MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016944	TGA	2	6	157656	157661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740053
3002	NC_016944	GTCA	2	8	157667	157674	25 %	25 %	25 %	25 %	379740053
3003	NC_016944	AAT	2	6	157690	157695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740053
3004	NC_016944	AAC	2	6	157718	157723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740053
3005	NC_016944	AGC	2	6	157766	157771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740053
3006	NC_016944	TGA	2	6	157802	157807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740053
3007	NC_016944	TGC	2	6	157815	157820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740053
3008	NC_016944	TGG	2	6	157892	157897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740053
3009	NC_016944	CTT	3	9	158060	158068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740053
3010	NC_016944	TGC	2	6	158123	158128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740053
3011	NC_016944	TTGG	2	8	158207	158214	0 %	50 %	50 %	0 %	379740053
3012	NC_016944	ATG	2	6	158257	158262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740053
3013	NC_016944	ACA	2	6	158339	158344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740053
3014	NC_016944	CAT	2	6	158358	158363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740053
3015	NC_016944	ATG	2	6	158386	158391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740053
3016	NC_016944	ATG	2	6	158405	158410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740053
3017	NC_016944	CAA	2	6	158468	158473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740053
3018	NC_016944	TGA	2	6	158519	158524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740053
3019	NC_016944	GTGC	2	8	158533	158540	0 %	25 %	50 %	25 %	379740053
3020	NC_016944	CAT	2	6	158580	158585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740053
3021	NC_016944	ATGAA	2	10	158660	158669	60 %	20 %	20 %	0 %	379740053
3022	NC_016944	CTG	2	6	158687	158692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740053
3023	NC_016944	AACGC	2	10	158812	158821	40 %	0 %	20 %	40 %	379740053
3024	NC_016944	CAT	2	6	158838	158843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740053
3025	NC_016944	ACA	3	9	158952	158960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016944	TAA	2	6	158966	158971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016944	AAG	2	6	158977	158982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016944	CTTT	2	8	159003	159010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_016944	TTAT	2	8	159052	159059	25 %	75 %	0 %	0 %	379740054
3030	NC_016944	T	6	6	159286	159291	0 %	100 %	0 %	0 %	379740054
3031	NC_016944	ATA	2	6	159367	159372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016944	A	6	6	159372	159377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016944	TGA	2	6	159399	159404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016944	TCA	2	6	159447	159452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740055
3035	NC_016944	CAA	2	6	159484	159489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740055
3036	NC_016944	CCAGA	2	10	159571	159580	40 %	0 %	20 %	40 %	379740055
3037	NC_016944	TGC	2	6	159662	159667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740055
3038	NC_016944	GCAT	2	8	159705	159712	25 %	25 %	25 %	25 %	379740055
3039	NC_016944	TGT	2	6	159736	159741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740055
3040	NC_016944	CTC	2	6	159749	159754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379740055
3041	NC_016944	CAC	2	6	159871	159876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740055
3042	NC_016944	GA	3	6	159920	159925	50 %	0 %	50 %	0 %	379740055
3043	NC_016944	AAG	2	6	159948	159953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740055
3044	NC_016944	GC	3	6	159988	159993	0 %	0 %	50 %	50 %	379740055
3045	NC_016944	TGC	2	6	160057	160062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740055
3046	NC_016944	GCACC	2	10	160117	160126	20 %	0 %	20 %	60 %	379740055
3047	NC_016944	AGCG	2	8	160161	160168	25 %	0 %	50 %	25 %	379740055
3048	NC_016944	CTG	2	6	160225	160230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740055
3049	NC_016944	GTA	2	6	160238	160243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740055
3050	NC_016944	CAT	2	6	160346	160351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740055
3051	NC_016944	CTTTAT	2	12	160402	160413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379740055
3052	NC_016944	CAGATC	2	12	160448	160459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379740055
3053	NC_016944	GTG	2	6	160542	160547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740055
3054	NC_016944	GGTT	2	8	160651	160658	0 %	50 %	50 %	0 %	379740055
3055	NC_016944	TGGCT	2	10	160663	160672	0 %	40 %	40 %	20 %	379740055
3056	NC_016944	GAACT	2	10	160754	160763	40 %	20 %	20 %	20 %	379740055
3057	NC_016944	CAGA	2	8	160774	160781	50 %	0 %	25 %	25 %	379740055
3058	NC_016944	CAT	2	6	160792	160797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740055
3059	NC_016944	CAT	2	6	161078	161083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740055
3060	NC_016944	CAA	2	6	161101	161106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740055
3061	NC_016944	CCAG	2	8	161127	161134	25 %	0 %	25 %	50 %	379740055
3062	NC_016944	GAT	2	6	161255	161260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740055
3063	NC_016944	CGC	2	6	161261	161266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740055
3064	NC_016944	CTT	2	6	161284	161289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740055
3065	NC_016944	ACG	2	6	161316	161321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740055
3066	NC_016944	CAG	2	6	161363	161368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740055
3067	NC_016944	CAT	2	6	161393	161398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740055
3068	NC_016944	TGA	2	6	161485	161490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740055
3069	NC_016944	ACA	2	6	161572	161577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740055
3070	NC_016944	GCA	2	6	161620	161625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740055
3071	NC_016944	CG	3	6	161714	161719	0 %	0 %	50 %	50 %	379740055
3072	NC_016944	CAC	2	6	161795	161800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740055
3073	NC_016944	CTGA	2	8	161887	161894	25 %	25 %	25 %	25 %	379740055
3074	NC_016944	GTT	2	6	161897	161902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740055
3075	NC_016944	TCA	2	6	161917	161922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740055
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3077	NC_016944	AC	3	6	162016	162021	50 %	0 %	0 %	50 %	379740055
3078	NC_016944	TCT	2	6	162156	162161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740055
3079	NC_016944	CTT	2	6	162163	162168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740055
3080	NC_016944	GCGA	2	8	162178	162185	25 %	0 %	50 %	25 %	379740055
3081	NC_016944	TAA	2	6	162340	162345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740055
3082	NC_016944	ATG	2	6	162528	162533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740055
3083	NC_016944	CTG	2	6	162558	162563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740056
3084	NC_016944	GTG	2	6	162564	162569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740056
3085	NC_016944	CGA	2	6	162585	162590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740056
3086	NC_016944	TTC	2	6	162736	162741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740056
3087	NC_016944	ATG	2	6	162827	162832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740056
3088	NC_016944	CAG	2	6	162921	162926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740056
3089	NC_016944	CTT	2	6	162990	162995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740056
3090	NC_016944	TGG	2	6	163167	163172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740056
3091	NC_016944	TAG	2	6	163205	163210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740056
3092	NC_016944	TCA	2	6	163223	163228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740056
3093	NC_016944	GCAG	2	8	163295	163302	25 %	0 %	50 %	25 %	379740056
3094	NC_016944	GC	3	6	163303	163308	0 %	0 %	50 %	50 %	379740056
3095	NC_016944	TGT	2	6	163565	163570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740056
3096	NC_016944	CAG	2	6	163603	163608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740056
3097	NC_016944	A	6	6	163627	163632	100 %	0 %	0 %	0 %	379740056
3098	NC_016944	ATC	2	6	163720	163725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740057
3099	NC_016944	GTT	2	6	163769	163774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740057
3100	NC_016944	AGAA	2	8	163789	163796	75 %	0 %	25 %	0 %	379740057
3101	NC_016944	CTG	2	6	163825	163830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740057
3102	NC_016944	AAC	2	6	163844	163849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740057
3103	NC_016944	T	6	6	163869	163874	0 %	100 %	0 %	0 %	379740057
3104	NC_016944	CAA	2	6	163895	163900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740057
3105	NC_016944	GTT	3	9	163901	163909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740057
3106	NC_016944	TAA	2	6	163938	163943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740057
3107	NC_016944	AGCC	2	8	163956	163963	25 %	0 %	25 %	50 %	379740057
3108	NC_016944	T	6	6	164049	164054	0 %	100 %	0 %	0 %	379740057
3109	NC_016944	TCAA	2	8	164075	164082	50 %	25 %	0 %	25 %	379740057
3110	NC_016944	GAT	2	6	164085	164090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740057
3111	NC_016944	GCT	2	6	164135	164140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740057
3112	NC_016944	GTT	2	6	164270	164275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016944	TTG	2	6	164345	164350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016944	ATT	3	9	164369	164377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016944	GGC	2	6	164378	164383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_016944	TAAA	2	8	164384	164391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016944	CAAGA	2	10	164421	164430	60 %	0 %	20 %	20 %	379740058
3118	NC_016944	GGCGGG	2	12	164470	164481	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	379740058
3119	NC_016944	TCA	2	6	164499	164504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740058
3120	NC_016944	TGC	2	6	164557	164562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740058
3121	NC_016944	GCG	2	6	164582	164587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740058
3122	NC_016944	CG	3	6	164634	164639	0 %	0 %	50 %	50 %	379740058
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3495	NC_016944	TCG	2	6	183692	183697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740074
3496	NC_016944	CTG	2	6	183742	183747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740074
3497	NC_016944	CA	4	8	183774	183781	50 %	0 %	0 %	50 %	379740074
3498	NC_016944	GAA	2	6	183829	183834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740074
3499	NC_016944	CGA	2	6	183845	183850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740074
3500	NC_016944	AAGA	3	12	183897	183908	75 %	0 %	25 %	0 %	379740074

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