MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 19756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016446	CAT	2	6	295952	295957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037555
5502	NC_016446	ACA	2	6	296116	296121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037555
5503	NC_016446	CAA	2	6	296219	296224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037555
5504	NC_016446	T	7	7	296260	296266	0 %	100 %	0 %	0 %	360037555
5505	NC_016446	TAA	2	6	296285	296290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037555
5506	NC_016446	TGG	2	6	296305	296310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037555
5507	NC_016446	TTG	2	6	296372	296377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037555
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5509	NC_016446	TTC	2	6	296433	296438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037555
5510	NC_016446	GGT	2	6	296470	296475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037555
5511	NC_016446	CGC	2	6	296492	296497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037555
5512	NC_016446	T	6	6	296532	296537	0 %	100 %	0 %	0 %	360037555
5513	NC_016446	AGC	2	6	296541	296546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037555
5514	NC_016446	TGA	2	6	296596	296601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037555
5515	NC_016446	CGT	2	6	296615	296620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037555
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5517	NC_016446	TTG	2	6	296693	296698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037555
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5519	NC_016446	TTA	2	6	296740	296745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016446	AAACTC	2	12	296747	296758	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_016446	AG	3	6	296898	296903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_016446	CGG	2	6	296954	296959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037556
5523	NC_016446	TAT	2	6	297123	297128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037556
5524	NC_016446	ATC	2	6	297263	297268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037556
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5527	NC_016446	CATTG	2	10	297358	297367	20 %	40 %	20 %	20 %	360037556
5528	NC_016446	GTCA	2	8	297472	297479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5529	NC_016446	CTT	2	6	297556	297561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037557
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5532	NC_016446	TTGC	2	8	297622	297629	0 %	50 %	25 %	25 %	360037557
5533	NC_016446	CATT	2	8	297660	297667	25 %	50 %	0 %	25 %	360037557
5534	NC_016446	GAC	2	6	297688	297693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_016446	ATT	2	6	297765	297770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037558
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5540	NC_016446	TGC	2	6	297931	297936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037558
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5542	NC_016446	CTG	2	6	298186	298191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037558
5543	NC_016446	T	6	6	298277	298282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_016446	ATCC	2	8	298361	298368	25 %	25 %	0 %	50 %	360037559
5545	NC_016446	TAA	2	6	298544	298549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037559
5546	NC_016446	GC	3	6	298555	298560	0 %	0 %	50 %	50 %	360037559
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5553	NC_016446	TAA	2	6	298934	298939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037559
5554	NC_016446	ATT	2	6	299002	299007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_016446	CTG	2	6	299017	299022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_016446	ATT	2	6	299128	299133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037560
5557	NC_016446	ATCA	2	8	299209	299216	50 %	25 %	0 %	25 %	360037560
5558	NC_016446	A	7	7	299309	299315	100 %	0 %	0 %	0 %	360037560
5559	NC_016446	CAT	2	6	299355	299360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037560
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5571	NC_016446	AGTC	2	8	299871	299878	25 %	25 %	25 %	25 %	360037560
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5593	NC_016446	TGA	2	6	300701	300706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037560
5594	NC_016446	GCTGA	2	10	300727	300736	20 %	20 %	40 %	20 %	360037560
5595	NC_016446	CCATG	2	10	300810	300819	20 %	20 %	20 %	40 %	360037560
5596	NC_016446	TCT	2	6	300901	300906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_016446	TG	3	6	300914	300919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_016446	CATA	2	8	300931	300938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_016446	CTT	2	6	300964	300969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_016446	CAT	2	6	301031	301036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5602	NC_016446	AATT	2	8	301194	301201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_016446	ACAT	2	8	301217	301224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_016446	TGC	2	6	301466	301471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037561
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5606	NC_016446	TG	3	6	301511	301516	0 %	50 %	50 %	0 %	360037561
5607	NC_016446	CAA	2	6	301548	301553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037561
5608	NC_016446	CT	3	6	301582	301587	0 %	50 %	0 %	50 %	360037561
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5611	NC_016446	TTG	2	6	301628	301633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037561
5612	NC_016446	TTA	2	6	301681	301686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037561
5613	NC_016446	ATG	2	6	301705	301710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037561
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5615	NC_016446	TC	4	8	301773	301780	0 %	50 %	0 %	50 %	360037561
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5622	NC_016446	GT	3	6	302021	302026	0 %	50 %	50 %	0 %	360037561
5623	NC_016446	TGT	2	6	302207	302212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037561
5624	NC_016446	GCA	2	6	302218	302223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037561
5625	NC_016446	CGC	2	6	302340	302345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037561
5626	NC_016446	ATT	2	6	302443	302448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037561
5627	NC_016446	TGC	2	6	302453	302458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037561
5628	NC_016446	GTA	2	6	302503	302508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037561
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5631	NC_016446	ATT	2	6	302728	302733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037562
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5643	NC_016446	AATCC	2	10	303311	303320	40 %	20 %	0 %	40 %	360037562
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5648	NC_016446	GCA	2	6	303568	303573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037562
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5730	NC_016446	AG	3	6	307369	307374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5882	NC_016446	GACT	2	8	315539	315546	25 %	25 %	25 %	25 %	360037573
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5987	NC_016446	GGCTGG	2	12	320998	321009	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	360037581
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