MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016944	GATT	2	8	313284	313291	25 %	50 %	25 %	0 %	379740187
6002	NC_016944	GCA	2	6	313333	313338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740187
6003	NC_016944	AGA	2	6	313363	313368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740187
6004	NC_016944	CCT	2	6	313416	313421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379740187
6005	NC_016944	GCGG	2	8	313429	313436	0 %	0 %	75 %	25 %	379740187
6006	NC_016944	CGG	2	6	313474	313479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740187
6007	NC_016944	TGA	2	6	313488	313493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740187
6008	NC_016944	AGA	2	6	313558	313563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740187
6009	NC_016944	GGC	2	6	313666	313671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740187
6010	NC_016944	CCA	2	6	313768	313773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740187
6011	NC_016944	GCG	2	6	313793	313798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740187
6012	NC_016944	CGC	2	6	313921	313926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740187
6013	NC_016944	CAT	2	6	313956	313961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740187
6014	NC_016944	TGC	2	6	313989	313994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740187
6015	NC_016944	TG	3	6	314098	314103	0 %	50 %	50 %	0 %	379740187
6016	NC_016944	AGC	2	6	314133	314138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740187
6017	NC_016944	GAG	2	6	314150	314155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379740187
6018	NC_016944	TCA	2	6	314239	314244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740187
6019	NC_016944	GGGCA	2	10	314267	314276	20 %	0 %	60 %	20 %	379740187
6020	NC_016944	CGT	2	6	314316	314321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740187
6021	NC_016944	CACT	2	8	314322	314329	25 %	25 %	0 %	50 %	379740187
6022	NC_016944	TG	3	6	314385	314390	0 %	50 %	50 %	0 %	379740187
6023	NC_016944	TTGG	2	8	314411	314418	0 %	50 %	50 %	0 %	379740187
6024	NC_016944	ACGG	2	8	314544	314551	25 %	0 %	50 %	25 %	379740187
6025	NC_016944	TGC	2	6	314565	314570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740187
6026	NC_016944	ATC	2	6	314612	314617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740187
6027	NC_016944	GTCT	2	8	314721	314728	0 %	50 %	25 %	25 %	379740187
6028	NC_016944	AAC	2	6	314749	314754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_016944	AGTA	2	8	314809	314816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016944	GCCA	2	8	314877	314884	25 %	0 %	25 %	50 %	379740188
6031	NC_016944	TCTAAC	2	12	314906	314917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740188
6032	NC_016944	T	6	6	314936	314941	0 %	100 %	0 %	0 %	379740188
6033	NC_016944	GCCA	2	8	314942	314949	25 %	0 %	25 %	50 %	379740188
6034	NC_016944	GCA	2	6	315051	315056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740188
6035	NC_016944	AAT	2	6	315150	315155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740188
6036	NC_016944	C	7	7	315216	315222	0 %	0 %	0 %	100 %	379740188
6037	NC_016944	T	6	6	315223	315228	0 %	100 %	0 %	0 %	379740188
6038	NC_016944	GCA	2	6	315273	315278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740188
6039	NC_016944	GC	3	6	315409	315414	0 %	0 %	50 %	50 %	379740188
6040	NC_016944	TCT	2	6	315422	315427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740188
6041	NC_016944	CCGC	2	8	315476	315483	0 %	0 %	25 %	75 %	379740188
6042	NC_016944	GAT	2	6	315597	315602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740188
6043	NC_016944	GCTT	2	8	315614	315621	0 %	50 %	25 %	25 %	379740188
6044	NC_016944	GTACC	2	10	315696	315705	20 %	20 %	20 %	40 %	379740188
6045	NC_016944	AC	4	8	315716	315723	50 %	0 %	0 %	50 %	379740188
6046	NC_016944	TGAG	2	8	315746	315753	25 %	25 %	50 %	0 %	379740188
6047	NC_016944	GGC	2	6	315775	315780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740188
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6049	NC_016944	TGG	2	6	315801	315806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740188
6050	NC_016944	CA	3	6	315847	315852	50 %	0 %	0 %	50 %	379740188
6051	NC_016944	CAC	2	6	315918	315923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740188
6052	NC_016944	ACT	2	6	315932	315937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740188
6053	NC_016944	CTT	3	9	315993	316001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740188
6054	NC_016944	TGG	2	6	316068	316073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740188
6055	NC_016944	GCATC	2	10	316170	316179	20 %	20 %	20 %	40 %	379740188
6056	NC_016944	GCA	2	6	316313	316318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740188
6057	NC_016944	GAA	2	6	316328	316333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740188
6058	NC_016944	GTG	2	6	316375	316380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740189
6059	NC_016944	GCG	2	6	316388	316393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740189
6060	NC_016944	CCA	2	6	316413	316418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740189
6061	NC_016944	TATTGC	2	12	316420	316431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379740189
6062	NC_016944	GCG	2	6	316451	316456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740189
6063	NC_016944	TGT	2	6	316458	316463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740189
6064	NC_016944	CGA	2	6	316466	316471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740189
6065	NC_016944	CAG	2	6	316502	316507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740189
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6067	NC_016944	GTCG	2	8	316730	316737	0 %	25 %	50 %	25 %	379740189
6068	NC_016944	T	6	6	316790	316795	0 %	100 %	0 %	0 %	379740189
6069	NC_016944	CAGT	2	8	316810	316817	25 %	25 %	25 %	25 %	379740189
6070	NC_016944	GGT	2	6	316828	316833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740189
6071	NC_016944	GCC	2	6	316839	316844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740189
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6073	NC_016944	AGC	2	6	316932	316937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740189
6074	NC_016944	GTTC	2	8	316948	316955	0 %	50 %	25 %	25 %	379740189
6075	NC_016944	T	6	6	316993	316998	0 %	100 %	0 %	0 %	379740189
6076	NC_016944	ACC	2	6	317010	317015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740189
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6078	NC_016944	CGG	2	6	317118	317123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740189
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6081	NC_016944	CCA	2	6	317310	317315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740189
6082	NC_016944	GCT	2	6	317325	317330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740189
6083	NC_016944	CAA	2	6	317348	317353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740189
6084	NC_016944	CAT	2	6	317362	317367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740189
6085	NC_016944	ATA	2	6	317403	317408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740189
6086	NC_016944	GCCTG	2	10	317514	317523	0 %	20 %	40 %	40 %	379740189
6087	NC_016944	AAAC	2	8	317581	317588	75 %	0 %	0 %	25 %	379740189
6088	NC_016944	T	7	7	317592	317598	0 %	100 %	0 %	0 %	379740189
6089	NC_016944	GTG	2	6	317875	317880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740190
6090	NC_016944	GAT	2	6	317893	317898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740190
6091	NC_016944	ACC	2	6	317983	317988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740190
6092	NC_016944	CTG	3	9	318017	318025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740190
6093	NC_016944	GTTTT	2	10	318148	318157	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016944	A	6	6	318162	318167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_016944	TTAA	2	8	318212	318219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_016944	GTT	2	6	318223	318228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_016944	CTT	2	6	318231	318236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_016944	CTTAA	2	10	318261	318270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6099	NC_016944	ACTA	2	8	318286	318293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_016944	CCA	2	6	318299	318304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_016944	GAA	2	6	318324	318329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740191
6102	NC_016944	ATT	2	6	318406	318411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740191
6103	NC_016944	GTG	2	6	318440	318445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740191
6104	NC_016944	TTC	2	6	318476	318481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740191
6105	NC_016944	GAC	2	6	318535	318540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740191
6106	NC_016944	TCG	2	6	318564	318569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740191
6107	NC_016944	CCG	2	6	318613	318618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740191
6108	NC_016944	CAA	2	6	318690	318695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740191
6109	NC_016944	CTC	2	6	318716	318721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379740191
6110	NC_016944	AGA	2	6	318768	318773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740191
6111	NC_016944	GCA	2	6	318799	318804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740191
6112	NC_016944	TGC	2	6	318863	318868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740191
6113	NC_016944	GT	3	6	318909	318914	0 %	50 %	50 %	0 %	379740191
6114	NC_016944	CTG	2	6	318925	318930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740191
6115	NC_016944	AGA	2	6	318945	318950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740191
6116	NC_016944	TGA	2	6	319002	319007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740191
6117	NC_016944	AAGA	2	8	319075	319082	75 %	0 %	25 %	0 %	379740191
6118	NC_016944	GTG	2	6	319084	319089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740191
6119	NC_016944	ACA	2	6	319127	319132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740191
6120	NC_016944	GGT	2	6	319165	319170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740191
6121	NC_016944	AGA	2	6	319227	319232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740191
6122	NC_016944	GGT	2	6	319234	319239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740191
6123	NC_016944	CAT	2	6	319248	319253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740191
6124	NC_016944	GATG	2	8	319284	319291	25 %	25 %	50 %	0 %	379740191
6125	NC_016944	CGT	2	6	319402	319407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740191
6126	NC_016944	CGATG	2	10	319485	319494	20 %	20 %	40 %	20 %	379740191
6127	NC_016944	TGAT	2	8	319502	319509	25 %	50 %	25 %	0 %	379740191
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6129	NC_016944	GGT	2	6	319596	319601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016944	TTTG	2	8	319605	319612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_016944	GTG	2	6	319625	319630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6153	NC_016944	TGCT	2	8	320560	320567	0 %	50 %	25 %	25 %	379740192
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6242	NC_016944	GGA	2	6	325325	325330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6246	NC_016944	CGT	2	6	325444	325449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6247	NC_016944	AC	3	6	325545	325550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6248	NC_016944	AAG	2	6	325581	325586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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