MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016446	CTT	2	6	321834	321839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037581
6002	NC_016446	GCA	2	6	321856	321861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037581
6003	NC_016446	CTG	2	6	321880	321885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037581
6004	NC_016446	CAA	2	6	322021	322026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_016446	ACGC	2	8	322057	322064	25 %	0 %	25 %	50 %	360037582
6006	NC_016446	GAT	2	6	322090	322095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037582
6007	NC_016446	TGG	2	6	322128	322133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037582
6008	NC_016446	TG	3	6	322158	322163	0 %	50 %	50 %	0 %	360037582
6009	NC_016446	CCT	2	6	322206	322211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037582
6010	NC_016446	AAC	2	6	322262	322267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037582
6011	NC_016446	CG	3	6	322271	322276	0 %	0 %	50 %	50 %	360037582
6012	NC_016446	CGG	2	6	322288	322293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037582
6013	NC_016446	CAT	2	6	322366	322371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037582
6014	NC_016446	ACT	2	6	322407	322412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037582
6015	NC_016446	TC	3	6	322647	322652	0 %	50 %	0 %	50 %	360037582
6016	NC_016446	ACT	2	6	322731	322736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037582
6017	NC_016446	CAC	2	6	322758	322763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037582
6018	NC_016446	ATT	2	6	322817	322822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037582
6019	NC_016446	TTG	2	6	322857	322862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037582
6020	NC_016446	AAG	2	6	322878	322883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037582
6021	NC_016446	AAG	2	6	322887	322892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037582
6022	NC_016446	TGA	2	6	323017	323022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037582
6023	NC_016446	TAAC	2	8	323068	323075	50 %	25 %	0 %	25 %	360037582
6024	NC_016446	AAT	2	6	323167	323172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_016446	CATG	2	8	323183	323190	25 %	25 %	25 %	25 %	360037583
6026	NC_016446	CCA	2	6	323219	323224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037583
6027	NC_016446	T	6	6	323245	323250	0 %	100 %	0 %	0 %	360037583
6028	NC_016446	CTGG	2	8	323252	323259	0 %	25 %	50 %	25 %	360037583
6029	NC_016446	TTC	2	6	323281	323286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037583
6030	NC_016446	GCC	2	6	323343	323348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037583
6031	NC_016446	CAT	2	6	323540	323545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037583
6032	NC_016446	TAT	2	6	323567	323572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037583
6033	NC_016446	CAT	2	6	323639	323644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037583
6034	NC_016446	CTG	2	6	323646	323651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037583
6035	NC_016446	CTT	2	6	323822	323827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037583
6036	NC_016446	GGTTT	2	10	323992	324001	0 %	60 %	40 %	0 %	360037583
6037	NC_016446	GAA	2	6	324120	324125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037583
6038	NC_016446	CTT	2	6	324161	324166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037583
6039	NC_016446	GGC	2	6	324264	324269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037583
6040	NC_016446	CTCGG	2	10	324345	324354	0 %	20 %	40 %	40 %	360037583
6041	NC_016446	CTG	3	9	324357	324365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037583
6042	NC_016446	GAT	2	6	324509	324514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037583
6043	NC_016446	GCA	2	6	324535	324540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037583
6044	NC_016446	TCT	2	6	324541	324546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037583
6045	NC_016446	TCA	2	6	324649	324654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037583
6046	NC_016446	CCA	2	6	324655	324660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037583
6047	NC_016446	GGC	2	6	324677	324682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037583
6048	NC_016446	ATTG	2	8	324707	324714	25 %	50 %	25 %	0 %	360037583
6049	NC_016446	TGG	2	6	324721	324726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037583
6050	NC_016446	CAG	2	6	324732	324737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037583
6051	NC_016446	A	6	6	324747	324752	100 %	0 %	0 %	0 %	360037583
6052	NC_016446	CCA	2	6	324766	324771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037583
6053	NC_016446	ATTT	2	8	324840	324847	25 %	75 %	0 %	0 %	360037583
6054	NC_016446	GCA	2	6	324858	324863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037583
6055	NC_016446	ATT	2	6	325002	325007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037583
6056	NC_016446	CTG	2	6	325014	325019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037583
6057	NC_016446	TTCT	2	8	325030	325037	0 %	75 %	0 %	25 %	360037583
6058	NC_016446	ATC	2	6	325083	325088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037583
6059	NC_016446	AGA	2	6	325142	325147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037583
6060	NC_016446	CAT	2	6	325205	325210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037583
6061	NC_016446	TGT	2	6	325213	325218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037583
6062	NC_016446	CCA	2	6	325261	325266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037583
6063	NC_016446	TGT	2	6	325309	325314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037584
6064	NC_016446	A	6	6	325379	325384	100 %	0 %	0 %	0 %	360037584
6065	NC_016446	GTTAC	2	10	325394	325403	20 %	40 %	20 %	20 %	360037584
6066	NC_016446	TGG	2	6	325443	325448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037584
6067	NC_016446	TCCA	2	8	325511	325518	25 %	25 %	0 %	50 %	360037584
6068	NC_016446	GAA	2	6	325622	325627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037584
6069	NC_016446	TGA	2	6	325642	325647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037584
6070	NC_016446	TTG	2	6	325659	325664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037584
6071	NC_016446	CAG	2	6	325712	325717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037584
6072	NC_016446	TGA	2	6	325771	325776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037584
6073	NC_016446	GCA	2	6	325809	325814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037584
6074	NC_016446	GCA	2	6	325837	325842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037584
6075	NC_016446	TGA	2	6	325917	325922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037584
6076	NC_016446	CAT	2	6	325933	325938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037584
6077	NC_016446	GCA	2	6	326038	326043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037584
6078	NC_016446	AAGCC	2	10	326164	326173	40 %	0 %	20 %	40 %	360037584
6079	NC_016446	CTG	2	6	326243	326248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037584
6080	NC_016446	TGC	2	6	326328	326333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037584
6081	NC_016446	ATA	2	6	326350	326355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016446	CTT	2	6	326438	326443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037585
6083	NC_016446	ACA	2	6	326486	326491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037585
6084	NC_016446	TGC	2	6	326531	326536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037585
6085	NC_016446	CATT	2	8	326557	326564	25 %	50 %	0 %	25 %	360037585
6086	NC_016446	CACC	2	8	326571	326578	25 %	0 %	0 %	75 %	360037585
6087	NC_016446	CCG	2	6	326618	326623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037585
6088	NC_016446	ATC	2	6	326625	326630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037585
6089	NC_016446	C	7	7	326727	326733	0 %	0 %	0 %	100 %	360037585
6090	NC_016446	TGG	2	6	326786	326791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037585
6091	NC_016446	AATC	2	8	326825	326832	50 %	25 %	0 %	25 %	360037585
6092	NC_016446	ACC	2	6	326838	326843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037585
6093	NC_016446	AAG	2	6	326899	326904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037585
6094	NC_016446	AGA	2	6	326950	326955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037585
6095	NC_016446	GTA	2	6	326997	327002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037585
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6098	NC_016446	CCAT	2	8	327058	327065	25 %	25 %	0 %	50 %	360037585
6099	NC_016446	ATT	2	6	327078	327083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037585
6100	NC_016446	AAT	2	6	327102	327107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037585
6101	NC_016446	GA	3	6	327143	327148	50 %	0 %	50 %	0 %	360037585
6102	NC_016446	GGT	2	6	327159	327164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037585
6103	NC_016446	T	6	6	327189	327194	0 %	100 %	0 %	0 %	360037585
6104	NC_016446	GTA	2	6	327210	327215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037585
6105	NC_016446	CCA	2	6	327241	327246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037585
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6107	NC_016446	GCT	2	6	327358	327363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037585
6108	NC_016446	GTA	2	6	327453	327458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037585
6109	NC_016446	TTG	2	6	327460	327465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037585
6110	NC_016446	TCAG	2	8	327508	327515	25 %	25 %	25 %	25 %	360037585
6111	NC_016446	ATT	2	6	327603	327608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037585
6112	NC_016446	GCA	2	6	327713	327718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037585
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6118	NC_016446	TGA	2	6	327872	327877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037585
6119	NC_016446	GAA	2	6	327882	327887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037585
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6121	NC_016446	ATG	2	6	327943	327948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037585
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6242	NC_016446	A	6	6	334068	334073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_016446	TACA	2	8	334109	334116	50 %	25 %	0 %	25 %	360037591
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6491	NC_016446	GTT	2	6	346629	346634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037602
6492	NC_016446	GATT	2	8	346660	346667	25 %	50 %	25 %	0 %	360037602
6493	NC_016446	ATC	2	6	346709	346714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037602
6494	NC_016446	CTG	2	6	346739	346744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037602
6495	NC_016446	ACCAAT	2	12	346764	346775	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	360037602
6496	NC_016446	GCT	2	6	346823	346828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037602
6497	NC_016446	CCT	2	6	346930	346935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037602
6498	NC_016446	CGC	2	6	347039	347044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037602
6499	NC_016446	TTC	2	6	347067	347072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037602
6500	NC_016446	GC	3	6	347085	347090	0 %	0 %	50 %	50 %	360037602

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