MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016944	GC	3	6	49419	49424	0 %	0 %	50 %	50 %	379739956
1002	NC_016944	AC	3	6	49448	49453	50 %	0 %	0 %	50 %	379739956
1003	NC_016944	CTC	2	6	49464	49469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379739957
1004	NC_016944	TCA	2	6	49532	49537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739957
1005	NC_016944	GAT	2	6	49557	49562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739957
1006	NC_016944	CAGA	2	8	49670	49677	50 %	0 %	25 %	25 %	379739957
1007	NC_016944	GCG	2	6	49723	49728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739957
1008	NC_016944	GCC	2	6	49752	49757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739957
1009	NC_016944	GAT	2	6	49767	49772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739957
1010	NC_016944	GAG	2	6	49823	49828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379739957
1011	NC_016944	CTG	2	6	49886	49891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739957
1012	NC_016944	ATA	2	6	49930	49935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739957
1013	NC_016944	TTAT	2	8	49964	49971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016944	CAAG	2	8	49976	49983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_016944	GCG	2	6	49991	49996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016944	T	7	7	50010	50016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016944	TGA	2	6	50044	50049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016944	GAA	2	6	50050	50055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016944	TGG	2	6	50111	50116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739958
1020	NC_016944	ACA	2	6	50124	50129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739958
1021	NC_016944	TGCGC	2	10	50139	50148	0 %	20 %	40 %	40 %	379739958
1022	NC_016944	GTTTG	2	10	50184	50193	0 %	60 %	40 %	0 %	379739958
1023	NC_016944	TGC	2	6	50222	50227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739958
1024	NC_016944	AGC	2	6	50243	50248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739958
1025	NC_016944	GCTA	2	8	50281	50288	25 %	25 %	25 %	25 %	379739958
1026	NC_016944	GCCA	2	8	50385	50392	25 %	0 %	25 %	50 %	379739958
1027	NC_016944	CGTG	2	8	50439	50446	0 %	25 %	50 %	25 %	379739958
1028	NC_016944	ATC	2	6	50453	50458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739958
1029	NC_016944	CAA	2	6	50545	50550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739958
1030	NC_016944	GTA	2	6	50587	50592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739958
1031	NC_016944	GA	3	6	50681	50686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016944	AAGAT	2	10	50741	50750	60 %	20 %	20 %	0 %	379739959
1033	NC_016944	CAA	2	6	50755	50760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739959
1034	NC_016944	GTG	3	9	50831	50839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739959
1035	NC_016944	TGCC	2	8	50918	50925	0 %	25 %	25 %	50 %	379739959
1036	NC_016944	CGC	2	6	50959	50964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739959
1037	NC_016944	T	6	6	51040	51045	0 %	100 %	0 %	0 %	379739959
1038	NC_016944	TGG	2	6	51076	51081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739959
1039	NC_016944	TGG	3	9	51084	51092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739959
1040	NC_016944	TTG	2	6	51119	51124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739959
1041	NC_016944	CGG	2	6	51255	51260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739959
1042	NC_016944	T	6	6	51265	51270	0 %	100 %	0 %	0 %	379739959
1043	NC_016944	GAT	2	6	51271	51276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739959
1044	NC_016944	AATG	2	8	51280	51287	50 %	25 %	25 %	0 %	379739959
1045	NC_016944	TCG	2	6	51414	51419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739959
1046	NC_016944	AATC	2	8	51494	51501	50 %	25 %	0 %	25 %	379739959
1047	NC_016944	CAG	2	6	51761	51766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739960
1048	NC_016944	GTGC	2	8	51787	51794	0 %	25 %	50 %	25 %	379739960
1049	NC_016944	GGC	2	6	51814	51819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739960
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1051	NC_016944	AGG	2	6	51876	51881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379739960
1052	NC_016944	GC	4	8	51910	51917	0 %	0 %	50 %	50 %	379739960
1053	NC_016944	A	6	6	51943	51948	100 %	0 %	0 %	0 %	379739960
1054	NC_016944	GAT	2	6	51953	51958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739960
1055	NC_016944	ACA	2	6	51975	51980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739960
1056	NC_016944	GCA	2	6	52015	52020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739960
1057	NC_016944	CGA	2	6	52038	52043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739960
1058	NC_016944	TTG	2	6	52046	52051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739960
1059	NC_016944	TGG	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739960
1060	NC_016944	GCG	2	6	52067	52072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739960
1061	NC_016944	TTA	2	6	52091	52096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739960
1062	NC_016944	CAG	2	6	52100	52105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739960
1063	NC_016944	ATG	2	6	52221	52226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739960
1064	NC_016944	ATC	2	6	52229	52234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739960
1065	NC_016944	ATG	2	6	52316	52321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739960
1066	NC_016944	ACA	2	6	52360	52365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739960
1067	NC_016944	GC	3	6	52371	52376	0 %	0 %	50 %	50 %	379739960
1068	NC_016944	CGAT	2	8	52380	52387	25 %	25 %	25 %	25 %	379739960
1069	NC_016944	TGT	2	6	52557	52562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739961
1070	NC_016944	T	6	6	52564	52569	0 %	100 %	0 %	0 %	379739961
1071	NC_016944	TGA	2	6	52661	52666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739961
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1073	NC_016944	CT	3	6	52737	52742	0 %	50 %	0 %	50 %	379739961
1074	NC_016944	TGCT	2	8	52862	52869	0 %	50 %	25 %	25 %	379739962
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1079	NC_016944	TGC	2	6	53177	53182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739962
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1081	NC_016944	AGCAC	2	10	53232	53241	40 %	0 %	20 %	40 %	379739962
1082	NC_016944	TCA	2	6	53305	53310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739962
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1084	NC_016944	TAG	2	6	53341	53346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016944	A	6	6	53410	53415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016944	A	6	6	53548	53553	100 %	0 %	0 %	0 %	379739963
1087	NC_016944	ACA	2	6	53563	53568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739963
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1092	NC_016944	TG	3	6	53649	53654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016944	TGA	2	6	53664	53669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016944	TTAA	2	8	53754	53761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016944	A	6	6	53806	53811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016944	GGC	2	6	53853	53858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_016944	GCA	2	6	53884	53889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_016944	GCG	2	6	53917	53922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_016944	CGA	2	6	54092	54097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_016944	GAT	2	6	54117	54122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016944	GCA	2	6	54166	54171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_016944	GAA	2	6	54225	54230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016944	GGT	2	6	54268	54273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016944	AGA	2	6	54308	54313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016944	CAG	2	6	54334	54339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_016944	GGT	2	6	54399	54404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016944	G	6	6	54481	54486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016944	GGC	2	6	54545	54550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_016944	GAA	2	6	54788	54793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016944	TGC	2	6	54864	54869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_016944	GTC	2	6	54876	54881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_016944	TGG	2	6	54954	54959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016944	GGA	2	6	54990	54995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016944	GAC	2	6	55003	55008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_016944	TCA	2	6	55015	55020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_016944	AC	3	6	55041	55046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_016944	CGT	2	6	55109	55114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_016944	AC	3	6	55210	55215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_016944	AAG	2	6	55246	55251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016944	GGA	2	6	55270	55275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016944	CCT	2	6	55351	55356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_016944	TGA	2	6	55373	55378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016944	CA	3	6	55384	55389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_016944	GATT	2	8	55390	55397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016944	GCATG	2	10	55450	55459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_016944	CCA	2	6	55491	55496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_016944	TCA	2	6	55536	55541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_016944	ACA	2	6	55580	55585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016944	TTG	2	6	55591	55596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016944	CAA	2	6	55634	55639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_016944	GTT	2	6	55745	55750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016944	GAG	2	6	55993	55998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016944	GTA	2	6	56020	56025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016944	GCG	2	6	56026	56031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_016944	TAC	2	6	56619	56624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1143	NC_016944	AC	3	6	56713	56718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1144	NC_016944	CGTC	2	8	56731	56738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1166	NC_016944	GGT	2	6	58162	58167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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