MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1503	NC_016446	GCG	2	6	78749	78754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037327
1504	NC_016446	ATT	2	6	78829	78834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037328
1505	NC_016446	ATC	2	6	78839	78844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037328
1506	NC_016446	GAA	2	6	78887	78892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037328
1507	NC_016446	AAC	2	6	78959	78964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037328
1508	NC_016446	A	6	6	79015	79020	100 %	0 %	0 %	0 %	360037328
1509	NC_016446	GCT	2	6	79051	79056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037328
1510	NC_016446	T	6	6	79075	79080	0 %	100 %	0 %	0 %	360037328
1511	NC_016446	CG	3	6	79105	79110	0 %	0 %	50 %	50 %	360037328
1512	NC_016446	GCT	2	6	79238	79243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037328
1513	NC_016446	AGA	2	6	79291	79296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037328
1514	NC_016446	CAA	2	6	79334	79339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037328
1515	NC_016446	TCA	2	6	79341	79346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037328
1516	NC_016446	TTG	2	6	79574	79579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037328
1517	NC_016446	TTG	2	6	79617	79622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037328
1518	NC_016446	GTGA	2	8	79664	79671	25 %	25 %	50 %	0 %	360037328
1519	NC_016446	TGG	2	6	79684	79689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037328
1520	NC_016446	AACA	2	8	79710	79717	75 %	0 %	0 %	25 %	360037328
1521	NC_016446	TTG	2	6	79845	79850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016446	T	6	6	79863	79868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016446	TGT	2	6	79881	79886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016446	TTA	2	6	79912	79917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016446	GGC	2	6	80045	80050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037330
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1527	NC_016446	A	6	6	80056	80061	100 %	0 %	0 %	0 %	360037330
1528	NC_016446	A	6	6	80078	80083	100 %	0 %	0 %	0 %	360037330
1529	NC_016446	TGA	2	6	80120	80125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037330
1530	NC_016446	TGAA	2	8	80128	80135	50 %	25 %	25 %	0 %	360037330
1531	NC_016446	TAG	3	9	80263	80271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037330
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1534	NC_016446	AGTTTT	2	12	80451	80462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	360037330
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1536	NC_016446	AG	3	6	80477	80482	50 %	0 %	50 %	0 %	360037330
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1539	NC_016446	AGTT	2	8	80588	80595	25 %	50 %	25 %	0 %	360037330
1540	NC_016446	AGA	2	6	80618	80623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037330
1541	NC_016446	ATG	3	9	80698	80706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037330
1542	NC_016446	GAA	3	9	80745	80753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037330
1543	NC_016446	CAA	2	6	80906	80911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037330
1544	NC_016446	AAG	2	6	80914	80919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037330
1545	NC_016446	TTA	2	6	80934	80939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037330
1546	NC_016446	AT	4	8	80975	80982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016446	TGG	2	6	80993	80998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016446	ATT	2	6	81003	81008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016446	TTG	2	6	81085	81090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016446	T	7	7	81105	81111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016446	GCT	2	6	81124	81129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_016446	GTG	2	6	81275	81280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016446	GAAA	2	8	81306	81313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016446	ATT	2	6	81382	81387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016446	ACA	2	6	81391	81396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_016446	TTGC	2	8	81397	81404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_016446	ACAG	2	8	81418	81425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_016446	TGA	2	6	81453	81458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016446	GC	3	6	81463	81468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_016446	ATAA	2	8	81495	81502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016446	TC	3	6	81657	81662	0 %	50 %	0 %	50 %	360037331
1562	NC_016446	TAT	2	6	81708	81713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037331
1563	NC_016446	G	6	6	81733	81738	0 %	0 %	100 %	0 %	360037331
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1565	NC_016446	CTTGAG	2	12	81792	81803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360037331
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1581	NC_016446	ATTA	2	8	83013	83020	50 %	50 %	0 %	0 %	360037332
1582	NC_016446	ACT	2	6	83049	83054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037332
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1585	NC_016446	T	7	7	83162	83168	0 %	100 %	0 %	0 %	360037333
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1597	NC_016446	GTT	2	6	83751	83756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016446	GGCG	2	8	83795	83802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_016446	GATA	2	8	83839	83846	50 %	25 %	25 %	0 %	360037335
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1602	NC_016446	TA	3	6	83944	83949	50 %	50 %	0 %	0 %	360037335
1603	NC_016446	AAT	2	6	84005	84010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037335
1604	NC_016446	GTG	2	6	84014	84019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037335
1605	NC_016446	GTG	2	6	84051	84056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037335
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1607	NC_016446	ATA	2	6	84105	84110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037335
1608	NC_016446	TTA	2	6	84126	84131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037335
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1611	NC_016446	AT	3	6	84375	84380	50 %	50 %	0 %	0 %	360037335
1612	NC_016446	TTCT	2	8	84387	84394	0 %	75 %	0 %	25 %	360037335
1613	NC_016446	GAA	2	6	84398	84403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037335
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1615	NC_016446	ATG	3	9	84513	84521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037335
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1621	NC_016446	TAA	2	6	84724	84729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037335
1622	NC_016446	TGA	2	6	84769	84774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037335
1623	NC_016446	ATA	2	6	84789	84794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037335
1624	NC_016446	AAG	2	6	84801	84806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037335
1625	NC_016446	GGTTGT	2	12	84994	85005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016446	A	6	6	85092	85097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016446	TGT	2	6	85118	85123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016446	TG	3	6	85130	85135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1996	NC_016446	ACTTC	2	10	105365	105374	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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