MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016446	GATGT	2	10	185445	185454	20 %	40 %	40 %	0 %	360037449
3502	NC_016446	GATTC	2	10	185463	185472	20 %	40 %	20 %	20 %	360037449
3503	NC_016446	CT	3	6	185546	185551	0 %	50 %	0 %	50 %	360037449
3504	NC_016446	ATG	2	6	185571	185576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037449
3505	NC_016446	GGCTTT	2	12	185600	185611	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	360037449
3506	NC_016446	ATG	2	6	185616	185621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037449
3507	NC_016446	GAT	2	6	185636	185641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037449
3508	NC_016446	CGG	2	6	185710	185715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037449
3509	NC_016446	GTT	2	6	185805	185810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016446	GTT	2	6	185852	185857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016446	T	6	6	185862	185867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_016446	A	6	6	185875	185880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016446	CAA	2	6	186046	186051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_016446	AG	3	6	186069	186074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016446	A	7	7	186132	186138	100 %	0 %	0 %	0 %	360037450
3516	NC_016446	GATT	2	8	186160	186167	25 %	50 %	25 %	0 %	360037450
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3518	NC_016446	TAC	2	6	186213	186218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037450
3519	NC_016446	CA	3	6	186235	186240	50 %	0 %	0 %	50 %	360037450
3520	NC_016446	T	6	6	186306	186311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016446	TAT	2	6	186381	186386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016446	ATC	2	6	186411	186416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_016446	ATG	2	6	186444	186449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037451
3524	NC_016446	ACCTT	2	10	186468	186477	20 %	40 %	0 %	40 %	360037451
3525	NC_016446	TGA	2	6	186532	186537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037451
3526	NC_016446	TGA	2	6	186568	186573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037451
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3530	NC_016446	CAT	2	6	186683	186688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037451
3531	NC_016446	CAG	2	6	186692	186697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037451
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3533	NC_016446	TAAA	2	8	186999	187006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016446	TAT	2	6	187017	187022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016446	CTT	2	6	187120	187125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_016446	GCA	2	6	187146	187151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_016446	T	6	6	187155	187160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016446	GAC	2	6	187161	187166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_016446	ATT	2	6	187197	187202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037452
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3542	NC_016446	TGT	2	6	187355	187360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037452
3543	NC_016446	ACCAA	2	10	187401	187410	60 %	0 %	0 %	40 %	360037452
3544	NC_016446	GCC	2	6	187589	187594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037452
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3546	NC_016446	ATCT	2	8	187706	187713	25 %	50 %	0 %	25 %	360037452
3547	NC_016446	TGG	2	6	187726	187731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037452
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3549	NC_016446	TTG	2	6	187820	187825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037452
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3551	NC_016446	TGG	2	6	188008	188013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037452
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3553	NC_016446	CAT	3	9	188191	188199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037452
3554	NC_016446	GTT	2	6	188239	188244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037452
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3556	NC_016446	TCA	2	6	188363	188368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037453
3557	NC_016446	GCT	2	6	188394	188399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037453
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3559	NC_016446	CT	3	6	188519	188524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_016446	ACA	2	6	188549	188554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_016446	AAT	2	6	188556	188561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_016446	T	6	6	188685	188690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016446	GAA	2	6	188699	188704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016446	CAAAC	2	10	188741	188750	60 %	0 %	0 %	40 %	360037454
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3572	NC_016446	CAT	2	6	189089	189094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037454
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3577	NC_016446	CTTG	2	8	189217	189224	0 %	50 %	25 %	25 %	360037454
3578	NC_016446	TACGT	2	10	189299	189308	20 %	40 %	20 %	20 %	360037454
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3599	NC_016446	AAATC	2	10	190578	190587	60 %	20 %	0 %	20 %	360037454
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3603	NC_016446	CAG	2	6	191036	191041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037454
3604	NC_016446	AAG	2	6	191082	191087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037454
3605	NC_016446	GCTT	2	8	191151	191158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_016446	AGTG	2	8	191209	191216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_016446	GAAC	2	8	191324	191331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_016446	TA	3	6	191404	191409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016446	GCT	2	6	191419	191424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037455
3610	NC_016446	AAG	2	6	191481	191486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037455
3611	NC_016446	AC	3	6	191490	191495	50 %	0 %	0 %	50 %	360037455
3612	NC_016446	CAT	2	6	191499	191504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037455
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3622	NC_016446	GCC	2	6	191841	191846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037455
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3871	NC_016446	GTC	2	6	206329	206334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037468
3872	NC_016446	CAA	2	6	206375	206380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037468
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3992	NC_016446	GC	3	6	213558	213563	0 %	0 %	50 %	50 %	360037475
3993	NC_016446	TATTGA	2	12	213623	213634	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	360037475
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3995	NC_016446	ATCC	2	8	213705	213712	25 %	25 %	0 %	50 %	360037475
3996	NC_016446	GCC	2	6	213790	213795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037475
3997	NC_016446	GAA	2	6	213825	213830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037475
3998	NC_016446	GCC	2	6	213900	213905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037475
3999	NC_016446	GA	3	6	214012	214017	50 %	0 %	50 %	0 %	360037475
4000	NC_016446	GTG	2	6	214036	214041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037475

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