MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016945	TCT	2	6	155894	155899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743586
3002	NC_016945	ATCA	2	8	155965	155972	50 %	25 %	0 %	25 %	379743586
3003	NC_016945	GGC	2	6	155988	155993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743586
3004	NC_016945	AAAC	2	8	156034	156041	75 %	0 %	0 %	25 %	379743586
3005	NC_016945	CAG	3	9	156115	156123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3006	NC_016945	CAG	3	9	156256	156264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3007	NC_016945	TTG	2	6	156278	156283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743586
3008	NC_016945	ACA	2	6	156315	156320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743586
3009	NC_016945	AGC	2	6	156386	156391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3010	NC_016945	AAT	2	6	156392	156397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743586
3011	NC_016945	GCG	2	6	156453	156458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743586
3012	NC_016945	ATC	2	6	156484	156489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743586
3013	NC_016945	CTG	2	6	156629	156634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3014	NC_016945	GA	3	6	156635	156640	50 %	0 %	50 %	0 %	379743586
3015	NC_016945	AAT	2	6	156642	156647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743586
3016	NC_016945	TCA	2	6	156677	156682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743586
3017	NC_016945	CGA	2	6	156738	156743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3018	NC_016945	GCA	2	6	156767	156772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3019	NC_016945	TGC	2	6	156789	156794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3020	NC_016945	GCT	2	6	156828	156833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3021	NC_016945	GAT	2	6	156847	156852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743586
3022	NC_016945	AG	3	6	156865	156870	50 %	0 %	50 %	0 %	379743586
3023	NC_016945	TTG	2	6	156970	156975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743586
3024	NC_016945	ATC	2	6	156997	157002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743586
3025	NC_016945	GT	3	6	157020	157025	0 %	50 %	50 %	0 %	379743586
3026	NC_016945	TCA	2	6	157038	157043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743586
3027	NC_016945	GCGCT	2	10	157120	157129	0 %	20 %	40 %	40 %	379743586
3028	NC_016945	CAG	2	6	157183	157188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743586
3029	NC_016945	GGC	2	6	157324	157329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016945	CAA	2	6	157369	157374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_016945	CGTT	2	8	157414	157421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_016945	TCTA	2	8	157438	157445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_016945	ACTC	2	8	157457	157464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_016945	GCC	2	6	157469	157474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_016945	GTT	2	6	157490	157495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016945	ATTG	2	8	157540	157547	25 %	50 %	25 %	0 %	379743587
3037	NC_016945	GAC	3	9	157550	157558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743587
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3039	NC_016945	AGC	2	6	157650	157655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743587
3040	NC_016945	CGC	2	6	157663	157668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743587
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3042	NC_016945	TGG	2	6	157716	157721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743587
3043	NC_016945	GTCA	2	8	157874	157881	25 %	25 %	25 %	25 %	379743587
3044	NC_016945	CTG	2	6	157979	157984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743587
3045	NC_016945	TGG	2	6	158061	158066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743587
3046	NC_016945	AGCG	2	8	158087	158094	25 %	0 %	50 %	25 %	379743587
3047	NC_016945	CGGTG	2	10	158188	158197	0 %	20 %	60 %	20 %	379743587
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3051	NC_016945	CGA	2	6	158470	158475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743587
3052	NC_016945	TGC	2	6	158481	158486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743587
3053	NC_016945	GCT	2	6	158554	158559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743587
3054	NC_016945	GAA	3	9	158672	158680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743587
3055	NC_016945	CAG	2	6	158685	158690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743587
3056	NC_016945	AGTGA	2	10	158771	158780	40 %	20 %	40 %	0 %	379743587
3057	NC_016945	GTTTG	2	10	158830	158839	0 %	60 %	40 %	0 %	379743587
3058	NC_016945	AGG	2	6	158862	158867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743587
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3060	NC_016945	TTA	2	6	158905	158910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016945	CG	3	6	158971	158976	0 %	0 %	50 %	50 %	379743588
3062	NC_016945	CGG	2	6	158982	158987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743588
3063	NC_016945	T	6	6	158988	158993	0 %	100 %	0 %	0 %	379743588
3064	NC_016945	TCT	2	6	159088	159093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_016945	AAT	2	6	159149	159154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016945	GCC	2	6	159207	159212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743589
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3069	NC_016945	TTA	2	6	159296	159301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743589
3070	NC_016945	TGA	2	6	159409	159414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743589
3071	NC_016945	GGGC	2	8	159469	159476	0 %	0 %	75 %	25 %	379743589
3072	NC_016945	CGG	2	6	159719	159724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743589
3073	NC_016945	CT	3	6	159837	159842	0 %	50 %	0 %	50 %	379743589
3074	NC_016945	CAC	2	6	159941	159946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743589
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3078	NC_016945	AAAG	2	8	160241	160248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016945	TTC	2	6	160261	160266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_016945	CCG	2	6	160280	160285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_016945	GCT	2	6	160303	160308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_016945	ACCCGT	2	12	160400	160411	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379743590
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3087	NC_016945	TGT	2	6	160608	160613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743590
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3090	NC_016945	GCG	2	6	160677	160682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743590
3091	NC_016945	GAT	2	6	160741	160746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743590
3092	NC_016945	CCG	2	6	160747	160752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743590
3093	NC_016945	GGTT	2	8	160760	160767	0 %	50 %	50 %	0 %	379743590
3094	NC_016945	TCTG	2	8	160788	160795	0 %	50 %	25 %	25 %	379743590
3095	NC_016945	GGC	2	6	160826	160831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743590
3096	NC_016945	CTG	2	6	160865	160870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743590
3097	NC_016945	GCG	2	6	160913	160918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743590
3098	NC_016945	GTTCAT	2	12	160936	160947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379743590
3099	NC_016945	CTT	2	6	160960	160965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743590
3100	NC_016945	CAT	2	6	160990	160995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743590
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3102	NC_016945	G	6	6	161029	161034	0 %	0 %	100 %	0 %	379743590
3103	NC_016945	TTA	2	6	161118	161123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743590
3104	NC_016945	ATG	2	6	161132	161137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743590
3105	NC_016945	A	6	6	161138	161143	100 %	0 %	0 %	0 %	379743590
3106	NC_016945	CGC	2	6	161164	161169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743590
3107	NC_016945	GCC	2	6	161209	161214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743590
3108	NC_016945	TCA	2	6	161235	161240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743590
3109	NC_016945	CGT	2	6	161244	161249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743590
3110	NC_016945	TTG	2	6	161274	161279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743590
3111	NC_016945	TTTCC	2	10	161308	161317	0 %	60 %	0 %	40 %	379743590
3112	NC_016945	TGC	2	6	161397	161402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743590
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3118	NC_016945	CTG	2	6	161699	161704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743590
3119	NC_016945	CGG	2	6	161763	161768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743590
3120	NC_016945	CTG	2	6	161813	161818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743590
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3122	NC_016945	GGC	2	6	161890	161895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743590
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3162	NC_016945	AAG	2	6	163858	163863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_016945	TAA	3	9	163935	163943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3220	NC_016945	GA	3	6	167909	167914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3222	NC_016945	GAC	2	6	168061	168066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743593
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3231	NC_016945	CTAT	2	8	168402	168409	25 %	50 %	0 %	25 %	379743593
3232	NC_016945	CAC	2	6	168410	168415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743593
3233	NC_016945	A	6	6	168436	168441	100 %	0 %	0 %	0 %	379743593
3234	NC_016945	A	6	6	168445	168450	100 %	0 %	0 %	0 %	379743593
3235	NC_016945	GAA	2	6	168456	168461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743593
3236	NC_016945	CG	4	8	168463	168470	0 %	0 %	50 %	50 %	379743593
3237	NC_016945	GCC	2	6	168507	168512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3238	NC_016945	GGC	2	6	168522	168527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3239	NC_016945	CT	3	6	168643	168648	0 %	50 %	0 %	50 %	379743594
3240	NC_016945	CAA	2	6	168709	168714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743594
3241	NC_016945	GCTT	2	8	168902	168909	0 %	50 %	25 %	25 %	379743594
3242	NC_016945	ACT	2	6	168941	168946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743594
3243	NC_016945	CCCG	2	8	168954	168961	0 %	0 %	25 %	75 %	379743594
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3369	NC_016945	TCA	2	6	175799	175804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743601
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3372	NC_016945	TCA	2	6	175959	175964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743601
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3388	NC_016945	CTT	2	6	177143	177148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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