MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016445	AAAC	2	8	188138	188145	75 %	0 %	0 %	25 %	360034572
3502	NC_016445	GCA	2	6	188161	188166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034572
3503	NC_016445	AGA	2	6	188248	188253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034572
3504	NC_016445	GAA	2	6	188274	188279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034572
3505	NC_016445	GTG	2	6	188298	188303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034572
3506	NC_016445	CAA	2	6	188397	188402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034572
3507	NC_016445	CAT	2	6	188441	188446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034572
3508	NC_016445	CTG	2	6	188514	188519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034572
3509	NC_016445	CTGA	2	8	188559	188566	25 %	25 %	25 %	25 %	360034572
3510	NC_016445	GAT	2	6	188708	188713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034572
3511	NC_016445	TGG	2	6	188726	188731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034572
3512	NC_016445	GC	3	6	188739	188744	0 %	0 %	50 %	50 %	360034572
3513	NC_016445	TCA	2	6	188749	188754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034572
3514	NC_016445	CAC	2	6	188757	188762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034572
3515	NC_016445	GGT	2	6	188829	188834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034572
3516	NC_016445	ATG	2	6	188910	188915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034572
3517	NC_016445	GCT	2	6	188969	188974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034572
3518	NC_016445	TGG	2	6	189041	189046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034572
3519	NC_016445	CG	3	6	189053	189058	0 %	0 %	50 %	50 %	360034572
3520	NC_016445	GAA	2	6	189123	189128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034572
3521	NC_016445	TCA	2	6	189265	189270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034572
3522	NC_016445	CAG	2	6	189280	189285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034572
3523	NC_016445	TC	3	6	189289	189294	0 %	50 %	0 %	50 %	360034572
3524	NC_016445	CGT	2	6	189303	189308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034572
3525	NC_016445	TTC	2	6	189324	189329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034572
3526	NC_016445	TTC	2	6	189345	189350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034572
3527	NC_016445	TGA	3	9	189449	189457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034572
3528	NC_016445	ATG	2	6	189469	189474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034572
3529	NC_016445	GGTATT	2	12	189525	189536	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360034572
3530	NC_016445	GTGAT	2	10	189577	189586	20 %	40 %	40 %	0 %	360034572
3531	NC_016445	AAT	2	6	189613	189618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034572
3532	NC_016445	GATT	2	8	189626	189633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_016445	T	7	7	189657	189663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016445	AAT	2	6	189676	189681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016445	TTG	2	6	189763	189768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016445	GAATA	2	10	189843	189852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016445	CT	3	6	189926	189931	0 %	50 %	0 %	50 %	360034573
3538	NC_016445	TGT	2	6	189932	189937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034573
3539	NC_016445	CTGG	2	8	189959	189966	0 %	25 %	50 %	25 %	360034573
3540	NC_016445	GTATTG	2	12	190051	190062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360034573
3541	NC_016445	ATG	2	6	190075	190080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034573
3542	NC_016445	TGGC	2	8	190134	190141	0 %	25 %	50 %	25 %	360034573
3543	NC_016445	T	6	6	190209	190214	0 %	100 %	0 %	0 %	360034573
3544	NC_016445	GTT	2	6	190238	190243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034573
3545	NC_016445	AAAG	2	8	190283	190290	75 %	0 %	25 %	0 %	360034573
3546	NC_016445	CGGC	2	8	190309	190316	0 %	0 %	50 %	50 %	360034573
3547	NC_016445	GATCA	2	10	190362	190371	40 %	20 %	20 %	20 %	360034573
3548	NC_016445	CCGA	2	8	190383	190390	25 %	0 %	25 %	50 %	360034573
3549	NC_016445	GAAA	2	8	190427	190434	75 %	0 %	25 %	0 %	360034573
3550	NC_016445	TCG	2	6	190461	190466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034573
3551	NC_016445	TTTCA	2	10	190481	190490	20 %	60 %	0 %	20 %	360034573
3552	NC_016445	GGA	2	6	190553	190558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034573
3553	NC_016445	CAA	2	6	190563	190568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034573
3554	NC_016445	TGC	2	6	190576	190581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034573
3555	NC_016445	TGG	2	6	190589	190594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034573
3556	NC_016445	CTG	2	6	190599	190604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034573
3557	NC_016445	AAG	2	6	190663	190668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034573
3558	NC_016445	GCC	2	6	190719	190724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034573
3559	NC_016445	GC	3	6	190826	190831	0 %	0 %	50 %	50 %	360034573
3560	NC_016445	TGA	2	6	190910	190915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034573
3561	NC_016445	TGA	2	6	190966	190971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034573
3562	NC_016445	CTG	3	9	191100	191108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034573
3563	NC_016445	T	6	6	191279	191284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016445	GTA	2	6	191285	191290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_016445	T	6	6	191447	191452	0 %	100 %	0 %	0 %	360034574
3566	NC_016445	TAA	2	6	191463	191468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034574
3567	NC_016445	GTT	2	6	191491	191496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016445	CTTT	2	8	191534	191541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_016445	CAT	2	6	191569	191574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_016445	CAT	2	6	191592	191597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_016445	TTA	2	6	191706	191711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_016445	TCT	2	6	191743	191748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_016445	TTAC	2	8	191817	191824	25 %	50 %	0 %	25 %	360034575
3574	NC_016445	CGT	2	6	191857	191862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034575
3575	NC_016445	GAG	2	6	191863	191868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034575
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3579	NC_016445	GTC	2	6	191960	191965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034575
3580	NC_016445	TGT	2	6	191991	191996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034575
3581	NC_016445	TCG	2	6	192021	192026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034575
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3586	NC_016445	GAC	2	6	192772	192777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034576
3587	NC_016445	ATC	2	6	192785	192790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034576
3588	NC_016445	GAT	2	6	192811	192816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034576
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3590	NC_016445	TC	3	6	192886	192891	0 %	50 %	0 %	50 %	360034576
3591	NC_016445	AGCC	2	8	192905	192912	25 %	0 %	25 %	50 %	360034576
3592	NC_016445	CCG	2	6	192976	192981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034576
3593	NC_016445	TGG	2	6	193195	193200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_016445	T	6	6	193283	193288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_016445	A	6	6	193320	193325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_016445	GGC	2	6	193463	193468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034577
3597	NC_016445	GCA	2	6	193483	193488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034577
3598	NC_016445	TCCAT	2	10	193534	193543	20 %	40 %	0 %	40 %	360034577
3599	NC_016445	CTT	3	9	193573	193581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034577
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3601	NC_016445	AGCG	2	8	193625	193632	25 %	0 %	50 %	25 %	360034577
3602	NC_016445	AG	3	6	193673	193678	50 %	0 %	50 %	0 %	360034577
3603	NC_016445	TTG	2	6	193820	193825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034577
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3605	NC_016445	CTG	2	6	193837	193842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034577
3606	NC_016445	TTG	2	6	193958	193963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034577
3607	NC_016445	TTG	2	6	193982	193987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034577
3608	NC_016445	GTC	2	6	193989	193994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034577
3609	NC_016445	GCTTGC	2	12	194055	194066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034578
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3611	NC_016445	TTG	2	6	194139	194144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034578
3612	NC_016445	AG	3	6	194186	194191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016445	GATTG	2	10	194202	194211	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_016445	TC	3	6	194217	194222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_016445	TGATT	2	10	194329	194338	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016445	T	6	6	194360	194365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_016445	GTT	2	6	194366	194371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_016445	TTTC	2	8	194372	194379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_016445	GTT	2	6	194382	194387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_016445	TTG	2	6	194398	194403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034580
3621	NC_016445	T	7	7	194413	194419	0 %	100 %	0 %	0 %	360034580
3622	NC_016445	TTC	2	6	194435	194440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034580
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3624	NC_016445	T	6	6	194527	194532	0 %	100 %	0 %	0 %	360034579
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3736	NC_016445	GAT	2	6	199992	199997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3741	NC_016445	GCG	2	6	200243	200248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034586
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3743	NC_016445	GAT	2	6	200363	200368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034586
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3745	NC_016445	CGA	2	6	200499	200504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034586
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3747	NC_016445	CAT	2	6	200698	200703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034586
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3763	NC_016445	TGG	2	6	201355	201360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3765	NC_016445	CTAA	2	8	201451	201458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3766	NC_016445	TTG	2	6	201490	201495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3859	NC_016445	A	6	6	206324	206329	100 %	0 %	0 %	0 %	360034592
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3869	NC_016445	CG	3	6	207050	207055	0 %	0 %	50 %	50 %	360034592
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3989	NC_016445	GTG	2	6	212870	212875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_016445	CGCGA	2	10	212936	212945	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3991	NC_016445	GCTAT	2	10	212966	212975	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3992	NC_016445	TCA	2	6	212993	212998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_016445	A	6	6	213034	213039	100 %	0 %	0 %	0 %	360034598
3994	NC_016445	TGC	2	6	213062	213067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034598
3995	NC_016445	GAGT	2	8	213084	213091	25 %	25 %	50 %	0 %	360034598
3996	NC_016445	CAAT	2	8	213363	213370	50 %	25 %	0 %	25 %	360034598
3997	NC_016445	ATG	2	6	213388	213393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034599
3998	NC_016445	GCCA	2	8	213477	213484	25 %	0 %	25 %	50 %	360034599
3999	NC_016445	TTTG	2	8	213600	213607	0 %	75 %	25 %	0 %	360034599
4000	NC_016445	TGC	2	6	213803	213808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034599

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