MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016944	GCC	2	6	23640	23645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739933
502	NC_016944	ATC	2	6	23682	23687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739933
503	NC_016944	AAT	2	6	23727	23732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739933
504	NC_016944	GTACC	2	10	23864	23873	20 %	20 %	20 %	40 %	379739933
505	NC_016944	GCT	3	9	23891	23899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739933
506	NC_016944	GC	3	6	23956	23961	0 %	0 %	50 %	50 %	379739933
507	NC_016944	CCG	2	6	23984	23989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739933
508	NC_016944	TCA	2	6	23998	24003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739933
509	NC_016944	CAC	2	6	24111	24116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739933
510	NC_016944	GCT	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739933
511	NC_016944	AGGC	2	8	24145	24152	25 %	0 %	50 %	25 %	379739933
512	NC_016944	CGC	2	6	24222	24227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739933
513	NC_016944	CCG	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739933
514	NC_016944	ACCG	2	8	24240	24247	25 %	0 %	25 %	50 %	379739933
515	NC_016944	TGC	2	6	24277	24282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739933
516	NC_016944	TTCGGC	2	12	24375	24386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739933
517	NC_016944	TGC	2	6	24404	24409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739933
518	NC_016944	GCA	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739933
519	NC_016944	CGC	2	6	24425	24430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739933
520	NC_016944	GTG	2	6	24466	24471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739933
521	NC_016944	TGG	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739933
522	NC_016944	TGT	2	6	24599	24604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739933
523	NC_016944	CTGG	2	8	24632	24639	0 %	25 %	50 %	25 %	379739933
524	NC_016944	GCG	2	6	24927	24932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739934
525	NC_016944	GCT	2	6	24934	24939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739934
526	NC_016944	CGC	2	6	25035	25040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739934
527	NC_016944	ACC	2	6	25077	25082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739934
528	NC_016944	GC	3	6	25106	25111	0 %	0 %	50 %	50 %	379739934
529	NC_016944	AGGT	2	8	25138	25145	25 %	25 %	50 %	0 %	379739934
530	NC_016944	ACG	2	6	25207	25212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739934
531	NC_016944	GCC	2	6	25230	25235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739934
532	NC_016944	CAG	2	6	25277	25282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739934
533	NC_016944	CAG	2	6	25316	25321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739934
534	NC_016944	CCA	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739934
535	NC_016944	TGCG	2	8	25389	25396	0 %	25 %	50 %	25 %	379739934
536	NC_016944	GTG	2	6	25471	25476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739934
537	NC_016944	CAG	2	6	25484	25489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739934
538	NC_016944	GTTT	2	8	25528	25535	0 %	75 %	25 %	0 %	379739934
539	NC_016944	CGT	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739934
540	NC_016944	GCT	2	6	25553	25558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739934
541	NC_016944	CCGC	2	8	25642	25649	0 %	0 %	25 %	75 %	379739934
542	NC_016944	CGAT	2	8	25726	25733	25 %	25 %	25 %	25 %	379739934
543	NC_016944	TGG	2	6	25796	25801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739934
544	NC_016944	GCC	2	6	25803	25808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739934
545	NC_016944	GCT	2	6	25843	25848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739934
546	NC_016944	TTG	2	6	25849	25854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739934
547	NC_016944	CAT	2	6	25880	25885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739934
548	NC_016944	GTA	2	6	25893	25898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739934
549	NC_016944	CAA	2	6	25913	25918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739934
550	NC_016944	CAG	2	6	25928	25933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739934
551	NC_016944	GA	4	8	25991	25998	50 %	0 %	50 %	0 %	379739934
552	NC_016944	CAT	2	6	26127	26132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739934
553	NC_016944	TGA	2	6	26153	26158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739934
554	NC_016944	GCC	2	6	26196	26201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739934
555	NC_016944	CGC	2	6	26235	26240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739934
556	NC_016944	AC	3	6	26280	26285	50 %	0 %	0 %	50 %	379739934
557	NC_016944	GCC	2	6	26367	26372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739934
558	NC_016944	GCC	2	6	26427	26432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739934
559	NC_016944	ACC	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739934
560	NC_016944	GC	3	6	26563	26568	0 %	0 %	50 %	50 %	379739934
561	NC_016944	GC	4	8	26575	26582	0 %	0 %	50 %	50 %	379739934
562	NC_016944	GT	3	6	26601	26606	0 %	50 %	50 %	0 %	379739934
563	NC_016944	GGT	2	6	26607	26612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739934
564	NC_016944	GCT	2	6	26650	26655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739935
565	NC_016944	TCT	2	6	26686	26691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739935
566	NC_016944	GTG	2	6	26692	26697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739935
567	NC_016944	TAC	2	6	26727	26732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739935
568	NC_016944	CGG	3	9	26801	26809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739935
569	NC_016944	TGG	2	6	26939	26944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739935
570	NC_016944	CAC	2	6	26973	26978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739935
571	NC_016944	AG	3	6	27003	27008	50 %	0 %	50 %	0 %	379739935
572	NC_016944	CCA	2	6	27064	27069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739935
573	NC_016944	AGA	2	6	27078	27083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739935
574	NC_016944	CTT	2	6	27179	27184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739935
575	NC_016944	C	6	6	27197	27202	0 %	0 %	0 %	100 %	379739935
576	NC_016944	ATC	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739935
577	NC_016944	TTG	2	6	27310	27315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739935
578	NC_016944	CG	3	6	27329	27334	0 %	0 %	50 %	50 %	379739935
579	NC_016944	ATG	2	6	27343	27348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739935
580	NC_016944	TCGA	2	8	27352	27359	25 %	25 %	25 %	25 %	379739935
581	NC_016944	GAT	2	6	27429	27434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739935
582	NC_016944	AGC	2	6	27455	27460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739935
583	NC_016944	TGCAT	2	10	27490	27499	20 %	40 %	20 %	20 %	379739935
584	NC_016944	ATC	2	6	27535	27540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739935
585	NC_016944	CAG	2	6	27563	27568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739935
586	NC_016944	TTG	2	6	27572	27577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739935
587	NC_016944	CCTT	2	8	27587	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	379739936
588	NC_016944	TGT	2	6	27609	27614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739936
589	NC_016944	GTT	2	6	27617	27622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739936
590	NC_016944	CTTG	2	8	27778	27785	0 %	50 %	25 %	25 %	379739936
591	NC_016944	GAT	2	6	27799	27804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739936
592	NC_016944	TAA	2	6	27827	27832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739936
593	NC_016944	TCT	2	6	27950	27955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739937
594	NC_016944	TCA	2	6	27956	27961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739937
595	NC_016944	GCA	2	6	27972	27977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739937
596	NC_016944	CGCAG	2	10	28007	28016	20 %	0 %	40 %	40 %	379739937
597	NC_016944	CTT	3	9	28023	28031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739937
598	NC_016944	TCA	2	6	28233	28238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739937
599	NC_016944	CAC	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739937
600	NC_016944	GCA	2	6	28292	28297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739937
601	NC_016944	GCC	2	6	28304	28309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739937
602	NC_016944	GC	3	6	28364	28369	0 %	0 %	50 %	50 %	379739937
603	NC_016944	TGC	2	6	28379	28384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739937
604	NC_016944	CAT	2	6	28438	28443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739937
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606	NC_016944	GTG	2	6	28467	28472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739937
607	NC_016944	TGT	2	6	28479	28484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739937
608	NC_016944	GAT	2	6	28491	28496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739937
609	NC_016944	ATG	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739937
610	NC_016944	GCA	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739937
611	NC_016944	TTG	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739937
612	NC_016944	CGG	2	6	28638	28643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739937
613	NC_016944	TCA	2	6	28709	28714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739937
614	NC_016944	CCAC	2	8	28919	28926	25 %	0 %	0 %	75 %	379739937
615	NC_016944	ATACA	2	10	28927	28936	60 %	20 %	0 %	20 %	379739937
616	NC_016944	CCA	2	6	29070	29075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739937
617	NC_016944	GAC	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739937
618	NC_016944	AG	3	6	29176	29181	50 %	0 %	50 %	0 %	379739937
619	NC_016944	CATC	2	8	29196	29203	25 %	25 %	0 %	50 %	379739937
620	NC_016944	TG	3	6	29226	29231	0 %	50 %	50 %	0 %	379739937
621	NC_016944	TGG	2	6	29307	29312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739937
622	NC_016944	GC	3	6	29359	29364	0 %	0 %	50 %	50 %	379739937
623	NC_016944	CGC	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739937
624	NC_016944	GGC	2	6	29400	29405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739937
625	NC_016944	CAT	2	6	29439	29444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739937
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627	NC_016944	TGT	2	6	29495	29500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739937
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