MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 20281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016945	TTG	2	6	262560	262565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743676
5003	NC_016945	GGTTTT	2	12	262602	262613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743676
5004	NC_016945	TCT	2	6	262636	262641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743676
5005	NC_016945	GCC	2	6	262650	262655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743676
5006	NC_016945	AG	3	6	262683	262688	50 %	0 %	50 %	0 %	379743676
5007	NC_016945	CCAA	2	8	262719	262726	50 %	0 %	0 %	50 %	379743676
5008	NC_016945	GGT	2	6	262754	262759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743676
5009	NC_016945	T	6	6	262863	262868	0 %	100 %	0 %	0 %	379743676
5010	NC_016945	TG	3	6	262889	262894	0 %	50 %	50 %	0 %	379743676
5011	NC_016945	GA	3	6	262945	262950	50 %	0 %	50 %	0 %	379743676
5012	NC_016945	GGT	2	6	262965	262970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743676
5013	NC_016945	CA	3	6	262979	262984	50 %	0 %	0 %	50 %	379743676
5014	NC_016945	TTCC	2	8	263033	263040	0 %	50 %	0 %	50 %	379743676
5015	NC_016945	GGTT	2	8	263120	263127	0 %	50 %	50 %	0 %	379743676
5016	NC_016945	TTGGT	2	10	263150	263159	0 %	60 %	40 %	0 %	379743676
5017	NC_016945	GTT	2	6	263213	263218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743677
5018	NC_016945	GC	3	6	263237	263242	0 %	0 %	50 %	50 %	379743677
5019	NC_016945	GCA	2	6	263299	263304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743677
5020	NC_016945	GGC	2	6	263348	263353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743677
5021	NC_016945	GGC	2	6	263408	263413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743677
5022	NC_016945	CGA	2	6	263509	263514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743677
5023	NC_016945	GCG	2	6	263578	263583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743677
5024	NC_016945	TGAG	2	8	263586	263593	25 %	25 %	50 %	0 %	379743677
5025	NC_016945	AG	3	6	263592	263597	50 %	0 %	50 %	0 %	379743677
5026	NC_016945	GCTGC	2	10	263642	263651	0 %	20 %	40 %	40 %	379743677
5027	NC_016945	TTGT	2	8	263732	263739	0 %	75 %	25 %	0 %	379743677
5028	NC_016945	GAT	2	6	263804	263809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743677
5029	NC_016945	GTA	2	6	263834	263839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743677
5030	NC_016945	GC	3	6	263843	263848	0 %	0 %	50 %	50 %	379743677
5031	NC_016945	GTG	2	6	263855	263860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743677
5032	NC_016945	TGC	2	6	263889	263894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743677
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5034	NC_016945	GTA	2	6	264007	264012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743678
5035	NC_016945	GAGC	2	8	264082	264089	25 %	0 %	50 %	25 %	379743678
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5037	NC_016945	ATGACG	2	12	264220	264231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379743678
5038	NC_016945	CGA	2	6	264240	264245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743678
5039	NC_016945	T	7	7	264260	264266	0 %	100 %	0 %	0 %	379743678
5040	NC_016945	CGC	2	6	264414	264419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743678
5041	NC_016945	CCA	2	6	264489	264494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743678
5042	NC_016945	CATCG	2	10	264535	264544	20 %	20 %	20 %	40 %	379743678
5043	NC_016945	CGC	2	6	264552	264557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743678
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5045	NC_016945	CTCC	2	8	264689	264696	0 %	25 %	0 %	75 %	379743679
5046	NC_016945	TTG	2	6	264717	264722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743679
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5052	NC_016945	GGGCA	2	10	265002	265011	20 %	0 %	60 %	20 %	379743679
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5054	NC_016945	GAT	2	6	265059	265064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743679
5055	NC_016945	TTGGCT	2	12	265144	265155	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379743679
5056	NC_016945	GTT	2	6	265170	265175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743679
5057	NC_016945	CTT	2	6	265237	265242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_016945	AG	3	6	265269	265274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_016945	GAG	2	6	265433	265438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743680
5060	NC_016945	ATG	2	6	265442	265447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743680
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5063	NC_016945	TAC	2	6	265671	265676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743680
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5070	NC_016945	GAA	2	6	265975	265980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743680
5071	NC_016945	GAT	2	6	265999	266004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743680
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5103	NC_016945	TGG	2	6	267102	267107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016945	ATT	2	6	267181	267186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016945	GAT	2	6	267335	267340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016945	AAT	2	6	267375	267380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016945	T	6	6	267403	267408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016945	ATGA	2	8	267426	267433	50 %	25 %	25 %	0 %	379743681
5109	NC_016945	ATT	2	6	267498	267503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743681
5110	NC_016945	CGGCG	2	10	267529	267538	0 %	0 %	60 %	40 %	379743681
5111	NC_016945	TGA	2	6	267554	267559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743681
5112	NC_016945	A	6	6	267610	267615	100 %	0 %	0 %	0 %	379743681
5113	NC_016945	GTG	2	6	267714	267719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743681
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5119	NC_016945	CAG	2	6	267999	268004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743681
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5372	NC_016945	CTT	2	6	280814	280819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743694
5373	NC_016945	TCAGAA	2	12	280828	280839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379743694
5374	NC_016945	ATTC	2	8	280899	280906	25 %	50 %	0 %	25 %	379743694
5375	NC_016945	GCA	2	6	280961	280966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743695
5376	NC_016945	ATAG	2	8	280975	280982	50 %	25 %	25 %	0 %	379743695
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5384	NC_016945	TAAG	2	8	281728	281735	50 %	25 %	25 %	0 %	379743695
5385	NC_016945	GA	3	6	281755	281760	50 %	0 %	50 %	0 %	379743695
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5392	NC_016945	T	6	6	282174	282179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_016945	CA	3	6	282183	282188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_016945	TACT	2	8	282250	282257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5395	NC_016945	AGA	2	6	282263	282268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_016945	TCA	2	6	282300	282305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743696
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5405	NC_016945	T	6	6	282762	282767	0 %	100 %	0 %	0 %	379743697
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5411	NC_016945	GGT	3	9	283092	283100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743697
5412	NC_016945	CT	3	6	283111	283116	0 %	50 %	0 %	50 %	379743697
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5446	NC_016945	CAA	2	6	284771	284776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5450	NC_016945	TCATT	2	10	284954	284963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5451	NC_016945	CATG	2	8	285009	285016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5482	NC_016945	GC	3	6	286250	286255	0 %	0 %	50 %	50 %	379743699
5483	NC_016945	AATCA	2	10	286278	286287	60 %	20 %	0 %	20 %	379743699
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5492	NC_016945	CAC	2	6	286585	286590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743699
5493	NC_016945	CGT	2	6	286636	286641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743699
5494	NC_016945	AGC	2	6	286662	286667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743699
5495	NC_016945	ACG	2	6	286676	286681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743699
5496	NC_016945	ATG	2	6	286718	286723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743699
5497	NC_016945	TGA	2	6	286744	286749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743699
5498	NC_016945	CA	3	6	286756	286761	50 %	0 %	0 %	50 %	379743699
5499	NC_016945	GCG	3	9	286766	286774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743699
5500	NC_016945	AGC	2	6	286779	286784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743699

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