MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_016445	A	7	7	1992499	1992505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38003	NC_016445	T	6	6	1992532	1992537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38004	NC_016445	CAG	2	6	1992553	1992558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38005	NC_016445	GGTAAT	2	12	1992582	1992593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38006	NC_016445	TGG	2	6	1992596	1992601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38007	NC_016445	TG	3	6	1992649	1992654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38008	NC_016445	TTGC	2	8	1992656	1992663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38009	NC_016445	GTC	2	6	1992691	1992696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38010	NC_016445	T	7	7	1992710	1992716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38011	NC_016445	AAC	2	6	1992754	1992759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38012	NC_016445	AGTG	2	8	1992782	1992789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38013	NC_016445	TCA	2	6	1992879	1992884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38015	NC_016445	TA	3	6	1992934	1992939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38016	NC_016445	ATGT	2	8	1992973	1992980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38017	NC_016445	T	6	6	1993050	1993055	0 %	100 %	0 %	0 %	360036237
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38045	NC_016445	CTA	2	6	1994669	1994674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38061	NC_016445	T	7	7	1995474	1995480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38062	NC_016445	TGCT	2	8	1995497	1995504	0 %	50 %	25 %	25 %	360036241
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38113	NC_016445	TGGTT	2	10	1997950	1997959	0 %	60 %	40 %	0 %	360036242
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38117	NC_016445	CA	3	6	1998344	1998349	50 %	0 %	0 %	50 %	360036242
38118	NC_016445	ATG	2	6	1998352	1998357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036242
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38120	NC_016445	ACG	3	9	1998417	1998425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036242
38121	NC_016445	TTGG	2	8	1998474	1998481	0 %	50 %	50 %	0 %	360036242
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38239	NC_016445	CGTCAA	2	12	2004347	2004358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360036245
38240	NC_016445	CATCG	2	10	2004386	2004395	20 %	20 %	20 %	40 %	360036245
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38302	NC_016445	TTAA	3	12	2007581	2007592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38303	NC_016445	GTTA	2	8	2007601	2007608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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38352	NC_016445	TGC	2	6	2010300	2010305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036248
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38356	NC_016445	CGC	2	6	2010503	2010508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036248
38357	NC_016445	CAAG	2	8	2010535	2010542	50 %	0 %	25 %	25 %	360036248
38358	NC_016445	TGC	2	6	2010594	2010599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036248
38359	NC_016445	CGG	2	6	2010663	2010668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036248
38360	NC_016445	CGC	4	12	2010714	2010725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036248
38361	NC_016445	CGG	2	6	2010895	2010900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036248
38362	NC_016445	CAGC	2	8	2010906	2010913	25 %	0 %	25 %	50 %	360036248
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38377	NC_016445	TC	3	6	2011555	2011560	0 %	50 %	0 %	50 %	360036248
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38382	NC_016445	TG	3	6	2011765	2011770	0 %	50 %	50 %	0 %	360036248
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38384	NC_016445	TCG	2	6	2011935	2011940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036248
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38392	NC_016445	TGAT	2	8	2012288	2012295	25 %	50 %	25 %	0 %	360036249
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38420	NC_016445	TGG	2	6	2013639	2013644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036249
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38422	NC_016445	ACA	2	6	2013736	2013741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38423	NC_016445	T	6	6	2013766	2013771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38424	NC_016445	TGAGA	2	10	2013869	2013878	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38425	NC_016445	ATT	2	6	2013914	2013919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38426	NC_016445	ACCGC	2	10	2013969	2013978	20 %	0 %	20 %	60 %	360036250
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38428	NC_016445	TCG	2	6	2014176	2014181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036250
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38430	NC_016445	TCGA	2	8	2014346	2014353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38431	NC_016445	AG	3	6	2014404	2014409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38432	NC_016445	CAT	2	6	2014426	2014431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036251
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38450	NC_016445	CTG	2	6	2015255	2015260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036252
38451	NC_016445	AC	3	6	2015274	2015279	50 %	0 %	0 %	50 %	360036252
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38455	NC_016445	GCT	3	9	2015404	2015412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036252
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38457	NC_016445	GCG	2	6	2015640	2015645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036252
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38461	NC_016445	TG	3	6	2015871	2015876	0 %	50 %	50 %	0 %	360036252
38462	NC_016445	GGC	2	6	2015906	2015911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036252
38463	NC_016445	A	6	6	2015931	2015936	100 %	0 %	0 %	0 %	360036252
38464	NC_016445	GGCG	2	8	2015954	2015961	0 %	0 %	75 %	25 %	360036252
38465	NC_016445	GCG	2	6	2015972	2015977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036252
38466	NC_016445	TAC	2	6	2016051	2016056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036252
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38468	NC_016445	CCG	2	6	2016147	2016152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036253
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38470	NC_016445	GCC	2	6	2016197	2016202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036253
38471	NC_016445	GTTG	2	8	2016217	2016224	0 %	50 %	50 %	0 %	360036253
38472	NC_016445	ATC	2	6	2016282	2016287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036253
38473	NC_016445	ATC	2	6	2016332	2016337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036253
38474	NC_016445	ATA	2	6	2016438	2016443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036253
38475	NC_016445	ACGC	2	8	2016526	2016533	25 %	0 %	25 %	50 %	360036253
38476	NC_016445	CAT	2	6	2016586	2016591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036253
38477	NC_016445	GGCA	2	8	2016771	2016778	25 %	0 %	50 %	25 %	360036253
38478	NC_016445	TGAT	2	8	2017012	2017019	25 %	50 %	25 %	0 %	360036254
38479	NC_016445	TGG	2	6	2017121	2017126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036254
38480	NC_016445	GTG	2	6	2017256	2017261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036254
38481	NC_016445	TGCGA	2	10	2017275	2017284	20 %	20 %	40 %	20 %	360036254
38482	NC_016445	TCG	2	6	2017300	2017305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036254
38483	NC_016445	GCG	2	6	2017381	2017386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036254
38484	NC_016445	TGC	2	6	2017429	2017434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036254
38485	NC_016445	TAT	2	6	2017460	2017465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036254
38486	NC_016445	CAG	2	6	2017505	2017510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036254
38487	NC_016445	GCTCT	2	10	2017518	2017527	0 %	40 %	20 %	40 %	360036254
38488	NC_016445	T	6	6	2017534	2017539	0 %	100 %	0 %	0 %	360036254
38489	NC_016445	TCA	2	6	2017752	2017757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38490	NC_016445	A	6	6	2017805	2017810	100 %	0 %	0 %	0 %	360036255
38491	NC_016445	CAG	2	6	2017850	2017855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036255
38492	NC_016445	A	6	6	2017882	2017887	100 %	0 %	0 %	0 %	360036255
38493	NC_016445	AATT	2	8	2017949	2017956	50 %	50 %	0 %	0 %	360036255
38494	NC_016445	AGC	2	6	2018003	2018008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036255
38495	NC_016445	GCT	2	6	2018028	2018033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036255
38496	NC_016445	GCAA	2	8	2018096	2018103	50 %	0 %	25 %	25 %	360036255
38497	NC_016445	CAC	2	6	2018121	2018126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036255
38498	NC_016445	CA	3	6	2018131	2018136	50 %	0 %	0 %	50 %	360036255
38499	NC_016445	TGA	2	6	2018235	2018240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036255
38500	NC_016445	GCAC	2	8	2018271	2018278	25 %	0 %	25 %	50 %	360036255

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