422545
23	NC_017269	GC	3	6	9564	9569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017269	GC	5	10	9596	9605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017269	AG	3	6	9723	9728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017269	GC	3	6	9956	9961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017269	GC	3	6	10692	10697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017269	TC	3	6	11703	11708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017269	GT	3	6	12536	12541	0 %	50 %	50 %	0 %	384422546
30	NC_017269	CG	3	6	12804	12809	0 %	0 %	50 %	50 %	384422546
31	NC_017269	TG	4	8	13550	13557	0 %	50 %	50 %	0 %	384422546
32	NC_017269	GC	3	6	14493	14498	0 %	0 %	50 %	50 %	384422546
33	NC_017269	GA	3	6	14798	14803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017269	GC	3	6	15065	15070	0 %	0 %	50 %	50 %	384422547
35	NC_017269	CG	3	6	15734	15739	0 %	0 %	50 %	50 %	384422547
36	NC_017269	AC	3	6	17074	17079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017269	CT	3	6	18762	18767	0 %	50 %	0 %	50 %	384422548
38	NC_017269	CG	3	6	19063	19068	0 %	0 %	50 %	50 %	384422548
39	NC_017269	GT	3	6	19144	19149	0 %	50 %	50 %	0 %	384422548
40	NC_017269	TG	4	8	20129	20136	0 %	50 %	50 %	0 %	384422550
41	NC_017269	GT	3	6	20139	20144	0 %	50 %	50 %	0 %	384422550
42	NC_017269	CT	3	6	21451	21456	0 %	50 %	0 %	50 %	384422552
43	NC_017269	GT	3	6	21490	21495	0 %	50 %	50 %	0 %	384422552
44	NC_017269	TC	3	6	22587	22592	0 %	50 %	0 %	50 %	384422552
45	NC_017269	AG	3	6	22758	22763	50 %	0 %	50 %	0 %	384422552
46	NC_017269	GC	3	6	23138	23143	0 %	0 %	50 %	50 %	384422552
47	NC_017269	AG	3	6	23823	23828	50 %	0 %	50 %	0 %	384422552
48	NC_017269	TG	3	6	24385	24390	0 %	50 %	50 %	0 %	384422553
49	NC_017269	GA	3	6	24871	24876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017269	CG	5	10	25264	25273	0 %	0 %	50 %	50 %	384422554
51	NC_017269	GT	3	6	25801	25806	0 %	50 %	50 %	0 %	384422555
52	NC_017269	GC	3	6	26090	26095	0 %	0 %	50 %	50 %	384422555
53	NC_017269	GT	3	6	26264	26269	0 %	50 %	50 %	0 %	384422555
54	NC_017269	GA	3	6	27100	27105	50 %	0 %	50 %	0 %	384422556
55	NC_017269	AG	3	6	27563	27568	50 %	0 %	50 %	0 %	384422556
56	NC_017269	CT	3	6	28229	28234	0 %	50 %	0 %	50 %	384422557
57	NC_017269	TC	3	6	30595	30600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017269	AG	3	6	30677	30682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017269	CT	3	6	31520	31525	0 %	50 %	0 %	50 %	384422559
60	NC_017269	GC	3	6	31720	31725	0 %	0 %	50 %	50 %	384422559
61	NC_017269	AG	3	6	33289	33294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017269	TC	4	8	33498	33505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017269	CA	3	6	33602	33607	50 %	0 %	0 %	50 %	384422560
64	NC_017269	AG	3	6	33783	33788	50 %	0 %	50 %	0 %	384422560
65	NC_017269	GT	3	6	34423	34428	0 %	50 %	50 %	0 %	384422561
66	NC_017269	CT	3	6	35588	35593	0 %	50 %	0 %	50 %	384422562
67	NC_017269	CT	3	6	35978	35983	0 %	50 %	0 %	50 %	384422562
68	NC_017269	TG	3	6	37065	37070	0 %	50 %	50 %	0 %	384422563
69	NC_017269	TG	3	6	37359	37364	0 %	50 %	50 %	0 %	384422563
70	NC_017269	TG	3	6	39583	39588	0 %	50 %	50 %	0 %	384422564
71	NC_017269	TG	3	6	39885	39890	0 %	50 %	50 %	0 %	384422565
72	NC_017269	GC	3	6	41739	41744	0 %	0 %	50 %	50 %	384422567
73	NC_017269	GT	3	6	42012	42017	0 %	50 %	50 %	0 %	384422567
74	NC_017269	CA	3	6	42127	42132	50 %	0 %	0 %	50 %	384422567
75	NC_017269	GT	3	6	42726	42731	0 %	50 %	50 %	0 %	384422567
76	NC_017269	CG	4	8	43651	43658	0 %	0 %	50 %	50 %	384422568
77	NC_017269	CT	3	6	44803	44808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017269	AG	3	6	45127	45132	50 %	0 %	50 %	0 %	384422571
79	NC_017269	AT	3	6	46170	46175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017269	GA	3	6	46393	46398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017269	TG	3	6	46571	46576	0 %	50 %	50 %	0 %	384422572
82	NC_017269	CT	3	6	46829	46834	0 %	50 %	0 %	50 %	384422572
83	NC_017269	CA	3	6	47017	47022	50 %	0 %	0 %	50 %	384422572
84	NC_017269	GA	3	6	48114	48119	50 %	0 %	50 %	0 %	384422573
85	NC_017269	CG	3	6	48203	48208	0 %	0 %	50 %	50 %	384422573
86	NC_017269	GT	3	6	48791	48796	0 %	50 %	50 %	0 %	384422574
87	NC_017269	TG	3	6	49091	49096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017269	GT	3	6	49277	49282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017269	TC	3	6	49365	49370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017269	GT	3	6	52405	52410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017269	AG	3	6	52772	52777	50 %	0 %	50 %	0 %	384422575
92	NC_017269	AC	3	6	53531	53536	50 %	0 %	0 %	50 %	384422575
93	NC_017269	GA	4	8	53620	53627	50 %	0 %	50 %	0 %	384422576
94	NC_017269	AC	4	8	54102	54109	50 %	0 %	0 %	50 %	384422577
95	NC_017269	CA	3	6	54799	54804	50 %	0 %	0 %	50 %	384422577
96	NC_017269	AG	3	6	54917	54922	50 %	0 %	50 %	0 %	384422577
97	NC_017269	GC	3	6	55476	55481	0 %	0 %	50 %	50 %	384422577
98	NC_017269	CA	3	6	55933	55938	50 %	0 %	0 %	50 %	384422578
99	NC_017269	GA	3	6	56053	56058	50 %	0 %	50 %	0 %	384422578
100	NC_017269	GC	3	6	56109	56114	0 %	0 %	50 %	50 %	384422578
101	NC_017269	TG	3	6	58158	58163	0 %	50 %	50 %	0 %	384422579
102	NC_017269	TG	3	6	59527	59532	0 %	50 %	50 %	0 %	384422580
103	NC_017269	GA	3	6	59653	59658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017269	CT	3	6	59673	59678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017269	CG	3	6	60093	60098	0 %	0 %	50 %	50 %	384422581
106	NC_017269	AG	3	6	60115	60120	50 %	0 %	50 %	0 %	384422581
107	NC_017269	TG	3	6	60162	60167	0 %	50 %	50 %	0 %	384422581
108	NC_017269	CG	3	6	60473	60478	0 %	0 %	50 %	50 %	384422581
109	NC_017269	GT	3	6	61565	61570	0 %	50 %	50 %	0 %	384422582
110	NC_017269	GC	3	6	62075	62080	0 %	0 %	50 %	50 %	384422583
111	NC_017269	GC	3	6	62240	62245	0 %	0 %	50 %	50 %	384422583
112	NC_017269	GT	3	6	63759	63764	0 %	50 %	50 %	0 %	384422584
113	NC_017269	GC	4	8	63875	63882	0 %	0 %	50 %	50 %	384422584
114	NC_017269	GA	3	6	63983	63988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017269	TG	3	6	65504	65509	0 %	50 %	50 %	0 %	384422587
116	NC_017269	GC	3	6	66724	66729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017269	AC	3	6	67247	67252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017269	TC	3	6	67438	67443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017269	GC	3	6	67907	67912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017269	CA	3	6	69316	69321	50 %	0 %	0 %	50 %	384422588
121	NC_017269	CG	3	6	72400	72405	0 %	0 %	50 %	50 %	384422589
122	NC_017269	TC	3	6	72764	72769	0 %	50 %	0 %	50 %	384422589
123	NC_017269	TC	3	6	72801	72806	0 %	50 %	0 %	50 %	384422589
124	NC_017269	GC	3	6	73126	73131	0 %	0 %	50 %	50 %	384422590
125	NC_017269	CA	3	6	74415	74420	50 %	0 %	0 %	50 %	384422591
126	NC_017269	GA	3	6	75199	75204	50 %	0 %	50 %	0 %	384422592
127	NC_017269	TG	3	6	75335	75340	0 %	50 %	50 %	0 %	384422592
128	NC_017269	CG	3	6	75341	75346	0 %	0 %	50 %	50 %	384422592
129	NC_017269	CG	3	6	75400	75405	0 %	0 %	50 %	50 %	384422592
130	NC_017269	CT	3	6	75569	75574	0 %	50 %	0 %	50 %	384422592
131	NC_017269	TG	3	6	75636	75641	0 %	50 %	50 %	0 %	384422592
132	NC_017269	CT	3	6	75803	75808	0 %	50 %	0 %	50 %	384422592
133	NC_017269	CG	3	6	78445	78450	0 %	0 %	50 %	50 %	384422594
134	NC_017269	GC	3	6	78532	78537	0 %	0 %	50 %	50 %	384422594
135	NC_017269	CG	3	6	80175	80180	0 %	0 %	50 %	50 %	384422596
136	NC_017269	GC	3	6	80326	80331	0 %	0 %	50 %	50 %	384422596
137	NC_017269	AC	3	6	80758	80763	50 %	0 %	0 %	50 %	384422597
138	NC_017269	AG	4	8	80884	80891	50 %	0 %	50 %	0 %	384422597
139	NC_017269	CA	3	6	81026	81031	50 %	0 %	0 %	50 %	384422597
140	NC_017269	GC	3	6	81239	81244	0 %	0 %	50 %	50 %	384422597
141	NC_017269	AC	3	6	83767	83772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017269	TG	3	6	84003	84008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017269	GC	3	6	84715	84720	0 %	0 %	50 %	50 %	384422601
144	NC_017269	CG	3	6	84910	84915	0 %	0 %	50 %	50 %	384422601
145	NC_017269	GA	3	6	86057	86062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017269	CA	3	6	86499	86504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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