MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016446	A	6	6	52318	52323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016446	AAC	2	6	52352	52357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016446	GGT	2	6	52408	52413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016446	GTT	2	6	52418	52423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016446	GGCG	2	8	52462	52469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_016446	AGA	2	6	52509	52514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037278
1007	NC_016446	GTT	2	6	52604	52609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037278
1008	NC_016446	TTG	2	6	52676	52681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037278
1009	NC_016446	CTG	2	6	52686	52691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037278
1010	NC_016446	GAT	2	6	52756	52761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037278
1011	NC_016446	A	6	6	52826	52831	100 %	0 %	0 %	0 %	360037278
1012	NC_016446	A	7	7	52885	52891	100 %	0 %	0 %	0 %	360037278
1013	NC_016446	CAA	2	6	52899	52904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037278
1014	NC_016446	CAAA	2	8	52913	52920	75 %	0 %	0 %	25 %	360037278
1015	NC_016446	GGT	2	6	53001	53006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016446	GTT	2	6	53011	53016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016446	GGCG	2	8	53055	53062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_016446	GC	3	6	53110	53115	0 %	0 %	50 %	50 %	360037279
1019	NC_016446	TAGTTG	2	12	53116	53127	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360037279
1020	NC_016446	CGC	2	6	53238	53243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037279
1021	NC_016446	ATG	2	6	53276	53281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037279
1022	NC_016446	TCTT	2	8	53315	53322	0 %	75 %	0 %	25 %	360037279
1023	NC_016446	TG	3	6	53327	53332	0 %	50 %	50 %	0 %	360037279
1024	NC_016446	CCA	2	6	53490	53495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037280
1025	NC_016446	TAA	2	6	53500	53505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037280
1026	NC_016446	TCGTG	2	10	53581	53590	0 %	40 %	40 %	20 %	360037280
1027	NC_016446	TGCA	2	8	53638	53645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_016446	CG	3	6	53709	53714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_016446	A	6	6	53924	53929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016446	TGT	2	6	53950	53955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016446	TTG	2	6	53977	53982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016446	TTAC	2	8	54013	54020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_016446	TCTG	2	8	54078	54085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_016446	GTG	2	6	54135	54140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016446	TTGAT	2	10	54280	54289	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016446	GTT	2	6	54386	54391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016446	GGCG	2	8	54430	54437	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_016446	CAG	2	6	54459	54464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016446	TTCA	2	8	54491	54498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_016446	GTG	2	6	54605	54610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016446	AAT	2	6	54728	54733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037281
1042	NC_016446	GGT	2	6	54845	54850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037281
1043	NC_016446	GTT	2	6	54855	54860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037281
1044	NC_016446	GGCG	2	8	54898	54905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_016446	TGA	2	6	54935	54940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037282
1046	NC_016446	CAA	3	9	54986	54994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037282
1047	NC_016446	AGA	2	6	55073	55078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037282
1048	NC_016446	TCA	2	6	55086	55091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037282
1049	NC_016446	TTA	2	6	55154	55159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037282
1050	NC_016446	TCTG	2	8	55170	55177	0 %	50 %	25 %	25 %	360037282
1051	NC_016446	CAT	2	6	55259	55264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037282
1052	NC_016446	GGT	2	6	55379	55384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016446	GGCG	2	8	55433	55440	0 %	0 %	75 %	25 %	360037283
1054	NC_016446	TCA	2	6	55449	55454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037283
1055	NC_016446	TAG	2	6	55655	55660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037284
1056	NC_016446	TAG	2	6	55730	55735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037284
1057	NC_016446	CA	3	6	55774	55779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_016446	GGC	2	6	55849	55854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_016446	CT	3	6	55903	55908	0 %	50 %	0 %	50 %	360037285
1060	NC_016446	T	8	8	55954	55961	0 %	100 %	0 %	0 %	360037285
1061	NC_016446	GAA	2	6	56012	56017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037285
1062	NC_016446	TGA	2	6	56035	56040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037285
1063	NC_016446	AG	3	6	56073	56078	50 %	0 %	50 %	0 %	360037285
1064	NC_016446	T	6	6	56103	56108	0 %	100 %	0 %	0 %	360037285
1065	NC_016446	AGT	2	6	56109	56114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037285
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1067	NC_016446	AGAT	2	8	56156	56163	50 %	25 %	25 %	0 %	360037285
1068	NC_016446	TGT	2	6	56165	56170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037285
1069	NC_016446	GGT	2	6	56305	56310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037286
1070	NC_016446	TGT	2	6	56317	56322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037286
1071	NC_016446	GGCG	2	8	56359	56366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_016446	AGT	2	6	56389	56394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016446	TGT	2	6	56517	56522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016446	TTG	2	6	56544	56549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016446	TTAC	2	8	56580	56587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_016446	GCT	2	6	56625	56630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_016446	TCTG	2	8	56645	56652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_016446	GTG	2	6	56702	56707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016446	GGT	2	6	56943	56948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016446	GTT	2	6	56953	56958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016446	GGCG	2	8	56997	57004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_016446	CTT	2	6	57009	57014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016446	CAA	2	6	57139	57144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_016446	CAA	2	6	57164	57169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016446	GTT	2	6	57186	57191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016446	TCG	2	6	57233	57238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_016446	T	6	6	57251	57256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016446	GT	3	6	57338	57343	0 %	50 %	50 %	0 %	360037287
1089	NC_016446	GGT	2	6	57480	57485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016446	GTT	2	6	57490	57495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016446	AGTTT	2	10	57503	57512	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016446	GGCG	2	8	57533	57540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_016446	TGG	2	6	57671	57676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037288
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1096	NC_016446	TTG	2	6	57760	57765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037288
1097	NC_016446	T	7	7	57793	57799	0 %	100 %	0 %	0 %	360037288
1098	NC_016446	GCA	2	6	57807	57812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037288
1099	NC_016446	TTG	2	6	57826	57831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037288
1100	NC_016446	GAA	2	6	57866	57871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037288
1101	NC_016446	CAG	2	6	57951	57956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037288
1102	NC_016446	CAT	2	6	57969	57974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037288
1103	NC_016446	AGT	2	6	58019	58024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037288
1104	NC_016446	ATT	2	6	58032	58037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037288
1105	NC_016446	GGT	2	6	58099	58104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016446	GTT	2	6	58109	58114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016446	AT	3	6	58167	58172	50 %	50 %	0 %	0 %	360037289
1108	NC_016446	T	6	6	58213	58218	0 %	100 %	0 %	0 %	360037289
1109	NC_016446	CTGT	2	8	58297	58304	0 %	50 %	25 %	25 %	360037289
1110	NC_016446	TGA	2	6	58356	58361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037289
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1112	NC_016446	GAT	2	6	58459	58464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037289
1113	NC_016446	A	6	6	58480	58485	100 %	0 %	0 %	0 %	360037289
1114	NC_016446	CTA	2	6	58503	58508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037289
1115	NC_016446	CAA	2	6	58574	58579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037289
1116	NC_016446	ACT	2	6	58625	58630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037289
1117	NC_016446	GAA	2	6	58644	58649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037289
1118	NC_016446	CAAG	2	8	58689	58696	50 %	0 %	25 %	25 %	360037289
1119	NC_016446	GATT	2	8	58719	58726	25 %	50 %	25 %	0 %	360037289
1120	NC_016446	TTC	2	6	58737	58742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037289
1121	NC_016446	ATT	2	6	58752	58757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037289
1122	NC_016446	GGA	2	6	58825	58830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037289
1123	NC_016446	CG	3	6	58870	58875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_016446	GTA	2	6	58928	58933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016446	TCA	2	6	58966	58971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_016446	ATTTGA	2	12	59026	59037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	360037290
1127	NC_016446	TGA	2	6	59143	59148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037290
1128	NC_016446	TACC	2	8	59203	59210	25 %	25 %	0 %	50 %	360037290
1129	NC_016446	ATC	2	6	59228	59233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037290
1130	NC_016446	GAC	2	6	59307	59312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037291
1131	NC_016446	GAT	2	6	59313	59318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037291
1132	NC_016446	TCAA	2	8	59447	59454	50 %	25 %	0 %	25 %	360037291
1133	NC_016446	TGGC	2	8	59466	59473	0 %	25 %	50 %	25 %	360037291
1134	NC_016446	AG	3	6	59483	59488	50 %	0 %	50 %	0 %	360037291
1135	NC_016446	TCA	2	6	59495	59500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037291
1136	NC_016446	GTTT	2	8	59571	59578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016446	TGA	2	6	59582	59587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016446	GTT	2	6	59616	59621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037292
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1140	NC_016446	GTT	3	9	59735	59743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037292
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1152	NC_016446	TGA	2	6	60199	60204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037292
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1158	NC_016446	CG	3	6	60438	60443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1159	NC_016446	GTA	2	6	60496	60501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_016446	ATC	2	6	60546	60551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1161	NC_016446	TGT	2	6	60699	60704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037293
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1164	NC_016446	A	6	6	60904	60909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_016446	CG	3	6	60966	60971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1166	NC_016446	GGT	2	6	60996	61001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1167	NC_016446	GGT	2	6	61005	61010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_016446	GTTTGG	2	12	61015	61026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1170	NC_016446	GGA	2	6	61081	61086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_016446	CA	3	6	65346	65351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1243	NC_016446	GGC	2	6	65421	65426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1246	NC_016446	TAA	2	6	65590	65595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_016446	A	6	6	65614	65619	100 %	0 %	0 %	0 %	360037303
1248	NC_016446	A	6	6	65715	65720	100 %	0 %	0 %	0 %	360037303
1249	NC_016446	ACA	2	6	65796	65801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037303
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1251	NC_016446	T	7	7	65852	65858	0 %	100 %	0 %	0 %	360037303
1252	NC_016446	GTT	2	6	65968	65973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037303
1253	NC_016446	ACTGA	2	10	66012	66021	40 %	20 %	20 %	20 %	360037303
1254	NC_016446	CG	3	6	66114	66119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1255	NC_016446	GGT	2	6	66144	66149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_016446	GTT	2	6	66154	66159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_016446	GTT	2	6	66173	66178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_016446	GGCG	2	8	66198	66205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1259	NC_016446	AAC	2	6	66222	66227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_016446	TGGTAA	2	12	66236	66247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037304
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1262	NC_016446	AGTG	2	8	66282	66289	25 %	25 %	50 %	0 %	360037304
1263	NC_016446	TTA	2	6	66351	66356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037304
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1267	NC_016446	GA	3	6	66710	66715	50 %	0 %	50 %	0 %	360037304
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1283	NC_016446	AGT	2	6	67703	67708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1298	NC_016446	GTT	2	6	68234	68239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1337	NC_016446	CAA	2	6	70180	70185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1338	NC_016446	GAG	2	6	70237	70242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1341	NC_016446	GTT	2	6	70408	70413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1343	NC_016446	ATC	2	6	70478	70483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1360	NC_016446	GGT	2	6	71550	71555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1371	NC_016446	AACA	2	8	72267	72274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1372	NC_016446	CCT	2	6	72452	72457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037314
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1386	NC_016446	GCG	2	6	73167	73172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1387	NC_016446	ATTGC	2	10	73181	73190	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1388	NC_016446	AAT	2	6	73303	73308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037315
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1391	NC_016446	AGAGT	2	10	73416	73425	40 %	20 %	40 %	0 %	360037315
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1393	NC_016446	TGT	2	6	73549	73554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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