MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 57573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016944	TAAG	2	8	261903	261910	50 %	25 %	25 %	0 %	379740142
5002	NC_016944	ATT	2	6	262008	262013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016944	CAA	2	6	262017	262022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_016944	T	6	6	262073	262078	0 %	100 %	0 %	0 %	379740143
5005	NC_016944	ATT	2	6	262087	262092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740143
5006	NC_016944	GTA	2	6	262103	262108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740143
5007	NC_016944	TAA	2	6	262119	262124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740143
5008	NC_016944	A	6	6	262123	262128	100 %	0 %	0 %	0 %	379740143
5009	NC_016944	ATTA	2	8	262141	262148	50 %	50 %	0 %	0 %	379740143
5010	NC_016944	TTAG	2	8	262327	262334	25 %	50 %	25 %	0 %	379740143
5011	NC_016944	ATC	2	6	262342	262347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740144
5012	NC_016944	GAC	2	6	262389	262394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740144
5013	NC_016944	AGC	2	6	262420	262425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740144
5014	NC_016944	AGC	2	6	262462	262467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740144
5015	NC_016944	AGA	2	6	262522	262527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740144
5016	NC_016944	AAG	2	6	262595	262600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740144
5017	NC_016944	A	7	7	262633	262639	100 %	0 %	0 %	0 %	379740144
5018	NC_016944	CT	3	6	262647	262652	0 %	50 %	0 %	50 %	379740144
5019	NC_016944	AGT	2	6	262747	262752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740145
5020	NC_016944	TTAA	2	8	262780	262787	50 %	50 %	0 %	0 %	379740145
5021	NC_016944	CGC	2	6	262830	262835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740145
5022	NC_016944	CAA	2	6	262913	262918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740145
5023	NC_016944	GTC	2	6	263015	263020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740145
5024	NC_016944	CTT	2	6	263352	263357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740145
5025	NC_016944	CAA	2	6	263416	263421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740145
5026	NC_016944	GGT	2	6	263479	263484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740145
5027	NC_016944	GCT	2	6	263658	263663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740146
5028	NC_016944	AAT	2	6	263745	263750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740146
5029	NC_016944	TCA	2	6	263765	263770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740146
5030	NC_016944	ATA	2	6	263830	263835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740146
5031	NC_016944	TCA	2	6	263841	263846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740146
5032	NC_016944	A	6	6	263858	263863	100 %	0 %	0 %	0 %	379740146
5033	NC_016944	AGT	2	6	263916	263921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740146
5034	NC_016944	AT	3	6	263926	263931	50 %	50 %	0 %	0 %	379740146
5035	NC_016944	CTA	2	6	263935	263940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740146
5036	NC_016944	ATATT	2	10	264032	264041	40 %	60 %	0 %	0 %	379740146
5037	NC_016944	TGA	2	6	264089	264094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740146
5038	NC_016944	ATA	2	6	264105	264110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740146
5039	NC_016944	ATC	2	6	264152	264157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740146
5040	NC_016944	TAA	2	6	264176	264181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740146
5041	NC_016944	AAT	2	6	264231	264236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016944	AT	3	6	264240	264245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016944	AAC	2	6	264442	264447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740147
5044	NC_016944	ACT	2	6	264499	264504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740147
5045	NC_016944	AAT	2	6	264505	264510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740147
5046	NC_016944	CTA	2	6	264636	264641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740147
5047	NC_016944	TGC	2	6	264739	264744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740147
5048	NC_016944	GTA	2	6	264769	264774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740147
5049	NC_016944	CAA	2	6	264786	264791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740147
5050	NC_016944	A	6	6	264797	264802	100 %	0 %	0 %	0 %	379740147
5051	NC_016944	TTA	2	6	264827	264832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740147
5052	NC_016944	GGATA	2	10	264849	264858	40 %	20 %	40 %	0 %	379740147
5053	NC_016944	TCA	2	6	264866	264871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740147
5054	NC_016944	ATT	2	6	264884	264889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740147
5055	NC_016944	TG	4	8	264925	264932	0 %	50 %	50 %	0 %	379740147
5056	NC_016944	A	6	6	264974	264979	100 %	0 %	0 %	0 %	379740147
5057	NC_016944	AAT	2	6	265024	265029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740147
5058	NC_016944	AG	3	6	265075	265080	50 %	0 %	50 %	0 %	379740147
5059	NC_016944	TAATGG	2	12	265103	265114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740147
5060	NC_016944	T	7	7	265195	265201	0 %	100 %	0 %	0 %	379740147
5061	NC_016944	ATT	2	6	265208	265213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740147
5062	NC_016944	AAT	2	6	265227	265232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740147
5063	NC_016944	AAG	3	9	265233	265241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740147
5064	NC_016944	TA	3	6	265356	265361	50 %	50 %	0 %	0 %	379740147
5065	NC_016944	TTC	2	6	265511	265516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740148
5066	NC_016944	TC	3	6	265558	265563	0 %	50 %	0 %	50 %	379740148
5067	NC_016944	TCA	2	6	265632	265637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
5068	NC_016944	CTT	2	6	265638	265643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740148
5069	NC_016944	CGA	2	6	265696	265701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740148
5070	NC_016944	T	6	6	265856	265861	0 %	100 %	0 %	0 %	379740148
5071	NC_016944	GTA	2	6	265954	265959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740148
5072	NC_016944	GCTT	2	8	265975	265982	0 %	50 %	25 %	25 %	379740148
5073	NC_016944	T	6	6	266037	266042	0 %	100 %	0 %	0 %	379740148
5074	NC_016944	TTG	2	6	266091	266096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740148
5075	NC_016944	GCA	2	6	266148	266153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740148
5076	NC_016944	TGA	2	6	266172	266177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740148
5077	NC_016944	T	6	6	266189	266194	0 %	100 %	0 %	0 %	379740148
5078	NC_016944	TGC	2	6	266225	266230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740148
5079	NC_016944	T	7	7	266418	266424	0 %	100 %	0 %	0 %	379740148
5080	NC_016944	GCA	2	6	266514	266519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740148
5081	NC_016944	GA	3	6	266563	266568	50 %	0 %	50 %	0 %	379740148
5082	NC_016944	ATT	2	6	266606	266611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740148
5083	NC_016944	ACT	2	6	266666	266671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
5084	NC_016944	ATC	3	9	266717	266725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
5085	NC_016944	AAG	2	6	266727	266732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740148
5086	NC_016944	TCA	2	6	266748	266753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
5087	NC_016944	TAA	2	6	266832	266837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740148
5088	NC_016944	ATAA	2	8	266900	266907	75 %	25 %	0 %	0 %	379740148
5089	NC_016944	GAAA	2	8	266935	266942	75 %	0 %	25 %	0 %	379740148
5090	NC_016944	ATG	2	6	266973	266978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740148
5091	NC_016944	GCAG	2	8	267003	267010	25 %	0 %	50 %	25 %	379740148
5092	NC_016944	CAT	2	6	267011	267016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
5093	NC_016944	ATAC	2	8	267035	267042	50 %	25 %	0 %	25 %	379740148
5094	NC_016944	AG	3	6	267061	267066	50 %	0 %	50 %	0 %	379740148
5095	NC_016944	TCA	2	6	267082	267087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
5096	NC_016944	GCA	2	6	267147	267152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740148
5097	NC_016944	CAT	2	6	267178	267183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
5098	NC_016944	ATG	2	6	267206	267211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740148
5099	NC_016944	AGC	2	6	267256	267261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_016944	CCAAC	2	10	267277	267286	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5101	NC_016944	ATG	2	6	267359	267364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740149
5102	NC_016944	CAA	2	6	267526	267531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740150
5103	NC_016944	GA	3	6	267583	267588	50 %	0 %	50 %	0 %	379740150
5104	NC_016944	AAGC	2	8	267712	267719	50 %	0 %	25 %	25 %	379740150
5105	NC_016944	CTG	2	6	267725	267730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740150
5106	NC_016944	ATG	2	6	267806	267811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740150
5107	NC_016944	AAC	2	6	267860	267865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740150
5108	NC_016944	TTA	2	6	267868	267873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740150
5109	NC_016944	GCA	2	6	267880	267885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740150
5110	NC_016944	ATG	2	6	267961	267966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740150
5111	NC_016944	TTG	2	6	268062	268067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740150
5112	NC_016944	T	7	7	268094	268100	0 %	100 %	0 %	0 %	379740150
5113	NC_016944	ACG	2	6	268115	268120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740150
5114	NC_016944	CTT	2	6	268135	268140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740150
5115	NC_016944	ATT	2	6	268176	268181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740150
5116	NC_016944	A	6	6	268286	268291	100 %	0 %	0 %	0 %	379740150
5117	NC_016944	GC	3	6	268333	268338	0 %	0 %	50 %	50 %	379740150
5118	NC_016944	ATC	2	6	268362	268367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740150
5119	NC_016944	ATTTT	2	10	268401	268410	20 %	80 %	0 %	0 %	379740151
5120	NC_016944	TGT	2	6	268425	268430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740151
5121	NC_016944	ATTG	2	8	268447	268454	25 %	50 %	25 %	0 %	379740151
5122	NC_016944	TG	3	6	268453	268458	0 %	50 %	50 %	0 %	379740151
5123	NC_016944	A	6	6	268558	268563	100 %	0 %	0 %	0 %	379740151
5124	NC_016944	TGGT	2	8	268587	268594	0 %	50 %	50 %	0 %	379740151
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5243	NC_016944	AGT	2	6	274387	274392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5371	NC_016944	CTTA	2	8	280849	280856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5372	NC_016944	ATC	2	6	280929	280934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740163
5373	NC_016944	GGC	2	6	280952	280957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740163
5374	NC_016944	ATCA	2	8	280958	280965	50 %	25 %	0 %	25 %	379740163
5375	NC_016944	GCA	2	6	281025	281030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740163
5376	NC_016944	GAA	2	6	281051	281056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740163
5377	NC_016944	CGG	2	6	281101	281106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740163
5378	NC_016944	GCCGAT	2	12	281156	281167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379740163
5379	NC_016944	CAG	2	6	281226	281231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740163
5380	NC_016944	TCAGC	2	10	281245	281254	20 %	20 %	20 %	40 %	379740163
5381	NC_016944	CCA	2	6	281299	281304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
5382	NC_016944	CCA	2	6	281334	281339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
5383	NC_016944	TCAAA	2	10	281350	281359	60 %	20 %	0 %	20 %	379740163
5384	NC_016944	CAC	2	6	281383	281388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
5385	NC_016944	ACGT	2	8	281399	281406	25 %	25 %	25 %	25 %	379740163
5386	NC_016944	TGC	2	6	281414	281419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740163
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5390	NC_016944	CA	3	6	281636	281641	50 %	0 %	0 %	50 %	379740163
5391	NC_016944	GGCT	2	8	281642	281649	0 %	25 %	50 %	25 %	379740163
5392	NC_016944	TGT	3	9	281695	281703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740163
5393	NC_016944	GC	3	6	281729	281734	0 %	0 %	50 %	50 %	379740163
5394	NC_016944	CTT	2	6	281749	281754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740163
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5396	NC_016944	TGA	2	6	281824	281829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740163
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5398	NC_016944	CTT	2	6	281872	281877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740163
5399	NC_016944	AAG	2	6	281890	281895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740163
5400	NC_016944	AGT	2	6	281911	281916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740163
5401	NC_016944	CGC	2	6	281936	281941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740163
5402	NC_016944	CAC	2	6	282047	282052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
5403	NC_016944	T	6	6	282072	282077	0 %	100 %	0 %	0 %	379740163
5404	NC_016944	GCA	2	6	282078	282083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740163
5405	NC_016944	CCG	2	6	282102	282107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740163
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5407	NC_016944	CAC	3	9	282182	282190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
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5410	NC_016944	CAT	2	6	282299	282304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740163
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5412	NC_016944	CGC	2	6	282397	282402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740163
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5415	NC_016944	CTG	2	6	282530	282535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5416	NC_016944	A	6	6	282575	282580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5417	NC_016944	CCG	2	6	282610	282615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5418	NC_016944	TTA	2	6	282645	282650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5419	NC_016944	AAT	2	6	282685	282690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5420	NC_016944	A	6	6	282695	282700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5421	NC_016944	ACT	2	6	282746	282751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5423	NC_016944	GAG	4	12	282765	282776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5424	NC_016944	GCG	2	6	282810	282815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740164
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5433	NC_016944	TAGAG	2	10	283170	283179	40 %	20 %	40 %	0 %	379740164
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5436	NC_016944	TAG	2	6	283292	283297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5457	NC_016944	TGAG	2	8	284608	284615	25 %	25 %	50 %	0 %	379740165
5458	NC_016944	GCA	2	6	284621	284626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740165
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5465	NC_016944	AAG	2	6	285020	285025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5466	NC_016944	CTT	2	6	285046	285051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5467	NC_016944	GC	3	6	285088	285093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5468	NC_016944	TC	3	6	285101	285106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5469	NC_016944	CTGA	2	8	285116	285123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5470	NC_016944	CTATGT	2	12	285148	285159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5471	NC_016944	GATG	2	8	285257	285264	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5472	NC_016944	T	6	6	285321	285326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5473	NC_016944	CCTC	2	8	285336	285343	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5474	NC_016944	TC	3	6	285402	285407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5475	NC_016944	T	6	6	285422	285427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5476	NC_016944	TGG	2	6	285457	285462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5477	NC_016944	TCA	2	6	285500	285505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5478	NC_016944	T	8	8	285529	285536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5479	NC_016944	T	7	7	285539	285545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5480	NC_016944	TCA	2	6	285666	285671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740166
5481	NC_016944	A	8	8	285677	285684	100 %	0 %	0 %	0 %	379740166
5482	NC_016944	GTG	2	6	285708	285713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740166
5483	NC_016944	ATG	2	6	285723	285728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740166
5484	NC_016944	GCT	2	6	285743	285748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740166
5485	NC_016944	GCTG	2	8	285790	285797	0 %	25 %	50 %	25 %	379740166
5486	NC_016944	TTG	2	6	285805	285810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740166
5487	NC_016944	TAC	2	6	285930	285935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740166
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5491	NC_016944	CTTG	2	8	286073	286080	0 %	50 %	25 %	25 %	379740166
5492	NC_016944	TTGGT	2	10	286111	286120	0 %	60 %	40 %	0 %	379740166
5493	NC_016944	TTGG	2	8	286156	286163	0 %	50 %	50 %	0 %	379740166
5494	NC_016944	GC	3	6	286177	286182	0 %	0 %	50 %	50 %	379740166
5495	NC_016944	TCTG	2	8	286249	286256	0 %	50 %	25 %	25 %	379740166
5496	NC_016944	TTC	2	6	286289	286294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740166
5497	NC_016944	GGC	2	6	286418	286423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740166
5498	NC_016944	GAT	2	6	286532	286537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740166
5499	NC_016944	A	6	6	286623	286628	100 %	0 %	0 %	0 %	379740166
5500	NC_016944	CTG	2	6	286632	286637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740166

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