MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016445	GGT	2	6	130573	130578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034512
2502	NC_016445	ATC	2	6	130592	130597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034512
2503	NC_016445	AGA	3	9	130638	130646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034512
2504	NC_016445	AT	3	6	130760	130765	50 %	50 %	0 %	0 %	360034513
2505	NC_016445	CTT	2	6	130806	130811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034513
2506	NC_016445	GTTT	2	8	130818	130825	0 %	75 %	25 %	0 %	360034513
2507	NC_016445	ATGA	2	8	130853	130860	50 %	25 %	25 %	0 %	360034513
2508	NC_016445	ATC	2	6	130864	130869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034513
2509	NC_016445	TCA	2	6	130937	130942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034513
2510	NC_016445	GCT	2	6	130968	130973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034513
2511	NC_016445	AAG	2	6	130991	130996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034513
2512	NC_016445	AGA	2	6	131071	131076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034513
2513	NC_016445	CAG	2	6	131142	131147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034513
2514	NC_016445	TCA	2	6	131159	131164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034513
2515	NC_016445	GT	4	8	131174	131181	0 %	50 %	50 %	0 %	360034513
2516	NC_016445	A	6	6	131313	131318	100 %	0 %	0 %	0 %	360034514
2517	NC_016445	A	6	6	131326	131331	100 %	0 %	0 %	0 %	360034514
2518	NC_016445	ATTTG	2	10	131335	131344	20 %	60 %	20 %	0 %	360034514
2519	NC_016445	GTC	2	6	131348	131353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034514
2520	NC_016445	TCA	2	6	131404	131409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034514
2521	NC_016445	TTC	2	6	131518	131523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034514
2522	NC_016445	GAG	2	6	131543	131548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016445	CGC	2	6	131591	131596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034515
2524	NC_016445	TTC	2	6	131750	131755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034515
2525	NC_016445	CCAA	2	8	131782	131789	50 %	0 %	0 %	50 %	360034515
2526	NC_016445	GGTGCT	2	12	131906	131917	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	360034516
2527	NC_016445	TGC	2	6	131926	131931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034516
2528	NC_016445	GAGTAT	2	12	132225	132236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034516
2529	NC_016445	TGGA	2	8	132360	132367	25 %	25 %	50 %	0 %	360034516
2530	NC_016445	ATG	2	6	132439	132444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034516
2531	NC_016445	GATG	2	8	132461	132468	25 %	25 %	50 %	0 %	360034517
2532	NC_016445	CGT	2	6	132518	132523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034517
2533	NC_016445	GCCA	2	8	132549	132556	25 %	0 %	25 %	50 %	360034517
2534	NC_016445	TGA	2	6	132560	132565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034517
2535	NC_016445	CAA	2	6	132623	132628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034517
2536	NC_016445	TGA	2	6	132635	132640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034517
2537	NC_016445	AAC	2	6	132723	132728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034517
2538	NC_016445	TGT	2	6	132759	132764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034517
2539	NC_016445	TCG	2	6	132855	132860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034517
2540	NC_016445	CAG	2	6	132898	132903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034517
2541	NC_016445	CGT	2	6	132918	132923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034517
2542	NC_016445	GCC	2	6	132934	132939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034517
2543	NC_016445	GTT	2	6	133270	133275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034517
2544	NC_016445	ATC	2	6	133280	133285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034517
2545	NC_016445	GAA	2	6	133288	133293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034517
2546	NC_016445	CTT	2	6	133318	133323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034517
2547	NC_016445	TGG	2	6	133406	133411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034518
2548	NC_016445	ATGGTG	2	12	133422	133433	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	360034518
2549	NC_016445	TGA	2	6	133448	133453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034518
2550	NC_016445	ACT	2	6	133553	133558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034518
2551	NC_016445	CGT	2	6	133602	133607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034518
2552	NC_016445	TGA	2	6	133694	133699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034518
2553	NC_016445	GCA	2	6	133719	133724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034518
2554	NC_016445	GAC	2	6	133809	133814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034518
2555	NC_016445	CAG	2	6	133851	133856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034518
2556	NC_016445	GCC	2	6	133898	133903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034518
2557	NC_016445	GTT	2	6	133950	133955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034518
2558	NC_016445	AAG	2	6	133960	133965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034518
2559	NC_016445	CGC	2	6	133966	133971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034518
2560	NC_016445	CGG	2	6	133984	133989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034518
2561	NC_016445	GCA	2	6	133990	133995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034518
2562	NC_016445	CGC	2	6	134141	134146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034518
2563	NC_016445	TG	3	6	134202	134207	0 %	50 %	50 %	0 %	360034518
2564	NC_016445	AGA	2	6	134210	134215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034518
2565	NC_016445	TGG	2	6	134216	134221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034518
2566	NC_016445	TGG	2	6	134311	134316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034518
2567	NC_016445	GAT	2	6	134324	134329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034518
2568	NC_016445	CGA	2	6	134380	134385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034518
2569	NC_016445	AAG	2	6	134437	134442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034518
2570	NC_016445	AAG	2	6	134621	134626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034518
2571	NC_016445	A	6	6	134630	134635	100 %	0 %	0 %	0 %	360034518
2572	NC_016445	ATA	2	6	134672	134677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034519
2573	NC_016445	GAC	2	6	134707	134712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034519
2574	NC_016445	AAC	2	6	134723	134728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034519
2575	NC_016445	AGT	2	6	134825	134830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034519
2576	NC_016445	GCA	2	6	135019	135024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034519
2577	NC_016445	GGA	2	6	135079	135084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034519
2578	NC_016445	GCA	2	6	135290	135295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034520
2579	NC_016445	GGT	2	6	135376	135381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034520
2580	NC_016445	TG	3	6	135396	135401	0 %	50 %	50 %	0 %	360034520
2581	NC_016445	TGG	2	6	135464	135469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034520
2582	NC_016445	TCGC	2	8	135485	135492	0 %	25 %	25 %	50 %	360034520
2583	NC_016445	TGG	2	6	135522	135527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034520
2584	NC_016445	TGT	2	6	135588	135593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034520
2585	NC_016445	AAG	2	6	135605	135610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034520
2586	NC_016445	CGT	2	6	135639	135644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034520
2587	NC_016445	ACA	2	6	135711	135716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_016445	TGT	2	6	135732	135737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016445	TTTCA	2	10	135746	135755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2590	NC_016445	ATT	2	6	135785	135790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_016445	TAA	2	6	135828	135833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_016445	TTG	2	6	135903	135908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034521
2593	NC_016445	CTGA	2	8	135947	135954	25 %	25 %	25 %	25 %	360034521
2594	NC_016445	GAA	2	6	136006	136011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034521
2595	NC_016445	GT	3	6	136023	136028	0 %	50 %	50 %	0 %	360034521
2596	NC_016445	AGC	2	6	136130	136135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2597	NC_016445	GTC	2	6	136207	136212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2598	NC_016445	AAAGAG	2	12	136316	136327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034521
2599	NC_016445	TGC	2	6	136351	136356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2600	NC_016445	ATT	2	6	136411	136416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034521
2601	NC_016445	AGC	2	6	136469	136474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2602	NC_016445	ATTTCT	2	12	136495	136506	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	360034521
2603	NC_016445	TAC	2	6	136514	136519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034521
2604	NC_016445	TGA	2	6	136603	136608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034521
2605	NC_016445	A	6	6	136646	136651	100 %	0 %	0 %	0 %	360034521
2606	NC_016445	AAC	2	6	136656	136661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034521
2607	NC_016445	ATTT	2	8	136771	136778	25 %	75 %	0 %	0 %	360034522
2608	NC_016445	GA	3	6	136781	136786	50 %	0 %	50 %	0 %	360034522
2609	NC_016445	ACAG	2	8	136884	136891	50 %	0 %	25 %	25 %	360034522
2610	NC_016445	ATA	2	6	136930	136935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034522
2611	NC_016445	TGA	2	6	136940	136945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034522
2612	NC_016445	CGA	2	6	136975	136980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034522
2613	NC_016445	AAT	2	6	137030	137035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034522
2614	NC_016445	AGTC	2	8	137087	137094	25 %	25 %	25 %	25 %	360034522
2615	NC_016445	TGG	2	6	137108	137113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034522
2616	NC_016445	TG	3	6	137119	137124	0 %	50 %	50 %	0 %	360034522
2617	NC_016445	GA	4	8	137195	137202	50 %	0 %	50 %	0 %	360034522
2618	NC_016445	TGG	2	6	137206	137211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034522
2619	NC_016445	T	6	6	137213	137218	0 %	100 %	0 %	0 %	360034522
2620	NC_016445	ATG	2	6	137361	137366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034522
2621	NC_016445	GCA	2	6	137466	137471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034522
2622	NC_016445	TGA	2	6	137570	137575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034522
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2624	NC_016445	CTC	2	6	137729	137734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2626	NC_016445	ATG	2	6	137934	137939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034523
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2659	NC_016445	CGGG	2	8	139899	139906	0 %	0 %	75 %	25 %	360034524
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2733	NC_016445	GGCA	2	8	144378	144385	25 %	0 %	50 %	25 %	360034529
2734	NC_016445	TTGGA	2	10	144447	144456	20 %	40 %	40 %	0 %	360034529
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2740	NC_016445	GGT	2	6	144816	144821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034529
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2742	NC_016445	CAC	2	6	144839	144844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034529
2743	NC_016445	AGC	2	6	144861	144866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2744	NC_016445	CGA	2	6	144875	144880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2745	NC_016445	CAAC	2	8	144923	144930	50 %	0 %	0 %	50 %	360034529
2746	NC_016445	GGT	2	6	144939	144944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034529
2747	NC_016445	TGGC	2	8	144989	144996	0 %	25 %	50 %	25 %	360034529
2748	NC_016445	AGTG	2	8	145023	145030	25 %	25 %	50 %	0 %	360034529
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2866	NC_016445	G	6	6	151612	151617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2988	NC_016445	GCT	2	6	159156	159161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034542
2989	NC_016445	TGGCT	2	10	159171	159180	0 %	40 %	40 %	20 %	360034542
2990	NC_016445	TGA	2	6	159186	159191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034542
2991	NC_016445	AATCA	2	10	159253	159262	60 %	20 %	0 %	20 %	360034542
2992	NC_016445	GAT	2	6	159301	159306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034542
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2997	NC_016445	ACC	2	6	159581	159586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2998	NC_016445	GTG	2	6	159615	159620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_016445	A	7	7	159713	159719	100 %	0 %	0 %	0 %	360034543
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