MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016446	ATAG	2	8	159383	159390	50 %	25 %	25 %	0 %	360037428
3002	NC_016446	GT	3	6	159426	159431	0 %	50 %	50 %	0 %	360037428
3003	NC_016446	CTG	2	6	159456	159461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037428
3004	NC_016446	AGA	2	6	159532	159537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037428
3005	NC_016446	TCA	2	6	159544	159549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037428
3006	NC_016446	TAA	2	6	159563	159568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037428
3007	NC_016446	GCC	2	6	159573	159578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037428
3008	NC_016446	AGT	2	6	159732	159737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037428
3009	NC_016446	ATA	2	6	159791	159796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037428
3010	NC_016446	CAATT	2	10	159885	159894	40 %	40 %	0 %	20 %	360037428
3011	NC_016446	TGC	2	6	159925	159930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_016446	TAT	2	6	160001	160006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016446	CTTTA	2	10	160016	160025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_016446	GGT	2	6	160058	160063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037429
3015	NC_016446	TTG	2	6	160069	160074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037429
3016	NC_016446	TAA	2	6	160170	160175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037429
3017	NC_016446	TAA	2	6	160219	160224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037429
3018	NC_016446	GCG	2	6	160253	160258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037429
3019	NC_016446	AAT	2	6	160259	160264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037429
3020	NC_016446	C	6	6	160387	160392	0 %	0 %	0 %	100 %	360037429
3021	NC_016446	CAAAG	2	10	160407	160416	60 %	0 %	20 %	20 %	360037429
3022	NC_016446	CAA	2	6	160437	160442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037429
3023	NC_016446	GCC	2	6	160471	160476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037429
3024	NC_016446	AGC	2	6	160532	160537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037429
3025	NC_016446	AGC	2	6	160548	160553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037429
3026	NC_016446	ATAG	2	8	160575	160582	50 %	25 %	25 %	0 %	360037429
3027	NC_016446	AAG	2	6	160678	160683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037429
3028	NC_016446	GAT	2	6	160792	160797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037429
3029	NC_016446	GCA	2	6	160889	160894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037429
3030	NC_016446	CCT	2	6	160898	160903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037429
3031	NC_016446	CAGC	2	8	160914	160921	25 %	0 %	25 %	50 %	360037429
3032	NC_016446	ATC	2	6	160967	160972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037429
3033	NC_016446	GCC	2	6	160984	160989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037429
3034	NC_016446	GCC	2	6	161047	161052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037429
3035	NC_016446	A	6	6	161053	161058	100 %	0 %	0 %	0 %	360037429
3036	NC_016446	CCA	2	6	161077	161082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037429
3037	NC_016446	CCAT	2	8	161099	161106	25 %	25 %	0 %	50 %	360037429
3038	NC_016446	AGC	2	6	161206	161211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037429
3039	NC_016446	AGCC	2	8	161310	161317	25 %	0 %	25 %	50 %	360037429
3040	NC_016446	ACCA	2	8	161323	161330	50 %	0 %	0 %	50 %	360037429
3041	NC_016446	AAAAC	2	10	161340	161349	80 %	0 %	0 %	20 %	360037429
3042	NC_016446	GA	3	6	161372	161377	50 %	0 %	50 %	0 %	360037429
3043	NC_016446	TC	3	6	161430	161435	0 %	50 %	0 %	50 %	360037429
3044	NC_016446	TTG	2	6	161436	161441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037429
3045	NC_016446	TGA	2	6	161461	161466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016446	AT	3	6	161544	161549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_016446	GATT	2	8	161550	161557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016446	A	6	6	161573	161578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016446	A	6	6	161593	161598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016446	GGA	2	6	161672	161677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016446	TGGA	2	8	161699	161706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016446	AT	3	6	161749	161754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016446	GC	3	6	161803	161808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_016446	ATT	2	6	161936	161941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037430
3055	NC_016446	ACC	2	6	161966	161971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037430
3056	NC_016446	CAT	2	6	162061	162066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037430
3057	NC_016446	GAGC	2	8	162067	162074	25 %	0 %	50 %	25 %	360037430
3058	NC_016446	GAT	2	6	162082	162087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037430
3059	NC_016446	AAG	2	6	162090	162095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037430
3060	NC_016446	G	6	6	162100	162105	0 %	0 %	100 %	0 %	360037430
3061	NC_016446	TTG	2	6	162155	162160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037430
3062	NC_016446	ATC	2	6	162182	162187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037430
3063	NC_016446	AGT	2	6	162217	162222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037430
3064	NC_016446	GCA	2	6	162387	162392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037430
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3066	NC_016446	CAT	3	9	162539	162547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037430
3067	NC_016446	TGC	2	6	162553	162558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037430
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3069	NC_016446	TGT	2	6	162678	162683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037430
3070	NC_016446	CTG	2	6	162689	162694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037430
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3072	NC_016446	TGAT	2	8	162825	162832	25 %	50 %	25 %	0 %	360037430
3073	NC_016446	CTTT	2	8	162911	162918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_016446	CTT	2	6	163000	163005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037431
3075	NC_016446	TCA	2	6	163038	163043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037431
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3083	NC_016446	GAGC	2	8	163585	163592	25 %	0 %	50 %	25 %	360037431
3084	NC_016446	CA	3	6	163739	163744	50 %	0 %	0 %	50 %	360037431
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3089	NC_016446	ATG	2	6	163959	163964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016446	CAG	2	6	163978	163983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_016446	GAA	2	6	164049	164054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016446	TA	3	6	164124	164129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016446	CTT	2	6	164163	164168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_016446	TAGT	2	8	164179	164186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016446	CAGC	2	8	164254	164261	25 %	0 %	25 %	50 %	360037432
3096	NC_016446	TTC	2	6	164334	164339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037432
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3100	NC_016446	ATG	2	6	164670	164675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037432
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3103	NC_016446	CTTT	2	8	165055	165062	0 %	75 %	0 %	25 %	360037432
3104	NC_016446	GCC	2	6	165191	165196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037432
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3107	NC_016446	TTGGTT	2	12	165372	165383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037432
3108	NC_016446	GTC	2	6	165417	165422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037432
3109	NC_016446	TGT	2	6	165457	165462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037432
3110	NC_016446	GGT	2	6	165492	165497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037432
3111	NC_016446	GTG	2	6	165522	165527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037432
3112	NC_016446	GCA	3	9	165548	165556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037432
3113	NC_016446	GAT	2	6	165605	165610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037432
3114	NC_016446	GGA	2	6	165620	165625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037432
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3117	NC_016446	TCGC	2	8	165668	165675	0 %	25 %	25 %	50 %	360037432
3118	NC_016446	CGCT	2	8	165690	165697	0 %	25 %	25 %	50 %	360037432
3119	NC_016446	ACA	2	6	165715	165720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037432
3120	NC_016446	GAAA	2	8	165732	165739	75 %	0 %	25 %	0 %	360037432
3121	NC_016446	TGA	2	6	165745	165750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037432
3122	NC_016446	AGT	2	6	165830	165835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037432
3123	NC_016446	TGC	2	6	165885	165890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037432
3124	NC_016446	CT	3	6	165936	165941	0 %	50 %	0 %	50 %	360037432
3125	NC_016446	TCC	2	6	166049	166054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037432
3126	NC_016446	GT	3	6	166075	166080	0 %	50 %	50 %	0 %	360037432
3127	NC_016446	GA	3	6	166084	166089	50 %	0 %	50 %	0 %	360037432
3128	NC_016446	T	7	7	166129	166135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3162	NC_016446	CTGA	2	8	168028	168035	25 %	25 %	25 %	25 %	360037433
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3224	NC_016446	TAAAA	2	10	171715	171724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3225	NC_016446	AC	3	6	171881	171886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3226	NC_016446	ACA	2	6	171904	171909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037436
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3232	NC_016446	T	6	6	172194	172199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_016446	TC	3	6	172221	172226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3234	NC_016446	TTAG	2	8	172268	172275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_016446	TCT	2	6	172365	172370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037437
3236	NC_016446	T	6	6	172397	172402	0 %	100 %	0 %	0 %	360037437
3237	NC_016446	GGC	2	6	172415	172420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037437
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3240	NC_016446	GA	3	6	172572	172577	50 %	0 %	50 %	0 %	360037437
3241	NC_016446	TAC	2	6	172634	172639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037437
3242	NC_016446	GAA	2	6	172643	172648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037437
3243	NC_016446	A	6	6	172655	172660	100 %	0 %	0 %	0 %	360037437
3244	NC_016446	TCA	2	6	172699	172704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037437
3245	NC_016446	ATT	2	6	172743	172748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037437
3246	NC_016446	CCA	2	6	172783	172788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037437
3247	NC_016446	TAA	2	6	172819	172824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037437
3248	NC_016446	AGCG	2	8	172856	172863	25 %	0 %	50 %	25 %	360037437
3249	NC_016446	GCA	2	6	172902	172907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037437
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3251	NC_016446	ATG	2	6	173052	173057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037437
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3287	NC_016446	GATG	2	8	174728	174735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3322	NC_016446	CGCAG	2	10	176742	176751	20 %	0 %	40 %	40 %	360037442
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3328	NC_016446	GCTT	2	8	177102	177109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3329	NC_016446	CAT	2	6	177220	177225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037443
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3353	NC_016446	TGGC	2	8	177870	177877	0 %	25 %	50 %	25 %	360037443
3354	NC_016446	CA	3	6	177959	177964	50 %	0 %	0 %	50 %	360037443
3355	NC_016446	AAAC	2	8	177982	177989	75 %	0 %	0 %	25 %	360037443
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3358	NC_016446	CAAA	2	8	178061	178068	75 %	0 %	0 %	25 %	360037443
3359	NC_016446	TGA	2	6	178116	178121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037443
3360	NC_016446	TGC	2	6	178128	178133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037443
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3362	NC_016446	AG	3	6	178256	178261	50 %	0 %	50 %	0 %	360037443
3363	NC_016446	AAC	2	6	178323	178328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037443
3364	NC_016446	ACC	2	6	178376	178381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037443
3365	NC_016446	T	7	7	178504	178510	0 %	100 %	0 %	0 %	360037443
3366	NC_016446	CAT	2	6	178544	178549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037443
3367	NC_016446	ACA	2	6	178642	178647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3368	NC_016446	TGAA	2	8	178790	178797	50 %	25 %	25 %	0 %	360037444
3369	NC_016446	ATAGG	2	10	178802	178811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3370	NC_016446	GTCA	2	8	178871	178878	25 %	25 %	25 %	25 %	360037445
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3372	NC_016446	A	6	6	178938	178943	100 %	0 %	0 %	0 %	360037445
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3497	NC_016446	GC	3	6	185280	185285	0 %	0 %	50 %	50 %	360037449
3498	NC_016446	TCG	2	6	185330	185335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037449
3499	NC_016446	AGC	2	6	185383	185388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037449
3500	NC_016446	GTG	2	6	185396	185401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037449

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