MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017269	TGC	2	6	155931	155936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422658
3002	NC_017269	GAA	3	9	156122	156130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422658
3003	NC_017269	CGG	2	6	156135	156140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422658
3004	NC_017269	TCA	2	6	156205	156210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422658
3005	NC_017269	AGTGA	2	10	156221	156230	40 %	20 %	40 %	0 %	384422658
3006	NC_017269	GTTTG	2	10	156280	156289	0 %	60 %	40 %	0 %	384422658
3007	NC_017269	AGG	2	6	156312	156317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422658
3008	NC_017269	TCA	2	6	156335	156340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017269	TTA	2	6	156355	156360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017269	CG	3	6	156421	156426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_017269	CGG	2	6	156432	156437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_017269	T	6	6	156438	156443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017269	TCT	2	6	156538	156543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422659
3014	NC_017269	GCA	2	6	156587	156592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422659
3015	NC_017269	AAT	2	6	156599	156604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422659
3016	NC_017269	GCC	2	6	156657	156662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422660
3017	NC_017269	GAA	2	6	156702	156707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422660
3018	NC_017269	GGA	2	6	156738	156743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422660
3019	NC_017269	TGA	2	6	156859	156864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422660
3020	NC_017269	GGGC	2	8	156919	156926	0 %	0 %	75 %	25 %	384422660
3021	NC_017269	CGG	2	6	157169	157174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422660
3022	NC_017269	CAG	2	6	157222	157227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422660
3023	NC_017269	CT	3	6	157287	157292	0 %	50 %	0 %	50 %	384422660
3024	NC_017269	TGA	2	6	157298	157303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422660
3025	NC_017269	CAC	2	6	157391	157396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422660
3026	NC_017269	GCG	2	6	157572	157577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422660
3027	NC_017269	TAC	2	6	157581	157586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422660
3028	NC_017269	AAG	2	6	157588	157593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422660
3029	NC_017269	AAAG	2	8	157697	157704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017269	TTC	2	6	157717	157722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_017269	AGT	2	6	157744	157749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017269	ACCCGT	2	12	157853	157864	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384422661
3033	NC_017269	TG	4	8	157896	157903	0 %	50 %	50 %	0 %	384422661
3034	NC_017269	TGT	2	6	157905	157910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422661
3035	NC_017269	GAT	2	6	157990	157995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422661
3036	NC_017269	GC	3	6	157998	158003	0 %	0 %	50 %	50 %	384422661
3037	NC_017269	GCT	2	6	158071	158076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
3038	NC_017269	GCG	2	6	158130	158135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3039	NC_017269	GAT	2	6	158194	158199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422661
3040	NC_017269	CCG	2	6	158200	158205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422661
3041	NC_017269	GGTT	2	8	158213	158220	0 %	50 %	50 %	0 %	384422661
3042	NC_017269	TCTG	2	8	158241	158248	0 %	50 %	25 %	25 %	384422661
3043	NC_017269	CGG	2	6	158278	158283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3044	NC_017269	CTG	2	6	158318	158323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
3045	NC_017269	GCG	2	6	158366	158371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3046	NC_017269	GTTCAT	2	12	158389	158400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384422661
3047	NC_017269	CTT	2	6	158413	158418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422661
3048	NC_017269	CAT	2	6	158443	158448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422661
3049	NC_017269	GTG	2	6	158477	158482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422661
3050	NC_017269	G	6	6	158482	158487	0 %	0 %	100 %	0 %	384422661
3051	NC_017269	TGCTG	2	10	158500	158509	0 %	40 %	40 %	20 %	384422661
3052	NC_017269	ATG	2	6	158585	158590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422661
3053	NC_017269	A	6	6	158591	158596	100 %	0 %	0 %	0 %	384422661
3054	NC_017269	GCC	2	6	158662	158667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422661
3055	NC_017269	TCA	2	6	158688	158693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422661
3056	NC_017269	CGT	2	6	158697	158702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
3057	NC_017269	TTG	2	6	158727	158732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422661
3058	NC_017269	TTTCC	2	10	158761	158770	0 %	60 %	0 %	40 %	384422661
3059	NC_017269	TGC	2	6	158850	158855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
3060	NC_017269	GTA	2	6	158906	158911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422661
3061	NC_017269	CGG	2	6	158931	158936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3062	NC_017269	CGG	2	6	159048	159053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3063	NC_017269	TGA	2	6	159123	159128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422661
3064	NC_017269	CAA	2	6	159130	159135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422661
3065	NC_017269	CTG	2	6	159152	159157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
3066	NC_017269	CGG	2	6	159216	159221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3067	NC_017269	CTG	2	6	159266	159271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
3068	NC_017269	TGG	2	6	159285	159290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422661
3069	NC_017269	GGC	2	6	159343	159348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3070	NC_017269	GGC	2	6	159382	159387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3071	NC_017269	ACA	2	6	159445	159450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422661
3072	NC_017269	TTA	2	6	159498	159503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422661
3073	NC_017269	TCT	2	6	159504	159509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422661
3074	NC_017269	GT	3	6	159542	159547	0 %	50 %	50 %	0 %	384422661
3075	NC_017269	CCA	2	6	159567	159572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422661
3076	NC_017269	CCG	2	6	159584	159589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422661
3077	NC_017269	TCA	2	6	159666	159671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422661
3078	NC_017269	TGC	2	6	159807	159812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
3079	NC_017269	TG	3	6	159851	159856	0 %	50 %	50 %	0 %	384422661
3080	NC_017269	CGG	2	6	159894	159899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
3081	NC_017269	TTG	2	6	159965	159970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422662
3082	NC_017269	GTG	2	6	159971	159976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422662
3083	NC_017269	TTGA	2	8	160039	160046	25 %	50 %	25 %	0 %	384422662
3084	NC_017269	AAG	2	6	160049	160054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422662
3085	NC_017269	TAT	2	6	160111	160116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422662
3086	NC_017269	GC	3	6	160178	160183	0 %	0 %	50 %	50 %	384422662
3087	NC_017269	TGG	2	6	160220	160225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422662
3088	NC_017269	CCA	2	6	160226	160231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422662
3089	NC_017269	GCAC	2	8	160254	160261	25 %	0 %	25 %	50 %	384422662
3090	NC_017269	GCT	2	6	160271	160276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422662
3091	NC_017269	G	6	6	160431	160436	0 %	0 %	100 %	0 %	384422662
3092	NC_017269	GTG	2	6	160459	160464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422662
3093	NC_017269	GAA	2	6	160471	160476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422662
3094	NC_017269	AGA	2	6	160508	160513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422662
3095	NC_017269	ATC	2	6	160612	160617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422662
3096	NC_017269	GTG	2	6	160663	160668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422662
3097	NC_017269	TGAT	2	8	160733	160740	25 %	50 %	25 %	0 %	384422662
3098	NC_017269	TG	3	6	160821	160826	0 %	50 %	50 %	0 %	384422662
3099	NC_017269	AGTG	2	8	160857	160864	25 %	25 %	50 %	0 %	384422662
3100	NC_017269	TGG	2	6	160906	160911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422662
3101	NC_017269	TG	3	6	161067	161072	0 %	50 %	50 %	0 %	384422662
3102	NC_017269	TTC	2	6	161191	161196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017269	TA	3	6	161217	161222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017269	TCA	2	6	161223	161228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_017269	ATTG	2	8	161235	161242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017269	TTG	2	6	161255	161260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017269	T	7	7	161285	161291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017269	AAG	2	6	161311	161316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017269	AGC	2	6	161355	161360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_017269	TAA	3	9	161388	161396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017269	CACG	2	8	161487	161494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_017269	A	6	6	161624	161629	100 %	0 %	0 %	0 %	384422663
3113	NC_017269	GGAC	2	8	161720	161727	25 %	0 %	50 %	25 %	384422663
3114	NC_017269	GGC	2	6	161779	161784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422663
3115	NC_017269	GAT	2	6	161785	161790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422663
3116	NC_017269	ATG	2	6	161839	161844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422663
3117	NC_017269	CGG	2	6	161850	161855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422663
3118	NC_017269	GCT	2	6	161906	161911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422663
3119	NC_017269	GT	3	6	162068	162073	0 %	50 %	50 %	0 %	384422663
3120	NC_017269	AAACG	2	10	162093	162102	60 %	0 %	20 %	20 %	384422663
3121	NC_017269	TGGG	2	8	162185	162192	0 %	25 %	75 %	0 %	384422663
3122	NC_017269	GTG	2	6	162262	162267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422663
3123	NC_017269	CTG	2	6	162448	162453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422663
3124	NC_017269	CGC	2	6	162458	162463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422663
3125	NC_017269	GAG	2	6	162472	162477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422663
3126	NC_017269	TGC	2	6	162536	162541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422663
3127	NC_017269	GTG	2	6	162592	162597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422663
3128	NC_017269	CAT	2	6	162604	162609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422663
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3130	NC_017269	GCG	2	6	162814	162819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422663
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3247	NC_017269	GCGT	2	8	169720	169727	0 %	25 %	50 %	25 %	384422669
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3356	NC_017269	AAT	2	6	175791	175796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422674
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3359	NC_017269	TGT	2	6	175868	175873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3360	NC_017269	A	7	7	175889	175895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3496	NC_017269	CTTG	2	8	183628	183635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3497	NC_017269	CT	3	6	183702	183707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3498	NC_017269	GGATGT	2	12	183715	183726	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_017269	TTG	3	9	183734	183742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_017269	ATGGC	2	10	183780	183789	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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