MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016944	TTG	2	6	208607	208612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016944	GAT	2	6	208653	208658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016944	TGT	2	6	208693	208698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016944	ATT	2	6	208714	208719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016944	CGAT	2	8	208782	208789	25 %	25 %	25 %	25 %	379740092
4006	NC_016944	CGTG	2	8	209002	209009	0 %	25 %	50 %	25 %	379740092
4007	NC_016944	A	6	6	209097	209102	100 %	0 %	0 %	0 %	379740092
4008	NC_016944	CGG	2	6	209146	209151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740092
4009	NC_016944	TGC	2	6	209178	209183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740092
4010	NC_016944	GCA	2	6	209188	209193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740092
4011	NC_016944	GCT	2	6	209263	209268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740092
4012	NC_016944	TCAA	2	8	209277	209284	50 %	25 %	0 %	25 %	379740092
4013	NC_016944	TAT	2	6	209299	209304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740092
4014	NC_016944	GCGCT	2	10	209330	209339	0 %	20 %	40 %	40 %	379740092
4015	NC_016944	TTG	2	6	209399	209404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740092
4016	NC_016944	AGC	2	6	209412	209417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740092
4017	NC_016944	TCAC	2	8	209434	209441	25 %	25 %	0 %	50 %	379740092
4018	NC_016944	TGAT	2	8	209451	209458	25 %	50 %	25 %	0 %	379740092
4019	NC_016944	CTA	2	6	209484	209489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740092
4020	NC_016944	TGA	2	6	209513	209518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740092
4021	NC_016944	TGGC	2	8	209568	209575	0 %	25 %	50 %	25 %	379740093
4022	NC_016944	GTG	3	9	209671	209679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740093
4023	NC_016944	GC	3	6	209732	209737	0 %	0 %	50 %	50 %	379740093
4024	NC_016944	CGC	2	6	209835	209840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740093
4025	NC_016944	CAA	2	6	209875	209880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740093
4026	NC_016944	GTG	2	6	209914	209919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740093
4027	NC_016944	GCA	2	6	210015	210020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740093
4028	NC_016944	GGT	2	6	210099	210104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740093
4029	NC_016944	CCAAC	2	10	210119	210128	40 %	0 %	0 %	60 %	379740093
4030	NC_016944	CGC	2	6	210158	210163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740093
4031	NC_016944	GCC	2	6	210207	210212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740093
4032	NC_016944	TGAG	2	8	210242	210249	25 %	25 %	50 %	0 %	379740093
4033	NC_016944	A	6	6	210304	210309	100 %	0 %	0 %	0 %	379740093
4034	NC_016944	GC	3	6	210330	210335	0 %	0 %	50 %	50 %	379740093
4035	NC_016944	TG	3	6	210378	210383	0 %	50 %	50 %	0 %	379740093
4036	NC_016944	CGG	2	6	210390	210395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740093
4037	NC_016944	TGC	2	6	210469	210474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4038	NC_016944	TCA	2	6	210575	210580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740094
4039	NC_016944	TGG	2	6	210670	210675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740094
4040	NC_016944	GCA	2	6	210686	210691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4041	NC_016944	CTCAC	2	10	210708	210717	20 %	20 %	0 %	60 %	379740094
4042	NC_016944	TTGG	2	8	210746	210753	0 %	50 %	50 %	0 %	379740094
4043	NC_016944	TGG	2	6	210904	210909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740094
4044	NC_016944	CTG	2	6	210948	210953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4045	NC_016944	TGC	2	6	211033	211038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4046	NC_016944	CTG	2	6	211065	211070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4047	NC_016944	GCG	3	9	211116	211124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740094
4048	NC_016944	TGGT	2	8	211176	211183	0 %	50 %	50 %	0 %	379740094
4049	NC_016944	TTA	2	6	211227	211232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740094
4050	NC_016944	GC	3	6	211260	211265	0 %	0 %	50 %	50 %	379740094
4051	NC_016944	CAG	2	6	211286	211291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4052	NC_016944	GCT	2	6	211295	211300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4053	NC_016944	TGC	2	6	211312	211317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4054	NC_016944	GCC	2	6	211386	211391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740094
4055	NC_016944	GTC	2	6	211423	211428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4056	NC_016944	CT	3	6	211452	211457	0 %	50 %	0 %	50 %	379740094
4057	NC_016944	TGT	2	6	211522	211527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740094
4058	NC_016944	TTGG	2	8	211546	211553	0 %	50 %	50 %	0 %	379740094
4059	NC_016944	GAGT	2	8	211583	211590	25 %	25 %	50 %	0 %	379740094
4060	NC_016944	AGCC	2	8	211694	211701	25 %	0 %	25 %	50 %	379740094
4061	NC_016944	TGG	2	6	211822	211827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740094
4062	NC_016944	TGC	2	6	211834	211839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4063	NC_016944	GCG	2	6	211844	211849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740094
4064	NC_016944	CAT	2	6	211851	211856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740094
4065	NC_016944	CACTG	2	10	211895	211904	20 %	20 %	20 %	40 %	379740094
4066	NC_016944	TGC	2	6	212011	212016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4067	NC_016944	GTG	2	6	212028	212033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740094
4068	NC_016944	GCTTG	2	10	212051	212060	0 %	40 %	40 %	20 %	379740094
4069	NC_016944	TGT	2	6	212161	212166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740094
4070	NC_016944	CA	3	6	212221	212226	50 %	0 %	0 %	50 %	379740094
4071	NC_016944	GAT	2	6	212231	212236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740094
4072	NC_016944	GC	3	6	212242	212247	0 %	0 %	50 %	50 %	379740094
4073	NC_016944	CTG	2	6	212268	212273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4074	NC_016944	GCC	2	6	212274	212279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740094
4075	NC_016944	GGT	2	6	212286	212291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740094
4076	NC_016944	TGT	2	6	212299	212304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740094
4077	NC_016944	TGG	2	6	212375	212380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740094
4078	NC_016944	CTG	3	9	212391	212399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740094
4079	NC_016944	TCAG	2	8	212404	212411	25 %	25 %	25 %	25 %	379740094
4080	NC_016944	GAA	2	6	212472	212477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740095
4081	NC_016944	CG	3	6	212496	212501	0 %	0 %	50 %	50 %	379740095
4082	NC_016944	GCT	2	6	212512	212517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740095
4083	NC_016944	GGTC	2	8	212539	212546	0 %	25 %	50 %	25 %	379740095
4084	NC_016944	TGC	2	6	212589	212594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740095
4085	NC_016944	AGC	2	6	212835	212840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740095
4086	NC_016944	CCA	2	6	212874	212879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740095
4087	NC_016944	GAT	2	6	212885	212890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740095
4088	NC_016944	TGC	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740095
4089	NC_016944	GGC	2	6	213241	213246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740095
4090	NC_016944	GTA	2	6	213286	213291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740095
4091	NC_016944	T	6	6	213298	213303	0 %	100 %	0 %	0 %	379740095
4092	NC_016944	CTC	2	6	213307	213312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_016944	ATT	2	6	213321	213326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016944	AAT	2	6	213337	213342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016944	TCAA	2	8	213365	213372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_016944	ATT	2	6	213416	213421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016944	A	6	6	213424	213429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016944	GCT	2	6	213432	213437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_016944	GATT	2	8	213534	213541	25 %	50 %	25 %	0 %	379740096
4100	NC_016944	CAA	2	6	213628	213633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740096
4101	NC_016944	GTTG	2	8	213639	213646	0 %	50 %	50 %	0 %	379740096
4102	NC_016944	CA	3	6	213841	213846	50 %	0 %	0 %	50 %	379740096
4103	NC_016944	ACGC	2	8	213992	213999	25 %	0 %	25 %	50 %	379740096
4104	NC_016944	GTA	2	6	214015	214020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740096
4105	NC_016944	GAT	2	6	214170	214175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740096
4106	NC_016944	TGG	2	6	214205	214210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740096
4107	NC_016944	CAAC	2	8	214220	214227	50 %	0 %	0 %	50 %	379740096
4108	NC_016944	TGA	2	6	214340	214345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740096
4109	NC_016944	G	6	6	214350	214355	0 %	0 %	100 %	0 %	379740096
4110	NC_016944	GCA	2	6	214389	214394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740096
4111	NC_016944	TGC	2	6	214410	214415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740096
4112	NC_016944	TCAA	2	8	214418	214425	50 %	25 %	0 %	25 %	379740096
4113	NC_016944	AGACA	2	10	214441	214450	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4114	NC_016944	GAT	2	6	214458	214463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740097
4115	NC_016944	ATG	2	6	214483	214488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740097
4116	NC_016944	TGG	2	6	214505	214510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740097
4117	NC_016944	AAT	2	6	214570	214575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740097
4118	NC_016944	A	7	7	214603	214609	100 %	0 %	0 %	0 %	379740097
4119	NC_016944	ATC	2	6	214654	214659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740097
4120	NC_016944	ATG	2	6	214693	214698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740097
4121	NC_016944	TTGA	2	8	214705	214712	25 %	50 %	25 %	0 %	379740097
4122	NC_016944	TC	3	6	214752	214757	0 %	50 %	0 %	50 %	379740097
4123	NC_016944	GCA	2	6	214770	214775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740097
4124	NC_016944	AGCA	2	8	214792	214799	50 %	0 %	25 %	25 %	379740097
4125	NC_016944	CCA	2	6	214835	214840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740097
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4132	NC_016944	TTC	2	6	215134	215139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740097
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4154	NC_016944	G	6	6	215941	215946	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_016944	CTTT	2	8	215973	215980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4163	NC_016944	AG	3	6	216326	216331	50 %	0 %	50 %	0 %	379740098
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4203	NC_016944	T	7	7	218340	218346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4206	NC_016944	AGGGG	2	10	218538	218547	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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4210	NC_016944	AAGT	2	8	218644	218651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4211	NC_016944	AG	4	8	218668	218675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_016944	ATG	2	6	218678	218683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740101
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4219	NC_016944	ATG	2	6	219051	219056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740101
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4232	NC_016944	ATG	2	6	219895	219900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740102
4233	NC_016944	GCC	2	6	219922	219927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740102
4234	NC_016944	CGG	2	6	219935	219940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740102
4235	NC_016944	CGC	2	6	219986	219991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740102
4236	NC_016944	AGC	2	6	219997	220002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740102
4237	NC_016944	GCA	2	6	220004	220009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740102
4238	NC_016944	GTT	2	6	220041	220046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740102
4239	NC_016944	GCG	2	6	220182	220187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740102
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4241	NC_016944	TGC	2	6	220275	220280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740102
4242	NC_016944	GC	3	6	220475	220480	0 %	0 %	50 %	50 %	379740103
4243	NC_016944	GGT	3	9	220657	220665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740103
4244	NC_016944	CTT	2	6	220671	220676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740103
4245	NC_016944	AAAG	2	8	220684	220691	75 %	0 %	25 %	0 %	379740103
4246	NC_016944	ATC	2	6	220769	220774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740103
4247	NC_016944	TCGGT	2	10	220784	220793	0 %	40 %	40 %	20 %	379740103
4248	NC_016944	TGAA	2	8	220832	220839	50 %	25 %	25 %	0 %	379740103
4249	NC_016944	GC	4	8	220904	220911	0 %	0 %	50 %	50 %	379740103
4250	NC_016944	ATCA	2	8	220999	221006	50 %	25 %	0 %	25 %	379740103
4251	NC_016944	AAAC	2	8	221091	221098	75 %	0 %	0 %	25 %	379740103
4252	NC_016944	AGC	2	6	221216	221221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740103
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4259	NC_016944	TGAT	2	8	221566	221573	25 %	50 %	25 %	0 %	379740104
4260	NC_016944	AG	3	6	221616	221621	50 %	0 %	50 %	0 %	379740104
4261	NC_016944	AGC	2	6	221659	221664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740104
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4265	NC_016944	GATT	2	8	221915	221922	25 %	50 %	25 %	0 %	379740104
4266	NC_016944	T	7	7	221921	221927	0 %	100 %	0 %	0 %	379740104
4267	NC_016944	CTG	2	6	221965	221970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4269	NC_016944	GTT	2	6	222045	222050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_016944	AGCG	2	8	222134	222141	25 %	0 %	50 %	25 %	379740105
4271	NC_016944	CTT	2	6	222175	222180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740105
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4273	NC_016944	TCAG	2	8	222345	222352	25 %	25 %	25 %	25 %	379740105
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4275	NC_016944	TCT	2	6	222430	222435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740105
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4333	NC_016944	TGC	2	6	225617	225622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740107
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4342	NC_016944	CCA	2	6	226195	226200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4353	NC_016944	T	7	7	226710	226716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4354	NC_016944	CTC	2	6	226770	226775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4355	NC_016944	ACT	2	6	226786	226791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4358	NC_016944	A	6	6	227077	227082	100 %	0 %	0 %	0 %	379740110
4359	NC_016944	TGAGT	2	10	227108	227117	20 %	40 %	40 %	0 %	379740110
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4361	NC_016944	CAAC	2	8	227196	227203	50 %	0 %	0 %	50 %	379740110
4362	NC_016944	A	6	6	227297	227302	100 %	0 %	0 %	0 %	379740110
4363	NC_016944	TGAAGT	2	12	227390	227401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740111
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4369	NC_016944	TGA	2	6	227732	227737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740111
4370	NC_016944	AT	3	6	227798	227803	50 %	50 %	0 %	0 %	379740111
4371	NC_016944	GC	3	6	227814	227819	0 %	0 %	50 %	50 %	379740111
4372	NC_016944	TCCA	2	8	227917	227924	25 %	25 %	0 %	50 %	379740111
4373	NC_016944	TGC	2	6	227989	227994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740111
4374	NC_016944	GGC	2	6	228012	228017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740111
4375	NC_016944	T	7	7	228287	228293	0 %	100 %	0 %	0 %	379740112
4376	NC_016944	CCG	2	6	228346	228351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740112
4377	NC_016944	CGA	2	6	228378	228383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740112
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4379	NC_016944	AC	3	6	228416	228421	50 %	0 %	0 %	50 %	379740112
4380	NC_016944	GC	3	6	228597	228602	0 %	0 %	50 %	50 %	379740112
4381	NC_016944	GGC	2	6	228651	228656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740112
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4383	NC_016944	TCA	2	6	228673	228678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740112
4384	NC_016944	GCGCG	2	10	228686	228695	0 %	0 %	60 %	40 %	379740112
4385	NC_016944	TCAA	2	8	228697	228704	50 %	25 %	0 %	25 %	379740112
4386	NC_016944	TCA	2	6	228787	228792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4387	NC_016944	ATG	2	6	228849	228854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4395	NC_016944	CAG	2	6	229368	229373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740113
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4399	NC_016944	GATG	2	8	229516	229523	25 %	25 %	50 %	0 %	379740113
4400	NC_016944	GTG	2	6	229535	229540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740113
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4403	NC_016944	GTTG	2	8	229639	229646	0 %	50 %	50 %	0 %	379740113
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4408	NC_016944	CTTTGT	2	12	229951	229962	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4409	NC_016944	GATA	2	8	229973	229980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_016944	AG	3	6	230055	230060	50 %	0 %	50 %	0 %	379740114
4411	NC_016944	A	6	6	230092	230097	100 %	0 %	0 %	0 %	379740114
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4439	NC_016944	GCA	2	6	231949	231954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4478	NC_016944	ATCCA	2	10	233851	233860	40 %	20 %	0 %	40 %	379740118
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4486	NC_016944	ATC	2	6	234406	234411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740118
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4489	NC_016944	CGT	2	6	234497	234502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740118
4490	NC_016944	GAC	2	6	234543	234548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740118
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4492	NC_016944	TCA	3	9	234593	234601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740118
4493	NC_016944	A	6	6	234659	234664	100 %	0 %	0 %	0 %	379740119
4494	NC_016944	CTCGC	2	10	234747	234756	0 %	20 %	20 %	60 %	379740119
4495	NC_016944	TAC	2	6	234839	234844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740119
4496	NC_016944	TGC	2	6	234890	234895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740119
4497	NC_016944	CAC	2	6	234929	234934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740119
4498	NC_016944	TTGCT	2	10	235050	235059	0 %	60 %	20 %	20 %	379740119
4499	NC_016944	GGC	2	6	235227	235232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740119
4500	NC_016944	AT	3	6	235282	235287	50 %	50 %	0 %	0 %	379740119

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