MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_016446	GCC	2	6	1034285	1034290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038241
19502	NC_016446	CTG	2	6	1034377	1034382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19503	NC_016446	CGC	2	6	1034390	1034395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19504	NC_016446	CAC	2	6	1034537	1034542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038242
19505	NC_016446	TCA	2	6	1034574	1034579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038242
19506	NC_016446	GCTT	2	8	1034680	1034687	0 %	50 %	25 %	25 %	360038242
19507	NC_016446	A	6	6	1034753	1034758	100 %	0 %	0 %	0 %	360038242
19508	NC_016446	GC	3	6	1034850	1034855	0 %	0 %	50 %	50 %	360038242
19509	NC_016446	GCG	2	6	1034868	1034873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038242
19510	NC_016446	TGA	2	6	1034898	1034903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038242
19511	NC_016446	CTC	2	6	1035095	1035100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360038242
19512	NC_016446	TGG	2	6	1035124	1035129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038242
19513	NC_016446	CAT	2	6	1035130	1035135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038242
19514	NC_016446	GGC	2	6	1035145	1035150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038242
19515	NC_016446	GCG	2	6	1035152	1035157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038242
19516	NC_016446	TCC	2	6	1035225	1035230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360038242
19517	NC_016446	TGC	2	6	1035298	1035303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038242
19518	NC_016446	GCC	2	6	1035344	1035349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038243
19519	NC_016446	TTG	2	6	1035355	1035360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038243
19520	NC_016446	GGTTTT	2	12	1035397	1035408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038243
19521	NC_016446	TCT	2	6	1035431	1035436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038243
19522	NC_016446	GCC	2	6	1035445	1035450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038243
19523	NC_016446	AG	3	6	1035478	1035483	50 %	0 %	50 %	0 %	360038243
19524	NC_016446	CCAA	2	8	1035514	1035521	50 %	0 %	0 %	50 %	360038243
19525	NC_016446	GGT	2	6	1035549	1035554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038243
19526	NC_016446	T	6	6	1035658	1035663	0 %	100 %	0 %	0 %	360038243
19527	NC_016446	TG	3	6	1035684	1035689	0 %	50 %	50 %	0 %	360038243
19528	NC_016446	GA	3	6	1035740	1035745	50 %	0 %	50 %	0 %	360038243
19529	NC_016446	GGT	2	6	1035760	1035765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038243
19530	NC_016446	CA	3	6	1035774	1035779	50 %	0 %	0 %	50 %	360038243
19531	NC_016446	TTCC	2	8	1035828	1035835	0 %	50 %	0 %	50 %	360038243
19532	NC_016446	GGTT	2	8	1035915	1035922	0 %	50 %	50 %	0 %	360038243
19533	NC_016446	TTGGT	2	10	1035945	1035954	0 %	60 %	40 %	0 %	360038243
19534	NC_016446	GTT	2	6	1036008	1036013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038244
19535	NC_016446	GC	3	6	1036032	1036037	0 %	0 %	50 %	50 %	360038244
19536	NC_016446	GCA	2	6	1036094	1036099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038244
19537	NC_016446	GGC	2	6	1036143	1036148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038244
19538	NC_016446	GGC	2	6	1036203	1036208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038244
19539	NC_016446	CGA	2	6	1036304	1036309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038244
19540	NC_016446	GCG	2	6	1036373	1036378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038244
19541	NC_016446	TGAG	2	8	1036381	1036388	25 %	25 %	50 %	0 %	360038244
19542	NC_016446	AG	3	6	1036387	1036392	50 %	0 %	50 %	0 %	360038244
19543	NC_016446	GCTGC	2	10	1036437	1036446	0 %	20 %	40 %	40 %	360038244
19544	NC_016446	TTGT	2	8	1036527	1036534	0 %	75 %	25 %	0 %	360038244
19545	NC_016446	GAT	2	6	1036599	1036604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038244
19546	NC_016446	GTA	2	6	1036629	1036634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038244
19547	NC_016446	GC	3	6	1036638	1036643	0 %	0 %	50 %	50 %	360038244
19548	NC_016446	GTG	2	6	1036650	1036655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038244
19549	NC_016446	TGC	2	6	1036684	1036689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038244
19550	NC_016446	TGGA	2	8	1036719	1036726	25 %	25 %	50 %	0 %	360038244
19551	NC_016446	GTA	2	6	1036802	1036807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038245
19552	NC_016446	GAGC	2	8	1036877	1036884	25 %	0 %	50 %	25 %	360038245
19553	NC_016446	CAC	2	6	1036919	1036924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038245
19554	NC_016446	ATGACG	2	12	1037015	1037026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360038245
19555	NC_016446	CGA	2	6	1037035	1037040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038245
19556	NC_016446	T	7	7	1037055	1037061	0 %	100 %	0 %	0 %	360038245
19557	NC_016446	CGC	2	6	1037209	1037214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038245
19558	NC_016446	CCA	2	6	1037284	1037289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360038245
19559	NC_016446	CATCG	2	10	1037330	1037339	20 %	20 %	20 %	40 %	360038245
19560	NC_016446	CGC	2	6	1037347	1037352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038245
19561	NC_016446	CGC	2	6	1037371	1037376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038245
19562	NC_016446	CTCC	2	8	1037484	1037491	0 %	25 %	0 %	75 %	360038246
19563	NC_016446	TTG	2	6	1037512	1037517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038246
19564	NC_016446	TTG	2	6	1037527	1037532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038246
19565	NC_016446	GCG	2	6	1037581	1037586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038246
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19567	NC_016446	GGA	2	6	1037671	1037676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038246
19568	NC_016446	GC	3	6	1037788	1037793	0 %	0 %	50 %	50 %	360038246
19569	NC_016446	GGGCA	2	10	1037797	1037806	20 %	0 %	60 %	20 %	360038246
19570	NC_016446	GCT	2	6	1037838	1037843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038246
19571	NC_016446	GAT	2	6	1037854	1037859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038246
19572	NC_016446	TTGGCT	2	12	1037939	1037950	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	360038246
19573	NC_016446	GTT	2	6	1037965	1037970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038246
19574	NC_016446	CTT	2	6	1038032	1038037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19575	NC_016446	AG	3	6	1038064	1038069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19576	NC_016446	GAG	2	6	1038228	1038233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360038247
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19578	NC_016446	GGT	2	6	1038245	1038250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038247
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19580	NC_016446	TAC	2	6	1038466	1038471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038247
19581	NC_016446	TCT	2	6	1038480	1038485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038247
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19583	NC_016446	TTG	2	6	1038641	1038646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038247
19584	NC_016446	TCA	2	6	1038712	1038717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038247
19585	NC_016446	CCG	2	6	1038729	1038734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038247
19586	NC_016446	CGTTG	2	10	1038758	1038767	0 %	40 %	40 %	20 %	360038247
19587	NC_016446	GAA	2	6	1038770	1038775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360038247
19588	NC_016446	GAT	2	6	1038794	1038799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038247
19589	NC_016446	CTG	2	6	1038835	1038840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038247
19590	NC_016446	GA	3	6	1038889	1038894	50 %	0 %	50 %	0 %	360038247
19591	NC_016446	CGC	2	6	1038905	1038910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038247
19592	NC_016446	GTGG	2	8	1039064	1039071	0 %	25 %	75 %	0 %	360038247
19593	NC_016446	AG	3	6	1039106	1039111	50 %	0 %	50 %	0 %	360038247
19594	NC_016446	ATG	2	6	1039116	1039121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038247
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19597	NC_016446	T	6	6	1039214	1039219	0 %	100 %	0 %	0 %	360038247
19598	NC_016446	TGG	2	6	1039243	1039248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038247
19599	NC_016446	TGG	2	6	1039272	1039277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360038247
19600	NC_016446	CGC	2	6	1039294	1039299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360038247
19601	NC_016446	CTT	2	6	1039306	1039311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360038247
19602	NC_016446	CGGT	2	8	1039312	1039319	0 %	25 %	50 %	25 %	360038247
19603	NC_016446	ATG	2	6	1039326	1039331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038247
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19606	NC_016446	ATG	2	6	1039377	1039382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038247
19607	NC_016446	ATG	2	6	1039446	1039451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038247
19608	NC_016446	ATG	2	6	1039464	1039469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038247
19609	NC_016446	GCG	2	6	1039487	1039492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038247
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19612	NC_016446	CAT	2	6	1039583	1039588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360038247
19613	NC_016446	TTGA	2	8	1039716	1039723	25 %	50 %	25 %	0 %	360038247
19614	NC_016446	ATG	2	6	1039731	1039736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360038247
19615	NC_016446	AGC	2	6	1039755	1039760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360038247
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19617	NC_016446	A	6	6	1039822	1039827	100 %	0 %	0 %	0 %	360038247
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19733	NC_016446	CG	3	6	1045473	1045478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19736	NC_016446	GC	3	6	1045621	1045626	0 %	0 %	50 %	50 %	360038254
19737	NC_016446	TTG	2	6	1045667	1045672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038254
19738	NC_016446	CCAG	2	8	1045690	1045697	25 %	0 %	25 %	50 %	360038254
19739	NC_016446	TTG	2	6	1045751	1045756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360038254
19740	NC_016446	GCT	2	6	1045768	1045773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360038254
19741	NC_016446	GGC	2	6	1045785	1045790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360038254
19742	NC_016446	CAAG	2	8	1045794	1045801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19743	NC_016446	ATG	2	6	1045814	1045819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19744	NC_016446	AGCT	2	8	1045840	1045847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19745	NC_016446	TTGA	2	8	1045893	1045900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19746	NC_016446	CG	3	6	1045911	1045916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19747	NC_016446	TG	3	6	1046017	1046022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19748	NC_016446	TCC	2	6	1046036	1046041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19749	NC_016446	GC	3	6	1046059	1046064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19750	NC_016446	TTG	2	6	1046105	1046110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19751	NC_016446	CCAG	2	8	1046128	1046135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19752	NC_016446	TTG	2	6	1046189	1046194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19753	NC_016446	GCT	2	6	1046206	1046211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19754	NC_016446	CG	3	6	1046217	1046222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19755	NC_016446	CACG	2	8	1046293	1046300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19756	NC_016446	GTG	2	6	1046339	1046344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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