MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio furnissii NCTC 11218 chromosome 2

Total Repeats: 1129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016628	TCCGC	2	10	93	102	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016628	TGCGT	2	10	4208	4217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016628	GTTGC	2	10	4251	4260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016628	AGACG	2	10	5241	5250	40 %	0 %	40 %	20 %	375132176
5	NC_016628	CAAAG	2	10	6545	6554	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016628	AAACG	2	10	7622	7631	60 %	0 %	20 %	20 %	375132178
7	NC_016628	ACACA	2	10	10830	10839	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016628	GCAGG	2	10	12375	12384	20 %	0 %	60 %	20 %	375132181
9	NC_016628	CCAAT	2	10	13469	13478	40 %	20 %	0 %	40 %	375132182
10	NC_016628	ATCGA	2	10	14573	14582	40 %	20 %	20 %	20 %	375132183
11	NC_016628	GCCAA	2	10	16485	16494	40 %	0 %	20 %	40 %	375132185
12	NC_016628	CAAGC	2	10	17950	17959	40 %	0 %	20 %	40 %	375132185
13	NC_016628	TGATC	2	10	18583	18592	20 %	40 %	20 %	20 %	375132186
14	NC_016628	GTTTG	2	10	21964	21973	0 %	60 %	40 %	0 %	375132191
15	NC_016628	CGTTT	2	10	22135	22144	0 %	60 %	20 %	20 %	375132191
16	NC_016628	GGTTG	2	10	24089	24098	0 %	40 %	60 %	0 %	375132192
17	NC_016628	TTGAT	2	10	24150	24159	20 %	60 %	20 %	0 %	375132192
18	NC_016628	CAAAG	2	10	24927	24936	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016628	CATGC	2	10	25692	25701	20 %	20 %	20 %	40 %	375132193
20	NC_016628	TTCAC	2	10	26675	26684	20 %	40 %	0 %	40 %	375132193
21	NC_016628	ATTCC	2	10	26741	26750	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016628	GAAAA	2	10	32234	32243	80 %	0 %	20 %	0 %	375132197
23	NC_016628	TGTCG	2	10	32652	32661	0 %	40 %	40 %	20 %	375132197
24	NC_016628	TGATA	2	10	32905	32914	40 %	40 %	20 %	0 %	375132197
25	NC_016628	ATGGG	2	10	33487	33496	20 %	20 %	60 %	0 %	375132199
26	NC_016628	TTTTG	2	10	34947	34956	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016628	CTTGG	2	10	35021	35030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016628	ATCGC	2	10	35701	35710	20 %	20 %	20 %	40 %	375132200
29	NC_016628	TCCAG	2	10	35807	35816	20 %	20 %	20 %	40 %	375132200
30	NC_016628	TGAAT	2	10	35819	35828	40 %	40 %	20 %	0 %	375132200
31	NC_016628	TTATG	2	10	39263	39272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016628	GCTTG	2	10	39873	39882	0 %	40 %	40 %	20 %	375132205
33	NC_016628	CAGGG	2	10	41018	41027	20 %	0 %	60 %	20 %	375132205
34	NC_016628	ATTCA	2	10	42266	42275	40 %	40 %	0 %	20 %	375132206
35	NC_016628	GTTCT	2	10	42800	42809	0 %	60 %	20 %	20 %	375132206
36	NC_016628	CAAAC	2	10	42888	42897	60 %	0 %	0 %	40 %	375132206
37	NC_016628	GTTTA	2	10	47180	47189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016628	TGTTC	2	10	47683	47692	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016628	TGCTT	2	10	47857	47866	0 %	60 %	20 %	20 %	375132211
40	NC_016628	AATTG	2	10	47939	47948	40 %	40 %	20 %	0 %	375132211
41	NC_016628	AAGAA	2	10	48107	48116	80 %	0 %	20 %	0 %	375132211
42	NC_016628	ATTTA	2	10	49078	49087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016628	CCTGA	2	10	49590	49599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016628	CGCCT	2	10	50198	50207	0 %	20 %	20 %	60 %	375132214
45	NC_016628	GTACC	2	10	51597	51606	20 %	20 %	20 %	40 %	375132217
46	NC_016628	ATCAA	2	10	53342	53351	60 %	20 %	0 %	20 %	375132220
47	NC_016628	GCGCT	2	10	54754	54763	0 %	20 %	40 %	40 %	375132223
48	NC_016628	TCAAA	2	10	56122	56131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016628	ATTTA	2	10	56617	56626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016628	AGTCT	2	10	57317	57326	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016628	AAGGG	2	10	59041	59050	40 %	0 %	60 %	0 %	375132228
52	NC_016628	GCCGC	2	10	61120	61129	0 %	0 %	40 %	60 %	375132231
53	NC_016628	AAATC	2	10	61467	61476	60 %	20 %	0 %	20 %	375132232
54	NC_016628	ATCGC	2	10	61896	61905	20 %	20 %	20 %	40 %	375132233
55	NC_016628	GGTTT	2	10	62331	62340	0 %	60 %	40 %	0 %	375132233
56	NC_016628	CGCAG	2	10	62952	62961	20 %	0 %	40 %	40 %	375132234
57	NC_016628	TCAAA	2	10	63929	63938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016628	ACTGA	2	10	64309	64318	40 %	20 %	20 %	20 %	375132236
59	NC_016628	CCGCA	2	10	64679	64688	20 %	0 %	20 %	60 %	375132237
60	NC_016628	AATTT	2	10	67450	67459	40 %	60 %	0 %	0 %	375132242
61	NC_016628	GTGTC	2	10	68234	68243	0 %	40 %	40 %	20 %	375132244
62	NC_016628	ATTTC	2	10	71114	71123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016628	GATTG	2	10	71787	71796	20 %	40 %	40 %	0 %	375132250
64	NC_016628	CAAAG	2	10	72714	72723	60 %	0 %	20 %	20 %	375132251
65	NC_016628	CGATT	2	10	72959	72968	20 %	40 %	20 %	20 %	375132252
66	NC_016628	TTCAT	2	10	73500	73509	20 %	60 %	0 %	20 %	375132252
67	NC_016628	CAGCG	2	10	73945	73954	20 %	0 %	40 %	40 %	375132253
68	NC_016628	TGCGT	2	10	77689	77698	0 %	40 %	40 %	20 %	375132258
69	NC_016628	AAGTG	2	10	80234	80243	40 %	20 %	40 %	0 %	375132259
70	NC_016628	GTTAC	2	10	84122	84131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016628	CGGCG	2	10	85977	85986	0 %	0 %	60 %	40 %	375132264
72	NC_016628	AGGTA	2	10	86321	86330	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016628	TGGCT	2	10	89069	89078	0 %	40 %	40 %	20 %	375132267
74	NC_016628	ACAGT	2	10	91001	91010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016628	CATGC	2	10	91533	91542	20 %	20 %	20 %	40 %	375132269
76	NC_016628	TGCGG	2	10	91790	91799	0 %	20 %	60 %	20 %	375132269
77	NC_016628	ATCGC	2	10	92058	92067	20 %	20 %	20 %	40 %	375132270
78	NC_016628	TCAGT	2	10	92631	92640	20 %	40 %	20 %	20 %	375132270
79	NC_016628	TCGAT	2	10	92856	92865	20 %	40 %	20 %	20 %	375132270
80	NC_016628	GCAGG	2	10	94504	94513	20 %	0 %	60 %	20 %	375132271
81	NC_016628	ATGGT	2	10	98303	98312	20 %	40 %	40 %	0 %	375132276
82	NC_016628	GAATG	2	10	98729	98738	40 %	20 %	40 %	0 %	375132277
83	NC_016628	CGGCG	2	10	99865	99874	0 %	0 %	60 %	40 %	375132278
84	NC_016628	CGGCG	2	10	101283	101292	0 %	0 %	60 %	40 %	375132279
85	NC_016628	TGGTT	2	10	101883	101892	0 %	60 %	40 %	0 %	375132280
86	NC_016628	ATGCC	2	10	105040	105049	20 %	20 %	20 %	40 %	375132282
87	NC_016628	TTGGC	2	10	105460	105469	0 %	40 %	40 %	20 %	375132283
88	NC_016628	CACAC	2	10	110332	110341	40 %	0 %	0 %	60 %	375132287
89	NC_016628	GCAAT	2	10	112984	112993	40 %	20 %	20 %	20 %	375132289
90	NC_016628	AATCG	2	10	117107	117116	40 %	20 %	20 %	20 %	375132293
91	NC_016628	TCGTC	2	10	117515	117524	0 %	40 %	20 %	40 %	375132293
92	NC_016628	TGGTG	2	10	117531	117540	0 %	40 %	60 %	0 %	375132293
93	NC_016628	CTTGG	2	10	117980	117989	0 %	40 %	40 %	20 %	375132293
94	NC_016628	GCAGG	2	10	119124	119133	20 %	0 %	60 %	20 %	375132294
95	NC_016628	CCTTG	2	10	119905	119914	0 %	40 %	20 %	40 %	375132295
96	NC_016628	GGCGA	2	10	120020	120029	20 %	0 %	60 %	20 %	375132295
97	NC_016628	ATTCT	2	10	121659	121668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016628	TGCAC	2	10	123259	123268	20 %	20 %	20 %	40 %	375132298
99	NC_016628	GTCAT	2	10	123800	123809	20 %	40 %	20 %	20 %	375132298
100	NC_016628	TGGTT	2	10	126567	126576	0 %	60 %	40 %	0 %	375132300
101	NC_016628	AAAAT	2	10	127354	127363	80 %	20 %	0 %	0 %	375132301
102	NC_016628	CGCAA	2	10	131598	131607	40 %	0 %	20 %	40 %	375132305
103	NC_016628	CGTCA	2	10	132579	132588	20 %	20 %	20 %	40 %	375132306
104	NC_016628	ACCAA	2	10	133288	133297	60 %	0 %	0 %	40 %	375132306
105	NC_016628	GATGC	2	10	133467	133476	20 %	20 %	40 %	20 %	375132306
106	NC_016628	AAAAT	2	10	135224	135233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016628	ACCAA	2	10	138180	138189	60 %	0 %	0 %	40 %	375132309
108	NC_016628	TTGGC	2	10	138889	138898	0 %	40 %	40 %	20 %	375132310
109	NC_016628	TTTGA	2	10	139984	139993	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016628	GGCGT	2	10	140623	140632	0 %	20 %	60 %	20 %	375132311
111	NC_016628	GTGCA	2	10	143554	143563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016628	ATCAC	2	10	143636	143645	40 %	20 %	0 %	40 %	375132312
113	NC_016628	GCAAG	2	10	145490	145499	40 %	0 %	40 %	20 %	375132313
114	NC_016628	TGTGT	2	10	145811	145820	0 %	60 %	40 %	0 %	375132313
115	NC_016628	AACAA	2	10	145953	145962	80 %	0 %	0 %	20 %	375132314
116	NC_016628	TGTGG	2	10	146390	146399	0 %	40 %	60 %	0 %	375132314
117	NC_016628	ATGAC	2	10	147176	147185	40 %	20 %	20 %	20 %	375132315
118	NC_016628	TGAAA	2	10	148520	148529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016628	TTGCG	2	10	149000	149009	0 %	40 %	40 %	20 %	375132317
120	NC_016628	TGATT	2	10	149254	149263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016628	GAAAG	2	10	150588	150597	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016628	TGGAT	2	10	151881	151890	20 %	40 %	40 %	0 %	375132320
123	NC_016628	GCTGA	2	10	153188	153197	20 %	20 %	40 %	20 %	375132321
124	NC_016628	GGTTG	2	10	154798	154807	0 %	40 %	60 %	0 %	375132323
125	NC_016628	TTGAA	2	10	155989	155998	40 %	40 %	20 %	0 %	375132324
126	NC_016628	GTTCG	2	10	168829	168838	0 %	40 %	40 %	20 %	375132338
127	NC_016628	GATGC	2	10	171120	171129	20 %	20 %	40 %	20 %	375132340
128	NC_016628	CAGGT	2	10	176547	176556	20 %	20 %	40 %	20 %	375132346
129	NC_016628	CTTGC	2	10	176615	176624	0 %	40 %	20 %	40 %	375132346
130	NC_016628	GTAAT	2	10	180038	180047	40 %	40 %	20 %	0 %	375132348
131	NC_016628	CCAGT	2	10	183214	183223	20 %	20 %	20 %	40 %	375132350
132	NC_016628	CAGCC	2	10	184212	184221	20 %	0 %	20 %	60 %	375132351
133	NC_016628	GGCGA	2	10	184715	184724	20 %	0 %	60 %	20 %	375132352
134	NC_016628	CGGCA	2	10	185081	185090	20 %	0 %	40 %	40 %	375132352
135	NC_016628	AATTG	2	10	185435	185444	40 %	40 %	20 %	0 %	375132352
136	NC_016628	GAAAA	2	10	187379	187388	80 %	0 %	20 %	0 %	375132354
137	NC_016628	GAACA	2	10	189246	189255	60 %	0 %	20 %	20 %	375132355
138	NC_016628	CTGAG	2	10	191683	191692	20 %	20 %	40 %	20 %	375132357
139	NC_016628	AAATC	2	10	192692	192701	60 %	20 %	0 %	20 %	375132359
140	NC_016628	TACAA	2	10	197386	197395	60 %	20 %	0 %	20 %	375132363
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159	NC_016628	GAAAA	2	10	224622	224631	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016628	CCAGC	2	10	225220	225229	20 %	0 %	20 %	60 %	375132392
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182	NC_016628	ATTTG	2	10	260777	260786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_016628	TTTAT	2	10	357668	357677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_016628	GTTCC	2	10	358572	358581	0 %	40 %	20 %	40 %	375132496
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252	NC_016628	GCACC	2	10	361436	361445	20 %	0 %	20 %	60 %	375132498
253	NC_016628	TCAGC	2	10	363702	363711	20 %	20 %	20 %	40 %	375132499
254	NC_016628	CCGCG	2	10	369921	369930	0 %	0 %	40 %	60 %	375132505
255	NC_016628	TTCCA	2	10	373595	373604	20 %	40 %	0 %	40 %	375132509
256	NC_016628	TCTGA	2	10	373779	373788	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_016628	CATGT	2	10	374669	374678	20 %	40 %	20 %	20 %	375132511
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263	NC_016628	TTCAT	2	10	380912	380921	20 %	60 %	0 %	20 %	375132517
264	NC_016628	GCCCT	2	10	381068	381077	0 %	20 %	20 %	60 %	375132517
265	NC_016628	TTTTG	2	10	381664	381673	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_016628	TAAAG	2	10	381724	381733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_016628	TGCAG	2	10	381825	381834	20 %	20 %	40 %	20 %	375132518
268	NC_016628	TGCGT	2	10	384857	384866	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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280	NC_016628	ACCCT	2	10	402234	402243	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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282	NC_016628	CGCGG	2	10	404806	404815	0 %	0 %	60 %	40 %	375132543
283	NC_016628	CGCAG	2	10	405704	405713	20 %	0 %	40 %	40 %	375132544
284	NC_016628	TTTGG	2	10	406737	406746	0 %	60 %	40 %	0 %	375132544
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292	NC_016628	GTTTT	2	10	416334	416343	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_016628	GCTGC	2	10	546142	546151	0 %	20 %	40 %	40 %	375132670
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388	NC_016628	ACTTT	2	10	552426	552435	20 %	60 %	0 %	20 %	375132674
389	NC_016628	CATTT	2	10	553156	553165	20 %	60 %	0 %	20 %	375132674
390	NC_016628	TATTT	2	10	553177	553186	20 %	80 %	0 %	0 %	375132674
391	NC_016628	TTCGT	2	10	554656	554665	0 %	60 %	20 %	20 %	375132675
392	NC_016628	CAAAA	2	10	555039	555048	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
393	NC_016628	GCCAA	2	10	556267	556276	40 %	0 %	20 %	40 %	375132676
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395	NC_016628	AACCA	2	10	563177	563186	60 %	0 %	0 %	40 %	375132682
396	NC_016628	CACCG	2	10	563247	563256	20 %	0 %	20 %	60 %	375132682
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