MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016446	TTC	2	6	26411	26416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016446	TTA	2	6	26440	26445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016446	AAGG	2	8	26449	26456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016446	CCTT	2	8	26461	26468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_016446	ATG	2	6	26541	26546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016446	T	6	6	26600	26605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016446	CGC	2	6	26616	26621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_016446	TATT	2	8	26622	26629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016446	GAAT	2	8	26633	26640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016446	T	6	6	26652	26657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016446	CA	3	6	26658	26663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_016446	A	6	6	26766	26771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016446	CTAT	2	8	26797	26804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_016446	AGTT	2	8	27105	27112	25 %	50 %	25 %	0 %	360037241
515	NC_016446	AAT	2	6	27163	27168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037241
516	NC_016446	ATT	2	6	27189	27194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037241
517	NC_016446	ACA	2	6	27216	27221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037241
518	NC_016446	AAC	2	6	27294	27299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037241
519	NC_016446	TGA	2	6	27372	27377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037241
520	NC_016446	CAAG	2	8	27385	27392	50 %	0 %	25 %	25 %	360037241
521	NC_016446	TTG	2	6	27419	27424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037241
522	NC_016446	A	6	6	27449	27454	100 %	0 %	0 %	0 %	360037241
523	NC_016446	GCC	2	6	27489	27494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037241
524	NC_016446	TGA	2	6	27532	27537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037241
525	NC_016446	GGCT	2	8	27612	27619	0 %	25 %	50 %	25 %	360037241
526	NC_016446	A	6	6	27620	27625	100 %	0 %	0 %	0 %	360037241
527	NC_016446	AAG	2	6	27686	27691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037241
528	NC_016446	A	6	6	27732	27737	100 %	0 %	0 %	0 %	360037241
529	NC_016446	ATG	2	6	27776	27781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037241
530	NC_016446	C	6	6	27784	27789	0 %	0 %	0 %	100 %	360037241
531	NC_016446	GCA	2	6	27843	27848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037241
532	NC_016446	GAA	2	6	27866	27871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037241
533	NC_016446	GAA	2	6	27906	27911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037241
534	NC_016446	ATT	2	6	28002	28007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037241
535	NC_016446	TCA	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037242
536	NC_016446	GCC	3	9	28230	28238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037242
537	NC_016446	GCA	2	6	28276	28281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037242
538	NC_016446	CAT	2	6	28390	28395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037242
539	NC_016446	AGC	2	6	28416	28421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037242
540	NC_016446	GT	3	6	28437	28442	0 %	50 %	50 %	0 %	360037242
541	NC_016446	ATCA	2	8	28451	28458	50 %	25 %	0 %	25 %	360037242
542	NC_016446	AGCG	2	8	28466	28473	25 %	0 %	50 %	25 %	360037242
543	NC_016446	TGA	2	6	28482	28487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037242
544	NC_016446	CGA	2	6	28509	28514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037242
545	NC_016446	ACCA	2	8	28547	28554	50 %	0 %	0 %	50 %	360037242
546	NC_016446	CTCA	2	8	28643	28650	25 %	25 %	0 %	50 %	360037242
547	NC_016446	ACT	2	6	28661	28666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037242
548	NC_016446	TGA	2	6	28714	28719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037242
549	NC_016446	CA	3	6	28755	28760	50 %	0 %	0 %	50 %	360037242
550	NC_016446	CGA	2	6	28765	28770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037242
551	NC_016446	CCAT	2	8	28860	28867	25 %	25 %	0 %	50 %	360037242
552	NC_016446	CAT	2	6	28918	28923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037242
553	NC_016446	TGA	2	6	28965	28970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037242
554	NC_016446	ACG	2	6	29035	29040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037242
555	NC_016446	CAC	2	6	29185	29190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_016446	ATA	2	6	29319	29324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016446	TAA	2	6	29367	29372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037243
558	NC_016446	AGA	2	6	29388	29393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037243
559	NC_016446	CAT	2	6	29536	29541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037243
560	NC_016446	TGG	2	6	29682	29687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037243
561	NC_016446	GGT	2	6	29713	29718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037243
562	NC_016446	A	6	6	29751	29756	100 %	0 %	0 %	0 %	360037243
563	NC_016446	TTA	2	6	29836	29841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037243
564	NC_016446	AGTT	2	8	30018	30025	25 %	50 %	25 %	0 %	360037243
565	NC_016446	GATG	2	8	30034	30041	25 %	25 %	50 %	0 %	360037243
566	NC_016446	GTAC	2	8	30081	30088	25 %	25 %	25 %	25 %	360037243
567	NC_016446	TCT	2	6	30140	30145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037243
568	NC_016446	ACAAG	2	10	30156	30165	60 %	0 %	20 %	20 %	360037243
569	NC_016446	ATT	2	6	30234	30239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037243
570	NC_016446	CCT	2	6	30287	30292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037243
571	NC_016446	TTG	2	6	30311	30316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037243
572	NC_016446	ACCAGA	20	120	30348	30467	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	360037243
573	NC_016446	AG	3	6	30533	30538	50 %	0 %	50 %	0 %	360037243
574	NC_016446	GAA	2	6	30546	30551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037243
575	NC_016446	AGT	2	6	30885	30890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016446	CTAG	2	8	30996	31003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_016446	T	6	6	31067	31072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016446	ATG	2	6	31155	31160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037244
579	NC_016446	CAA	2	6	31170	31175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037244
580	NC_016446	GGT	2	6	31340	31345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037244
581	NC_016446	TGG	2	6	31357	31362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037244
582	NC_016446	TCA	2	6	31379	31384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037244
583	NC_016446	TGA	2	6	31513	31518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037244
584	NC_016446	TGA	2	6	31533	31538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037244
585	NC_016446	A	6	6	31589	31594	100 %	0 %	0 %	0 %	360037244
586	NC_016446	CAAA	2	8	31608	31615	75 %	0 %	0 %	25 %	360037244
587	NC_016446	A	6	6	31618	31623	100 %	0 %	0 %	0 %	360037244
588	NC_016446	TGAC	2	8	31646	31653	25 %	25 %	25 %	25 %	360037245
589	NC_016446	ATC	2	6	31659	31664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037245
590	NC_016446	TTTC	2	8	31699	31706	0 %	75 %	0 %	25 %	360037245
591	NC_016446	T	6	6	31719	31724	0 %	100 %	0 %	0 %	360037245
592	NC_016446	GTA	2	6	31732	31737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037245
593	NC_016446	TAAAAA	2	12	31793	31804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	360037245
594	NC_016446	TAT	2	6	31879	31884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037245
595	NC_016446	AAG	2	6	32006	32011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037245
596	NC_016446	AGG	2	6	32030	32035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037245
597	NC_016446	TAA	2	6	32112	32117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037245
598	NC_016446	CCT	2	6	32215	32220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037245
599	NC_016446	GTT	2	6	32221	32226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037245
600	NC_016446	CAA	2	6	32292	32297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037245
601	NC_016446	A	7	7	32321	32327	100 %	0 %	0 %	0 %	360037246
602	NC_016446	ATT	2	6	32429	32434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037246
603	NC_016446	CTAT	2	8	32499	32506	25 %	50 %	0 %	25 %	360037246
604	NC_016446	ATA	2	6	32535	32540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037246
605	NC_016446	AC	3	6	32574	32579	50 %	0 %	0 %	50 %	360037246
606	NC_016446	GCTA	2	8	32606	32613	25 %	25 %	25 %	25 %	360037246
607	NC_016446	GAA	2	6	32621	32626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037246
608	NC_016446	AAG	2	6	32679	32684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016446	ATTG	2	8	32748	32755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016446	T	6	6	32886	32891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016446	CA	3	6	32892	32897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_016446	ATA	2	6	32930	32935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016446	TAT	2	6	32942	32947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037247
614	NC_016446	ATC	2	6	33111	33116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037247
615	NC_016446	CTTG	2	8	33170	33177	0 %	50 %	25 %	25 %	360037247
616	NC_016446	AGC	2	6	33190	33195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037247
617	NC_016446	TAC	2	6	33246	33251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037247
618	NC_016446	TC	5	10	33270	33279	0 %	50 %	0 %	50 %	360037247
619	NC_016446	AAG	2	6	33280	33285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037247
620	NC_016446	AAAG	2	8	33347	33354	75 %	0 %	25 %	0 %	360037247
621	NC_016446	GC	3	6	33369	33374	0 %	0 %	50 %	50 %	360037247
622	NC_016446	TGA	2	6	33419	33424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037247
623	NC_016446	TGA	2	6	33437	33442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037247
624	NC_016446	GAA	2	6	33465	33470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037247
625	NC_016446	TGC	2	6	33580	33585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037247
626	NC_016446	GAA	2	6	33648	33653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037247
627	NC_016446	GCA	2	6	33707	33712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037247
628	NC_016446	CAC	2	6	33738	33743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037247
629	NC_016446	TGGT	2	8	33746	33753	0 %	50 %	50 %	0 %	360037247
630	NC_016446	AAG	2	6	33811	33816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037247
631	NC_016446	TGA	2	6	33829	33834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037247
632	NC_016446	CAC	2	6	33893	33898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037247
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635	NC_016446	TCT	2	6	34096	34101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037247
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637	NC_016446	GTG	2	6	34188	34193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037247
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639	NC_016446	TGA	2	6	34462	34467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037247
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643	NC_016446	TGT	3	9	34565	34573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037247
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651	NC_016446	CAG	2	6	35014	35019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_016446	CCA	2	6	35064	35069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037248
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657	NC_016446	GAT	2	6	35387	35392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037248
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669	NC_016446	GA	3	6	35750	35755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
670	NC_016446	GTG	2	6	35776	35781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037250
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695	NC_016446	GTTG	2	8	37201	37208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
696	NC_016446	GTT	2	6	37296	37301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
697	NC_016446	GTA	2	6	37305	37310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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701	NC_016446	ATT	2	6	37460	37465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
702	NC_016446	TC	3	6	37483	37488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
703	NC_016446	CAA	2	6	37511	37516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
704	NC_016446	ATTT	2	8	37581	37588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
705	NC_016446	TAT	2	6	37614	37619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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721	NC_016446	GTT	2	6	38762	38767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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730	NC_016446	GGT	2	6	39263	39268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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